MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella bongori N268-08 plasmid RM1

Total Repeats: 987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021871	CGG	2	6	249	254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230593
2	NC_021871	TAT	2	6	269	274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230593
3	NC_021871	GCA	2	6	281	286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230594
4	NC_021871	TCA	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230594
5	NC_021871	CAT	2	6	441	446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230594
6	NC_021871	GTT	2	6	522	527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230594
7	NC_021871	CAG	2	6	553	558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230594
8	NC_021871	CTG	2	6	614	619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230595
9	NC_021871	GCA	2	6	666	671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230595
10	NC_021871	TGT	2	6	1162	1167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230596
11	NC_021871	GCT	2	6	1970	1975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230597
12	NC_021871	GCG	2	6	1999	2004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230597
13	NC_021871	GGC	2	6	2005	2010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230597
14	NC_021871	ACA	2	6	2011	2016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230597
15	NC_021871	TCG	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230597
16	NC_021871	AGC	2	6	2289	2294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230599
17	NC_021871	ACG	2	6	2306	2311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230599
18	NC_021871	GCA	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230599
19	NC_021871	GGC	2	6	2322	2327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230599
20	NC_021871	TCT	2	6	2439	2444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230598
21	NC_021871	CGG	2	6	2453	2458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230598
22	NC_021871	AGT	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230600
23	NC_021871	GCT	2	6	2917	2922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230600
24	NC_021871	CGT	2	6	2972	2977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230600
25	NC_021871	TCT	3	9	3001	3009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230600
26	NC_021871	GGA	2	6	3014	3019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230600
27	NC_021871	CTG	2	6	3303	3308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230601
28	NC_021871	ACG	2	6	3554	3559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230601
29	NC_021871	CAG	2	6	3663	3668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230603
30	NC_021871	ACC	2	6	3692	3697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230603
31	NC_021871	CAT	2	6	3783	3788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230603
32	NC_021871	CAG	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230603
33	NC_021871	CCA	2	6	3947	3952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230603
34	NC_021871	ACA	2	6	4019	4024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230602
35	NC_021871	CCA	2	6	4051	4056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230602
36	NC_021871	CCA	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230605
37	NC_021871	ATC	2	6	4278	4283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230605
38	NC_021871	CGT	2	6	4375	4380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230606
39	NC_021871	GCT	2	6	4417	4422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230606
40	NC_021871	CAT	2	6	4423	4428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230606
41	NC_021871	GCA	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230606
42	NC_021871	CTT	2	6	4464	4469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230606
43	NC_021871	AGC	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230606
44	NC_021871	CGC	2	6	4484	4489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230606
45	NC_021871	TTC	2	6	4542	4547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230606
46	NC_021871	CCA	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230606
47	NC_021871	GCC	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230606
48	NC_021871	GCT	2	6	4728	4733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230606
49	NC_021871	TCA	2	6	4743	4748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230606
50	NC_021871	CGG	2	6	4775	4780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230606
51	NC_021871	GCA	2	6	4824	4829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230606
52	NC_021871	ATG	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230606
53	NC_021871	CAC	2	6	4993	4998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230607
54	NC_021871	GCA	2	6	5016	5021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230607
55	NC_021871	CTG	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230607
56	NC_021871	TTC	2	6	5127	5132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230607
57	NC_021871	ACA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230607
58	NC_021871	CTC	2	6	5166	5171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230607
59	NC_021871	CTG	2	6	5253	5258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230607
60	NC_021871	CGC	3	9	5295	5303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230607
61	NC_021871	TCA	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230607
62	NC_021871	CAC	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230607
63	NC_021871	CAT	2	6	5464	5469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230608
64	NC_021871	TCC	2	6	5523	5528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230608
65	NC_021871	CCA	2	6	5529	5534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230608
66	NC_021871	TCA	2	6	5547	5552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230608
67	NC_021871	CAC	2	6	5558	5563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230608
68	NC_021871	CAG	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230608
69	NC_021871	CTT	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230608
70	NC_021871	GCA	2	6	5673	5678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230608
71	NC_021871	CAG	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230608
72	NC_021871	GCA	2	6	5812	5817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230608
73	NC_021871	TCG	2	6	5877	5882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230608
74	NC_021871	TCC	2	6	6051	6056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230608
75	NC_021871	CGT	2	6	6115	6120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230608
76	NC_021871	CTG	2	6	6257	6262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230608
77	NC_021871	CAT	2	6	6356	6361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230608
78	NC_021871	TTC	2	6	6452	6457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230608
79	NC_021871	GGC	2	6	6485	6490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230608
80	NC_021871	CAT	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230608
81	NC_021871	CTG	3	9	6548	6556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230608
82	NC_021871	ATG	2	6	6600	6605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230608
83	NC_021871	GAT	2	6	6800	6805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230608
84	NC_021871	CAC	2	6	6857	6862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230608
85	NC_021871	GCT	2	6	6880	6885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230608
86	NC_021871	CCG	2	6	6957	6962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230608
87	NC_021871	CCA	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230608
88	NC_021871	GGT	2	6	7232	7237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230608
89	NC_021871	GAT	2	6	7400	7405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230608
90	NC_021871	CAG	2	6	7559	7564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230608
91	NC_021871	CTG	2	6	7592	7597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230608
92	NC_021871	TGC	2	6	7751	7756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230608
93	NC_021871	GCG	2	6	7771	7776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230608
94	NC_021871	TTA	2	6	7827	7832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230608
95	NC_021871	CGG	2	6	7849	7854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230608
96	NC_021871	CGC	2	6	7954	7959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230608
97	NC_021871	GCA	2	6	8155	8160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230608
98	NC_021871	TCT	2	6	8215	8220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230608
99	NC_021871	CGC	2	6	8349	8354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230608
100	NC_021871	TGC	2	6	8379	8384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230608
101	NC_021871	GCA	3	9	8641	8649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230608
102	NC_021871	GCA	2	6	8737	8742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230608
103	NC_021871	CAT	2	6	8837	8842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230608
104	NC_021871	ACA	2	6	8923	8928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230608
105	NC_021871	CAG	2	6	9265	9270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230608
106	NC_021871	CAA	2	6	9328	9333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230608
107	NC_021871	CAG	2	6	9428	9433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230608
108	NC_021871	CCT	2	6	9625	9630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230608
109	NC_021871	CCA	2	6	9826	9831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230608
110	NC_021871	CAC	2	6	9952	9957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230608
111	NC_021871	ATC	3	9	9966	9974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230608
112	NC_021871	TAG	2	6	10176	10181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230608
113	NC_021871	AGA	2	6	10220	10225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230608
114	NC_021871	GTC	2	6	10252	10257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230609
115	NC_021871	CTG	2	6	10476	10481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230609
116	NC_021871	AGG	2	6	10546	10551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230609
117	NC_021871	CAG	2	6	10572	10577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230609
118	NC_021871	CCA	2	6	10578	10583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230609
119	NC_021871	TTC	3	9	10696	10704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230609
120	NC_021871	GCA	2	6	10761	10766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230609
121	NC_021871	CAC	2	6	10888	10893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230609
122	NC_021871	TCC	2	6	10907	10912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230609
123	NC_021871	AGA	2	6	11040	11045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230609
124	NC_021871	GCA	2	6	11075	11080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230609
125	NC_021871	TTC	2	6	11098	11103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230609
126	NC_021871	ACC	2	6	11140	11145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230609
127	NC_021871	AAT	2	6	11164	11169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230609
128	NC_021871	AGA	2	6	11214	11219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230609
129	NC_021871	CGC	2	6	11228	11233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230609
130	NC_021871	TGG	2	6	11262	11267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230609
131	NC_021871	TTC	2	6	11348	11353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230609
132	NC_021871	TCT	2	6	11481	11486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230609
133	NC_021871	TGT	2	6	11580	11585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230609
134	NC_021871	CAC	2	6	11667	11672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230609
135	NC_021871	TCC	2	6	11729	11734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230609
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144	NC_021871	ATA	2	6	12383	12388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230609
145	NC_021871	TAA	2	6	12392	12397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230609
146	NC_021871	CAG	2	6	12511	12516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230609
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152	NC_021871	AGT	2	6	13092	13097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230610
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162	NC_021871	TAC	2	6	14490	14495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230612
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239	NC_021871	CAT	2	6	19761	19766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230615
240	NC_021871	GAT	2	6	19823	19828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230616
241	NC_021871	TCA	2	6	19909	19914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230616
242	NC_021871	ACG	2	6	20003	20008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230616
243	NC_021871	GCT	2	6	20162	20167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230616
244	NC_021871	GCA	2	6	20210	20215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230616
245	NC_021871	CGG	2	6	20320	20325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230616
246	NC_021871	CAC	2	6	20407	20412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230616
247	NC_021871	CAG	2	6	20595	20600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230616
248	NC_021871	TGA	2	6	20604	20609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230616
249	NC_021871	CAA	2	6	20629	20634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230616
250	NC_021871	CGA	2	6	20791	20796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230616
251	NC_021871	GAT	2	6	20807	20812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230616
252	NC_021871	GGT	2	6	20984	20989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230616
253	NC_021871	GAT	2	6	21011	21016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230616
254	NC_021871	CCG	3	9	21234	21242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230616
255	NC_021871	TGT	2	6	21310	21315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230616
256	NC_021871	GCA	2	6	21375	21380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230616
257	NC_021871	TGA	2	6	21407	21412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230616
258	NC_021871	GTA	2	6	21425	21430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230616
259	NC_021871	CTG	2	6	21527	21532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230616
260	NC_021871	CAG	2	6	21637	21642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230617
261	NC_021871	CGG	2	6	21771	21776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230617
262	NC_021871	TGT	2	6	21780	21785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230617
263	NC_021871	GGT	2	6	21796	21801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230617
264	NC_021871	ACC	2	6	21899	21904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230617
265	NC_021871	TCA	2	6	21947	21952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230617
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267	NC_021871	GCG	2	6	22062	22067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230617
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277	NC_021871	GCG	2	6	22997	23002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230619
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281	NC_021871	GAC	2	6	23558	23563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230619
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283	NC_021871	CAG	2	6	24224	24229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230620
284	NC_021871	GCC	2	6	24247	24252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230621
285	NC_021871	CGC	2	6	24256	24261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230621
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293	NC_021871	CAG	3	9	24565	24573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230621
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362	NC_021871	CAT	2	6	30346	30351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230630
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372	NC_021871	TTA	2	6	30869	30874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230630
373	NC_021871	TTC	2	6	30925	30930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230631
374	NC_021871	GTT	2	6	30953	30958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230631
375	NC_021871	ACC	2	6	31100	31105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230631
376	NC_021871	AGC	2	6	31194	31199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230631
377	NC_021871	TCA	2	6	31261	31266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230631
378	NC_021871	GCC	2	6	31505	31510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230631
379	NC_021871	CAT	2	6	31568	31573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230631
380	NC_021871	CCT	2	6	31648	31653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230632
381	NC_021871	CAT	2	6	31796	31801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230632
382	NC_021871	GGA	2	6	31829	31834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230632
383	NC_021871	TCC	2	6	31846	31851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230632
384	NC_021871	CGA	2	6	31865	31870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230632
385	NC_021871	TCA	2	6	31946	31951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230632
386	NC_021871	GAC	2	6	32019	32024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230632
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388	NC_021871	AAT	2	6	32127	32132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230632
389	NC_021871	TGG	2	6	32135	32140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230632
390	NC_021871	ATA	2	6	32164	32169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230632
391	NC_021871	AAT	2	6	32240	32245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230633
392	NC_021871	CGC	2	6	32305	32310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230633
393	NC_021871	AAT	2	6	32338	32343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230633
394	NC_021871	AAC	2	6	32386	32391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230633
395	NC_021871	TCA	2	6	32408	32413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230633
396	NC_021871	AAT	2	6	32425	32430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230633
397	NC_021871	TGA	2	6	32497	32502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230634
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400	NC_021871	CAT	2	6	32618	32623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230634
401	NC_021871	CAT	2	6	32656	32661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230634
402	NC_021871	CAG	2	6	32675	32680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230634
403	NC_021871	CAG	2	6	32717	32722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230634
404	NC_021871	CAC	2	6	32767	32772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230634
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407	NC_021871	AAT	2	6	32987	32992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230635
408	NC_021871	CTC	2	6	33047	33052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230635
409	NC_021871	CTG	2	6	33091	33096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230635
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420	NC_021871	TTC	2	6	34629	34634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230637
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431	NC_021871	GTT	2	6	35842	35847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230639
432	NC_021871	GTA	2	6	35880	35885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230639
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450	NC_021871	GCC	2	6	36952	36957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230643
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452	NC_021871	CGG	2	6	37093	37098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230643
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500	NC_021871	GGT	2	6	42061	42066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230652

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