MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella bongori N268-08 plasmid RM1

Total Repeats: 1494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021871	TGT	2	6	29338	29343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230629
502	NC_021871	TCT	2	6	29377	29382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230629
503	NC_021871	TG	3	6	29528	29533	0 %	50 %	50 %	0 %	526230630
504	NC_021871	GTC	2	6	29546	29551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230630
505	NC_021871	GCT	2	6	29586	29591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230630
506	NC_021871	CGCA	2	8	29677	29684	25 %	0 %	25 %	50 %	526230630
507	NC_021871	CTT	2	6	29685	29690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230630
508	NC_021871	GTA	2	6	29788	29793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230630
509	NC_021871	ACC	2	6	29824	29829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230630
510	NC_021871	CCTG	2	8	29837	29844	0 %	25 %	25 %	50 %	526230630
511	NC_021871	AAC	2	6	29980	29985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230630
512	NC_021871	TCT	2	6	30033	30038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230630
513	NC_021871	GTC	2	6	30046	30051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230630
514	NC_021871	ACGA	2	8	30082	30089	50 %	0 %	25 %	25 %	526230630
515	NC_021871	C	6	6	30111	30116	0 %	0 %	0 %	100 %	526230630
516	NC_021871	ACG	2	6	30254	30259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230630
517	NC_021871	GAA	2	6	30281	30286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230630
518	NC_021871	CAT	2	6	30346	30351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230630
519	NC_021871	TCA	2	6	30372	30377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230630
520	NC_021871	CCG	2	6	30398	30403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230630
521	NC_021871	CTG	2	6	30405	30410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230630
522	NC_021871	GA	3	6	30496	30501	50 %	0 %	50 %	0 %	526230630
523	NC_021871	TTC	2	6	30509	30514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230630
524	NC_021871	GCA	2	6	30534	30539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230630
525	NC_021871	T	6	6	30622	30627	0 %	100 %	0 %	0 %	526230630
526	NC_021871	TCTG	2	8	30632	30639	0 %	50 %	25 %	25 %	526230630
527	NC_021871	TTA	2	6	30647	30652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230630
528	NC_021871	GCGG	2	8	30755	30762	0 %	0 %	75 %	25 %	526230630
529	NC_021871	TTC	2	6	30767	30772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230630
530	NC_021871	CCAT	2	8	30789	30796	25 %	25 %	0 %	50 %	526230630
531	NC_021871	GAC	2	6	30852	30857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230630
532	NC_021871	GAC	2	6	30862	30867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230630
533	NC_021871	TTA	2	6	30869	30874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230630
534	NC_021871	TTC	2	6	30925	30930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230631
535	NC_021871	GTT	2	6	30953	30958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230631
536	NC_021871	GCAC	2	8	30972	30979	25 %	0 %	25 %	50 %	526230631
537	NC_021871	C	6	6	31015	31020	0 %	0 %	0 %	100 %	526230631
538	NC_021871	CGCC	2	8	31066	31073	0 %	0 %	25 %	75 %	526230631
539	NC_021871	G	6	6	31084	31089	0 %	0 %	100 %	0 %	526230631
540	NC_021871	ACC	2	6	31100	31105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230631
541	NC_021871	GCACG	2	10	31171	31180	20 %	0 %	40 %	40 %	526230631
542	NC_021871	AGC	2	6	31194	31199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230631
543	NC_021871	TCA	2	6	31261	31266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230631
544	NC_021871	GCC	2	6	31505	31510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230631
545	NC_021871	CAT	2	6	31568	31573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230631
546	NC_021871	CCT	2	6	31648	31653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230632
547	NC_021871	CAT	2	6	31796	31801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230632
548	NC_021871	GGA	2	6	31829	31834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230632
549	NC_021871	T	6	6	31836	31841	0 %	100 %	0 %	0 %	526230632
550	NC_021871	TCC	2	6	31846	31851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230632
551	NC_021871	CGA	2	6	31865	31870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230632
552	NC_021871	AGGA	2	8	31933	31940	50 %	0 %	50 %	0 %	526230632
553	NC_021871	TCA	2	6	31946	31951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230632
554	NC_021871	GAC	2	6	32019	32024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230632
555	NC_021871	CAGC	2	8	32060	32067	25 %	0 %	25 %	50 %	526230632
556	NC_021871	AAT	2	6	32115	32120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230632
557	NC_021871	AAT	2	6	32127	32132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230632
558	NC_021871	TGG	2	6	32135	32140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230632
559	NC_021871	ATA	2	6	32164	32169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230632
560	NC_021871	ATTT	2	8	32183	32190	25 %	75 %	0 %	0 %	526230633
561	NC_021871	AAT	2	6	32240	32245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230633
562	NC_021871	CGC	2	6	32305	32310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230633
563	NC_021871	AAT	2	6	32338	32343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230633
564	NC_021871	AATA	2	8	32351	32358	75 %	25 %	0 %	0 %	526230633
565	NC_021871	AAC	2	6	32386	32391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230633
566	NC_021871	TCA	2	6	32408	32413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230633
567	NC_021871	AAT	2	6	32425	32430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230633
568	NC_021871	TGA	2	6	32497	32502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230634
569	NC_021871	CAG	2	6	32555	32560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230634
570	NC_021871	GAT	3	9	32606	32614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230634
571	NC_021871	CAT	2	6	32618	32623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230634
572	NC_021871	CAT	2	6	32656	32661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230634
573	NC_021871	CAG	2	6	32675	32680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230634
574	NC_021871	CAG	2	6	32717	32722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230634
575	NC_021871	T	6	6	32753	32758	0 %	100 %	0 %	0 %	526230634
576	NC_021871	CAC	2	6	32767	32772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230634
577	NC_021871	GCCAT	2	10	32773	32782	20 %	20 %	20 %	40 %	526230634
578	NC_021871	T	7	7	32804	32810	0 %	100 %	0 %	0 %	526230634
579	NC_021871	GCC	2	6	32825	32830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230634
580	NC_021871	CCT	2	6	32980	32985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230635
581	NC_021871	AAT	2	6	32987	32992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230635
582	NC_021871	T	8	8	33024	33031	0 %	100 %	0 %	0 %	526230635
583	NC_021871	CTTT	2	8	33034	33041	0 %	75 %	0 %	25 %	526230635
584	NC_021871	CTC	2	6	33047	33052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230635
585	NC_021871	CTG	2	6	33091	33096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230635
586	NC_021871	CTC	2	6	33348	33353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230636
587	NC_021871	CA	3	6	33452	33457	50 %	0 %	0 %	50 %	526230636
588	NC_021871	GTA	3	9	33487	33495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230636
589	NC_021871	CAT	2	6	33563	33568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230636
590	NC_021871	GAT	2	6	33615	33620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230636
591	NC_021871	TTC	2	6	34296	34301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230637
592	NC_021871	GAAA	2	8	34310	34317	75 %	0 %	25 %	0 %	526230637
593	NC_021871	TCT	2	6	34330	34335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230637
594	NC_021871	TGA	2	6	34358	34363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230637
595	NC_021871	GC	3	6	34406	34411	0 %	0 %	50 %	50 %	526230637
596	NC_021871	CCTT	2	8	34498	34505	0 %	50 %	0 %	50 %	526230637
597	NC_021871	T	7	7	34504	34510	0 %	100 %	0 %	0 %	526230637
598	NC_021871	CT	3	6	34511	34516	0 %	50 %	0 %	50 %	526230637
599	NC_021871	CGA	2	6	34544	34549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230637
600	NC_021871	CAT	2	6	34577	34582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230637
601	NC_021871	CCT	2	6	34602	34607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230637
602	NC_021871	TTC	2	6	34629	34634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230637
603	NC_021871	GAA	2	6	35144	35149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230638
604	NC_021871	TTG	2	6	35158	35163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230638
605	NC_021871	TTA	2	6	35244	35249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230638
606	NC_021871	AG	3	6	35265	35270	50 %	0 %	50 %	0 %	526230638
607	NC_021871	TCA	2	6	35271	35276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230638
608	NC_021871	GGC	2	6	35278	35283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230638
609	NC_021871	AATG	2	8	35291	35298	50 %	25 %	25 %	0 %	526230638
610	NC_021871	ATG	2	6	35328	35333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230638
611	NC_021871	T	6	6	35350	35355	0 %	100 %	0 %	0 %	526230638
612	NC_021871	CTA	2	6	35429	35434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230638
613	NC_021871	AGGAA	2	10	35518	35527	60 %	0 %	40 %	0 %	526230638
614	NC_021871	CCA	2	6	35586	35591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230638
615	NC_021871	ATCA	2	8	35608	35615	50 %	25 %	0 %	25 %	526230639
616	NC_021871	CG	3	6	35618	35623	0 %	0 %	50 %	50 %	526230639
617	NC_021871	CT	3	6	35637	35642	0 %	50 %	0 %	50 %	526230639
618	NC_021871	GCGA	2	8	35684	35691	25 %	0 %	50 %	25 %	526230639
619	NC_021871	TCATTA	2	12	35755	35766	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	526230639
620	NC_021871	AAT	2	6	35774	35779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230639
621	NC_021871	AAT	2	6	35812	35817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230639
622	NC_021871	GTT	2	6	35842	35847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230639
623	NC_021871	AT	3	6	35862	35867	50 %	50 %	0 %	0 %	526230639
624	NC_021871	TG	3	6	35874	35879	0 %	50 %	50 %	0 %	526230639
625	NC_021871	GTA	2	6	35880	35885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230639
626	NC_021871	CCG	2	6	35913	35918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230639
627	NC_021871	AAT	2	6	35930	35935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230639
628	NC_021871	CCA	2	6	35952	35957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230639
629	NC_021871	TGT	2	6	35995	36000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230639
630	NC_021871	A	6	6	36014	36019	100 %	0 %	0 %	0 %	526230639
631	NC_021871	TCA	2	6	36045	36050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230639
632	NC_021871	TG	3	6	36131	36136	0 %	50 %	50 %	0 %	526230639
633	NC_021871	TTA	2	6	36160	36165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230640
634	NC_021871	TCA	2	6	36178	36183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230640
635	NC_021871	GCG	2	6	36188	36193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230640
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638	NC_021871	TA	3	6	36243	36248	50 %	50 %	0 %	0 %	526230640
639	NC_021871	TCCT	2	8	36259	36266	0 %	50 %	0 %	50 %	526230640
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642	NC_021871	TTA	2	6	36397	36402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230641
643	NC_021871	GAC	2	6	36526	36531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230642
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652	NC_021871	ATCGAT	2	12	36963	36974	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526230643
653	NC_021871	GCC	2	6	37051	37056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230643
654	NC_021871	CGG	2	6	37093	37098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230643
655	NC_021871	CA	3	6	37244	37249	50 %	0 %	0 %	50 %	526230643
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657	NC_021871	GGC	2	6	37415	37420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230643
658	NC_021871	GCGGCT	2	12	37446	37457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526230643
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661	NC_021871	GCC	2	6	37608	37613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230643
662	NC_021871	GGC	2	6	37623	37628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230643
663	NC_021871	CGAGGC	2	12	37644	37655	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526230643
664	NC_021871	CTG	2	6	37678	37683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230644
665	NC_021871	CGA	2	6	37761	37766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230644
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667	NC_021871	CCT	2	6	37903	37908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230645
668	NC_021871	TAA	2	6	37962	37967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230645
669	NC_021871	GCT	2	6	38051	38056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230645
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671	NC_021871	GCT	2	6	38133	38138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230645
672	NC_021871	TATT	2	8	38275	38282	25 %	75 %	0 %	0 %	526230646
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682	NC_021871	TG	3	6	38642	38647	0 %	50 %	50 %	0 %	526230646
683	NC_021871	A	6	6	39428	39433	100 %	0 %	0 %	0 %	526230647
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705	NC_021871	CGC	2	6	40783	40788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230650
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744	NC_021871	TGACCA	2	12	42586	42597	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526230652
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754	NC_021871	CCA	2	6	43116	43121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230652
755	NC_021871	GTC	2	6	43129	43134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230652
756	NC_021871	ACA	2	6	43148	43153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230652
757	NC_021871	AGC	2	6	43187	43192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230652
758	NC_021871	GCA	2	6	43202	43207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230652
759	NC_021871	GAC	3	9	43209	43217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230652
760	NC_021871	CGCC	2	8	43218	43225	0 %	0 %	25 %	75 %	526230652
761	NC_021871	ACC	2	6	43259	43264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230652
762	NC_021871	AAT	2	6	43333	43338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230652
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764	NC_021871	T	6	6	43444	43449	0 %	100 %	0 %	0 %	526230652
765	NC_021871	CTG	2	6	43567	43572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230653
766	NC_021871	TCA	2	6	43605	43610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230653
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769	NC_021871	CTGCG	2	10	43723	43732	0 %	20 %	40 %	40 %	526230653
770	NC_021871	GTGA	2	8	43750	43757	25 %	25 %	50 %	0 %	526230653
771	NC_021871	TCA	2	6	43847	43852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230653
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777	NC_021871	CAG	2	6	43984	43989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230654
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785	NC_021871	CGC	2	6	44329	44334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230654
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879	NC_021871	TCGG	2	8	49304	49311	0 %	25 %	50 %	25 %	526230669
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881	NC_021871	CCAGC	2	10	49336	49345	20 %	0 %	20 %	60 %	526230669
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