MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021845	AT	3	6	873	878	50 %	50 %	0 %	0 %	525937633
2	NC_021845	TA	3	6	1769	1774	50 %	50 %	0 %	0 %	525937634
3	NC_021845	AT	3	6	1889	1894	50 %	50 %	0 %	0 %	525937634
4	NC_021845	GA	3	6	3313	3318	50 %	0 %	50 %	0 %	525937635
5	NC_021845	AT	3	6	3539	3544	50 %	50 %	0 %	0 %	525937635
6	NC_021845	AT	3	6	4512	4517	50 %	50 %	0 %	0 %	525937637
7	NC_021845	TC	3	6	5312	5317	0 %	50 %	0 %	50 %	525937637
8	NC_021845	AT	3	6	5551	5556	50 %	50 %	0 %	0 %	525937637
9	NC_021845	AC	4	8	8388	8395	50 %	0 %	0 %	50 %	525937640
10	NC_021845	TA	3	6	9437	9442	50 %	50 %	0 %	0 %	525937641
11	NC_021845	TC	3	6	9883	9888	0 %	50 %	0 %	50 %	525937642
12	NC_021845	TC	4	8	10009	10016	0 %	50 %	0 %	50 %	525937642
13	NC_021845	AT	3	6	10141	10146	50 %	50 %	0 %	0 %	525937642
14	NC_021845	GA	3	6	11747	11752	50 %	0 %	50 %	0 %	525937644
15	NC_021845	GA	3	6	12031	12036	50 %	0 %	50 %	0 %	525937644
16	NC_021845	CT	3	6	12141	12146	0 %	50 %	0 %	50 %	525937644
17	NC_021845	CA	3	6	16563	16568	50 %	0 %	0 %	50 %	525937646
18	NC_021845	AT	3	6	16609	16614	50 %	50 %	0 %	0 %	525937646
19	NC_021845	GT	3	6	16704	16709	0 %	50 %	50 %	0 %	525937646
20	NC_021845	TC	3	6	17009	17014	0 %	50 %	0 %	50 %	525937646
21	NC_021845	GA	3	6	17084	17089	50 %	0 %	50 %	0 %	525937646
22	NC_021845	GA	4	8	17454	17461	50 %	0 %	50 %	0 %	525937646
23	NC_021845	TA	3	6	17568	17573	50 %	50 %	0 %	0 %	525937647
24	NC_021845	CA	3	6	17777	17782	50 %	0 %	0 %	50 %	525937647
25	NC_021845	TA	3	6	18084	18089	50 %	50 %	0 %	0 %	525937647
26	NC_021845	TA	3	6	18105	18110	50 %	50 %	0 %	0 %	525937647
27	NC_021845	AG	3	6	18724	18729	50 %	0 %	50 %	0 %	525937648
28	NC_021845	GT	3	6	18857	18862	0 %	50 %	50 %	0 %	525937649
29	NC_021845	AC	3	6	20675	20680	50 %	0 %	0 %	50 %	525937650
30	NC_021845	CT	3	6	20739	20744	0 %	50 %	0 %	50 %	525937650
31	NC_021845	CT	3	6	21379	21384	0 %	50 %	0 %	50 %	525937651
32	NC_021845	AT	3	6	21576	21581	50 %	50 %	0 %	0 %	525937651
33	NC_021845	TG	3	6	22049	22054	0 %	50 %	50 %	0 %	525937651
34	NC_021845	TA	3	6	23176	23181	50 %	50 %	0 %	0 %	525937651
35	NC_021845	GA	3	6	23359	23364	50 %	0 %	50 %	0 %	525937651
36	NC_021845	TG	3	6	23508	23513	0 %	50 %	50 %	0 %	525937651
37	NC_021845	AG	3	6	26714	26719	50 %	0 %	50 %	0 %	525937654
38	NC_021845	CT	3	6	28101	28106	0 %	50 %	0 %	50 %	525937656
39	NC_021845	TG	3	6	28842	28847	0 %	50 %	50 %	0 %	525937656
40	NC_021845	GA	3	6	29684	29689	50 %	0 %	50 %	0 %	525937658
41	NC_021845	GT	3	6	29692	29697	0 %	50 %	50 %	0 %	525937658
42	NC_021845	TC	3	6	31509	31514	0 %	50 %	0 %	50 %	525937660
43	NC_021845	TG	3	6	32300	32305	0 %	50 %	50 %	0 %	525937661
44	NC_021845	CT	3	6	32916	32921	0 %	50 %	0 %	50 %	525937661
45	NC_021845	AG	3	6	34182	34187	50 %	0 %	50 %	0 %	525937662
46	NC_021845	TG	3	6	38797	38802	0 %	50 %	50 %	0 %	525937663
47	NC_021845	TG	3	6	40387	40392	0 %	50 %	50 %	0 %	525937663
48	NC_021845	AG	3	6	41460	41465	50 %	0 %	50 %	0 %	525937664
49	NC_021845	AG	3	6	42094	42099	50 %	0 %	50 %	0 %	525937665
50	NC_021845	GA	3	6	42262	42267	50 %	0 %	50 %	0 %	525937665
51	NC_021845	AC	3	6	42769	42774	50 %	0 %	0 %	50 %	525937665
52	NC_021845	CT	3	6	44167	44172	0 %	50 %	0 %	50 %	525937667
53	NC_021845	TG	3	6	44249	44254	0 %	50 %	50 %	0 %	525937667
54	NC_021845	TA	3	6	44571	44576	50 %	50 %	0 %	0 %	525937667
55	NC_021845	TA	3	6	45140	45145	50 %	50 %	0 %	0 %	525937668
56	NC_021845	AG	3	6	49414	49419	50 %	0 %	50 %	0 %	525937673
57	NC_021845	GC	3	6	49649	49654	0 %	0 %	50 %	50 %	525937673
58	NC_021845	CA	3	6	49690	49695	50 %	0 %	0 %	50 %	525937673
59	NC_021845	TC	3	6	56436	56441	0 %	50 %	0 %	50 %	525937680
60	NC_021845	TC	3	6	57244	57249	0 %	50 %	0 %	50 %	525937680
61	NC_021845	TG	3	6	58196	58201	0 %	50 %	50 %	0 %	525937682
62	NC_021845	TG	3	6	58642	58647	0 %	50 %	50 %	0 %	525937683
63	NC_021845	TC	3	6	62070	62075	0 %	50 %	0 %	50 %	525937685
64	NC_021845	AG	3	6	63519	63524	50 %	0 %	50 %	0 %	525937686
65	NC_021845	CT	3	6	63690	63695	0 %	50 %	0 %	50 %	525937686
66	NC_021845	CT	3	6	64129	64134	0 %	50 %	0 %	50 %	525937686
67	NC_021845	GC	3	6	65685	65690	0 %	0 %	50 %	50 %	525937687
68	NC_021845	GC	3	6	66956	66961	0 %	0 %	50 %	50 %	525937687
69	NC_021845	CG	3	6	68550	68555	0 %	0 %	50 %	50 %	525937688
70	NC_021845	GC	3	6	68818	68823	0 %	0 %	50 %	50 %	525937689
71	NC_021845	TC	3	6	70269	70274	0 %	50 %	0 %	50 %	525937693
72	NC_021845	GC	3	6	70512	70517	0 %	0 %	50 %	50 %	525937693
73	NC_021845	CA	3	6	70798	70803	50 %	0 %	0 %	50 %	525937694
74	NC_021845	CG	3	6	70968	70973	0 %	0 %	50 %	50 %	525937694
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76	NC_021845	CG	3	6	72191	72196	0 %	0 %	50 %	50 %	525937695
77	NC_021845	CG	3	6	72598	72603	0 %	0 %	50 %	50 %	525937695
78	NC_021845	AG	3	6	74409	74414	50 %	0 %	50 %	0 %	525937697
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81	NC_021845	GC	4	8	76426	76433	0 %	0 %	50 %	50 %	525937698
82	NC_021845	GC	3	6	77213	77218	0 %	0 %	50 %	50 %	525937698
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87	NC_021845	GC	3	6	80073	80078	0 %	0 %	50 %	50 %	525937702
88	NC_021845	CA	3	6	80550	80555	50 %	0 %	0 %	50 %	525937702
89	NC_021845	GC	3	6	80609	80614	0 %	0 %	50 %	50 %	525937702
90	NC_021845	GC	3	6	81400	81405	0 %	0 %	50 %	50 %	525937703
91	NC_021845	GC	3	6	82078	82083	0 %	0 %	50 %	50 %	525937705
92	NC_021845	GT	3	6	84844	84849	0 %	50 %	50 %	0 %	525937707
93	NC_021845	AT	3	6	86054	86059	50 %	50 %	0 %	0 %	525937707
94	NC_021845	AT	3	6	86546	86551	50 %	50 %	0 %	0 %	525937707
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103	NC_021845	AT	3	6	98246	98251	50 %	50 %	0 %	0 %	525937723
104	NC_021845	GA	3	6	103620	103625	50 %	0 %	50 %	0 %	525937732
105	NC_021845	TG	3	6	103998	104003	0 %	50 %	50 %	0 %	525937732
106	NC_021845	AT	3	6	104775	104780	50 %	50 %	0 %	0 %	525937734
107	NC_021845	GA	3	6	106367	106372	50 %	0 %	50 %	0 %	525937734
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110	NC_021845	AC	4	8	110787	110794	50 %	0 %	0 %	50 %	525937740
111	NC_021845	AG	3	6	111910	111915	50 %	0 %	50 %	0 %	525937741
112	NC_021845	TG	4	8	112138	112145	0 %	50 %	50 %	0 %	525937742
113	NC_021845	TA	3	6	113109	113114	50 %	50 %	0 %	0 %	525937743
114	NC_021845	CA	3	6	114837	114842	50 %	0 %	0 %	50 %	525937746
115	NC_021845	TC	3	6	119456	119461	0 %	50 %	0 %	50 %	525937628
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117	NC_021845	CA	3	6	121291	121296	50 %	0 %	0 %	50 %	525937755
118	NC_021845	CT	3	6	128382	128387	0 %	50 %	0 %	50 %	525937765
119	NC_021845	AG	3	6	130886	130891	50 %	0 %	50 %	0 %	525937769
120	NC_021845	TA	3	6	132212	132217	50 %	50 %	0 %	0 %	525937771
121	NC_021845	AG	3	6	132715	132720	50 %	0 %	50 %	0 %	525937772
122	NC_021845	GA	3	6	132744	132749	50 %	0 %	50 %	0 %	525937772
123	NC_021845	AG	3	6	133203	133208	50 %	0 %	50 %	0 %	525937772
124	NC_021845	CT	3	6	135628	135633	0 %	50 %	0 %	50 %	525937775
125	NC_021845	TA	3	6	135798	135803	50 %	50 %	0 %	0 %	525937775
126	NC_021845	TG	3	6	138360	138365	0 %	50 %	50 %	0 %	525937776
127	NC_021845	GA	3	6	138749	138754	50 %	0 %	50 %	0 %	525937776
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129	NC_021845	TA	3	6	138872	138877	50 %	50 %	0 %	0 %	525937776
130	NC_021845	AG	3	6	140186	140191	50 %	0 %	50 %	0 %	525937776
131	NC_021845	GA	3	6	140527	140532	50 %	0 %	50 %	0 %	525937776
132	NC_021845	AT	3	6	140539	140544	50 %	50 %	0 %	0 %	525937776
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134	NC_021845	AT	3	6	141431	141436	50 %	50 %	0 %	0 %	525937778
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141	NC_021845	TC	3	6	149916	149921	0 %	50 %	0 %	50 %	525937783
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.