MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 2468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021845	AAAG	2	8	97741	97748	75 %	0 %	25 %	0 %	525937722
1502	NC_021845	TAA	2	6	97883	97888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937723
1503	NC_021845	ATTT	2	8	97909	97916	25 %	75 %	0 %	0 %	525937723
1504	NC_021845	GGCA	2	8	98100	98107	25 %	0 %	50 %	25 %	525937723
1505	NC_021845	A	7	7	98220	98226	100 %	0 %	0 %	0 %	525937723
1506	NC_021845	AT	3	6	98246	98251	50 %	50 %	0 %	0 %	525937723
1507	NC_021845	AGA	2	6	98595	98600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937724
1508	NC_021845	TGA	2	6	98782	98787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937725
1509	NC_021845	GCT	2	6	98791	98796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937725
1510	NC_021845	CCCG	2	8	98924	98931	0 %	0 %	25 %	75 %	525937725
1511	NC_021845	T	6	6	99008	99013	0 %	100 %	0 %	0 %	525937725
1512	NC_021845	TGGTCT	2	12	99044	99055	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525937725
1513	NC_021845	TTC	2	6	99076	99081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937725
1514	NC_021845	AGA	2	6	99086	99091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937725
1515	NC_021845	TTA	2	6	99130	99135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937725
1516	NC_021845	ATG	2	6	99195	99200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937725
1517	NC_021845	CAG	2	6	99211	99216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937725
1518	NC_021845	GAG	2	6	99342	99347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937725
1519	NC_021845	TGA	2	6	99561	99566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937726
1520	NC_021845	ACG	2	6	99627	99632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937726
1521	NC_021845	GCG	2	6	99723	99728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937726
1522	NC_021845	CAG	2	6	99752	99757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937726
1523	NC_021845	CTC	2	6	99817	99822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937726
1524	NC_021845	AAAC	2	8	99831	99838	75 %	0 %	0 %	25 %	525937726
1525	NC_021845	TGT	2	6	99865	99870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937726
1526	NC_021845	CTT	2	6	99919	99924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937726
1527	NC_021845	CGC	2	6	99963	99968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937726
1528	NC_021845	CCT	2	6	99973	99978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937726
1529	NC_021845	G	6	6	100007	100012	0 %	0 %	100 %	0 %	525937726
1530	NC_021845	CTGTG	2	10	100293	100302	0 %	40 %	40 %	20 %	525937726
1531	NC_021845	ATG	2	6	100311	100316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937726
1532	NC_021845	GTTC	2	8	100325	100332	0 %	50 %	25 %	25 %	525937726
1533	NC_021845	AAC	2	6	100334	100339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937726
1534	NC_021845	AGC	2	6	100365	100370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937726
1535	NC_021845	GCAG	2	8	100381	100388	25 %	0 %	50 %	25 %	525937726
1536	NC_021845	CCATT	2	10	100528	100537	20 %	40 %	0 %	40 %	525937726
1537	NC_021845	TTG	2	6	100629	100634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937726
1538	NC_021845	TGGC	2	8	100694	100701	0 %	25 %	50 %	25 %	525937726
1539	NC_021845	TGGC	2	8	100721	100728	0 %	25 %	50 %	25 %	525937726
1540	NC_021845	ACCTAT	2	12	101306	101317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937727
1541	NC_021845	A	6	6	101434	101439	100 %	0 %	0 %	0 %	525937727
1542	NC_021845	CGA	2	6	101676	101681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937728
1543	NC_021845	CAG	2	6	101694	101699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937728
1544	NC_021845	TAA	2	6	101757	101762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937728
1545	NC_021845	GGCT	2	8	101789	101796	0 %	25 %	50 %	25 %	525937728
1546	NC_021845	CTA	2	6	101874	101879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937728
1547	NC_021845	TTG	2	6	101972	101977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937729
1548	NC_021845	CGG	2	6	101997	102002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937729
1549	NC_021845	AGC	2	6	102012	102017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937729
1550	NC_021845	GAG	2	6	102098	102103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937729
1551	NC_021845	CGA	2	6	102113	102118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937729
1552	NC_021845	CTTTA	2	10	102133	102142	20 %	60 %	0 %	20 %	525937729
1553	NC_021845	GCAT	2	8	102442	102449	25 %	25 %	25 %	25 %	525937730
1554	NC_021845	CGA	2	6	102491	102496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937730
1555	NC_021845	CGT	2	6	102573	102578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937730
1556	NC_021845	TGC	2	6	102679	102684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937730
1557	NC_021845	GCCA	2	8	102730	102737	25 %	0 %	25 %	50 %	525937730
1558	NC_021845	A	6	6	102831	102836	100 %	0 %	0 %	0 %	525937731
1559	NC_021845	GAAC	2	8	102844	102851	50 %	0 %	25 %	25 %	525937731
1560	NC_021845	GCA	2	6	102863	102868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937731
1561	NC_021845	TGA	4	12	102916	102927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937731
1562	NC_021845	AGG	2	6	102969	102974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937731
1563	NC_021845	CAT	2	6	102983	102988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937731
1564	NC_021845	CGA	2	6	103003	103008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937731
1565	NC_021845	CAG	2	6	103057	103062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937731
1566	NC_021845	CGT	2	6	103344	103349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937732
1567	NC_021845	TTA	2	6	103350	103355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937732
1568	NC_021845	AAG	2	6	103389	103394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937732
1569	NC_021845	CTGA	2	8	103469	103476	25 %	25 %	25 %	25 %	525937732
1570	NC_021845	TAT	2	6	103492	103497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937732
1571	NC_021845	ACC	2	6	103503	103508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937732
1572	NC_021845	TGT	2	6	103572	103577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937732
1573	NC_021845	CAG	2	6	103594	103599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937732
1574	NC_021845	GA	3	6	103620	103625	50 %	0 %	50 %	0 %	525937732
1575	NC_021845	CTG	2	6	103704	103709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937732
1576	NC_021845	ATGA	2	8	103814	103821	50 %	25 %	25 %	0 %	525937732
1577	NC_021845	AGC	2	6	103880	103885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937732
1578	NC_021845	AGG	2	6	103932	103937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937732
1579	NC_021845	AGA	2	6	103978	103983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937732
1580	NC_021845	TG	3	6	103998	104003	0 %	50 %	50 %	0 %	525937732
1581	NC_021845	AAG	2	6	104004	104009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937732
1582	NC_021845	ACA	2	6	104010	104015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937732
1583	NC_021845	TCCCT	2	10	104082	104091	0 %	40 %	0 %	60 %	525937732
1584	NC_021845	GCG	2	6	104103	104108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937732
1585	NC_021845	GGC	2	6	104280	104285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937733
1586	NC_021845	GAAA	2	8	104292	104299	75 %	0 %	25 %	0 %	525937733
1587	NC_021845	TGC	2	6	104426	104431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937733
1588	NC_021845	TTA	2	6	104468	104473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937733
1589	NC_021845	TGA	2	6	104477	104482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937733
1590	NC_021845	TGA	2	6	104523	104528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937733
1591	NC_021845	ATA	2	6	104576	104581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937733
1592	NC_021845	CGC	2	6	104594	104599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937733
1593	NC_021845	AT	3	6	104775	104780	50 %	50 %	0 %	0 %	525937734
1594	NC_021845	A	6	6	104789	104794	100 %	0 %	0 %	0 %	525937734
1595	NC_021845	GGC	2	6	104838	104843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937734
1596	NC_021845	TGC	2	6	104847	104852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937734
1597	NC_021845	TCTT	2	8	104943	104950	0 %	75 %	0 %	25 %	525937734
1598	NC_021845	ACGG	2	8	104992	104999	25 %	0 %	50 %	25 %	525937734
1599	NC_021845	GGC	2	6	105025	105030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937734
1600	NC_021845	TCT	2	6	105045	105050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937734
1601	NC_021845	CAT	2	6	105109	105114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937734
1602	NC_021845	TTCA	2	8	105115	105122	25 %	50 %	0 %	25 %	525937734
1603	NC_021845	TTC	2	6	105306	105311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937734
1604	NC_021845	GAT	2	6	105430	105435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937734
1605	NC_021845	CTGA	2	8	105496	105503	25 %	25 %	25 %	25 %	525937734
1606	NC_021845	GGT	2	6	105508	105513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937734
1607	NC_021845	CAG	2	6	105728	105733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937734
1608	NC_021845	GTC	2	6	105806	105811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937734
1609	NC_021845	TTTC	2	8	105820	105827	0 %	75 %	0 %	25 %	525937734
1610	NC_021845	TTC	2	6	105915	105920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937734
1611	NC_021845	CTGA	2	8	105925	105932	25 %	25 %	25 %	25 %	525937734
1612	NC_021845	CGT	2	6	106039	106044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937734
1613	NC_021845	CTT	2	6	106186	106191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937734
1614	NC_021845	ATG	2	6	106283	106288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937734
1615	NC_021845	GACT	2	8	106289	106296	25 %	25 %	25 %	25 %	525937734
1616	NC_021845	TGA	2	6	106310	106315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937734
1617	NC_021845	GA	3	6	106367	106372	50 %	0 %	50 %	0 %	525937734
1618	NC_021845	GTC	2	6	106381	106386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937734
1619	NC_021845	GAA	2	6	106420	106425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937734
1620	NC_021845	ACG	2	6	106457	106462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937734
1621	NC_021845	CTG	2	6	106505	106510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937734
1622	NC_021845	TCT	2	6	106518	106523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937734
1623	NC_021845	ATC	2	6	106568	106573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937734
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1740	NC_021845	T	6	6	115755	115760	0 %	100 %	0 %	0 %	525937747
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1744	NC_021845	A	6	6	115846	115851	100 %	0 %	0 %	0 %	525937747
1745	NC_021845	GGC	2	6	116101	116106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937748
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1988	NC_021845	AAC	2	6	134952	134957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937774
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1990	NC_021845	GAAA	2	8	135010	135017	75 %	0 %	25 %	0 %	525937774
1991	NC_021845	TGG	2	6	135054	135059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937774
1992	NC_021845	ATG	2	6	135235	135240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937774
1993	NC_021845	T	7	7	135248	135254	0 %	100 %	0 %	0 %	525937774
1994	NC_021845	TTAG	2	8	135260	135267	25 %	50 %	25 %	0 %	525937774
1995	NC_021845	CGAG	2	8	135330	135337	25 %	0 %	50 %	25 %	525937774
1996	NC_021845	T	6	6	135393	135398	0 %	100 %	0 %	0 %	525937774
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2000	NC_021845	CT	3	6	135628	135633	0 %	50 %	0 %	50 %	525937775

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