MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 2468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021845	ACA	2	6	30279	30284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937658
502	NC_021845	GCA	2	6	30352	30357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937659
503	NC_021845	CAC	2	6	30362	30367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937659
504	NC_021845	AAAGA	2	10	30383	30392	80 %	0 %	20 %	0 %	525937659
505	NC_021845	TCT	2	6	30400	30405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937659
506	NC_021845	GGT	2	6	30461	30466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937659
507	NC_021845	ACA	2	6	30752	30757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937659
508	NC_021845	GAC	2	6	30844	30849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937659
509	NC_021845	A	7	7	30864	30870	100 %	0 %	0 %	0 %	525937659
510	NC_021845	AGA	2	6	30920	30925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937659
511	NC_021845	GAAAA	2	10	31014	31023	80 %	0 %	20 %	0 %	525937659
512	NC_021845	GGT	2	6	31033	31038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937659
513	NC_021845	GAAA	2	8	31053	31060	75 %	0 %	25 %	0 %	525937659
514	NC_021845	GAT	2	6	31126	31131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937659
515	NC_021845	ACTG	2	8	31162	31169	25 %	25 %	25 %	25 %	525937660
516	NC_021845	GTCA	2	8	31173	31180	25 %	25 %	25 %	25 %	525937660
517	NC_021845	GAA	2	6	31196	31201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937660
518	NC_021845	GGT	2	6	31358	31363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937660
519	NC_021845	GTA	2	6	31386	31391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937660
520	NC_021845	CAA	2	6	31462	31467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937660
521	NC_021845	TTA	2	6	31485	31490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937660
522	NC_021845	TC	3	6	31509	31514	0 %	50 %	0 %	50 %	525937660
523	NC_021845	GTTA	2	8	31556	31563	25 %	50 %	25 %	0 %	525937660
524	NC_021845	A	7	7	31648	31654	100 %	0 %	0 %	0 %	525937660
525	NC_021845	TATT	2	8	32092	32099	25 %	75 %	0 %	0 %	525937661
526	NC_021845	CTC	2	6	32128	32133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937661
527	NC_021845	TAA	2	6	32142	32147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937661
528	NC_021845	TAA	2	6	32238	32243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937661
529	NC_021845	TG	3	6	32300	32305	0 %	50 %	50 %	0 %	525937661
530	NC_021845	T	6	6	32307	32312	0 %	100 %	0 %	0 %	525937661
531	NC_021845	T	7	7	32408	32414	0 %	100 %	0 %	0 %	525937661
532	NC_021845	AAT	2	6	32480	32485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937661
533	NC_021845	GCC	2	6	32510	32515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937661
534	NC_021845	TGC	2	6	32557	32562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937661
535	NC_021845	TTC	2	6	32566	32571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937661
536	NC_021845	TAG	2	6	32574	32579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937661
537	NC_021845	TTC	2	6	32590	32595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937661
538	NC_021845	TGC	2	6	32653	32658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937661
539	NC_021845	ATC	2	6	32677	32682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937661
540	NC_021845	GAA	2	6	32700	32705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937661
541	NC_021845	CAG	2	6	32738	32743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937661
542	NC_021845	CTTC	2	8	32756	32763	0 %	50 %	0 %	50 %	525937661
543	NC_021845	TAA	2	6	32767	32772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937661
544	NC_021845	TTC	2	6	32821	32826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937661
545	NC_021845	AAT	2	6	32853	32858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937661
546	NC_021845	CTT	2	6	32868	32873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937661
547	NC_021845	CT	3	6	32916	32921	0 %	50 %	0 %	50 %	525937661
548	NC_021845	T	6	6	32981	32986	0 %	100 %	0 %	0 %	525937661
549	NC_021845	TTC	2	6	33171	33176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937662
550	NC_021845	T	6	6	33216	33221	0 %	100 %	0 %	0 %	525937662
551	NC_021845	AGC	2	6	33249	33254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937662
552	NC_021845	T	6	6	33274	33279	0 %	100 %	0 %	0 %	525937662
553	NC_021845	GTA	2	6	33451	33456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937662
554	NC_021845	GTG	2	6	33476	33481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937662
555	NC_021845	CAG	2	6	33515	33520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937662
556	NC_021845	TAA	2	6	33557	33562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937662
557	NC_021845	GTA	2	6	33611	33616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937662
558	NC_021845	CGTT	2	8	33624	33631	0 %	50 %	25 %	25 %	525937662
559	NC_021845	TTA	2	6	33689	33694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937662
560	NC_021845	TGA	2	6	33734	33739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937662
561	NC_021845	TCT	2	6	33742	33747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937662
562	NC_021845	T	6	6	33771	33776	0 %	100 %	0 %	0 %	525937662
563	NC_021845	TTC	2	6	33789	33794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937662
564	NC_021845	CAT	2	6	33833	33838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937662
565	NC_021845	TGC	2	6	33860	33865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937662
566	NC_021845	AGC	2	6	33930	33935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937662
567	NC_021845	ATT	2	6	34051	34056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937662
568	NC_021845	T	6	6	34055	34060	0 %	100 %	0 %	0 %	525937662
569	NC_021845	GAT	2	6	34082	34087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937662
570	NC_021845	TTTTG	2	10	34088	34097	0 %	80 %	20 %	0 %	525937662
571	NC_021845	TCT	2	6	34126	34131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937662
572	NC_021845	A	7	7	34173	34179	100 %	0 %	0 %	0 %	525937662
573	NC_021845	AG	3	6	34182	34187	50 %	0 %	50 %	0 %	525937662
574	NC_021845	T	8	8	34189	34196	0 %	100 %	0 %	0 %	525937662
575	NC_021845	ATC	2	6	34242	34247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937662
576	NC_021845	TGA	2	6	34263	34268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937662
577	NC_021845	TACGC	2	10	38414	38423	20 %	20 %	20 %	40 %	525937663
578	NC_021845	GCT	2	6	38434	38439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937663
579	NC_021845	CTT	2	6	38441	38446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937663
580	NC_021845	GTA	2	6	38533	38538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937663
581	NC_021845	TTA	2	6	38683	38688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937663
582	NC_021845	CTTT	2	8	38707	38714	0 %	75 %	0 %	25 %	525937663
583	NC_021845	ATT	2	6	38725	38730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937663
584	NC_021845	AGA	2	6	38769	38774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937663
585	NC_021845	AAT	2	6	38780	38785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937663
586	NC_021845	TG	3	6	38797	38802	0 %	50 %	50 %	0 %	525937663
587	NC_021845	GTTT	2	8	38820	38827	0 %	75 %	25 %	0 %	525937663
588	NC_021845	AGGA	2	8	38854	38861	50 %	0 %	50 %	0 %	525937663
589	NC_021845	AGA	2	6	38864	38869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937663
590	NC_021845	TGAT	2	8	38877	38884	25 %	50 %	25 %	0 %	525937663
591	NC_021845	TGA	2	6	38895	38900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937663
592	NC_021845	TCA	2	6	38929	38934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937663
593	NC_021845	CGA	2	6	38947	38952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937663
594	NC_021845	T	6	6	38961	38966	0 %	100 %	0 %	0 %	525937663
595	NC_021845	AGC	2	6	38985	38990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937663
596	NC_021845	CTC	2	6	39042	39047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937663
597	NC_021845	CTG	2	6	39067	39072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937663
598	NC_021845	CTT	2	6	39180	39185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937663
599	NC_021845	TTG	2	6	39276	39281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937663
600	NC_021845	ATC	2	6	39285	39290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937663
601	NC_021845	TCG	2	6	39418	39423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937663
602	NC_021845	CAA	2	6	39548	39553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937663
603	NC_021845	ATC	3	9	39573	39581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937663
604	NC_021845	A	6	6	39598	39603	100 %	0 %	0 %	0 %	525937663
605	NC_021845	TTA	2	6	39634	39639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937663
606	NC_021845	AAACT	2	10	39782	39791	60 %	20 %	0 %	20 %	525937663
607	NC_021845	ACT	2	6	39865	39870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937663
608	NC_021845	GACAT	2	10	39920	39929	40 %	20 %	20 %	20 %	525937663
609	NC_021845	ATC	2	6	39954	39959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937663
610	NC_021845	GCT	2	6	40006	40011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937663
611	NC_021845	TAC	2	6	40031	40036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937663
612	NC_021845	TTA	2	6	40171	40176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937663
613	NC_021845	ACT	2	6	40291	40296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937663
614	NC_021845	CATA	2	8	40301	40308	50 %	25 %	0 %	25 %	525937663
615	NC_021845	GTT	2	6	40349	40354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937663
616	NC_021845	TCG	2	6	40375	40380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937663
617	NC_021845	TG	3	6	40387	40392	0 %	50 %	50 %	0 %	525937663
618	NC_021845	TGA	2	6	40395	40400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937663
619	NC_021845	ACTT	2	8	40589	40596	25 %	50 %	0 %	25 %	525937663
620	NC_021845	GTA	2	6	40749	40754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937663
621	NC_021845	GACA	2	8	40880	40887	50 %	0 %	25 %	25 %	525937663
622	NC_021845	ATAAAC	2	12	40969	40980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525937663
623	NC_021845	ATCA	2	8	40995	41002	50 %	25 %	0 %	25 %	525937663
624	NC_021845	A	6	6	41002	41007	100 %	0 %	0 %	0 %	525937663
625	NC_021845	ATT	2	6	41082	41087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937663
626	NC_021845	TGC	3	9	41160	41168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937664
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628	NC_021845	ATC	2	6	41303	41308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937664
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