MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 60927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021844	CAA	2	6	1608	1613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945527
2	NC_021844	TTC	2	6	1699	1704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945527
3	NC_021844	GCT	2	6	1859	1864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945527
4	NC_021844	TGG	2	6	1869	1874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945527
5	NC_021844	GAA	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945527
6	NC_021844	TCA	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945527
7	NC_021844	GGT	2	6	1898	1903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945527
8	NC_021844	GGC	2	6	1955	1960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945527
9	NC_021844	GGT	2	6	2177	2182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945527
10	NC_021844	TTG	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945527
11	NC_021844	GTT	2	6	2261	2266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945527
12	NC_021844	CTT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949035
13	NC_021844	CCA	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949035
14	NC_021844	CAC	2	6	2439	2444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949035
15	NC_021844	TAT	2	6	2461	2466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949035
16	NC_021844	CGT	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949035
17	NC_021844	CGG	2	6	2641	2646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949035
18	NC_021844	GAT	3	9	2650	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949035
19	NC_021844	GCT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949035
20	NC_021844	GGC	2	6	2771	2776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949035
21	NC_021844	CAC	2	6	2875	2880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949035
22	NC_021844	CTT	2	6	2908	2913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949035
23	NC_021844	ATT	2	6	2999	3004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949035
24	NC_021844	CTA	2	6	3020	3025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949035
25	NC_021844	ATG	2	6	3215	3220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949035
26	NC_021844	TAT	2	6	3241	3246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949035
27	NC_021844	TGA	2	6	3327	3332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949035
28	NC_021844	TGC	2	6	3381	3386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949035
29	NC_021844	CAG	2	6	3472	3477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949035
30	NC_021844	GCA	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949035
31	NC_021844	GCG	2	6	3539	3544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949035
32	NC_021844	TGC	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949035
33	NC_021844	CAA	2	6	3673	3678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949035
34	NC_021844	TGT	2	6	3748	3753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945528
35	NC_021844	GTC	2	6	3832	3837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945528
36	NC_021844	GCG	3	9	3839	3847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945528
37	NC_021844	ATC	2	6	3870	3875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945528
38	NC_021844	GCC	3	9	4020	4028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945528
39	NC_021844	CGC	2	6	4089	4094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945528
40	NC_021844	CGC	2	6	4199	4204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945528
41	NC_021844	AAC	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945528
42	NC_021844	CAT	2	6	4266	4271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945528
43	NC_021844	CAG	3	9	4335	4343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945528
44	NC_021844	TCG	2	6	4399	4404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945528
45	NC_021844	CGC	2	6	4460	4465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945528
46	NC_021844	CGC	2	6	4584	4589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945528
47	NC_021844	TAA	2	6	4634	4639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945528
48	NC_021844	TAG	2	6	4691	4696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945528
49	NC_021844	CTG	2	6	4710	4715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945529
50	NC_021844	CGG	3	9	4787	4795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945529
51	NC_021844	TCC	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945529
52	NC_021844	CGG	2	6	4874	4879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945529
53	NC_021844	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945529
54	NC_021844	TCG	2	6	5023	5028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945529
55	NC_021844	TGA	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945529
56	NC_021844	CCA	2	6	5090	5095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945529
57	NC_021844	CAG	2	6	5100	5105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945529
58	NC_021844	AGT	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945529
59	NC_021844	ATG	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945529
60	NC_021844	CGC	3	9	5175	5183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945529
61	NC_021844	GCG	2	6	5198	5203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945529
62	NC_021844	TAA	2	6	5363	5368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945529
63	NC_021844	GCA	2	6	5482	5487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945529
64	NC_021844	TGC	2	6	5597	5602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945529
65	NC_021844	TTA	2	6	5763	5768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949036
66	NC_021844	TGA	2	6	5774	5779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949036
67	NC_021844	ACC	2	6	5947	5952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949036
68	NC_021844	CAG	2	6	6051	6056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949036
69	NC_021844	CAG	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949036
70	NC_021844	GGC	2	6	6129	6134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949036
71	NC_021844	CTG	2	6	6141	6146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949036
72	NC_021844	CGC	2	6	6168	6173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949036
73	NC_021844	GAC	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949036
74	NC_021844	CAG	2	6	6396	6401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949036
75	NC_021844	GTT	2	6	6456	6461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949036
76	NC_021844	CAC	2	6	6474	6479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949036
77	NC_021844	GAA	2	6	6534	6539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949036
78	NC_021844	ATT	2	6	6543	6548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949036
79	NC_021844	CAG	2	6	6620	6625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949036
80	NC_021844	GTT	2	6	6677	6682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945530
81	NC_021844	TGT	2	6	6692	6697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945530
82	NC_021844	CAC	2	6	6720	6725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945530
83	NC_021844	ATC	2	6	6736	6741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945530
84	NC_021844	AGG	2	6	6749	6754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525945530
85	NC_021844	ATT	2	6	6777	6782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945530
86	NC_021844	CAA	2	6	6818	6823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945530
87	NC_021844	ACC	2	6	6834	6839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945530
88	NC_021844	GCC	2	6	6852	6857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945530
89	NC_021844	CAC	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945530
90	NC_021844	GGC	2	6	6867	6872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945530
91	NC_021844	CCG	2	6	6899	6904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945530
92	NC_021844	ATG	2	6	6937	6942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945530
93	NC_021844	CGC	2	6	7023	7028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945530
94	NC_021844	GCA	2	6	7076	7081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945530
95	NC_021844	GGC	2	6	7089	7094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945530
96	NC_021844	AGC	2	6	7240	7245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945530
97	NC_021844	ATC	2	6	7246	7251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945530
98	NC_021844	CGA	2	6	7289	7294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945530
99	NC_021844	GGC	2	6	7338	7343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945530
100	NC_021844	CGA	2	6	7373	7378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945530
101	NC_021844	CAG	2	6	7407	7412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945530
102	NC_021844	GAA	2	6	7496	7501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945530
103	NC_021844	ATT	2	6	7512	7517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945530
104	NC_021844	CAG	2	6	7566	7571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945530
105	NC_021844	AAG	2	6	7593	7598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945530
106	NC_021844	GAT	2	6	7760	7765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945531
107	NC_021844	ATG	2	6	7812	7817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945531
108	NC_021844	CGC	2	6	7882	7887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945531
109	NC_021844	TCG	2	6	7896	7901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945531
110	NC_021844	TCA	2	6	7924	7929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945531
111	NC_021844	TGC	2	6	8040	8045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945531
112	NC_021844	AAT	2	6	8083	8088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945531
113	NC_021844	CAC	2	6	8207	8212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945531
114	NC_021844	TCA	2	6	8272	8277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945531
115	NC_021844	GCA	2	6	8332	8337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945531
116	NC_021844	CAT	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945531
117	NC_021844	CAT	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945531
118	NC_021844	ATG	2	6	8667	8672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945531
119	NC_021844	CCA	2	6	8707	8712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945531
120	NC_021844	CCA	2	6	8740	8745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945531
121	NC_021844	TGA	2	6	8901	8906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945531
122	NC_021844	GGT	2	6	8951	8956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945531
123	NC_021844	AAC	2	6	8973	8978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945531
124	NC_021844	TCA	2	6	9016	9021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945531
125	NC_021844	TGG	2	6	9022	9027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945531
126	NC_021844	CCA	2	6	9049	9054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945531
127	NC_021844	TGC	2	6	9307	9312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945532
128	NC_021844	TGT	2	6	9358	9363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945532
129	NC_021844	CGC	2	6	9384	9389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945532
130	NC_021844	CCA	2	6	9419	9424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945532
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133	NC_021844	CGA	2	6	9546	9551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945532
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252	NC_021844	TGG	2	6	18845	18850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945539
253	NC_021844	ATG	2	6	18851	18856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945539
254	NC_021844	CCG	2	6	18947	18952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945539
255	NC_021844	CGT	2	6	19015	19020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945539
256	NC_021844	CAG	2	6	19138	19143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945539
257	NC_021844	AAC	2	6	19157	19162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945539
258	NC_021844	TGC	2	6	19181	19186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945539
259	NC_021844	CTG	2	6	19318	19323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945539
260	NC_021844	TGC	2	6	19346	19351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945539
261	NC_021844	CAA	2	6	19473	19478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945540
262	NC_021844	CTG	2	6	19489	19494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945540
263	NC_021844	GCT	2	6	19533	19538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945540
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265	NC_021844	CCG	2	6	19858	19863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945540
266	NC_021844	ATT	2	6	20068	20073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945540
267	NC_021844	TGT	2	6	20861	20866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949037
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269	NC_021844	TGG	2	6	21041	21046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949037
270	NC_021844	AAC	2	6	21073	21078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949037
271	NC_021844	CAT	2	6	21092	21097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945541
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273	NC_021844	TGG	2	6	21178	21183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945541
274	NC_021844	TTC	2	6	21234	21239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945541
275	NC_021844	GGT	2	6	21242	21247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945541
276	NC_021844	TGT	2	6	21256	21261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945541
277	NC_021844	GCG	2	6	21301	21306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945541
278	NC_021844	CTG	2	6	21468	21473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945541
279	NC_021844	CTG	2	6	21526	21531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945541
280	NC_021844	CGG	2	6	21608	21613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945541
281	NC_021844	CTG	2	6	21693	21698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945541
282	NC_021844	GTG	2	6	21785	21790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945541
283	NC_021844	ATT	2	6	21837	21842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945541
284	NC_021844	CTG	2	6	21979	21984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949038
285	NC_021844	TGA	2	6	22001	22006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949038
286	NC_021844	GGC	2	6	22014	22019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949038
287	NC_021844	TGC	2	6	22026	22031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949038
288	NC_021844	CTG	2	6	22099	22104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949038
289	NC_021844	TGG	2	6	22133	22138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949038
290	NC_021844	GAT	2	6	22149	22154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949038
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292	NC_021844	CAA	2	6	22270	22275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945542
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294	NC_021844	CTG	2	6	22393	22398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945542
295	NC_021844	ATC	2	6	22479	22484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945542
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321	NC_021844	GCA	2	6	24613	24618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945544
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372	NC_021844	CGA	2	6	27442	27447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945547
373	NC_021844	TAC	2	6	27875	27880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945548
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375	NC_021844	TCG	2	6	27919	27924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945548
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