MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 86720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021844	GCG	2	6	180130	180135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949065
3502	NC_021844	CTG	2	6	180167	180172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949065
3503	NC_021844	TGA	2	6	180210	180215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949065
3504	NC_021844	TTG	2	6	180243	180248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949065
3505	NC_021844	AT	3	6	180296	180301	50 %	50 %	0 %	0 %	525949065
3506	NC_021844	ATGGT	2	10	180315	180324	20 %	40 %	40 %	0 %	525949065
3507	NC_021844	ATT	2	6	180377	180382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949065
3508	NC_021844	GA	3	6	180469	180474	50 %	0 %	50 %	0 %	525949065
3509	NC_021844	A	6	6	180503	180508	100 %	0 %	0 %	0 %	525949065
3510	NC_021844	TAT	2	6	180774	180779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945665
3511	NC_021844	TTTC	2	8	180781	180788	0 %	75 %	0 %	25 %	525945665
3512	NC_021844	CGC	2	6	180809	180814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945665
3513	NC_021844	TCC	2	6	180920	180925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945665
3514	NC_021844	TCG	2	6	180927	180932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945665
3515	NC_021844	CAGT	2	8	180963	180970	25 %	25 %	25 %	25 %	525945665
3516	NC_021844	GAT	2	6	181012	181017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945665
3517	NC_021844	AT	3	6	181023	181028	50 %	50 %	0 %	0 %	525945665
3518	NC_021844	GAA	2	6	181030	181035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945665
3519	NC_021844	ATT	2	6	181045	181050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945665
3520	NC_021844	A	8	8	181086	181093	100 %	0 %	0 %	0 %	525945665
3521	NC_021844	CTGG	2	8	181165	181172	0 %	25 %	50 %	25 %	525945665
3522	NC_021844	TAT	2	6	181263	181268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945665
3523	NC_021844	T	6	6	181372	181377	0 %	100 %	0 %	0 %	525945665
3524	NC_021844	A	6	6	181389	181394	100 %	0 %	0 %	0 %	525945665
3525	NC_021844	GAT	2	6	181426	181431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945665
3526	NC_021844	AT	3	6	181458	181463	50 %	50 %	0 %	0 %	525945665
3527	NC_021844	AT	3	6	181489	181494	50 %	50 %	0 %	0 %	525945665
3528	NC_021844	TAT	2	6	181608	181613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945666
3529	NC_021844	A	7	7	181618	181624	100 %	0 %	0 %	0 %	525945666
3530	NC_021844	TCC	2	6	181656	181661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945666
3531	NC_021844	GTG	2	6	181664	181669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945666
3532	NC_021844	ATA	2	6	181763	181768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945666
3533	NC_021844	ATA	2	6	181928	181933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945666
3534	NC_021844	AG	3	6	181957	181962	50 %	0 %	50 %	0 %	525945666
3535	NC_021844	ATG	2	6	182027	182032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945666
3536	NC_021844	CAGT	2	8	182049	182056	25 %	25 %	25 %	25 %	525945666
3537	NC_021844	GAA	2	6	182074	182079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945666
3538	NC_021844	CGC	2	6	182088	182093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945666
3539	NC_021844	A	6	6	182257	182262	100 %	0 %	0 %	0 %	525945666
3540	NC_021844	GTT	2	6	182296	182301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945666
3541	NC_021844	AAAG	2	8	182346	182353	75 %	0 %	25 %	0 %	525945666
3542	NC_021844	CGC	2	6	182361	182366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945666
3543	NC_021844	TAT	2	6	182388	182393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945666
3544	NC_021844	G	6	6	182398	182403	0 %	0 %	100 %	0 %	525945666
3545	NC_021844	GAA	2	6	182470	182475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945666
3546	NC_021844	TGG	2	6	182486	182491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945666
3547	NC_021844	GCA	2	6	182506	182511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945666
3548	NC_021844	A	6	6	182533	182538	100 %	0 %	0 %	0 %	525945666
3549	NC_021844	G	6	6	182539	182544	0 %	0 %	100 %	0 %	525945666
3550	NC_021844	TAAT	2	8	182612	182619	50 %	50 %	0 %	0 %	525945666
3551	NC_021844	CCA	2	6	182652	182657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945666
3552	NC_021844	T	7	7	182809	182815	0 %	100 %	0 %	0 %	525945667
3553	NC_021844	CAG	2	6	182832	182837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945667
3554	NC_021844	ACGA	2	8	182889	182896	50 %	0 %	25 %	25 %	525945667
3555	NC_021844	CGA	2	6	182906	182911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945667
3556	NC_021844	GCTG	2	8	182973	182980	0 %	25 %	50 %	25 %	525945667
3557	NC_021844	TGA	2	6	182987	182992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945667
3558	NC_021844	TAT	2	6	183062	183067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945667
3559	NC_021844	TAT	2	6	183119	183124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945667
3560	NC_021844	CAT	2	6	183140	183145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945667
3561	NC_021844	TCTG	2	8	183232	183239	0 %	50 %	25 %	25 %	525945667
3562	NC_021844	AGT	2	6	183253	183258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945667
3563	NC_021844	AGC	2	6	183321	183326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945667
3564	NC_021844	CAC	2	6	183378	183383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945667
3565	NC_021844	GCCA	2	8	183391	183398	25 %	0 %	25 %	50 %	525945667
3566	NC_021844	AAAG	2	8	183453	183460	75 %	0 %	25 %	0 %	525945667
3567	NC_021844	CAA	2	6	183498	183503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945667
3568	NC_021844	AT	3	6	183533	183538	50 %	50 %	0 %	0 %	525945667
3569	NC_021844	C	6	6	183569	183574	0 %	0 %	0 %	100 %	525945667
3570	NC_021844	TAA	2	6	183699	183704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945667
3571	NC_021844	TA	3	6	183707	183712	50 %	50 %	0 %	0 %	525945667
3572	NC_021844	CTTT	2	8	183754	183761	0 %	75 %	0 %	25 %	525945667
3573	NC_021844	ATA	2	6	183803	183808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945667
3574	NC_021844	CAA	2	6	183950	183955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945667
3575	NC_021844	TTTA	2	8	183999	184006	25 %	75 %	0 %	0 %	525945667
3576	NC_021844	ATG	2	6	184013	184018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945667
3577	NC_021844	GTTCT	2	10	184113	184122	0 %	60 %	20 %	20 %	525945668
3578	NC_021844	AGC	2	6	184127	184132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945668
3579	NC_021844	TTC	2	6	184144	184149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945668
3580	NC_021844	GCG	2	6	184213	184218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945668
3581	NC_021844	GCCA	2	8	184263	184270	25 %	0 %	25 %	50 %	525945668
3582	NC_021844	CCT	2	6	184283	184288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945668
3583	NC_021844	CCT	2	6	184352	184357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945668
3584	NC_021844	GC	3	6	184364	184369	0 %	0 %	50 %	50 %	525945668
3585	NC_021844	CCA	2	6	184403	184408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945668
3586	NC_021844	ATC	2	6	184449	184454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945668
3587	NC_021844	CTG	2	6	184500	184505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945668
3588	NC_021844	CG	3	6	184586	184591	0 %	0 %	50 %	50 %	525945668
3589	NC_021844	TGT	2	6	184606	184611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945668
3590	NC_021844	ATCA	2	8	184746	184753	50 %	25 %	0 %	25 %	525945668
3591	NC_021844	CGT	2	6	184757	184762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945668
3592	NC_021844	CGA	2	6	184783	184788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945668
3593	NC_021844	CTT	2	6	184904	184909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945668
3594	NC_021844	GCAG	2	8	184963	184970	25 %	0 %	50 %	25 %	525945668
3595	NC_021844	GAT	2	6	184993	184998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945668
3596	NC_021844	ACA	2	6	185038	185043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949066
3597	NC_021844	GCG	2	6	185071	185076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949066
3598	NC_021844	GCGG	2	8	185221	185228	0 %	0 %	75 %	25 %	525949066
3599	NC_021844	GCC	2	6	185235	185240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949066
3600	NC_021844	GGC	2	6	185285	185290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949066
3601	NC_021844	CTG	2	6	185348	185353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949066
3602	NC_021844	GCC	2	6	185367	185372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949066
3603	NC_021844	AGA	2	6	185534	185539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949066
3604	NC_021844	CCA	2	6	185671	185676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949066
3605	NC_021844	CG	3	6	185704	185709	0 %	0 %	50 %	50 %	525949066
3606	NC_021844	CAG	2	6	185717	185722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949066
3607	NC_021844	CGC	2	6	185737	185742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949066
3608	NC_021844	GCCA	2	8	185743	185750	25 %	0 %	25 %	50 %	525949066
3609	NC_021844	AAAG	2	8	185771	185778	75 %	0 %	25 %	0 %	525949066
3610	NC_021844	TC	3	6	185833	185838	0 %	50 %	0 %	50 %	525949066
3611	NC_021844	GCG	2	6	185858	185863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949066
3612	NC_021844	GC	3	6	185878	185883	0 %	0 %	50 %	50 %	525949066
3613	NC_021844	AAC	2	6	185934	185939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949066
3614	NC_021844	GC	3	6	185987	185992	0 %	0 %	50 %	50 %	525949066
3615	NC_021844	CAT	3	9	186020	186028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949066
3616	NC_021844	CCCA	2	8	186033	186040	25 %	0 %	0 %	75 %	525949066
3617	NC_021844	TGC	2	6	186228	186233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945669
3618	NC_021844	T	6	6	186235	186240	0 %	100 %	0 %	0 %	525945669
3619	NC_021844	GCGTC	2	10	186252	186261	0 %	20 %	40 %	40 %	525945669
3620	NC_021844	CG	3	6	186283	186288	0 %	0 %	50 %	50 %	525945669
3621	NC_021844	CGG	2	6	186345	186350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945669
3622	NC_021844	GTT	2	6	186421	186426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945669
3623	NC_021844	TGC	2	6	186462	186467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945669
3624	NC_021844	TCA	2	6	186557	186562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945669
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3626	NC_021844	GGC	2	6	186649	186654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945669
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3747	NC_021844	ATG	2	6	193574	193579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945675
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3755	NC_021844	CGC	2	6	194011	194016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945675
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3763	NC_021844	GCG	3	9	194283	194291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945675
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3868	NC_021844	AAT	2	6	199799	199804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945680
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3880	NC_021844	GC	3	6	200397	200402	0 %	0 %	50 %	50 %	525945680
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3985	NC_021844	AC	3	6	205629	205634	50 %	0 %	0 %	50 %	525945685
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3988	NC_021844	CGC	2	6	205754	205759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945685
3989	NC_021844	GAC	2	6	205820	205825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945685
3990	NC_021844	CAG	2	6	205974	205979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945685
3991	NC_021844	CGG	2	6	205982	205987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945685
3992	NC_021844	GC	3	6	206000	206005	0 %	0 %	50 %	50 %	525945685
3993	NC_021844	CGC	2	6	206013	206018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945685
3994	NC_021844	AAT	2	6	206103	206108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945685
3995	NC_021844	GAT	2	6	206157	206162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945685
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4000	NC_021844	GCGAT	2	10	206345	206354	20 %	20 %	40 %	20 %	525945685

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