MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 86720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021844	CGG	3	9	154818	154826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945640
3002	NC_021844	TCA	2	6	154859	154864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945640
3003	NC_021844	CGG	2	6	154881	154886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945640
3004	NC_021844	AGT	2	6	154888	154893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945640
3005	NC_021844	GCTT	2	8	154954	154961	0 %	50 %	25 %	25 %	525945640
3006	NC_021844	GGT	2	6	154971	154976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945640
3007	NC_021844	GGAT	2	8	155044	155051	25 %	25 %	50 %	0 %	525945640
3008	NC_021844	CGCTT	2	10	155074	155083	0 %	40 %	20 %	40 %	525945640
3009	NC_021844	CGT	2	6	155101	155106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945640
3010	NC_021844	CGT	2	6	155109	155114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945640
3011	NC_021844	CGC	2	6	155130	155135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945640
3012	NC_021844	TCA	2	6	155192	155197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945640
3013	NC_021844	CGA	2	6	155200	155205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945640
3014	NC_021844	CCG	2	6	155206	155211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945640
3015	NC_021844	GCA	2	6	155264	155269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945640
3016	NC_021844	AGG	2	6	155326	155331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525945640
3017	NC_021844	TGCGC	2	10	155374	155383	0 %	20 %	40 %	40 %	525945640
3018	NC_021844	GCC	2	6	155448	155453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945641
3019	NC_021844	TCG	2	6	155458	155463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945641
3020	NC_021844	CCA	2	6	155465	155470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945641
3021	NC_021844	CTG	2	6	155495	155500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945641
3022	NC_021844	ACC	2	6	155558	155563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945641
3023	NC_021844	CAG	2	6	155570	155575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945641
3024	NC_021844	GCT	2	6	155578	155583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945641
3025	NC_021844	GCA	2	6	155596	155601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945641
3026	NC_021844	CGCTGG	2	12	155637	155648	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525945641
3027	NC_021844	ATC	2	6	155706	155711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945641
3028	NC_021844	ATG	3	9	155715	155723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945641
3029	NC_021844	AATC	2	8	155803	155810	50 %	25 %	0 %	25 %	525945641
3030	NC_021844	TGC	2	6	155929	155934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945641
3031	NC_021844	CCG	3	9	155935	155943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945641
3032	NC_021844	TAA	2	6	156158	156163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949061
3033	NC_021844	TTC	2	6	156261	156266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949061
3034	NC_021844	GGT	3	9	156291	156299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949061
3035	NC_021844	CGC	2	6	156306	156311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949061
3036	NC_021844	GC	3	6	156326	156331	0 %	0 %	50 %	50 %	525949061
3037	NC_021844	TGG	2	6	156457	156462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949061
3038	NC_021844	GAT	2	6	156495	156500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949061
3039	NC_021844	GAC	2	6	156518	156523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949061
3040	NC_021844	CAC	2	6	156603	156608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949061
3041	NC_021844	TGC	2	6	156619	156624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949061
3042	NC_021844	CAG	2	6	156675	156680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949061
3043	NC_021844	GCC	2	6	156759	156764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949061
3044	NC_021844	GAC	2	6	156782	156787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949061
3045	NC_021844	TCA	2	6	156805	156810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949061
3046	NC_021844	GC	4	8	156844	156851	0 %	0 %	50 %	50 %	525949061
3047	NC_021844	GAC	2	6	156861	156866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949061
3048	NC_021844	GGC	2	6	156879	156884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949061
3049	NC_021844	CG	3	6	156892	156897	0 %	0 %	50 %	50 %	525949061
3050	NC_021844	TAA	2	6	156908	156913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949061
3051	NC_021844	GCT	2	6	156930	156935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949061
3052	NC_021844	CG	3	6	156973	156978	0 %	0 %	50 %	50 %	525949061
3053	NC_021844	TGT	2	6	157147	157152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949061
3054	NC_021844	CAG	2	6	157158	157163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949061
3055	NC_021844	GTG	2	6	157198	157203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949061
3056	NC_021844	ATC	2	6	157315	157320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949061
3057	NC_021844	TA	3	6	157362	157367	50 %	50 %	0 %	0 %	525949061
3058	NC_021844	GCT	2	6	157490	157495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949061
3059	NC_021844	AG	3	6	157593	157598	50 %	0 %	50 %	0 %	525949061
3060	NC_021844	T	6	6	157601	157606	0 %	100 %	0 %	0 %	525949061
3061	NC_021844	ATC	2	6	157609	157614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949061
3062	NC_021844	CG	3	6	157628	157633	0 %	0 %	50 %	50 %	525949061
3063	NC_021844	CTT	2	6	157646	157651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949061
3064	NC_021844	TGA	2	6	157652	157657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949061
3065	NC_021844	TGATG	2	10	157712	157721	20 %	40 %	40 %	0 %	525949061
3066	NC_021844	ACG	3	9	157776	157784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949061
3067	NC_021844	GCA	2	6	158033	158038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949061
3068	NC_021844	AGGT	2	8	158203	158210	25 %	25 %	50 %	0 %	525949061
3069	NC_021844	ACG	2	6	158268	158273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945642
3070	NC_021844	GTT	2	6	158358	158363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945642
3071	NC_021844	CTT	2	6	158372	158377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945642
3072	NC_021844	TTC	2	6	158415	158420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945642
3073	NC_021844	CG	3	6	158467	158472	0 %	0 %	50 %	50 %	525945642
3074	NC_021844	CAA	2	6	158604	158609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945643
3075	NC_021844	GCT	2	6	158633	158638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945643
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3077	NC_021844	ATG	2	6	158671	158676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945643
3078	NC_021844	GTC	2	6	158706	158711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945643
3079	NC_021844	CTT	2	6	158786	158791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945643
3080	NC_021844	GGC	2	6	158842	158847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945643
3081	NC_021844	TGC	2	6	158858	158863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945643
3082	NC_021844	CG	3	6	158960	158965	0 %	0 %	50 %	50 %	525945643
3083	NC_021844	GTA	2	6	158973	158978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945643
3084	NC_021844	TCA	2	6	159037	159042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945643
3085	NC_021844	GC	4	8	159089	159096	0 %	0 %	50 %	50 %	525945643
3086	NC_021844	TAA	2	6	159144	159149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945643
3087	NC_021844	TGA	2	6	159473	159478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945644
3088	NC_021844	GCC	2	6	159549	159554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945644
3089	NC_021844	GAA	2	6	159568	159573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945644
3090	NC_021844	GT	3	6	159650	159655	0 %	50 %	50 %	0 %	525945644
3091	NC_021844	CCG	2	6	159730	159735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945644
3092	NC_021844	ACA	2	6	159745	159750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945644
3093	NC_021844	CGTA	2	8	159774	159781	25 %	25 %	25 %	25 %	525945644
3094	NC_021844	ACA	2	6	159976	159981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945644
3095	NC_021844	GC	3	6	159986	159991	0 %	0 %	50 %	50 %	525945644
3096	NC_021844	GC	3	6	160069	160074	0 %	0 %	50 %	50 %	525945644
3097	NC_021844	AATA	2	8	160219	160226	75 %	25 %	0 %	0 %	525945644
3098	NC_021844	GC	3	6	160264	160269	0 %	0 %	50 %	50 %	525945644
3099	NC_021844	CTGG	2	8	160371	160378	0 %	25 %	50 %	25 %	525945644
3100	NC_021844	GTA	2	6	160462	160467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945644
3101	NC_021844	GAT	2	6	160492	160497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945644
3102	NC_021844	TGA	2	6	160608	160613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945644
3103	NC_021844	GTC	2	6	160615	160620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945644
3104	NC_021844	TCT	2	6	160820	160825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945644
3105	NC_021844	GGC	2	6	160898	160903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945644
3106	NC_021844	GC	3	6	160915	160920	0 %	0 %	50 %	50 %	525945644
3107	NC_021844	GCG	2	6	160988	160993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945644
3108	NC_021844	TTA	2	6	161011	161016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945644
3109	NC_021844	GGC	2	6	161036	161041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945644
3110	NC_021844	CGT	2	6	161062	161067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945644
3111	NC_021844	AAT	2	6	161092	161097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945644
3112	NC_021844	TGGC	2	8	161122	161129	0 %	25 %	50 %	25 %	525945644
3113	NC_021844	TAA	2	6	161176	161181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945645
3114	NC_021844	TAA	2	6	161214	161219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945645
3115	NC_021844	ACG	2	6	161254	161259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945645
3116	NC_021844	CCG	2	6	161303	161308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945645
3117	NC_021844	CGAA	2	8	161312	161319	50 %	0 %	25 %	25 %	525945645
3118	NC_021844	CGC	2	6	161384	161389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945645
3119	NC_021844	AGT	2	6	161400	161405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945645
3120	NC_021844	CGG	2	6	161408	161413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945645
3121	NC_021844	CCA	2	6	161414	161419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945645
3122	NC_021844	AAT	2	6	161466	161471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945645
3123	NC_021844	ACC	2	6	161479	161484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945645
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3133	NC_021844	TCATT	2	10	162017	162026	20 %	60 %	0 %	20 %	525945646
3134	NC_021844	GCT	2	6	162030	162035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945646
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3143	NC_021844	GTTGG	2	10	162505	162514	0 %	40 %	60 %	0 %	525945646
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3228	NC_021844	T	7	7	166784	166790	0 %	100 %	0 %	0 %	525945651
3229	NC_021844	CCGA	2	8	166907	166914	25 %	0 %	25 %	50 %	525945651
3230	NC_021844	GCC	2	6	166916	166921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945651
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3232	NC_021844	CGA	2	6	166997	167002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945651
3233	NC_021844	GTTT	2	8	167015	167022	0 %	75 %	25 %	0 %	525945651
3234	NC_021844	TTAC	2	8	167139	167146	25 %	50 %	0 %	25 %	525945652
3235	NC_021844	GCC	2	6	167163	167168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945652
3236	NC_021844	CCA	2	6	167198	167203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945652
3237	NC_021844	AACA	2	8	167229	167236	75 %	0 %	0 %	25 %	525945652
3238	NC_021844	AATC	2	8	167327	167334	50 %	25 %	0 %	25 %	525945652
3239	NC_021844	GCC	2	6	167401	167406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945652
3240	NC_021844	GGTA	2	8	167439	167446	25 %	25 %	50 %	0 %	525945652
3241	NC_021844	CGT	2	6	167451	167456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945652
3242	NC_021844	CGT	2	6	167480	167485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945652
3243	NC_021844	GC	3	6	167494	167499	0 %	0 %	50 %	50 %	525945652
3244	NC_021844	CTG	2	6	167547	167552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945652
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3246	NC_021844	CAT	2	6	167592	167597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945652
3247	NC_021844	TCG	2	6	167612	167617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945653
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3249	NC_021844	CAT	2	6	167733	167738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945653
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3342	NC_021844	GCAGC	2	10	172555	172564	20 %	0 %	40 %	40 %	525945658
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3344	NC_021844	GCA	2	6	172819	172824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945658
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3349	NC_021844	ATT	2	6	173237	173242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949063
3350	NC_021844	TGC	2	6	173253	173258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949063
3351	NC_021844	AAG	2	6	173261	173266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949063
3352	NC_021844	TTAC	2	8	173444	173451	25 %	50 %	0 %	25 %	525945659
3353	NC_021844	TCA	2	6	173460	173465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945659
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3355	NC_021844	AGA	2	6	173598	173603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945659
3356	NC_021844	A	6	6	173627	173632	100 %	0 %	0 %	0 %	525945659
3357	NC_021844	GTC	2	6	173657	173662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945659
3358	NC_021844	T	6	6	173701	173706	0 %	100 %	0 %	0 %	525945659
3359	NC_021844	AAAAAT	2	12	173713	173724	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525945659
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3487	NC_021844	ATT	2	6	179771	179776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945664
3488	NC_021844	CTG	2	6	179785	179790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945664
3489	NC_021844	AAT	2	6	179828	179833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945664
3490	NC_021844	ATT	2	6	179858	179863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949065
3491	NC_021844	A	7	7	179865	179871	100 %	0 %	0 %	0 %	525949065
3492	NC_021844	A	6	6	179897	179902	100 %	0 %	0 %	0 %	525949065
3493	NC_021844	ATC	2	6	179949	179954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949065
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3495	NC_021844	AGA	2	6	179980	179985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949065
3496	NC_021844	AT	3	6	180022	180027	50 %	50 %	0 %	0 %	525949065
3497	NC_021844	A	6	6	180052	180057	100 %	0 %	0 %	0 %	525949065
3498	NC_021844	T	6	6	180068	180073	0 %	100 %	0 %	0 %	525949065
3499	NC_021844	TAC	2	6	180095	180100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949065
3500	NC_021844	TCA	2	6	180112	180117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949065

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