MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 86720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_021844	GAT	2	6	100307	100312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945599
2003	NC_021844	TGG	2	6	100371	100376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945599
2004	NC_021844	GCA	2	6	100384	100389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945599
2005	NC_021844	CGC	2	6	100456	100461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945599
2006	NC_021844	TG	3	6	100463	100468	0 %	50 %	50 %	0 %	525945599
2007	NC_021844	GAC	2	6	100469	100474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945599
2008	NC_021844	ATT	2	6	100481	100486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945599
2009	NC_021844	CGG	2	6	100564	100569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945599
2010	NC_021844	GGCGC	2	10	100607	100616	0 %	0 %	60 %	40 %	525945599
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2012	NC_021844	TGA	3	9	100665	100673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945599
2013	NC_021844	ATC	2	6	100721	100726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945599
2014	NC_021844	TGA	2	6	100728	100733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945599
2015	NC_021844	ACG	2	6	100737	100742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945599
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2022	NC_021844	TGG	2	6	101001	101006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945599
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2052	NC_021844	CGA	2	6	102602	102607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945602
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2058	NC_021844	ATCG	2	8	102780	102787	25 %	25 %	25 %	25 %	525945602
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2064	NC_021844	GCG	2	6	103162	103167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945602
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2094	NC_021844	TGGC	2	8	105353	105360	0 %	25 %	50 %	25 %	525945604
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2121	NC_021844	CCG	2	6	106432	106437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945606
2122	NC_021844	GGC	2	6	106490	106495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945606
2123	NC_021844	TGC	2	6	106531	106536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945606
2124	NC_021844	CG	3	6	106543	106548	0 %	0 %	50 %	50 %	525945606
2125	NC_021844	GCT	2	6	106580	106585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945606
2126	NC_021844	TGA	2	6	106633	106638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945606
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2129	NC_021844	CCG	2	6	106735	106740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945606
2130	NC_021844	CCCTG	2	10	106756	106765	0 %	20 %	20 %	60 %	525945606
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2135	NC_021844	CTG	3	9	106944	106952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945606
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2153	NC_021844	GTCA	2	8	107556	107563	25 %	25 %	25 %	25 %	525945606
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2227	NC_021844	CGG	2	6	111098	111103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945609
2228	NC_021844	TGA	2	6	111135	111140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945609
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2232	NC_021844	T	6	6	111358	111363	0 %	100 %	0 %	0 %	525945609
2233	NC_021844	CA	3	6	111771	111776	50 %	0 %	0 %	50 %	525949055
2234	NC_021844	A	6	6	111905	111910	100 %	0 %	0 %	0 %	525949055
2235	NC_021844	AAG	2	6	111974	111979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949055
2236	NC_021844	AGCC	2	8	112033	112040	25 %	0 %	25 %	50 %	525949055
2237	NC_021844	AGA	2	6	112041	112046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949055
2238	NC_021844	TTGA	2	8	112184	112191	25 %	50 %	25 %	0 %	525949055
2239	NC_021844	TAT	2	6	112222	112227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949055
2240	NC_021844	ATTT	2	8	112251	112258	25 %	75 %	0 %	0 %	525949055
2241	NC_021844	AATT	2	8	112320	112327	50 %	50 %	0 %	0 %	525949055
2242	NC_021844	TAA	2	6	112447	112452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949055
2243	NC_021844	TTAA	2	8	112600	112607	50 %	50 %	0 %	0 %	525949056
2244	NC_021844	ATGGT	2	10	112610	112619	20 %	40 %	40 %	0 %	525949056
2245	NC_021844	GTG	2	6	112816	112821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949056
2246	NC_021844	TGCT	2	8	112826	112833	0 %	50 %	25 %	25 %	525949056
2247	NC_021844	AGC	2	6	112850	112855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949056
2248	NC_021844	GCA	2	6	112905	112910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949056
2249	NC_021844	ATGA	2	8	112921	112928	50 %	25 %	25 %	0 %	525949056
2250	NC_021844	TGA	3	9	112926	112934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949056
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2252	NC_021844	TTTG	2	8	112998	113005	0 %	75 %	25 %	0 %	525945610
2253	NC_021844	ATT	2	6	113083	113088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945610
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2258	NC_021844	CT	3	6	113362	113367	0 %	50 %	0 %	50 %	525945611
2259	NC_021844	T	7	7	113425	113431	0 %	100 %	0 %	0 %	525945611
2260	NC_021844	TTC	2	6	113442	113447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945611
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2265	NC_021844	TAC	2	6	113769	113774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945611
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2269	NC_021844	A	7	7	114006	114012	100 %	0 %	0 %	0 %	525945611
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2275	NC_021844	TGA	2	6	114227	114232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945611
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2329	NC_021844	TAA	2	6	117218	117223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945614
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2340	NC_021844	T	6	6	118003	118008	0 %	100 %	0 %	0 %	525945615
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2350	NC_021844	CG	3	6	118766	118771	0 %	0 %	50 %	50 %	525949058
2351	NC_021844	CGC	2	6	118829	118834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949058
2352	NC_021844	T	6	6	118847	118852	0 %	100 %	0 %	0 %	525949058
2353	NC_021844	TAT	2	6	118859	118864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949058
2354	NC_021844	TGGC	2	8	118865	118872	0 %	25 %	50 %	25 %	525949058
2355	NC_021844	CGC	2	6	118886	118891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949058
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2357	NC_021844	GAT	2	6	119015	119020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949058
2358	NC_021844	CTTT	2	8	119053	119060	0 %	75 %	0 %	25 %	525949058
2359	NC_021844	CTT	2	6	119158	119163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949058
2360	NC_021844	GCT	2	6	119216	119221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949058
2361	NC_021844	GC	3	6	119233	119238	0 %	0 %	50 %	50 %	525949058
2362	NC_021844	TG	3	6	119249	119254	0 %	50 %	50 %	0 %	525949058
2363	NC_021844	GGC	3	9	119273	119281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949058
2364	NC_021844	TCCA	2	8	119379	119386	25 %	25 %	0 %	50 %	525949058
2365	NC_021844	GCG	2	6	119421	119426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949058
2366	NC_021844	GCT	2	6	119456	119461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949058
2367	NC_021844	CGC	2	6	119464	119469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949058
2368	NC_021844	CGG	2	6	119480	119485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949058
2369	NC_021844	GGC	2	6	119513	119518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949058
2370	NC_021844	GGC	2	6	119633	119638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945616
2371	NC_021844	T	7	7	119653	119659	0 %	100 %	0 %	0 %	525945616
2372	NC_021844	ATC	2	6	119837	119842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945616
2373	NC_021844	GCT	2	6	119869	119874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945616
2374	NC_021844	TGA	2	6	119944	119949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945616
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2377	NC_021844	ATA	2	6	120098	120103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945616
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2388	NC_021844	CGG	2	6	120376	120381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945616
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2403	NC_021844	GC	3	6	121237	121242	0 %	0 %	50 %	50 %	525945617
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2455	NC_021844	CTG	3	9	124631	124639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945619
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2472	NC_021844	CGA	2	6	125498	125503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945620
2473	NC_021844	A	6	6	125511	125516	100 %	0 %	0 %	0 %	525945620
2474	NC_021844	GGT	2	6	125763	125768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945621
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2479	NC_021844	CAT	2	6	126075	126080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945621
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2481	NC_021844	TGC	2	6	126119	126124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945621
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2483	NC_021844	ACT	2	6	126149	126154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945621
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2485	NC_021844	GGC	2	6	126226	126231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945621
2486	NC_021844	CGG	2	6	126303	126308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945621
2487	NC_021844	TTC	2	6	126310	126315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945621
2488	NC_021844	CAT	2	6	126339	126344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945621
2489	NC_021844	AGC	2	6	126408	126413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945621
2490	NC_021844	ATG	2	6	126414	126419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945621
2491	NC_021844	GC	4	8	126452	126459	0 %	0 %	50 %	50 %	525945622
2492	NC_021844	CTGG	2	8	126512	126519	0 %	25 %	50 %	25 %	525945622
2493	NC_021844	ATC	2	6	126585	126590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945622
2494	NC_021844	A	6	6	126591	126596	100 %	0 %	0 %	0 %	525945622
2495	NC_021844	CTT	2	6	126647	126652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945622
2496	NC_021844	GAA	2	6	126705	126710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945622
2497	NC_021844	A	6	6	126712	126717	100 %	0 %	0 %	0 %	525945622
2498	NC_021844	CG	3	6	126718	126723	0 %	0 %	50 %	50 %	525945622
2499	NC_021844	GCG	2	6	126810	126815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945622
2500	NC_021844	TAT	2	6	126878	126883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945622

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