MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 86720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021844	CGA	2	6	78787	78792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949043
1502	NC_021844	GC	3	6	78824	78829	0 %	0 %	50 %	50 %	525949043
1503	NC_021844	CGG	2	6	78836	78841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949043
1504	NC_021844	GGC	2	6	78844	78849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949043
1505	NC_021844	CAC	2	6	78880	78885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949043
1506	NC_021844	CCA	2	6	78886	78891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949043
1507	NC_021844	CCG	2	6	78919	78924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949043
1508	NC_021844	CGG	2	6	78937	78942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949043
1509	NC_021844	G	7	7	78941	78947	0 %	0 %	100 %	0 %	525949043
1510	NC_021844	TCT	2	6	78968	78973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945584
1511	NC_021844	TTC	2	6	79030	79035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945584
1512	NC_021844	TCA	2	6	79043	79048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945584
1513	NC_021844	GCCGCA	2	12	79071	79082	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525945584
1514	NC_021844	GCT	2	6	79083	79088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945584
1515	NC_021844	CAT	2	6	79107	79112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945584
1516	NC_021844	GGC	2	6	79119	79124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945584
1517	NC_021844	GCT	2	6	79125	79130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945584
1518	NC_021844	GCT	2	6	79137	79142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945584
1519	NC_021844	CGA	2	6	79164	79169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945584
1520	NC_021844	AGC	2	6	79190	79195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945584
1521	NC_021844	TGC	3	9	79199	79207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945584
1522	NC_021844	CGG	2	6	79220	79225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945584
1523	NC_021844	TGA	2	6	79274	79279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945584
1524	NC_021844	TGG	2	6	79292	79297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945584
1525	NC_021844	GCT	3	9	79299	79307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945584
1526	NC_021844	GCT	3	9	79347	79355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945584
1527	NC_021844	CGC	2	6	79380	79385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945584
1528	NC_021844	CGGC	2	8	79403	79410	0 %	0 %	50 %	50 %	525945584
1529	NC_021844	GCG	2	6	79413	79418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945584
1530	NC_021844	CGG	2	6	79419	79424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945584
1531	NC_021844	CTG	2	6	79429	79434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945584
1532	NC_021844	TGC	2	6	79445	79450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945584
1533	NC_021844	GCT	2	6	79545	79550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945584
1534	NC_021844	CGG	2	6	79586	79591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945584
1535	NC_021844	TCA	2	6	79680	79685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945585
1536	NC_021844	GGC	2	6	79689	79694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945585
1537	NC_021844	GCC	2	6	79695	79700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945585
1538	NC_021844	TGGC	2	8	79735	79742	0 %	25 %	50 %	25 %	525945585
1539	NC_021844	CAT	2	6	79752	79757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945585
1540	NC_021844	CGG	2	6	79799	79804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945585
1541	NC_021844	CAG	2	6	79810	79815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945585
1542	NC_021844	CGG	2	6	79850	79855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945585
1543	NC_021844	GCG	2	6	79879	79884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945585
1544	NC_021844	TGGCGG	2	12	79886	79897	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	525945585
1545	NC_021844	CGGCG	2	10	79995	80004	0 %	0 %	60 %	40 %	525945585
1546	NC_021844	TGG	2	6	80029	80034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945585
1547	NC_021844	CG	3	6	80043	80048	0 %	0 %	50 %	50 %	525945585
1548	NC_021844	TGC	2	6	80066	80071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945585
1549	NC_021844	GAC	2	6	80113	80118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945585
1550	NC_021844	GC	3	6	80133	80138	0 %	0 %	50 %	50 %	525945585
1551	NC_021844	GTG	2	6	80164	80169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945585
1552	NC_021844	GTG	2	6	80199	80204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945585
1553	NC_021844	GCA	2	6	80235	80240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945585
1554	NC_021844	CGC	2	6	80264	80269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945585
1555	NC_021844	CTG	2	6	80293	80298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945585
1556	NC_021844	GATGCG	2	12	80319	80330	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525945585
1557	NC_021844	CGC	2	6	80356	80361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945585
1558	NC_021844	T	6	6	80429	80434	0 %	100 %	0 %	0 %	525949044
1559	NC_021844	T	6	6	80454	80459	0 %	100 %	0 %	0 %	525949044
1560	NC_021844	CTGG	2	8	80462	80469	0 %	25 %	50 %	25 %	525949044
1561	NC_021844	GCT	2	6	80498	80503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949044
1562	NC_021844	TGC	2	6	80518	80523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949044
1563	NC_021844	GCG	2	6	80542	80547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949044
1564	NC_021844	GCA	2	6	80552	80557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949044
1565	NC_021844	GC	3	6	80562	80567	0 %	0 %	50 %	50 %	525949044
1566	NC_021844	AGG	2	6	80599	80604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525949044
1567	NC_021844	GGT	2	6	80638	80643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945586
1568	NC_021844	ACC	2	6	80672	80677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945586
1569	NC_021844	GC	3	6	80698	80703	0 %	0 %	50 %	50 %	525945586
1570	NC_021844	GCA	2	6	80758	80763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945586
1571	NC_021844	CGG	2	6	80769	80774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945586
1572	NC_021844	CGG	2	6	80794	80799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945586
1573	NC_021844	ACG	2	6	80862	80867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945586
1574	NC_021844	CGGTGA	2	12	80877	80888	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525945586
1575	NC_021844	GTG	3	9	80933	80941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945586
1576	NC_021844	CCG	2	6	81014	81019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945586
1577	NC_021844	ACC	2	6	81045	81050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945586
1578	NC_021844	GCC	2	6	81051	81056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945586
1579	NC_021844	TCA	2	6	81080	81085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945586
1580	NC_021844	GCT	2	6	81108	81113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1581	NC_021844	GCT	3	9	81135	81143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1582	NC_021844	GC	3	6	81169	81174	0 %	0 %	50 %	50 %	525949045
1583	NC_021844	CG	3	6	81180	81185	0 %	0 %	50 %	50 %	525949045
1584	NC_021844	GAT	2	6	81186	81191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949045
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1586	NC_021844	GGCG	2	8	81234	81241	0 %	0 %	75 %	25 %	525949045
1587	NC_021844	GCC	2	6	81340	81345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949045
1588	NC_021844	GCT	3	9	81369	81377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1589	NC_021844	TGC	2	6	81383	81388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1590	NC_021844	TGA	2	6	81389	81394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949045
1591	NC_021844	TGGCGG	2	12	81407	81418	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	525949045
1592	NC_021844	CGG	2	6	81437	81442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
1593	NC_021844	TCG	2	6	81446	81451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1594	NC_021844	GCT	2	6	81573	81578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1595	NC_021844	CGC	2	6	81605	81610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949045
1596	NC_021844	GCCTTC	2	12	81643	81654	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525949045
1597	NC_021844	CGC	2	6	81660	81665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949045
1598	NC_021844	GCT	2	6	81666	81671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1599	NC_021844	GCCC	2	8	81706	81713	0 %	0 %	25 %	75 %	525949045
1600	NC_021844	GGC	2	6	81723	81728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
1601	NC_021844	GCTCG	2	10	81756	81765	0 %	20 %	40 %	40 %	525949045
1602	NC_021844	CTA	2	6	81774	81779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949045
1603	NC_021844	GCTGG	2	10	81783	81792	0 %	20 %	60 %	20 %	525949045
1604	NC_021844	GGC	2	6	81793	81798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
1605	NC_021844	TGG	2	6	81799	81804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949045
1606	NC_021844	CCT	2	6	81827	81832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525949045
1607	NC_021844	TGGC	2	8	81841	81848	0 %	25 %	50 %	25 %	525949045
1608	NC_021844	CTG	2	6	81859	81864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1609	NC_021844	GC	3	6	81888	81893	0 %	0 %	50 %	50 %	525949045
1610	NC_021844	GCT	3	9	81912	81920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1611	NC_021844	CTG	2	6	81946	81951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1612	NC_021844	GC	3	6	82012	82017	0 %	0 %	50 %	50 %	525949045
1613	NC_021844	CGG	2	6	82053	82058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
1614	NC_021844	GCT	3	9	82062	82070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1615	NC_021844	AAC	2	6	82108	82113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949045
1616	NC_021844	CG	3	6	82124	82129	0 %	0 %	50 %	50 %	525949045
1617	NC_021844	GCT	3	9	82134	82142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1618	NC_021844	CAA	2	6	82146	82151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949045
1619	NC_021844	CTG	2	6	82156	82161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1620	NC_021844	GCC	2	6	82165	82170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949045
1621	NC_021844	TGG	2	6	82175	82180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949045
1622	NC_021844	TGC	2	6	82181	82186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1623	NC_021844	CTG	2	6	82195	82200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1624	NC_021844	GCTGGG	2	12	82218	82229	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	525949045
1625	NC_021844	CTG	3	9	82294	82302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1626	NC_021844	GCT	3	9	82356	82364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1627	NC_021844	GCT	2	6	82410	82415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1628	NC_021844	ATC	2	6	82426	82431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949045
1629	NC_021844	CGG	2	6	82439	82444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
1630	NC_021844	GATGGC	2	12	82449	82460	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525949045
1631	NC_021844	CTG	2	6	82461	82466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1632	NC_021844	CT	3	6	82524	82529	0 %	50 %	0 %	50 %	525949045
1633	NC_021844	TGG	2	6	82544	82549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949045
1634	NC_021844	GCGG	2	8	82629	82636	0 %	0 %	75 %	25 %	525949045
1635	NC_021844	CGG	2	6	82710	82715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
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1640	NC_021844	CGG	2	6	82824	82829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
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1642	NC_021844	GAG	2	6	82861	82866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525949045
1643	NC_021844	TAC	2	6	82897	82902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949045
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1645	NC_021844	CTG	2	6	82936	82941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
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1647	NC_021844	CCG	3	9	82983	82991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949045
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1653	NC_021844	TGC	2	6	83224	83229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945587
1654	NC_021844	GGT	2	6	83309	83314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945587
1655	NC_021844	GAC	2	6	83331	83336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945587
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1658	NC_021844	ACC	2	6	83633	83638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945588
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1732	NC_021844	TCAT	2	8	86296	86303	25 %	50 %	0 %	25 %	525949047
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1742	NC_021844	A	6	6	87237	87242	100 %	0 %	0 %	0 %	525945591
1743	NC_021844	CGA	2	6	87244	87249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945591
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1997	NC_021844	GC	3	6	100173	100178	0 %	0 %	50 %	50 %	525945599
1998	NC_021844	TGA	2	6	100183	100188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945599
1999	NC_021844	ATC	2	6	100232	100237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945599
2000	NC_021844	ATCG	2	8	100247	100254	25 %	25 %	25 %	25 %	525945599

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