MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 86720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021844	CAG	2	6	53354	53359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945567
1002	NC_021844	GTC	2	6	53379	53384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945567
1003	NC_021844	CTC	2	6	53411	53416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945567
1004	NC_021844	CG	4	8	53473	53480	0 %	0 %	50 %	50 %	525945567
1005	NC_021844	CTGC	2	8	53642	53649	0 %	25 %	25 %	50 %	525945567
1006	NC_021844	GAC	2	6	53669	53674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945567
1007	NC_021844	TCA	2	6	53752	53757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945567
1008	NC_021844	CTA	2	6	53767	53772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945567
1009	NC_021844	CGAC	2	8	53823	53830	25 %	0 %	25 %	50 %	525945567
1010	NC_021844	TAA	2	6	53971	53976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945567
1011	NC_021844	CG	3	6	53981	53986	0 %	0 %	50 %	50 %	525945567
1012	NC_021844	TGG	2	6	54018	54023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945567
1013	NC_021844	GAA	2	6	54058	54063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945567
1014	NC_021844	CG	3	6	54116	54121	0 %	0 %	50 %	50 %	525945567
1015	NC_021844	CT	3	6	54128	54133	0 %	50 %	0 %	50 %	525945567
1016	NC_021844	GCGT	2	8	54150	54157	0 %	25 %	50 %	25 %	525945567
1017	NC_021844	GAA	2	6	54209	54214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945567
1018	NC_021844	CGG	2	6	54241	54246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945567
1019	NC_021844	GCG	2	6	54365	54370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945567
1020	NC_021844	TGT	2	6	54388	54393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945567
1021	NC_021844	AT	3	6	54556	54561	50 %	50 %	0 %	0 %	525945568
1022	NC_021844	CTAT	2	8	54684	54691	25 %	50 %	0 %	25 %	525945568
1023	NC_021844	TTC	2	6	54765	54770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945568
1024	NC_021844	TTTAC	2	10	54923	54932	20 %	60 %	0 %	20 %	525945568
1025	NC_021844	CGG	2	6	54937	54942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945568
1026	NC_021844	AGA	2	6	54953	54958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945568
1027	NC_021844	TTC	2	6	54998	55003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945568
1028	NC_021844	GGCG	2	8	55131	55138	0 %	0 %	75 %	25 %	525945568
1029	NC_021844	CAG	2	6	55181	55186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945568
1030	NC_021844	AGAC	2	8	55239	55246	50 %	0 %	25 %	25 %	525945568
1031	NC_021844	GC	3	6	55344	55349	0 %	0 %	50 %	50 %	525945568
1032	NC_021844	CG	3	6	55368	55373	0 %	0 %	50 %	50 %	525945568
1033	NC_021844	GCGG	2	8	55437	55444	0 %	0 %	75 %	25 %	525945568
1034	NC_021844	GAT	2	6	55463	55468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945568
1035	NC_021844	CTG	2	6	55502	55507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945568
1036	NC_021844	CTC	2	6	55679	55684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945569
1037	NC_021844	GTAT	2	8	55732	55739	25 %	50 %	25 %	0 %	525945569
1038	NC_021844	CAC	2	6	55770	55775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945569
1039	NC_021844	GGT	2	6	55787	55792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945569
1040	NC_021844	CGA	2	6	55805	55810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1041	NC_021844	TCG	2	6	55837	55842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1042	NC_021844	GAT	2	6	55878	55883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945569
1043	NC_021844	GAA	2	6	55914	55919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945569
1044	NC_021844	CGG	3	9	55927	55935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945569
1045	NC_021844	CGG	2	6	55997	56002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945569
1046	NC_021844	AACTGG	2	12	56047	56058	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525945569
1047	NC_021844	AGA	2	6	56297	56302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945569
1048	NC_021844	GGC	2	6	56319	56324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945569
1049	NC_021844	TTG	2	6	56335	56340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945569
1050	NC_021844	TCT	2	6	56380	56385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945569
1051	NC_021844	CAA	2	6	56471	56476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945569
1052	NC_021844	CGG	2	6	56492	56497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945569
1053	NC_021844	GCG	2	6	56520	56525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945569
1054	NC_021844	AAG	2	6	56557	56562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945569
1055	NC_021844	A	6	6	56571	56576	100 %	0 %	0 %	0 %	525945569
1056	NC_021844	TGA	2	6	56597	56602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945569
1057	NC_021844	GGT	2	6	56624	56629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945569
1058	NC_021844	CGG	2	6	56701	56706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945569
1059	NC_021844	CAG	2	6	56712	56717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1060	NC_021844	GAAC	2	8	56720	56727	50 %	0 %	25 %	25 %	525945569
1061	NC_021844	CTG	2	6	56742	56747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1062	NC_021844	TCG	3	9	56770	56778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1063	NC_021844	CGC	2	6	56792	56797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945569
1064	NC_021844	GCG	2	6	56811	56816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945569
1065	NC_021844	CGT	2	6	56838	56843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1066	NC_021844	GC	3	6	56848	56853	0 %	0 %	50 %	50 %	525945569
1067	NC_021844	TGG	2	6	56926	56931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945569
1068	NC_021844	GGC	2	6	56946	56951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945569
1069	NC_021844	GC	3	6	57027	57032	0 %	0 %	50 %	50 %	525945569
1070	NC_021844	CTCTC	2	10	57045	57054	0 %	40 %	0 %	60 %	525945569
1071	NC_021844	CGA	2	6	57101	57106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1072	NC_021844	CAT	4	12	57137	57148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945569
1073	NC_021844	GCT	2	6	57185	57190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1074	NC_021844	CTT	2	6	57197	57202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945569
1075	NC_021844	GCC	2	6	57254	57259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945569
1076	NC_021844	GAC	2	6	57303	57308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1077	NC_021844	GCT	2	6	57473	57478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1078	NC_021844	TGA	2	6	57524	57529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945569
1079	NC_021844	AGC	2	6	57583	57588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1080	NC_021844	CAGT	2	8	57593	57600	25 %	25 %	25 %	25 %	525945569
1081	NC_021844	CGTGCG	2	12	57650	57661	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525945569
1082	NC_021844	TCG	2	6	57722	57727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1083	NC_021844	ACC	2	6	57918	57923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945569
1084	NC_021844	GCC	2	6	57937	57942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945569
1085	NC_021844	TGC	2	6	57946	57951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1086	NC_021844	TGC	2	6	57974	57979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945569
1087	NC_021844	GCG	2	6	58056	58061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945569
1088	NC_021844	CAT	2	6	58115	58120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945570
1089	NC_021844	AT	3	6	58132	58137	50 %	50 %	0 %	0 %	525945570
1090	NC_021844	GGCG	2	8	58167	58174	0 %	0 %	75 %	25 %	525945570
1091	NC_021844	GC	3	6	58180	58185	0 %	0 %	50 %	50 %	525945570
1092	NC_021844	CAC	2	6	58290	58295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945570
1093	NC_021844	GCC	2	6	58309	58314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945570
1094	NC_021844	ATC	2	6	58384	58389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945570
1095	NC_021844	T	7	7	58451	58457	0 %	100 %	0 %	0 %	525945570
1096	NC_021844	GTTT	2	8	58510	58517	0 %	75 %	25 %	0 %	525945570
1097	NC_021844	T	6	6	58583	58588	0 %	100 %	0 %	0 %	525945570
1098	NC_021844	TGC	2	6	58636	58641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945570
1099	NC_021844	GAT	2	6	58656	58661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945570
1100	NC_021844	GCG	2	6	58688	58693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945570
1101	NC_021844	CAA	2	6	58697	58702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945570
1102	NC_021844	T	6	6	58716	58721	0 %	100 %	0 %	0 %	525945570
1103	NC_021844	CAA	2	6	58769	58774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945570
1104	NC_021844	GGC	2	6	58782	58787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945570
1105	NC_021844	CAC	2	6	58821	58826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945570
1106	NC_021844	GGC	2	6	58923	58928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945570
1107	NC_021844	CG	3	6	58962	58967	0 %	0 %	50 %	50 %	525945570
1108	NC_021844	TGGT	2	8	59120	59127	0 %	50 %	50 %	0 %	525945571
1109	NC_021844	T	6	6	59130	59135	0 %	100 %	0 %	0 %	525945571
1110	NC_021844	TTC	2	6	59142	59147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945571
1111	NC_021844	CGT	2	6	59183	59188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945571
1112	NC_021844	CAG	2	6	59241	59246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945571
1113	NC_021844	CCG	2	6	59309	59314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945571
1114	NC_021844	CGC	2	6	59327	59332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945571
1115	NC_021844	TTC	2	6	59383	59388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945571
1116	NC_021844	GCC	2	6	59400	59405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945571
1117	NC_021844	TA	3	6	59479	59484	50 %	50 %	0 %	0 %	525945571
1118	NC_021844	GCC	2	6	59494	59499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945571
1119	NC_021844	GTA	2	6	59568	59573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945571
1120	NC_021844	TTC	2	6	59586	59591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945571
1121	NC_021844	GGT	2	6	59619	59624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945571
1122	NC_021844	GCAT	2	8	59635	59642	25 %	25 %	25 %	25 %	525945571
1123	NC_021844	GAT	2	6	59649	59654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945571
1124	NC_021844	GGC	2	6	59685	59690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945571
1125	NC_021844	CGG	2	6	59816	59821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945571
1126	NC_021844	GCC	2	6	59827	59832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945571
1127	NC_021844	C	6	6	59879	59884	0 %	0 %	0 %	100 %	525945571
1128	NC_021844	GCC	2	6	59934	59939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945571
1129	NC_021844	CGC	2	6	60012	60017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945571
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1131	NC_021844	T	7	7	60053	60059	0 %	100 %	0 %	0 %	525945571
1132	NC_021844	GAT	2	6	60105	60110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945571
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1139	NC_021844	T	6	6	60319	60324	0 %	100 %	0 %	0 %	525945572
1140	NC_021844	GCC	2	6	60385	60390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945572
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1148	NC_021844	CGA	2	6	60681	60686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945572
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1157	NC_021844	GACT	2	8	61114	61121	25 %	25 %	25 %	25 %	525945572
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1369	NC_021844	GC	3	6	72775	72780	0 %	0 %	50 %	50 %	525945580
1370	NC_021844	CGATG	2	10	72825	72834	20 %	20 %	40 %	20 %	525945580
1371	NC_021844	GCG	2	6	72859	72864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945580
1372	NC_021844	GAAA	2	8	72885	72892	75 %	0 %	25 %	0 %	525945580
1373	NC_021844	CCA	2	6	72927	72932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945580
1374	NC_021844	AGC	2	6	72946	72951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945580
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1377	NC_021844	GACGGA	2	12	73149	73160	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525945580
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