MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 86720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021844	ACC	2	6	27186	27191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945547
502	NC_021844	GTC	2	6	27197	27202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945547
503	NC_021844	CAA	2	6	27212	27217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945547
504	NC_021844	CGC	2	6	27291	27296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945547
505	NC_021844	AGC	2	6	27336	27341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945547
506	NC_021844	TATC	2	8	27358	27365	25 %	50 %	0 %	25 %	525945547
507	NC_021844	CGG	2	6	27370	27375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945547
508	NC_021844	CGA	2	6	27442	27447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945547
509	NC_021844	GAAGC	2	10	27461	27470	40 %	0 %	40 %	20 %	525945547
510	NC_021844	A	6	6	27578	27583	100 %	0 %	0 %	0 %	525945547
511	NC_021844	TAC	2	6	27875	27880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945548
512	NC_021844	TCG	2	6	27887	27892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945548
513	NC_021844	TCG	2	6	27919	27924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945548
514	NC_021844	GCG	2	6	27942	27947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945548
515	NC_021844	TGC	2	6	27985	27990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945548
516	NC_021844	TGG	2	6	27995	28000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945548
517	NC_021844	TGGT	2	8	28011	28018	0 %	50 %	50 %	0 %	525945548
518	NC_021844	TGG	2	6	28039	28044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945548
519	NC_021844	C	6	6	28141	28146	0 %	0 %	0 %	100 %	525945548
520	NC_021844	GGC	2	6	28157	28162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945548
521	NC_021844	GCG	2	6	28188	28193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945548
522	NC_021844	A	7	7	28247	28253	100 %	0 %	0 %	0 %	525945548
523	NC_021844	CTTTT	2	10	28256	28265	0 %	80 %	0 %	20 %	525945548
524	NC_021844	ATT	2	6	28311	28316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945548
525	NC_021844	CTG	2	6	28371	28376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945548
526	NC_021844	ATT	2	6	28410	28415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945548
527	NC_021844	CTG	2	6	28438	28443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945548
528	NC_021844	TGC	2	6	28916	28921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945549
529	NC_021844	GCA	2	6	28947	28952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945549
530	NC_021844	CTA	2	6	28967	28972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945549
531	NC_021844	GTT	2	6	29019	29024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945549
532	NC_021844	GCA	2	6	29097	29102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945549
533	NC_021844	CTT	2	6	29112	29117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945549
534	NC_021844	CGA	2	6	29121	29126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945549
535	NC_021844	GGT	2	6	29209	29214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945549
536	NC_021844	TTA	2	6	29221	29226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945549
537	NC_021844	TGA	2	6	29316	29321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945549
538	NC_021844	GTTG	2	8	29384	29391	0 %	50 %	50 %	0 %	525945549
539	NC_021844	AAT	2	6	29407	29412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945549
540	NC_021844	AGGA	2	8	29459	29466	50 %	0 %	50 %	0 %	525945549
541	NC_021844	CGC	2	6	29475	29480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945549
542	NC_021844	ACGG	2	8	29506	29513	25 %	0 %	50 %	25 %	525945549
543	NC_021844	CTG	2	6	29578	29583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945549
544	NC_021844	ATC	2	6	29674	29679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945549
545	NC_021844	ATT	2	6	29728	29733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945549
546	NC_021844	GTG	2	6	29779	29784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945549
547	NC_021844	TGAAA	2	10	29883	29892	60 %	20 %	20 %	0 %	525945549
548	NC_021844	A	6	6	29890	29895	100 %	0 %	0 %	0 %	525945549
549	NC_021844	ACCT	2	8	29932	29939	25 %	25 %	0 %	50 %	525945549
550	NC_021844	ATG	2	6	29999	30004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945549
551	NC_021844	CGA	2	6	30033	30038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945549
552	NC_021844	TGG	2	6	30065	30070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945549
553	NC_021844	CCA	2	6	30095	30100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945549
554	NC_021844	CGC	2	6	30102	30107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945549
555	NC_021844	GAA	2	6	30198	30203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945549
556	NC_021844	TG	3	6	30400	30405	0 %	50 %	50 %	0 %	525949039
557	NC_021844	TTG	2	6	30409	30414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949039
558	NC_021844	CGT	2	6	30462	30467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949039
559	NC_021844	GAA	2	6	30576	30581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949039
560	NC_021844	GGC	2	6	30594	30599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949039
561	NC_021844	TGG	2	6	30682	30687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949039
562	NC_021844	CAT	2	6	30698	30703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949039
563	NC_021844	GCT	2	6	30905	30910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949039
564	NC_021844	TCG	2	6	31001	31006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949039
565	NC_021844	CGA	2	6	31256	31261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949039
566	NC_021844	CTG	2	6	31263	31268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949039
567	NC_021844	CTT	2	6	31306	31311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949039
568	NC_021844	TGA	2	6	31426	31431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949039
569	NC_021844	CTGG	2	8	31467	31474	0 %	25 %	50 %	25 %	525949039
570	NC_021844	CT	3	6	31508	31513	0 %	50 %	0 %	50 %	525949039
571	NC_021844	TGA	2	6	31567	31572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949039
572	NC_021844	CAC	2	6	31616	31621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949039
573	NC_021844	TGG	2	6	31645	31650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949039
574	NC_021844	GC	3	6	31846	31851	0 %	0 %	50 %	50 %	525949039
575	NC_021844	TGC	2	6	31892	31897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949039
576	NC_021844	TGG	2	6	31954	31959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949039
577	NC_021844	AAC	2	6	31965	31970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949039
578	NC_021844	CTG	2	6	31974	31979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949039
579	NC_021844	GAA	2	6	32001	32006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949039
580	NC_021844	ACA	2	6	32071	32076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949039
581	NC_021844	CAT	2	6	32081	32086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949039
582	NC_021844	CTG	2	6	32145	32150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949039
583	NC_021844	AGTA	2	8	32224	32231	50 %	25 %	25 %	0 %	525949039
584	NC_021844	GTG	2	6	32478	32483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945550
585	NC_021844	AGCC	2	8	32497	32504	25 %	0 %	25 %	50 %	525945550
586	NC_021844	GGT	2	6	32511	32516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945550
587	NC_021844	GTT	2	6	32528	32533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945550
588	NC_021844	CAG	2	6	32577	32582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945550
589	NC_021844	CAT	2	6	32585	32590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945550
590	NC_021844	TGGCG	2	10	32603	32612	0 %	20 %	60 %	20 %	525945550
591	NC_021844	CCAG	2	8	32681	32688	25 %	0 %	25 %	50 %	525945550
592	NC_021844	TCA	2	6	32719	32724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945550
593	NC_021844	CTG	2	6	32757	32762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945550
594	NC_021844	CGA	3	9	32847	32855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945550
595	NC_021844	AGG	2	6	32900	32905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525945550
596	NC_021844	CAG	2	6	32907	32912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945550
597	NC_021844	GCC	2	6	32916	32921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945550
598	NC_021844	CTCA	2	8	32946	32953	25 %	25 %	0 %	50 %	525945550
599	NC_021844	CAGC	2	8	32991	32998	25 %	0 %	25 %	50 %	525945550
600	NC_021844	CGG	2	6	33008	33013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945550
601	NC_021844	ATA	2	6	33041	33046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945550
602	NC_021844	A	6	6	33046	33051	100 %	0 %	0 %	0 %	525945550
603	NC_021844	TCC	2	6	33054	33059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945550
604	NC_021844	TGTC	2	8	33200	33207	0 %	50 %	25 %	25 %	525945550
605	NC_021844	CAG	2	6	33246	33251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945550
606	NC_021844	CCA	2	6	33311	33316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945550
607	NC_021844	AGC	3	9	33406	33414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945550
608	NC_021844	CAT	2	6	33557	33562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945550
609	NC_021844	CGG	2	6	33572	33577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945550
610	NC_021844	CAGCG	2	10	33595	33604	20 %	0 %	40 %	40 %	525945550
611	NC_021844	GCC	2	6	33614	33619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945550
612	NC_021844	GTG	2	6	33621	33626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945550
613	NC_021844	TGC	2	6	33700	33705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945550
614	NC_021844	GCA	2	6	33812	33817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945550
615	NC_021844	CAG	2	6	33846	33851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945550
616	NC_021844	CCT	2	6	33989	33994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945550
617	NC_021844	GCC	2	6	34022	34027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945550
618	NC_021844	AAC	2	6	34036	34041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945550
619	NC_021844	TCA	2	6	34226	34231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945551
620	NC_021844	TAA	2	6	34245	34250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945551
621	NC_021844	GGC	2	6	34275	34280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945551
622	NC_021844	CCGA	2	8	34363	34370	25 %	0 %	25 %	50 %	525945551
623	NC_021844	GCG	2	6	34388	34393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945551
624	NC_021844	AAG	2	6	34439	34444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945551
625	NC_021844	TGG	2	6	34457	34462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945551
626	NC_021844	ACA	2	6	34538	34543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945551
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