MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 86720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_021844	CGG	2	6	412048	412053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945818
8003	NC_021844	ACC	2	6	412119	412124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945818
8004	NC_021844	CCCG	2	8	412160	412167	0 %	0 %	25 %	75 %	525945818
8005	NC_021844	TGA	2	6	412175	412180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945818
8006	NC_021844	TCTG	2	8	412300	412307	0 %	50 %	25 %	25 %	525945818
8007	NC_021844	TGC	2	6	412333	412338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945818
8008	NC_021844	CG	3	6	412348	412353	0 %	0 %	50 %	50 %	525945818
8009	NC_021844	GCA	2	6	412394	412399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945818
8010	NC_021844	GAAG	2	8	412455	412462	50 %	0 %	50 %	0 %	525945818
8011	NC_021844	CAA	2	6	412503	412508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945818
8012	NC_021844	GAT	2	6	412532	412537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945818
8013	NC_021844	GGC	2	6	412550	412555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945818
8014	NC_021844	CCA	2	6	412610	412615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945818
8015	NC_021844	AGC	2	6	412633	412638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945818
8016	NC_021844	CGGCG	2	10	412681	412690	0 %	0 %	60 %	40 %	525945818
8017	NC_021844	GAA	2	6	412758	412763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945818
8018	NC_021844	TGA	2	6	412798	412803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945818
8019	NC_021844	CGAA	2	8	412806	412813	50 %	0 %	25 %	25 %	525945818
8020	NC_021844	GAA	2	6	412817	412822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945818
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8033	NC_021844	TGC	2	6	413305	413310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945819
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8039	NC_021844	GTC	2	6	413511	413516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945819
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8055	NC_021844	TGA	2	6	414362	414367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945820
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8063	NC_021844	CGA	2	6	418220	418225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945821
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8085	NC_021844	CCTGG	2	10	419213	419222	0 %	20 %	40 %	40 %	525945821
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8112	NC_021844	CG	3	6	420375	420380	0 %	0 %	50 %	50 %	525945821
8113	NC_021844	GGCA	2	8	420434	420441	25 %	0 %	50 %	25 %	525945821
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8120	NC_021844	A	6	6	420739	420744	100 %	0 %	0 %	0 %	525945822
8121	NC_021844	TAT	2	6	420822	420827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945822
8122	NC_021844	CGC	2	6	420836	420841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945822
8123	NC_021844	GCT	2	6	420861	420866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945822
8124	NC_021844	A	6	6	420874	420879	100 %	0 %	0 %	0 %	525945822
8125	NC_021844	G	6	6	420884	420889	0 %	0 %	100 %	0 %	525945822
8126	NC_021844	A	7	7	420920	420926	100 %	0 %	0 %	0 %	525945822
8127	NC_021844	CGG	2	6	420984	420989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945822
8128	NC_021844	TCGTC	2	10	421063	421072	0 %	40 %	20 %	40 %	525945822
8129	NC_021844	GCTG	2	8	421073	421080	0 %	25 %	50 %	25 %	525945822
8130	NC_021844	AT	4	8	421087	421094	50 %	50 %	0 %	0 %	525945822
8131	NC_021844	TGG	2	6	421144	421149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945822
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8134	NC_021844	CGA	2	6	421272	421277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945822
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8136	NC_021844	AGC	2	6	421382	421387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945822
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8138	NC_021844	CGC	2	6	421518	421523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945822
8139	NC_021844	CTG	2	6	421524	421529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945822
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8147	NC_021844	TGG	2	6	421822	421827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945822
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8150	NC_021844	CAA	2	6	422065	422070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945822
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8152	NC_021844	CTGG	2	8	422370	422377	0 %	25 %	50 %	25 %	525945822
8153	NC_021844	GGC	2	6	422429	422434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945822
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8160	NC_021844	ACCG	2	8	422822	422829	25 %	0 %	25 %	50 %	525945823
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8221	NC_021844	GC	3	6	426039	426044	0 %	0 %	50 %	50 %	525945826
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8227	NC_021844	TGA	2	6	426450	426455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945826
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8230	NC_021844	CTTGC	2	10	426637	426646	0 %	40 %	20 %	40 %	525945827
8231	NC_021844	TCCT	2	8	426664	426671	0 %	50 %	0 %	50 %	525945827
8232	NC_021844	TCTG	2	8	426679	426686	0 %	50 %	25 %	25 %	525945827
8233	NC_021844	TCT	2	6	426699	426704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945827
8234	NC_021844	GC	3	6	426754	426759	0 %	0 %	50 %	50 %	525945827
8235	NC_021844	CAT	2	6	426775	426780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945827
8236	NC_021844	AAAC	2	8	426787	426794	75 %	0 %	0 %	25 %	525945827
8237	NC_021844	CAG	2	6	426829	426834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945827
8238	NC_021844	CAG	2	6	426898	426903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945827
8239	NC_021844	TCG	2	6	426929	426934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945827
8240	NC_021844	CCAG	2	8	427014	427021	25 %	0 %	25 %	50 %	525945827
8241	NC_021844	CAC	2	6	427072	427077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945827
8242	NC_021844	TTGCA	2	10	427114	427123	20 %	40 %	20 %	20 %	525945827
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8486	NC_021844	GCC	2	6	440379	440384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945837
8487	NC_021844	CGC	2	6	440465	440470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945837
8488	NC_021844	CAC	2	6	440492	440497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945837
8489	NC_021844	CGC	2	6	440608	440613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945837
8490	NC_021844	CTG	3	9	440618	440626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945837
8491	NC_021844	ATT	2	6	440627	440632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945837
8492	NC_021844	CAG	2	6	440714	440719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945837
8493	NC_021844	CAG	2	6	440732	440737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945837
8494	NC_021844	CGC	2	6	440821	440826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945837
8495	NC_021844	ATC	2	6	440880	440885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945837
8496	NC_021844	TC	3	6	440884	440889	0 %	50 %	0 %	50 %	525945837
8497	NC_021844	TCTT	2	8	440946	440953	0 %	75 %	0 %	25 %	525945838
8498	NC_021844	T	6	6	441013	441018	0 %	100 %	0 %	0 %	525945838
8499	NC_021844	CCG	2	6	441037	441042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945838
8500	NC_021844	CCGT	2	8	441109	441116	0 %	25 %	25 %	50 %	525945838

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