MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 86720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021844	GCC	2	6	232581	232586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945701
4502	NC_021844	GAC	2	6	232587	232592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945701
4503	NC_021844	CGC	2	6	232602	232607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945701
4504	NC_021844	GGC	2	6	232620	232625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945701
4505	NC_021844	CAC	2	6	232665	232670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945701
4506	NC_021844	G	6	6	232671	232676	0 %	0 %	100 %	0 %	525945701
4507	NC_021844	GC	3	6	232679	232684	0 %	0 %	50 %	50 %	525945701
4508	NC_021844	TGT	2	6	232745	232750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945701
4509	NC_021844	CTC	2	6	232776	232781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945701
4510	NC_021844	TCA	2	6	232826	232831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945701
4511	NC_021844	CTT	2	6	232952	232957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945701
4512	NC_021844	AG	3	6	232998	233003	50 %	0 %	50 %	0 %	525945701
4513	NC_021844	AACAGG	2	12	233038	233049	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525945701
4514	NC_021844	CAG	2	6	233112	233117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945701
4515	NC_021844	TGA	2	6	233123	233128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945701
4516	NC_021844	CAC	2	6	233267	233272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945701
4517	NC_021844	CCAG	2	8	233282	233289	25 %	0 %	25 %	50 %	525945701
4518	NC_021844	AGG	2	6	233329	233334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525945702
4519	NC_021844	TCAG	2	8	233416	233423	25 %	25 %	25 %	25 %	525945702
4520	NC_021844	CTT	2	6	233438	233443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945702
4521	NC_021844	T	6	6	233459	233464	0 %	100 %	0 %	0 %	525945702
4522	NC_021844	CTT	2	6	233504	233509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945702
4523	NC_021844	CAG	2	6	233520	233525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945702
4524	NC_021844	CCT	2	6	233528	233533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945702
4525	NC_021844	CAG	3	9	233577	233585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945702
4526	NC_021844	TGA	2	6	233599	233604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945702
4527	NC_021844	ACG	2	6	233650	233655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945702
4528	NC_021844	TGT	2	6	233774	233779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945702
4529	NC_021844	GC	3	6	233825	233830	0 %	0 %	50 %	50 %	525945702
4530	NC_021844	T	6	6	233901	233906	0 %	100 %	0 %	0 %	525945702
4531	NC_021844	ATGCGC	2	12	233940	233951	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525945702
4532	NC_021844	AAGT	2	8	233979	233986	50 %	25 %	25 %	0 %	525945702
4533	NC_021844	CCG	2	6	234046	234051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945702
4534	NC_021844	T	6	6	234128	234133	0 %	100 %	0 %	0 %	525945702
4535	NC_021844	T	6	6	234153	234158	0 %	100 %	0 %	0 %	525945702
4536	NC_021844	GCC	2	6	234217	234222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945702
4537	NC_021844	GAC	2	6	234226	234231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945702
4538	NC_021844	AAT	2	6	234259	234264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945702
4539	NC_021844	ATA	2	6	234289	234294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945702
4540	NC_021844	TAAT	2	8	234303	234310	50 %	50 %	0 %	0 %	525945703
4541	NC_021844	AATAAA	2	12	234341	234352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525945703
4542	NC_021844	CAG	2	6	234359	234364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
4543	NC_021844	TCA	2	6	234408	234413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945703
4544	NC_021844	TAA	2	6	234490	234495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945703
4545	NC_021844	AAAT	2	8	234510	234517	75 %	25 %	0 %	0 %	525945703
4546	NC_021844	CTT	2	6	234532	234537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945703
4547	NC_021844	AAT	2	6	234549	234554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945703
4548	NC_021844	CGA	2	6	234601	234606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
4549	NC_021844	ATAA	2	8	234630	234637	75 %	25 %	0 %	0 %	525945703
4550	NC_021844	GCA	2	6	234664	234669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
4551	NC_021844	CAT	2	6	234680	234685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945703
4552	NC_021844	CCA	2	6	234733	234738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945703
4553	NC_021844	GAC	2	6	234746	234751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
4554	NC_021844	CGT	2	6	234755	234760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945703
4555	NC_021844	GGC	2	6	234764	234769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945703
4556	NC_021844	GATA	2	8	234811	234818	50 %	25 %	25 %	0 %	525945703
4557	NC_021844	GGC	2	6	234845	234850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945703
4558	NC_021844	CGGAA	2	10	234883	234892	40 %	0 %	40 %	20 %	525945703
4559	NC_021844	GCC	2	6	234893	234898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945703
4560	NC_021844	ATA	2	6	234900	234905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945703
4561	NC_021844	CCA	3	9	235007	235015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945703
4562	NC_021844	GCGCC	2	10	235027	235036	0 %	0 %	40 %	60 %	525945703
4563	NC_021844	CAT	2	6	235037	235042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945703
4564	NC_021844	ATA	2	6	235107	235112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945703
4565	NC_021844	G	6	6	235124	235129	0 %	0 %	100 %	0 %	525945703
4566	NC_021844	AAT	2	6	235130	235135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945703
4567	NC_021844	CCG	2	6	235149	235154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945703
4568	NC_021844	CAT	2	6	235202	235207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945703
4569	NC_021844	CAG	2	6	235214	235219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
4570	NC_021844	GCC	2	6	235304	235309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945703
4571	NC_021844	GCC	2	6	235361	235366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945703
4572	NC_021844	CAAAA	2	10	235388	235397	80 %	0 %	0 %	20 %	525945703
4573	NC_021844	A	6	6	235394	235399	100 %	0 %	0 %	0 %	525945703
4574	NC_021844	CAG	2	6	235409	235414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
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4576	NC_021844	AGC	3	9	235503	235511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
4577	NC_021844	GCAG	2	8	235549	235556	25 %	0 %	50 %	25 %	525945703
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4581	NC_021844	CAG	2	6	235807	235812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945704
4582	NC_021844	GA	3	6	235814	235819	50 %	0 %	50 %	0 %	525945704
4583	NC_021844	CCA	2	6	235848	235853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945704
4584	NC_021844	CGTAA	2	10	235971	235980	40 %	20 %	20 %	20 %	525945704
4585	NC_021844	TAA	2	6	235989	235994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945704
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4587	NC_021844	AT	3	6	236238	236243	50 %	50 %	0 %	0 %	525945705
4588	NC_021844	CAA	2	6	236281	236286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945705
4589	NC_021844	GCG	2	6	236321	236326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945705
4590	NC_021844	TCA	2	6	236355	236360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945705
4591	NC_021844	TCCA	2	8	236419	236426	25 %	25 %	0 %	50 %	525945705
4592	NC_021844	CTG	2	6	236476	236481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945705
4593	NC_021844	AG	3	6	236498	236503	50 %	0 %	50 %	0 %	525945705
4594	NC_021844	GC	3	6	236527	236532	0 %	0 %	50 %	50 %	525945705
4595	NC_021844	GC	3	6	236689	236694	0 %	0 %	50 %	50 %	525945705
4596	NC_021844	C	6	6	236729	236734	0 %	0 %	0 %	100 %	525945705
4597	NC_021844	GGC	2	6	236740	236745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945705
4598	NC_021844	TTTA	2	8	236791	236798	25 %	75 %	0 %	0 %	525945705
4599	NC_021844	TCT	2	6	236799	236804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945705
4600	NC_021844	GTA	2	6	236818	236823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945705
4601	NC_021844	CCG	2	6	236873	236878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945705
4602	NC_021844	CGG	2	6	236888	236893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945705
4603	NC_021844	TCG	2	6	236960	236965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945705
4604	NC_021844	GCT	2	6	236994	236999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945705
4605	NC_021844	AG	3	6	237025	237030	50 %	0 %	50 %	0 %	525945705
4606	NC_021844	GCC	2	6	237033	237038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945705
4607	NC_021844	ATA	2	6	237101	237106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945705
4608	NC_021844	TAT	2	6	237114	237119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945705
4609	NC_021844	TTA	2	6	237208	237213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945706
4610	NC_021844	AATG	2	8	237273	237280	50 %	25 %	25 %	0 %	525945706
4611	NC_021844	A	6	6	237302	237307	100 %	0 %	0 %	0 %	525945706
4612	NC_021844	TAA	2	6	237324	237329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945706
4613	NC_021844	TGATT	2	10	237338	237347	20 %	60 %	20 %	0 %	525945706
4614	NC_021844	GCG	2	6	237414	237419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945706
4615	NC_021844	CAG	2	6	237440	237445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945706
4616	NC_021844	GGT	2	6	237453	237458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945706
4617	NC_021844	ATG	2	6	237613	237618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945706
4618	NC_021844	GTC	2	6	237656	237661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949073
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4620	NC_021844	GTC	2	6	237737	237742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949073
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4622	NC_021844	TGA	2	6	237760	237765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949073
4623	NC_021844	GAA	2	6	237891	237896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949073
4624	NC_021844	GCG	2	6	237974	237979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949073
4625	NC_021844	TCG	2	6	238023	238028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949073
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4627	NC_021844	CGA	2	6	238141	238146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949073
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4629	NC_021844	GGC	2	6	238188	238193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949073
4630	NC_021844	CCG	2	6	238240	238245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949073
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4637	NC_021844	GCGA	2	8	238520	238527	25 %	0 %	50 %	25 %	525949073
4638	NC_021844	TCG	2	6	238542	238547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949073
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4642	NC_021844	CGG	2	6	239050	239055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945707
4643	NC_021844	GAC	2	6	239072	239077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945707
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4646	NC_021844	ACC	2	6	239163	239168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945707
4647	NC_021844	ACC	2	6	239235	239240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945707
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4653	NC_021844	CAG	2	6	239855	239860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945708
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4655	NC_021844	GAC	2	6	239875	239880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945708
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4659	NC_021844	GCGT	2	8	240155	240162	0 %	25 %	50 %	25 %	525945708
4660	NC_021844	GCA	2	6	240200	240205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945708
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4693	NC_021844	CGT	2	6	241456	241461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945709
4694	NC_021844	TCC	2	6	241467	241472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945709
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4697	NC_021844	GAC	2	6	241723	241728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945710
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4704	NC_021844	CTG	2	6	242095	242100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945710
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4721	NC_021844	CGT	2	6	242890	242895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945710
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4726	NC_021844	CG	3	6	243208	243213	0 %	0 %	50 %	50 %	525945710
4727	NC_021844	TAA	2	6	243293	243298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945710
4728	NC_021844	GCG	2	6	243348	243353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945710
4729	NC_021844	GTTCAG	2	12	243396	243407	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525945710
4730	NC_021844	AAC	2	6	243419	243424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945710
4731	NC_021844	AAAC	2	8	243478	243485	75 %	0 %	0 %	25 %	525945710
4732	NC_021844	GC	3	6	243498	243503	0 %	0 %	50 %	50 %	525945710
4733	NC_021844	ACA	2	6	243522	243527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945710
4734	NC_021844	CTG	2	6	243565	243570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945710
4735	NC_021844	CG	3	6	243589	243594	0 %	0 %	50 %	50 %	525945710
4736	NC_021844	GCA	2	6	243611	243616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945710
4737	NC_021844	ATG	2	6	243675	243680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945710
4738	NC_021844	GGC	2	6	243718	243723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945710
4739	NC_021844	TCA	2	6	243729	243734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945710
4740	NC_021844	TCA	2	6	243757	243762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949074
4741	NC_021844	CTC	3	9	243789	243797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525949074
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4743	NC_021844	AGG	3	9	243813	243821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525949074
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4990	NC_021844	GCA	2	6	259697	259702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945719
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