MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_02

Total Repeats: 360

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021841	TTA	2	6	1859	1864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932972
2	NC_021841	CAT	2	6	1871	1876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932972
3	NC_021841	GAT	3	9	1916	1924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932972
4	NC_021841	CCA	2	6	1950	1955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932972
5	NC_021841	CAG	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932972
6	NC_021841	CAG	2	6	2137	2142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932972
7	NC_021841	TTG	2	6	2216	2221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932973
8	NC_021841	CAA	2	6	2234	2239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932973
9	NC_021841	CTT	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932973
10	NC_021841	ACA	2	6	2332	2337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932973
11	NC_021841	TAT	2	6	2384	2389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932973
12	NC_021841	AAC	2	6	2438	2443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932973
13	NC_021841	CTC	2	6	2461	2466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525932973
14	NC_021841	CTG	2	6	2566	2571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932973
15	NC_021841	TCC	2	6	2641	2646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525932973
16	NC_021841	AAT	2	6	2706	2711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932973
17	NC_021841	CGC	2	6	2784	2789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525932973
18	NC_021841	CAA	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932973
19	NC_021841	TAA	2	6	2864	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932974
20	NC_021841	AAT	2	6	2873	2878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932974
21	NC_021841	TTG	2	6	3209	3214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932975
22	NC_021841	CTT	2	6	3272	3277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932975
23	NC_021841	TCC	2	6	3303	3308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525932975
24	NC_021841	GAT	2	6	3310	3315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932975
25	NC_021841	CCA	2	6	3320	3325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932975
26	NC_021841	CAC	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932975
27	NC_021841	CAT	2	6	3447	3452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932976
28	NC_021841	GAT	2	6	3521	3526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932976
29	NC_021841	TTC	2	6	3567	3572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932976
30	NC_021841	TGA	2	6	3646	3651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932976
31	NC_021841	CAT	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932976
32	NC_021841	TTC	2	6	3817	3822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932977
33	NC_021841	GCT	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932977
34	NC_021841	CAT	3	9	4026	4034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932977
35	NC_021841	CAT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932977
36	NC_021841	TCT	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932977
37	NC_021841	TCA	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932977
38	NC_021841	GAT	2	6	4461	4466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932977
39	NC_021841	CTT	2	6	4467	4472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932977
40	NC_021841	ATC	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932977
41	NC_021841	TGG	3	9	4573	4581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932977
42	NC_021841	TCT	2	6	4682	4687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932978
43	NC_021841	CAT	2	6	4716	4721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932978
44	NC_021841	CTT	2	6	4818	4823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932978
45	NC_021841	TTG	2	6	4824	4829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932978
46	NC_021841	AAC	2	6	5011	5016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932979
47	NC_021841	CAG	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932979
48	NC_021841	TCA	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932979
49	NC_021841	GCA	2	6	5282	5287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932979
50	NC_021841	TGA	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932979
51	NC_021841	TCA	3	9	5465	5473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932979
52	NC_021841	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932979
53	NC_021841	GAT	2	6	5875	5880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932980
54	NC_021841	CTT	2	6	5887	5892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932980
55	NC_021841	TTA	2	6	5904	5909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932980
56	NC_021841	TCT	2	6	5931	5936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932980
57	NC_021841	CGA	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932980
58	NC_021841	TCC	2	6	6027	6032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525932980
59	NC_021841	ATT	2	6	6149	6154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932980
60	NC_021841	ATA	2	6	6207	6212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932980
61	NC_021841	ACC	2	6	6253	6258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932981
62	NC_021841	AGT	2	6	6568	6573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932982
63	NC_021841	ACC	3	9	6577	6585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932982
64	NC_021841	CTT	2	6	6773	6778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932983
65	NC_021841	TCT	3	9	6906	6914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932983
66	NC_021841	CAT	2	6	7027	7032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932983
67	NC_021841	AGC	2	6	7037	7042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932983
68	NC_021841	ATT	2	6	7055	7060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932983
69	NC_021841	ACA	2	6	7386	7391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932984
70	NC_021841	TGT	2	6	7395	7400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932984
71	NC_021841	ATA	2	6	7422	7427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932984
72	NC_021841	TAT	2	6	8164	8169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932985
73	NC_021841	TGT	2	6	8257	8262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932986
74	NC_021841	CAT	2	6	8285	8290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932986
75	NC_021841	CTT	2	6	8372	8377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932986
76	NC_021841	CCT	2	6	8656	8661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525932987
77	NC_021841	ATG	2	6	8741	8746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932987
78	NC_021841	CAC	2	6	8780	8785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932987
79	NC_021841	ATC	2	6	8867	8872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932987
80	NC_021841	TCT	2	6	9134	9139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932988
81	NC_021841	GCC	2	6	9209	9214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525932988
82	NC_021841	TCA	2	6	9344	9349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932988
83	NC_021841	TCA	2	6	9371	9376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932988
84	NC_021841	TCA	2	6	9444	9449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932988
85	NC_021841	GAT	2	6	9477	9482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932988
86	NC_021841	TGC	2	6	9505	9510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932988
87	NC_021841	CAA	2	6	10395	10400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932989
88	NC_021841	ACC	2	6	10405	10410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932989
89	NC_021841	ACC	2	6	10414	10419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932989
90	NC_021841	TTC	2	6	10432	10437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932989
91	NC_021841	TTC	2	6	10486	10491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932989
92	NC_021841	GGC	2	6	10498	10503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525932989
93	NC_021841	GCT	2	6	10620	10625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932990
94	NC_021841	CTT	2	6	10630	10635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932990
95	NC_021841	TCA	2	6	10666	10671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932990
96	NC_021841	TCA	2	6	10910	10915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932991
97	NC_021841	TAG	2	6	10955	10960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932991
98	NC_021841	TGG	2	6	10972	10977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932991
99	NC_021841	AAT	2	6	12490	12495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932992
100	NC_021841	ATG	2	6	12512	12517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932992
101	NC_021841	TTG	2	6	12526	12531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932992
102	NC_021841	TCT	2	6	12588	12593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932992
103	NC_021841	CTG	2	6	12719	12724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932992
104	NC_021841	TTC	2	6	12810	12815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932992
105	NC_021841	CTG	2	6	13124	13129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932992
106	NC_021841	TGT	2	6	13203	13208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932992
107	NC_021841	ATG	2	6	13238	13243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932992
108	NC_021841	ATG	2	6	13382	13387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932992
109	NC_021841	ATG	2	6	13621	13626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932993
110	NC_021841	CTG	2	6	13668	13673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932993
111	NC_021841	GCT	2	6	13695	13700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932993
112	NC_021841	GTT	3	9	13713	13721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932993
113	NC_021841	TTG	2	6	13755	13760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932993
114	NC_021841	GTT	2	6	13833	13838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932993
115	NC_021841	TGC	2	6	13841	13846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932993
116	NC_021841	TGG	2	6	13893	13898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932993
117	NC_021841	GAA	2	6	13947	13952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932993
118	NC_021841	TAA	2	6	14105	14110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932994
119	NC_021841	AAC	2	6	14122	14127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932994
120	NC_021841	TTC	2	6	14132	14137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932994
121	NC_021841	TGT	2	6	14138	14143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932994
122	NC_021841	TTA	2	6	14176	14181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932994
123	NC_021841	ATT	2	6	14311	14316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932994
124	NC_021841	ATG	2	6	14434	14439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932994
125	NC_021841	ATG	2	6	14568	14573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932994
126	NC_021841	GAT	2	6	14604	14609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932994
127	NC_021841	TCT	2	6	15203	15208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932995
128	NC_021841	CTT	3	9	15231	15239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932995
129	NC_021841	AAC	2	6	15280	15285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932995
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252	NC_021841	ATC	2	6	25664	25669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933009
253	NC_021841	AGT	2	6	25736	25741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933009
254	NC_021841	ATC	2	6	25754	25759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933010
255	NC_021841	AGC	2	6	25801	25806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525933010
256	NC_021841	TTG	2	6	26004	26009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525933010
257	NC_021841	CTG	2	6	26146	26151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525933011
258	NC_021841	CAT	2	6	26200	26205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933011
259	NC_021841	TAA	2	6	26244	26249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525933011
260	NC_021841	TGA	2	6	26417	26422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933011
261	NC_021841	CTT	2	6	26459	26464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525933011
262	NC_021841	CAT	2	6	26465	26470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933011
263	NC_021841	TAC	2	6	26512	26517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525933012
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265	NC_021841	TAG	2	6	26654	26659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933012
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273	NC_021841	AGA	2	6	27431	27436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525933012
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277	NC_021841	ATA	2	6	27688	27693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525933012
278	NC_021841	AAT	2	6	27811	27816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525933012
279	NC_021841	CCA	2	6	27823	27828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525933012
280	NC_021841	TGA	2	6	27846	27851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525933012
281	NC_021841	TGC	2	6	27901	27906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525933012
282	NC_021841	TTG	2	6	28008	28013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525933012
283	NC_021841	CGC	2	6	28066	28071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525933012
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289	NC_021841	GAA	2	6	28438	28443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525933013
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360	NC_021841	AAT	2	6	34344	34349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525933020

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.