MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Spiroplasma taiwanense CT-1 plasmid

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021832	GAT	2	6	209	214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905725
2	NC_021832	CTA	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905725
3	NC_021832	TTA	2	6	469	474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
4	NC_021832	ATT	2	6	507	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
5	NC_021832	ATT	2	6	531	536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
6	NC_021832	ATA	2	6	556	561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905725
7	NC_021832	TAT	2	6	642	647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
8	NC_021832	ATA	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905725
9	NC_021832	ATA	2	6	772	777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905725
10	NC_021832	TTA	2	6	787	792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
11	NC_021832	TGT	2	6	929	934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905725
12	NC_021832	GAA	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905725
13	NC_021832	TAT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905725
14	NC_021832	TTG	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905725
15	NC_021832	GAT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905725
16	NC_021832	AAC	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905725
17	NC_021832	ATT	2	6	1407	1412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905726
18	NC_021832	TAC	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905726
19	NC_021832	AAT	2	6	1512	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905726
20	NC_021832	ATA	2	6	1522	1527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905726
21	NC_021832	TTA	3	9	2114	2122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
22	NC_021832	TTA	2	6	2159	2164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
23	NC_021832	CCA	2	6	2240	2245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525905727
24	NC_021832	TAT	2	6	2248	2253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
25	NC_021832	ATT	2	6	2314	2319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
26	NC_021832	TAA	2	6	2347	2352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905727
27	NC_021832	ATT	3	9	2389	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
28	NC_021832	TAT	2	6	2481	2486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
29	NC_021832	ATT	2	6	2495	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
30	NC_021832	TCA	2	6	2507	2512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905727
31	NC_021832	TAT	2	6	2518	2523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
32	NC_021832	TGG	2	6	2613	2618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525905727
33	NC_021832	CTA	2	6	2658	2663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905727
34	NC_021832	TCA	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905727
35	NC_021832	ATT	2	6	2731	2736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
36	NC_021832	ATT	2	6	2755	2760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905727
37	NC_021832	TTA	2	6	3048	3053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905728
38	NC_021832	ACA	2	6	3075	3080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905728
39	NC_021832	AGT	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905728
40	NC_021832	AGA	2	6	3134	3139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
41	NC_021832	AGC	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905728
42	NC_021832	GAA	2	6	3168	3173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
43	NC_021832	TAA	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905728
44	NC_021832	TAG	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905728
45	NC_021832	GAA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
46	NC_021832	AAG	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905728
47	NC_021832	TTA	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905729
48	NC_021832	TTA	2	6	3550	3555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905729
49	NC_021832	GTA	2	6	3631	3636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905729
50	NC_021832	ATA	2	6	3665	3670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
51	NC_021832	AAG	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905729
52	NC_021832	ATA	2	6	3698	3703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
53	NC_021832	AAT	3	9	3721	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
54	NC_021832	TTA	2	6	3730	3735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905729
55	NC_021832	ATA	2	6	3746	3751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
56	NC_021832	GAT	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905729
57	NC_021832	TAA	2	6	3897	3902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
58	NC_021832	CAA	2	6	3947	3952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905729
59	NC_021832	AGT	2	6	4081	4086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905729
60	NC_021832	GCT	2	6	4099	4104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525905729
61	NC_021832	GCA	3	9	4108	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905729
62	NC_021832	GCA	3	9	4201	4209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905729
63	NC_021832	CAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905729
64	NC_021832	TAA	2	6	4334	4339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
65	NC_021832	CAG	2	6	4346	4351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905729
66	NC_021832	TTG	2	6	4365	4370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905729
67	NC_021832	CAA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905729
68	NC_021832	AAT	2	6	4413	4418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905729
69	NC_021832	TAT	2	6	4588	4593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
70	NC_021832	TAT	2	6	4663	4668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
71	NC_021832	TGA	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905730
72	NC_021832	TTA	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
73	NC_021832	AGA	3	9	4816	4824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905730
74	NC_021832	ATT	2	6	4993	4998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
75	NC_021832	TTG	2	6	5020	5025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905730
76	NC_021832	TAA	2	6	5077	5082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905730
77	NC_021832	ATT	2	6	5105	5110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905730
78	NC_021832	TGT	2	6	5445	5450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905731
79	NC_021832	AGA	2	6	5511	5516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905731
80	NC_021832	TAT	2	6	5549	5554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905731
81	NC_021832	TTA	2	6	5718	5723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905732
82	NC_021832	TTA	2	6	5803	5808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905732
83	NC_021832	AAT	2	6	5835	5840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905732
84	NC_021832	TAG	2	6	5989	5994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905733
85	NC_021832	TCA	2	6	6018	6023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905733
86	NC_021832	TGT	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905733
87	NC_021832	AGA	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905733
88	NC_021832	TAA	2	6	6221	6226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905733
89	NC_021832	GAA	2	6	6234	6239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905733
90	NC_021832	AGA	2	6	6242	6247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905733
91	NC_021832	TGG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525905733
92	NC_021832	GAA	2	6	6360	6365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905733
93	NC_021832	TGA	2	6	6434	6439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905733
94	NC_021832	ATT	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905733
95	NC_021832	AGA	2	6	6494	6499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905733
96	NC_021832	TAG	2	6	6631	6636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905734
97	NC_021832	TCA	2	6	6660	6665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905734
98	NC_021832	TGT	2	6	6671	6676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905734
99	NC_021832	AGA	2	6	6746	6751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905734
100	NC_021832	TAA	2	6	6767	6772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905734
101	NC_021832	GAA	2	6	6780	6785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905734
102	NC_021832	AGA	2	6	6809	6814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905734
103	NC_021832	TGT	2	6	7216	7221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905735
104	NC_021832	GAC	2	6	7237	7242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525905735
105	NC_021832	AGA	2	6	7261	7266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905735
106	NC_021832	ACA	3	9	7281	7289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905735
107	NC_021832	ATA	2	6	7307	7312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905735
108	NC_021832	TTA	2	6	7313	7318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905735
109	NC_021832	ATA	3	9	7326	7334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905735
110	NC_021832	AAG	2	6	7350	7355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905735
111	NC_021832	ATA	2	6	7397	7402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905735
112	NC_021832	TTA	2	6	7403	7408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905735
113	NC_021832	GAG	2	6	7425	7430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525905735
114	NC_021832	AGA	2	6	7459	7464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905735
115	NC_021832	GAA	2	6	7472	7477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905735
116	NC_021832	TGT	2	6	7811	7816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905736
117	NC_021832	AGA	2	6	7856	7861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905736
118	NC_021832	ACA	3	9	7876	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905736
119	NC_021832	ATA	2	6	7902	7907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905736
120	NC_021832	TTA	2	6	7908	7913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905736
121	NC_021832	GAT	2	6	7926	7931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905736
122	NC_021832	ATA	2	6	7992	7997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905736
123	NC_021832	TTA	2	6	7998	8003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905736
124	NC_021832	GAA	2	6	8022	8027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905736
125	NC_021832	AGA	2	6	8054	8059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905736
126	NC_021832	ATT	2	6	8069	8074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905736
127	NC_021832	TAA	2	6	8168	8173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905736
128	NC_021832	GTT	2	6	8688	8693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905737
129	NC_021832	TAT	2	6	8743	8748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905737
130	NC_021832	TTC	2	6	8762	8767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525905737
131	NC_021832	TTC	2	6	8889	8894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525905738
132	NC_021832	TTA	2	6	8935	8940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905738
133	NC_021832	TTA	2	6	8995	9000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905738
134	NC_021832	ATA	2	6	9072	9077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905738
135	NC_021832	ATT	2	6	9084	9089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905738
136	NC_021832	TAC	2	6	9098	9103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905738
137	NC_021832	TGT	2	6	9131	9136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905738
138	NC_021832	AAT	2	6	9192	9197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905738
139	NC_021832	TCA	2	6	9202	9207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525905738
140	NC_021832	TAA	2	6	9225	9230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905738
141	NC_021832	TTG	2	6	9242	9247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905738
142	NC_021832	AAT	3	9	9430	9438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905738
143	NC_021832	TCT	2	6	9439	9444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525905738
144	NC_021832	TCT	2	6	9454	9459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525905738
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146	NC_021832	TTA	2	6	9481	9486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905738
147	NC_021832	TTG	2	6	9596	9601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525905738
148	NC_021832	ACA	2	6	10474	10479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525905740
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150	NC_021832	TTA	2	6	10513	10518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525905740
151	NC_021832	AAT	2	6	10560	10565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905740
152	NC_021832	GAT	2	6	10750	10755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525905740
153	NC_021832	TAA	2	6	10812	10817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525905740
154	NC_021832	AGA	2	6	10823	10828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525905740

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.