MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 9512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021820	CCGC	2	8	4791	4798	0 %	0 %	25 %	75 %	526218031
2	NC_021820	GATG	2	8	5149	5156	25 %	25 %	50 %	0 %	526218031
3	NC_021820	GCAG	2	8	5374	5381	25 %	0 %	50 %	25 %	526218031
4	NC_021820	AGCC	2	8	5511	5518	25 %	0 %	25 %	50 %	526218031
5	NC_021820	CCGA	2	8	5897	5904	25 %	0 %	25 %	50 %	526218031
6	NC_021820	CTCG	2	8	6607	6614	0 %	25 %	25 %	50 %	526218032
7	NC_021820	AGCC	2	8	6659	6666	25 %	0 %	25 %	50 %	526218032
8	NC_021820	GGCA	2	8	6789	6796	25 %	0 %	50 %	25 %	526218032
9	NC_021820	TGGC	2	8	7530	7537	0 %	25 %	50 %	25 %	526218032
10	NC_021820	TCCC	2	8	8205	8212	0 %	25 %	0 %	75 %	526218033
11	NC_021820	TTCA	2	8	8424	8431	25 %	50 %	0 %	25 %	526218033
12	NC_021820	TTAA	2	8	8569	8576	50 %	50 %	0 %	0 %	526218033
13	NC_021820	AGCC	2	8	9005	9012	25 %	0 %	25 %	50 %	526218034
14	NC_021820	CGGT	2	8	9117	9124	0 %	25 %	50 %	25 %	526218034
15	NC_021820	CTTT	2	8	9129	9136	0 %	75 %	0 %	25 %	526218034
16	NC_021820	CTGA	2	8	9293	9300	25 %	25 %	25 %	25 %	526218034
17	NC_021820	GAGT	2	8	9312	9319	25 %	25 %	50 %	0 %	526218034
18	NC_021820	CGCC	2	8	9529	9536	0 %	0 %	25 %	75 %	526218034
19	NC_021820	GTTT	2	8	9744	9751	0 %	75 %	25 %	0 %	526218034
20	NC_021820	CTTA	2	8	10316	10323	25 %	50 %	0 %	25 %	526218034
21	NC_021820	TCGT	2	8	11550	11557	0 %	50 %	25 %	25 %	526218036
22	NC_021820	GCAG	2	8	11639	11646	25 %	0 %	50 %	25 %	526218036
23	NC_021820	CAGA	2	8	11685	11692	50 %	0 %	25 %	25 %	526218036
24	NC_021820	CTTA	2	8	11742	11749	25 %	50 %	0 %	25 %	526218037
25	NC_021820	AAAC	2	8	11775	11782	75 %	0 %	0 %	25 %	526218037
26	NC_021820	ACCA	2	8	11878	11885	50 %	0 %	0 %	50 %	526218037
27	NC_021820	ATCA	2	8	11992	11999	50 %	25 %	0 %	25 %	526218037
28	NC_021820	GATG	2	8	13589	13596	25 %	25 %	50 %	0 %	526218040
29	NC_021820	CGCC	2	8	14447	14454	0 %	0 %	25 %	75 %	526218040
30	NC_021820	GCTG	2	8	15547	15554	0 %	25 %	50 %	25 %	526218042
31	NC_021820	TGAA	2	8	15631	15638	50 %	25 %	25 %	0 %	526218042
32	NC_021820	GGAA	2	8	15725	15732	50 %	0 %	50 %	0 %	526218042
33	NC_021820	GCCA	2	8	16627	16634	25 %	0 %	25 %	50 %	526218043
34	NC_021820	CGTG	2	8	16943	16950	0 %	25 %	50 %	25 %	526218043
35	NC_021820	CCGC	2	8	18019	18026	0 %	0 %	25 %	75 %	526218043
36	NC_021820	ATGA	2	8	18861	18868	50 %	25 %	25 %	0 %	526218044
37	NC_021820	ATTG	2	8	18953	18960	25 %	50 %	25 %	0 %	526218045
38	NC_021820	CCAG	2	8	19537	19544	25 %	0 %	25 %	50 %	526218045
39	NC_021820	ATCC	2	8	20093	20100	25 %	25 %	0 %	50 %	526218047
40	NC_021820	GCTG	2	8	20109	20116	0 %	25 %	50 %	25 %	526218047
41	NC_021820	ACCG	2	8	20581	20588	25 %	0 %	25 %	50 %	526218048
42	NC_021820	GAAA	2	8	21158	21165	75 %	0 %	25 %	0 %	526218048
43	NC_021820	TTCC	2	8	21339	21346	0 %	50 %	0 %	50 %	526218048
44	NC_021820	GATG	2	8	21390	21397	25 %	25 %	50 %	0 %	526218048
45	NC_021820	ACTG	2	8	22399	22406	25 %	25 %	25 %	25 %	526221719
46	NC_021820	TACA	2	8	22504	22511	50 %	25 %	0 %	25 %	526221719
47	NC_021820	CCAT	2	8	22817	22824	25 %	25 %	0 %	50 %	526221719
48	NC_021820	AGTA	2	8	22836	22843	50 %	25 %	25 %	0 %	526221719
49	NC_021820	TAAT	2	8	22849	22856	50 %	50 %	0 %	0 %	526221719
50	NC_021820	TACT	2	8	23392	23399	25 %	50 %	0 %	25 %	526221719
51	NC_021820	AATA	3	12	24254	24265	75 %	25 %	0 %	0 %	526221721
52	NC_021820	GCTG	2	8	24573	24580	0 %	25 %	50 %	25 %	526218049
53	NC_021820	ACGA	2	8	24938	24945	50 %	0 %	25 %	25 %	526218049
54	NC_021820	CACT	2	8	25615	25622	25 %	25 %	0 %	50 %	526218049
55	NC_021820	GTGG	2	8	26381	26388	0 %	25 %	75 %	0 %	526218049
56	NC_021820	CGGT	2	8	26860	26867	0 %	25 %	50 %	25 %	526218049
57	NC_021820	GATA	2	8	27100	27107	50 %	25 %	25 %	0 %	526218049
58	NC_021820	TCAG	2	8	28227	28234	25 %	25 %	25 %	25 %	526218049
59	NC_021820	AGCG	2	8	28819	28826	25 %	0 %	50 %	25 %	526218050
60	NC_021820	GCAT	2	8	29083	29090	25 %	25 %	25 %	25 %	526218050
61	NC_021820	CCAG	2	8	29822	29829	25 %	0 %	25 %	50 %	526218050
62	NC_021820	CGCA	2	8	30105	30112	25 %	0 %	25 %	50 %	526218050
63	NC_021820	ACGC	2	8	30301	30308	25 %	0 %	25 %	50 %	526218050
64	NC_021820	GGAC	2	8	30453	30460	25 %	0 %	50 %	25 %	526218050
65	NC_021820	GCTG	2	8	31286	31293	0 %	25 %	50 %	25 %	526218050
66	NC_021820	AGAC	2	8	31377	31384	50 %	0 %	25 %	25 %	526218050
67	NC_021820	GCAG	2	8	32200	32207	25 %	0 %	50 %	25 %	526218050
68	NC_021820	TACG	2	8	32225	32232	25 %	25 %	25 %	25 %	526218050
69	NC_021820	CCAG	2	8	32264	32271	25 %	0 %	25 %	50 %	526218050
70	NC_021820	TTGT	2	8	34037	34044	0 %	75 %	25 %	0 %	526218052
71	NC_021820	TTTC	2	8	34626	34633	0 %	75 %	0 %	25 %	526218053
72	NC_021820	TACC	2	8	34899	34906	25 %	25 %	0 %	50 %	526218053
73	NC_021820	CTGA	2	8	35792	35799	25 %	25 %	25 %	25 %	526218055
74	NC_021820	AGCC	2	8	37539	37546	25 %	0 %	25 %	50 %	526221722
75	NC_021820	ACGA	2	8	37606	37613	50 %	0 %	25 %	25 %	526221722
76	NC_021820	GAAA	2	8	39913	39920	75 %	0 %	25 %	0 %	526218057
77	NC_021820	ATCC	2	8	40357	40364	25 %	25 %	0 %	50 %	526218058
78	NC_021820	GACC	2	8	41058	41065	25 %	0 %	25 %	50 %	526218059
79	NC_021820	CCAG	2	8	41086	41093	25 %	0 %	25 %	50 %	526218059
80	NC_021820	CAGC	2	8	41249	41256	25 %	0 %	25 %	50 %	526218059
81	NC_021820	CTTC	2	8	41904	41911	0 %	50 %	0 %	50 %	526218059
82	NC_021820	TTGC	2	8	41944	41951	0 %	50 %	25 %	25 %	526218059
83	NC_021820	CATT	2	8	48358	48365	25 %	50 %	0 %	25 %	526221723
84	NC_021820	CGCC	2	8	49608	49615	0 %	0 %	25 %	75 %	526218060
85	NC_021820	ATCA	2	8	49828	49835	50 %	25 %	0 %	25 %	526218060
86	NC_021820	CACG	2	8	49893	49900	25 %	0 %	25 %	50 %	526218060
87	NC_021820	ACGC	2	8	50299	50306	25 %	0 %	25 %	50 %	526218060
88	NC_021820	TCAA	2	8	50309	50316	50 %	25 %	0 %	25 %	526218060
89	NC_021820	TCGC	2	8	51094	51101	0 %	25 %	25 %	50 %	526218061
90	NC_021820	GTCA	2	8	51104	51111	25 %	25 %	25 %	25 %	526218061
91	NC_021820	TGCG	2	8	51120	51127	0 %	25 %	50 %	25 %	526218061
92	NC_021820	CCGT	2	8	51710	51717	0 %	25 %	25 %	50 %	526218061
93	NC_021820	GCAC	2	8	52240	52247	25 %	0 %	25 %	50 %	526218062
94	NC_021820	CTGC	2	8	54128	54135	0 %	25 %	25 %	50 %	526218064
95	NC_021820	ACAG	2	8	54198	54205	50 %	0 %	25 %	25 %	526218064
96	NC_021820	CCAT	2	8	54757	54764	25 %	25 %	0 %	50 %	526218065
97	NC_021820	CGCC	2	8	55076	55083	0 %	0 %	25 %	75 %	526218065
98	NC_021820	TGGC	2	8	55551	55558	0 %	25 %	50 %	25 %	526218065
99	NC_021820	GCAG	2	8	56284	56291	25 %	0 %	50 %	25 %	526218066
100	NC_021820	CAGC	2	8	56654	56661	25 %	0 %	25 %	50 %	526218066
101	NC_021820	CAGT	2	8	57148	57155	25 %	25 %	25 %	25 %	526218066
102	NC_021820	TCTT	2	8	58008	58015	0 %	75 %	0 %	25 %	526218067
103	NC_021820	TAAT	2	8	58177	58184	50 %	50 %	0 %	0 %	526218067
104	NC_021820	ATTA	2	8	58665	58672	50 %	50 %	0 %	0 %	526218068
105	NC_021820	GTGG	2	8	59132	59139	0 %	25 %	75 %	0 %	526218068
106	NC_021820	TTGC	2	8	59407	59414	0 %	50 %	25 %	25 %	526218069
107	NC_021820	GCGG	2	8	59509	59516	0 %	0 %	75 %	25 %	526218069
108	NC_021820	GAAC	2	8	60818	60825	50 %	0 %	25 %	25 %	526218070
109	NC_021820	AACC	2	8	61152	61159	50 %	0 %	0 %	50 %	526218070
110	NC_021820	CTGG	2	8	61799	61806	0 %	25 %	50 %	25 %	526218070
111	NC_021820	GATC	2	8	62215	62222	25 %	25 %	25 %	25 %	526218070
112	NC_021820	GCTG	2	8	62264	62271	0 %	25 %	50 %	25 %	526218070
113	NC_021820	CTGG	2	8	63005	63012	0 %	25 %	50 %	25 %	526218070
114	NC_021820	TGGC	2	8	63144	63151	0 %	25 %	50 %	25 %	526218070
115	NC_021820	CTGA	2	8	63369	63376	25 %	25 %	25 %	25 %	526218070
116	NC_021820	GGCA	2	8	65173	65180	25 %	0 %	50 %	25 %	526218071
117	NC_021820	TGAT	2	8	65362	65369	25 %	50 %	25 %	0 %	526218071
118	NC_021820	ATTT	2	8	65635	65642	25 %	75 %	0 %	0 %	526218072
119	NC_021820	GATT	2	8	65999	66006	25 %	50 %	25 %	0 %	526218072
120	NC_021820	CAGC	2	8	66387	66394	25 %	0 %	25 %	50 %	526218072
121	NC_021820	CGCC	2	8	66541	66548	0 %	0 %	25 %	75 %	526218073
122	NC_021820	TGCT	2	8	66792	66799	0 %	50 %	25 %	25 %	526218074
123	NC_021820	ATTT	2	8	67427	67434	25 %	75 %	0 %	0 %	526218074
124	NC_021820	AGAT	2	8	67463	67470	50 %	25 %	25 %	0 %	526218074
125	NC_021820	ACTT	2	8	67905	67912	25 %	50 %	0 %	25 %	526218075
126	NC_021820	TAAG	2	8	68534	68541	50 %	25 %	25 %	0 %	526218075
127	NC_021820	ATCA	2	8	68794	68801	50 %	25 %	0 %	25 %	526218075
128	NC_021820	TGAG	2	8	69050	69057	25 %	25 %	50 %	0 %	526218075
129	NC_021820	TGGC	2	8	69815	69822	0 %	25 %	50 %	25 %	526218075
130	NC_021820	ATGG	2	8	70584	70591	25 %	25 %	50 %	0 %	526218077
131	NC_021820	ACCC	2	8	71132	71139	25 %	0 %	0 %	75 %	526218077
132	NC_021820	GCCA	2	8	71333	71340	25 %	0 %	25 %	50 %	526218077
133	NC_021820	GCTG	2	8	71901	71908	0 %	25 %	50 %	25 %	526218078
134	NC_021820	GCGG	2	8	72109	72116	0 %	0 %	75 %	25 %	526218078
135	NC_021820	TCGC	2	8	72404	72411	0 %	25 %	25 %	50 %	526218078
136	NC_021820	ATCT	2	8	72528	72535	25 %	50 %	0 %	25 %	526218078
137	NC_021820	CCGT	2	8	73139	73146	0 %	25 %	25 %	50 %	526218078
138	NC_021820	GATT	2	8	73398	73405	25 %	50 %	25 %	0 %	526218078
139	NC_021820	AACA	2	8	74083	74090	75 %	0 %	0 %	25 %	526218078
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