MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021820	ATT	2	6	63777	63782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218071
1002	NC_021820	TGC	2	6	63887	63892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218071
1003	NC_021820	CGT	2	6	63902	63907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218071
1004	NC_021820	GCC	2	6	63915	63920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218071
1005	NC_021820	GGC	2	6	63926	63931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218071
1006	NC_021820	GGC	2	6	64076	64081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218071
1007	NC_021820	CTG	2	6	64152	64157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218071
1008	NC_021820	TCC	2	6	64168	64173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218071
1009	NC_021820	CGC	2	6	64253	64258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218071
1010	NC_021820	TTA	2	6	64270	64275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218071
1011	NC_021820	CTA	2	6	64280	64285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218071
1012	NC_021820	CTCGC	2	10	64302	64311	0 %	20 %	20 %	60 %	526218071
1013	NC_021820	CTG	2	6	64320	64325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218071
1014	NC_021820	GCC	2	6	64343	64348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218071
1015	NC_021820	CG	3	6	64450	64455	0 %	0 %	50 %	50 %	526218071
1016	NC_021820	TAA	2	6	64511	64516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218071
1017	NC_021820	TGA	2	6	64615	64620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218071
1018	NC_021820	ATG	2	6	64623	64628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218071
1019	NC_021820	CAG	2	6	64665	64670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218071
1020	NC_021820	CAG	2	6	64740	64745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218071
1021	NC_021820	GC	4	8	64756	64763	0 %	0 %	50 %	50 %	526218071
1022	NC_021820	A	6	6	64821	64826	100 %	0 %	0 %	0 %	526218071
1023	NC_021820	ATT	2	6	64830	64835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218071
1024	NC_021820	CTG	2	6	64842	64847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218071
1025	NC_021820	CCG	2	6	64920	64925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218071
1026	NC_021820	TGT	2	6	64991	64996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218071
1027	NC_021820	GAA	2	6	65067	65072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218071
1028	NC_021820	CGC	3	9	65083	65091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218071
1029	NC_021820	ACGAA	2	10	65105	65114	60 %	0 %	20 %	20 %	526218071
1030	NC_021820	CTG	2	6	65151	65156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218071
1031	NC_021820	GGCA	2	8	65173	65180	25 %	0 %	50 %	25 %	526218071
1032	NC_021820	CG	3	6	65188	65193	0 %	0 %	50 %	50 %	526218071
1033	NC_021820	CAG	2	6	65222	65227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218071
1034	NC_021820	ATG	2	6	65272	65277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218071
1035	NC_021820	TGAT	2	8	65362	65369	25 %	50 %	25 %	0 %	526218071
1036	NC_021820	ACG	2	6	65579	65584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218072
1037	NC_021820	TC	3	6	65595	65600	0 %	50 %	0 %	50 %	526218072
1038	NC_021820	TCA	2	6	65606	65611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218072
1039	NC_021820	CGCTGC	2	12	65618	65629	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	526218072
1040	NC_021820	ATTT	2	8	65635	65642	25 %	75 %	0 %	0 %	526218072
1041	NC_021820	GCCAGC	2	12	65644	65655	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526218072
1042	NC_021820	GGC	2	6	65782	65787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218072
1043	NC_021820	CAC	2	6	65817	65822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218072
1044	NC_021820	CAG	2	6	65845	65850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218072
1045	NC_021820	CAG	2	6	65881	65886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218072
1046	NC_021820	GC	3	6	65914	65919	0 %	0 %	50 %	50 %	526218072
1047	NC_021820	GATGCA	2	12	65964	65975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526218072
1048	NC_021820	AGC	2	6	65984	65989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218072
1049	NC_021820	GATT	2	8	65999	66006	25 %	50 %	25 %	0 %	526218072
1050	NC_021820	CTA	2	6	66016	66021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218072
1051	NC_021820	CG	3	6	66073	66078	0 %	0 %	50 %	50 %	526218072
1052	NC_021820	TGA	2	6	66105	66110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218072
1053	NC_021820	CGC	2	6	66117	66122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218072
1054	NC_021820	CG	3	6	66131	66136	0 %	0 %	50 %	50 %	526218072
1055	NC_021820	TGAAAG	2	12	66275	66286	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	526218072
1056	NC_021820	GCC	2	6	66329	66334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218072
1057	NC_021820	CGC	2	6	66373	66378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218072
1058	NC_021820	CAGC	2	8	66387	66394	25 %	0 %	25 %	50 %	526218072
1059	NC_021820	GCG	2	6	66436	66441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218073
1060	NC_021820	A	6	6	66489	66494	100 %	0 %	0 %	0 %	526218073
1061	NC_021820	CGCC	2	8	66541	66548	0 %	0 %	25 %	75 %	526218073
1062	NC_021820	CGG	2	6	66585	66590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218073
1063	NC_021820	CTG	2	6	66662	66667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218073
1064	NC_021820	CAG	2	6	66688	66693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218073
1065	NC_021820	CCA	2	6	66736	66741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218073
1066	NC_021820	CCT	2	6	66769	66774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218074
1067	NC_021820	GTG	2	6	66775	66780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218074
1068	NC_021820	TGCT	2	8	66792	66799	0 %	50 %	25 %	25 %	526218074
1069	NC_021820	TCA	2	6	66854	66859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218074
1070	NC_021820	AGC	2	6	66874	66879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218074
1071	NC_021820	TGA	2	6	66901	66906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218074
1072	NC_021820	CAA	2	6	66945	66950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218074
1073	NC_021820	CG	3	6	67061	67066	0 %	0 %	50 %	50 %	526218074
1074	NC_021820	CG	3	6	67088	67093	0 %	0 %	50 %	50 %	526218074
1075	NC_021820	TCA	2	6	67132	67137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218074
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1078	NC_021820	CGC	2	6	67265	67270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218074
1079	NC_021820	CGC	2	6	67286	67291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218074
1080	NC_021820	AGA	2	6	67304	67309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218074
1081	NC_021820	GTC	2	6	67311	67316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218074
1082	NC_021820	TCG	2	6	67390	67395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218074
1083	NC_021820	ATTT	2	8	67427	67434	25 %	75 %	0 %	0 %	526218074
1084	NC_021820	GCG	2	6	67457	67462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218074
1085	NC_021820	AGAT	2	8	67463	67470	50 %	25 %	25 %	0 %	526218074
1086	NC_021820	CAC	2	6	67483	67488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218074
1087	NC_021820	A	6	6	67512	67517	100 %	0 %	0 %	0 %	526218074
1088	NC_021820	ACC	2	6	67519	67524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218074
1089	NC_021820	CG	3	6	67576	67581	0 %	0 %	50 %	50 %	526218074
1090	NC_021820	CG	3	6	67592	67597	0 %	0 %	50 %	50 %	526218074
1091	NC_021820	GCG	2	6	67627	67632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218074
1092	NC_021820	AAT	2	6	67633	67638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218074
1093	NC_021820	AAG	2	6	67670	67675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218075
1094	NC_021820	CAC	2	6	67696	67701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218075
1095	NC_021820	CAC	2	6	67756	67761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218075
1096	NC_021820	TGC	2	6	67775	67780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1097	NC_021820	CG	3	6	67798	67803	0 %	0 %	50 %	50 %	526218075
1098	NC_021820	CAG	2	6	67888	67893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1099	NC_021820	ACTT	2	8	67905	67912	25 %	50 %	0 %	25 %	526218075
1100	NC_021820	CCG	2	6	67926	67931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218075
1101	NC_021820	GCC	2	6	67969	67974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218075
1102	NC_021820	ACC	2	6	68021	68026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218075
1103	NC_021820	GCC	2	6	68077	68082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218075
1104	NC_021820	GCA	2	6	68124	68129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1105	NC_021820	TGGCG	2	10	68218	68227	0 %	20 %	60 %	20 %	526218075
1106	NC_021820	GTT	2	6	68230	68235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218075
1107	NC_021820	CAG	2	6	68248	68253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1108	NC_021820	GCT	2	6	68271	68276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1109	NC_021820	GC	4	8	68359	68366	0 %	0 %	50 %	50 %	526218075
1110	NC_021820	AG	3	6	68416	68421	50 %	0 %	50 %	0 %	526218075
1111	NC_021820	TGC	2	6	68466	68471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1112	NC_021820	TAAG	2	8	68534	68541	50 %	25 %	25 %	0 %	526218075
1113	NC_021820	CAG	2	6	68587	68592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1114	NC_021820	CAC	2	6	68656	68661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218075
1115	NC_021820	CG	3	6	68670	68675	0 %	0 %	50 %	50 %	526218075
1116	NC_021820	TCC	2	6	68678	68683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218075
1117	NC_021820	ACC	2	6	68714	68719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218075
1118	NC_021820	CGG	2	6	68769	68774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218075
1119	NC_021820	ATCA	2	8	68794	68801	50 %	25 %	0 %	25 %	526218075
1120	NC_021820	AG	3	6	68872	68877	50 %	0 %	50 %	0 %	526218075
1121	NC_021820	CAG	2	6	68917	68922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1122	NC_021820	GC	4	8	68956	68963	0 %	0 %	50 %	50 %	526218075
1123	NC_021820	TGG	2	6	68967	68972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218075
1124	NC_021820	GCA	3	9	68976	68984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1125	NC_021820	TCG	2	6	69041	69046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1126	NC_021820	TGAG	2	8	69050	69057	25 %	25 %	50 %	0 %	526218075
1127	NC_021820	GCA	2	6	69075	69080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1128	NC_021820	AAT	2	6	69136	69141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218075
1129	NC_021820	TGC	2	6	69191	69196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1130	NC_021820	GGC	2	6	69214	69219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218075
1131	NC_021820	GAC	3	9	69237	69245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1132	NC_021820	CTG	2	6	69268	69273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1133	NC_021820	AAC	2	6	69323	69328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218075
1134	NC_021820	GC	5	10	69370	69379	0 %	0 %	50 %	50 %	526218075
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1140	NC_021820	ATA	2	6	69677	69682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218075
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1142	NC_021820	CGGTT	2	10	69699	69708	0 %	40 %	40 %	20 %	526218075
1143	NC_021820	CTC	2	6	69721	69726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218075
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1145	NC_021820	CTG	2	6	69808	69813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218075
1146	NC_021820	TGGC	2	8	69815	69822	0 %	25 %	50 %	25 %	526218075
1147	NC_021820	AGC	2	6	69830	69835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218075
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1149	NC_021820	GCC	2	6	70264	70269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218076
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1154	NC_021820	ACCGC	2	10	70557	70566	20 %	0 %	20 %	60 %	526218077
1155	NC_021820	ATGG	2	8	70584	70591	25 %	25 %	50 %	0 %	526218077
1156	NC_021820	GCG	2	6	70614	70619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218077
1157	NC_021820	CCCAGT	2	12	70728	70739	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526218077
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1159	NC_021820	TA	3	6	70780	70785	50 %	50 %	0 %	0 %	526218077
1160	NC_021820	GCC	2	6	70838	70843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218077
1161	NC_021820	CAG	2	6	70880	70885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218077
1162	NC_021820	TGC	2	6	70891	70896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218077
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1164	NC_021820	GCT	2	6	70928	70933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218077
1165	NC_021820	CAT	2	6	70967	70972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218077
1166	NC_021820	GCA	2	6	71032	71037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218077
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1231	NC_021820	AACA	2	8	74083	74090	75 %	0 %	0 %	25 %	526218078
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1237	NC_021820	CTG	2	6	74203	74208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218078
1238	NC_021820	TGAACT	2	12	74214	74225	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526218078
1239	NC_021820	GC	3	6	74288	74293	0 %	0 %	50 %	50 %	526218079
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1242	NC_021820	ATCT	2	8	74350	74357	25 %	50 %	0 %	25 %	526218079
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1246	NC_021820	TGG	2	6	74442	74447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218079
1247	NC_021820	AAG	2	6	74448	74453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218079
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1249	NC_021820	A	6	6	74537	74542	100 %	0 %	0 %	0 %	526218079
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1251	NC_021820	CTG	2	6	74591	74596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218079
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1492	NC_021820	CCA	2	6	86662	86667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218087
1493	NC_021820	TCG	2	6	86712	86717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218087
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1496	NC_021820	CAGA	2	8	86888	86895	50 %	0 %	25 %	25 %	526218087
1497	NC_021820	ATC	2	6	86897	86902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218087
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1500	NC_021820	GCA	2	6	87088	87093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218087

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