MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_021820	TTC	2	6	510985	510990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218411
9502	NC_021820	ATC	2	6	511054	511059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218412
9503	NC_021820	CCA	2	6	511097	511102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218412
9504	NC_021820	CCG	2	6	511172	511177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218412
9505	NC_021820	GGCGAT	2	12	511182	511193	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	526218412
9506	NC_021820	GCG	2	6	511199	511204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218412
9507	NC_021820	ATC	2	6	511207	511212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218412
9508	NC_021820	CGC	2	6	511239	511244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218412
9509	NC_021820	TGC	2	6	511273	511278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218412
9510	NC_021820	AG	3	6	511294	511299	50 %	0 %	50 %	0 %	526218412
9511	NC_021820	CAGC	2	8	511347	511354	25 %	0 %	25 %	50 %	526218412
9512	NC_021820	GAA	2	6	511368	511373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218412
9513	NC_021820	GAA	2	6	511417	511422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218412
9514	NC_021820	TGC	2	6	511502	511507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218412
9515	NC_021820	ACA	2	6	511556	511561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218412
9516	NC_021820	CCG	2	6	511616	511621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218412
9517	NC_021820	CGG	2	6	511647	511652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218412
9518	NC_021820	GC	3	6	511712	511717	0 %	0 %	50 %	50 %	526218412
9519	NC_021820	AAC	2	6	511729	511734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218412
9520	NC_021820	CGG	2	6	511743	511748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218412
9521	NC_021820	AG	3	6	511757	511762	50 %	0 %	50 %	0 %	526218412
9522	NC_021820	AC	3	6	511920	511925	50 %	0 %	0 %	50 %	526218412
9523	NC_021820	GAT	2	6	511944	511949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218412
9524	NC_021820	GCC	2	6	512007	512012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218412
9525	NC_021820	TTTC	2	8	512036	512043	0 %	75 %	0 %	25 %	526218412
9526	NC_021820	CGC	2	6	512045	512050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218412
9527	NC_021820	GAC	2	6	512111	512116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218412
9528	NC_021820	CAG	2	6	512265	512270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218412
9529	NC_021820	CGG	2	6	512273	512278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218412
9530	NC_021820	GC	3	6	512291	512296	0 %	0 %	50 %	50 %	526218412
9531	NC_021820	AAT	2	6	512394	512399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218412
9532	NC_021820	GAT	2	6	512448	512453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218412
9533	NC_021820	AGA	2	6	512480	512485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218412
9534	NC_021820	CAG	2	6	512535	512540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218412
9535	NC_021820	ACC	2	6	512560	512565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218412
9536	NC_021820	AGA	2	6	512618	512623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218412
9537	NC_021820	GCGAT	2	10	512636	512645	20 %	20 %	40 %	20 %	526218412
9538	NC_021820	CCG	2	6	512669	512674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218412
9539	NC_021820	TTG	2	6	512685	512690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218412
9540	NC_021820	GCCATC	2	12	513194	513205	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526218413
9541	NC_021820	CCG	2	6	513218	513223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
9542	NC_021820	T	6	6	513270	513275	0 %	100 %	0 %	0 %	526218413
9543	NC_021820	CTT	2	6	513294	513299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218413
9544	NC_021820	CCG	2	6	513348	513353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
9545	NC_021820	GTG	2	6	513374	513379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9546	NC_021820	GTT	2	6	513499	513504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218413
9547	NC_021820	GTT	2	6	513534	513539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218413
9548	NC_021820	AGA	2	6	513544	513549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218413
9549	NC_021820	GACA	2	8	513553	513560	50 %	0 %	25 %	25 %	526218413
9550	NC_021820	GCA	2	6	513617	513622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218413
9551	NC_021820	AGAGCC	2	12	513625	513636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218413
9552	NC_021820	CGC	2	6	513874	513879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
9553	NC_021820	GT	3	6	513945	513950	0 %	50 %	50 %	0 %	526218413
9554	NC_021820	TGT	2	6	513954	513959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218413
9555	NC_021820	AGTC	2	8	513969	513976	25 %	25 %	25 %	25 %	526218413
9556	NC_021820	CGC	2	6	513981	513986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
9557	NC_021820	GCGT	2	8	514036	514043	0 %	25 %	50 %	25 %	526218413
9558	NC_021820	ACCAAT	2	12	514096	514107	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	526218413
9559	NC_021820	TCT	2	6	514175	514180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218413
9560	NC_021820	GTA	2	6	514198	514203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218413
9561	NC_021820	GTA	2	6	514214	514219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218413
9562	NC_021820	CT	3	6	514348	514353	0 %	50 %	0 %	50 %	526218413
9563	NC_021820	TGT	2	6	514357	514362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218413
9564	NC_021820	CAC	2	6	514375	514380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218413
9565	NC_021820	TTG	2	6	514389	514394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218413
9566	NC_021820	TGC	4	12	514470	514481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218413
9567	NC_021820	CGT	2	6	514524	514529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218413
9568	NC_021820	CTG	2	6	514755	514760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218413
9569	NC_021820	TGGC	2	8	514796	514803	0 %	25 %	50 %	25 %	526218413
9570	NC_021820	TGGT	2	8	514907	514914	0 %	50 %	50 %	0 %	526218413
9571	NC_021820	CGG	2	6	514968	514973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218413
9572	NC_021820	TGG	2	6	515136	515141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9573	NC_021820	GGC	2	6	515146	515151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218413
9574	NC_021820	AAC	2	6	515192	515197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218413
9575	NC_021820	TTC	2	6	515224	515229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218413
9576	NC_021820	GCA	2	6	515243	515248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218413
9577	NC_021820	TAC	2	6	515271	515276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218413
9578	NC_021820	TGGC	2	8	515282	515289	0 %	25 %	50 %	25 %	526218413
9579	NC_021820	GAAC	2	8	515293	515300	50 %	0 %	25 %	25 %	526218413
9580	NC_021820	GTT	2	6	515303	515308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218413
9581	NC_021820	TGGT	2	8	515393	515400	0 %	50 %	50 %	0 %	526218413
9582	NC_021820	CGC	2	6	515455	515460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
9583	NC_021820	CAT	2	6	515535	515540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218413
9584	NC_021820	GTG	2	6	515549	515554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9585	NC_021820	GTT	2	6	515569	515574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218413
9586	NC_021820	TGG	2	6	515580	515585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9587	NC_021820	TGG	2	6	515589	515594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9588	NC_021820	GTG	2	6	515603	515608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9589	NC_021820	TGAT	2	8	515612	515619	25 %	50 %	25 %	0 %	526218413
9590	NC_021820	TGG	2	6	515631	515636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9591	NC_021820	TGG	2	6	515670	515675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9592	NC_021820	AAC	2	6	515678	515683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218413
9593	NC_021820	CGC	2	6	515728	515733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
9594	NC_021820	CAT	2	6	515808	515813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218413
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9596	NC_021820	GTT	2	6	515842	515847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218413
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9598	NC_021820	TGG	2	6	515862	515867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9599	NC_021820	GTG	2	6	515876	515881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9600	NC_021820	TGAT	2	8	515885	515892	25 %	50 %	25 %	0 %	526218413
9601	NC_021820	TGG	2	6	515904	515909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9602	NC_021820	AAC	2	6	515951	515956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218413
9603	NC_021820	CGC	2	6	516001	516006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
9604	NC_021820	CAT	2	6	516081	516086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218413
9605	NC_021820	GTG	2	6	516095	516100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9606	NC_021820	TGG	2	6	516126	516131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9607	NC_021820	TGG	2	6	516135	516140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9608	NC_021820	GTG	2	6	516149	516154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9609	NC_021820	TGAT	2	8	516158	516165	25 %	50 %	25 %	0 %	526218413
9610	NC_021820	GGC	2	6	516178	516183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218413
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9612	NC_021820	TGG	2	6	516261	516266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
9613	NC_021820	CAG	2	6	516273	516278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218413
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9615	NC_021820	CGC	2	6	516358	516363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
9616	NC_021820	CTAC	2	8	516506	516513	25 %	25 %	0 %	50 %	526218413
9617	NC_021820	CCG	2	6	516587	516592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
9618	NC_021820	GTCG	2	8	516594	516601	0 %	25 %	50 %	25 %	526218413
9619	NC_021820	TGG	2	6	516654	516659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
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9621	NC_021820	AGC	2	6	516802	516807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218413
9622	NC_021820	GTC	2	6	516811	516816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218413
9623	NC_021820	CCATTG	2	12	516924	516935	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526218413
9624	NC_021820	GCG	2	6	517097	517102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218413
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9982	NC_021820	TGC	2	6	536283	536288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218428
9983	NC_021820	CAGC	2	8	536341	536348	25 %	0 %	25 %	50 %	526218428
9984	NC_021820	AGC	2	6	536359	536364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218428
9985	NC_021820	TCC	2	6	536370	536375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218428
9986	NC_021820	GGGCC	2	10	536440	536449	0 %	0 %	60 %	40 %	526218428
9987	NC_021820	GC	3	6	536554	536559	0 %	0 %	50 %	50 %	526218428
9988	NC_021820	TGC	2	6	536614	536619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218428
9989	NC_021820	A	8	8	536636	536643	100 %	0 %	0 %	0 %	526218428
9990	NC_021820	TGAT	2	8	536679	536686	25 %	50 %	25 %	0 %	526218428
9991	NC_021820	AG	3	6	536696	536701	50 %	0 %	50 %	0 %	526218428
9992	NC_021820	GGA	2	6	536738	536743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218428
9993	NC_021820	GGCT	2	8	536749	536756	0 %	25 %	50 %	25 %	526218428
9994	NC_021820	GCC	2	6	536933	536938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218428
9995	NC_021820	GAC	2	6	536939	536944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218428
9996	NC_021820	CGC	2	6	536954	536959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218428
9997	NC_021820	GGC	2	6	536972	536977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218428
9998	NC_021820	CAC	2	6	537017	537022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218428
9999	NC_021820	GC	3	6	537031	537036	0 %	0 %	50 %	50 %	526218428
10000	NC_021820	TGT	2	6	537097	537102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218428

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