MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021820	GCT	2	6	29045	29050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218050
502	NC_021820	GCAT	2	8	29083	29090	25 %	25 %	25 %	25 %	526218050
503	NC_021820	TCA	2	6	29095	29100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218050
504	NC_021820	GGT	2	6	29105	29110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218050
505	NC_021820	CATGTA	2	12	29121	29132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526218050
506	NC_021820	CAG	2	6	29220	29225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218050
507	NC_021820	CTT	2	6	29240	29245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218050
508	NC_021820	GCA	2	6	29306	29311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218050
509	NC_021820	TCA	2	6	29314	29319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218050
510	NC_021820	CTG	3	9	29409	29417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218050
511	NC_021820	GAC	2	6	29609	29614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218050
512	NC_021820	TCG	2	6	29695	29700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218050
513	NC_021820	GCTTC	2	10	29720	29729	0 %	40 %	20 %	40 %	526218050
514	NC_021820	T	6	6	29733	29738	0 %	100 %	0 %	0 %	526218050
515	NC_021820	GTT	2	6	29777	29782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218050
516	NC_021820	TCG	2	6	29803	29808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218050
517	NC_021820	CCAG	2	8	29822	29829	25 %	0 %	25 %	50 %	526218050
518	NC_021820	CG	3	6	29834	29839	0 %	0 %	50 %	50 %	526218050
519	NC_021820	CGC	2	6	29867	29872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218050
520	NC_021820	TTC	2	6	29928	29933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218050
521	NC_021820	T	6	6	29943	29948	0 %	100 %	0 %	0 %	526218050
522	NC_021820	AGA	2	6	30066	30071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218050
523	NC_021820	CGCA	2	8	30105	30112	25 %	0 %	25 %	50 %	526218050
524	NC_021820	ACGC	2	8	30301	30308	25 %	0 %	25 %	50 %	526218050
525	NC_021820	TGG	2	6	30326	30331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218050
526	NC_021820	ACA	2	6	30349	30354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218050
527	NC_021820	GGAC	2	8	30453	30460	25 %	0 %	50 %	25 %	526218050
528	NC_021820	CGC	2	6	30476	30481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218050
529	NC_021820	AC	3	6	30503	30508	50 %	0 %	0 %	50 %	526218050
530	NC_021820	CCA	2	6	30716	30721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218050
531	NC_021820	GC	3	6	30733	30738	0 %	0 %	50 %	50 %	526218050
532	NC_021820	ACC	2	6	30835	30840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218050
533	NC_021820	TCT	2	6	30922	30927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218050
534	NC_021820	CTT	2	6	30983	30988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218050
535	NC_021820	ACG	2	6	31038	31043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218050
536	NC_021820	ACG	2	6	31230	31235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218050
537	NC_021820	GTT	2	6	31260	31265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218050
538	NC_021820	GCTG	2	8	31286	31293	0 %	25 %	50 %	25 %	526218050
539	NC_021820	GCG	2	6	31315	31320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218050
540	NC_021820	AGAC	2	8	31377	31384	50 %	0 %	25 %	25 %	526218050
541	NC_021820	ACGGA	2	10	31450	31459	40 %	0 %	40 %	20 %	526218050
542	NC_021820	ACG	2	6	31461	31466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218050
543	NC_021820	GGT	2	6	31475	31480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218050
544	NC_021820	ATC	2	6	31485	31490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218050
545	NC_021820	CTT	2	6	31524	31529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218050
546	NC_021820	ATG	2	6	31540	31545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218050
547	NC_021820	TCG	2	6	31579	31584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218050
548	NC_021820	GCA	2	6	31586	31591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218050
549	NC_021820	GAA	2	6	31647	31652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218050
550	NC_021820	CGG	2	6	31689	31694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218050
551	NC_021820	CAT	2	6	31707	31712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218050
552	NC_021820	GC	3	6	31730	31735	0 %	0 %	50 %	50 %	526218050
553	NC_021820	CAG	2	6	31851	31856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218050
554	NC_021820	CGC	2	6	31878	31883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218050
555	NC_021820	GAC	2	6	31926	31931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218050
556	NC_021820	CG	3	6	32002	32007	0 %	0 %	50 %	50 %	526218050
557	NC_021820	ACG	2	6	32060	32065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218050
558	NC_021820	TGT	2	6	32111	32116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218050
559	NC_021820	GAC	2	6	32130	32135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218050
560	NC_021820	GTG	2	6	32167	32172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218050
561	NC_021820	GAT	2	6	32190	32195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218050
562	NC_021820	GCAG	2	8	32200	32207	25 %	0 %	50 %	25 %	526218050
563	NC_021820	TACG	2	8	32225	32232	25 %	25 %	25 %	25 %	526218050
564	NC_021820	CCAG	2	8	32264	32271	25 %	0 %	25 %	50 %	526218050
565	NC_021820	ATG	2	6	32287	32292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218050
566	NC_021820	CG	3	6	32293	32298	0 %	0 %	50 %	50 %	526218050
567	NC_021820	AGA	2	6	32348	32353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218050
568	NC_021820	CTT	2	6	32453	32458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218050
569	NC_021820	ACGGA	2	10	32650	32659	40 %	0 %	40 %	20 %	526218050
570	NC_021820	GCT	2	6	32662	32667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218050
571	NC_021820	T	6	6	32790	32795	0 %	100 %	0 %	0 %	526218050
572	NC_021820	AACTTC	2	12	33140	33151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218051
573	NC_021820	CTT	2	6	33160	33165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218051
574	NC_021820	T	6	6	33173	33178	0 %	100 %	0 %	0 %	526218051
575	NC_021820	CTT	2	6	33208	33213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218051
576	NC_021820	CTT	2	6	33250	33255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218051
577	NC_021820	CAG	2	6	33313	33318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218051
578	NC_021820	T	6	6	33343	33348	0 %	100 %	0 %	0 %	526218051
579	NC_021820	CAG	2	6	33352	33357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218051
580	NC_021820	CAG	2	6	33370	33375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218051
581	NC_021820	CTACAG	2	12	33376	33387	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526218051
582	NC_021820	CAG	4	12	33385	33396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218051
583	NC_021820	TTC	2	6	33413	33418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218051
584	NC_021820	CTT	2	6	33574	33579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218052
585	NC_021820	CAG	2	6	33592	33597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218052
586	NC_021820	CTT	2	6	33628	33633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218052
587	NC_021820	CTT	2	6	33661	33666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218052
588	NC_021820	AGC	3	9	33785	33793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218052
589	NC_021820	CAA	2	6	33832	33837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218052
590	NC_021820	ACG	2	6	33873	33878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218052
591	NC_021820	GCA	2	6	33883	33888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218052
592	NC_021820	AAC	2	6	33899	33904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218052
593	NC_021820	ACT	2	6	33984	33989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218052
594	NC_021820	GC	3	6	33997	34002	0 %	0 %	50 %	50 %	526218052
595	NC_021820	CAA	2	6	34027	34032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218052
596	NC_021820	TTGT	2	8	34037	34044	0 %	75 %	25 %	0 %	526218052
597	NC_021820	TGG	3	9	34536	34544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218053
598	NC_021820	T	6	6	34594	34599	0 %	100 %	0 %	0 %	526218053
599	NC_021820	CAG	2	6	34609	34614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218053
600	NC_021820	TTTC	2	8	34626	34633	0 %	75 %	0 %	25 %	526218053
601	NC_021820	TGG	2	6	34665	34670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218053
602	NC_021820	GAT	2	6	34675	34680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218053
603	NC_021820	ACCTG	2	10	34706	34715	20 %	20 %	20 %	40 %	526218053
604	NC_021820	CG	3	6	34785	34790	0 %	0 %	50 %	50 %	526218053
605	NC_021820	CAA	2	6	34815	34820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218053
606	NC_021820	AAC	2	6	34846	34851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218053
607	NC_021820	TACC	2	8	34899	34906	25 %	25 %	0 %	50 %	526218053
608	NC_021820	CAG	2	6	34917	34922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218053
609	NC_021820	GCT	2	6	34928	34933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218053
610	NC_021820	CAG	2	6	35098	35103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218053
611	NC_021820	TCC	2	6	35195	35200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218054
612	NC_021820	CTTTGT	2	12	35328	35339	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	526218054
613	NC_021820	T	6	6	35374	35379	0 %	100 %	0 %	0 %	526218054
614	NC_021820	CAG	2	6	35380	35385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218054
615	NC_021820	TAA	2	6	35442	35447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218054
616	NC_021820	ATG	2	6	35513	35518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218054
617	NC_021820	CTG	2	6	35527	35532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218054
618	NC_021820	CGG	2	6	35551	35556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218054
619	NC_021820	CTGA	2	8	35792	35799	25 %	25 %	25 %	25 %	526218055
620	NC_021820	CTT	2	6	35872	35877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218055
621	NC_021820	CGT	2	6	35908	35913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218055
622	NC_021820	CTG	2	6	35972	35977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218055
623	NC_021820	CTT	2	6	36001	36006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218055
624	NC_021820	CCG	2	6	36039	36044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218055
625	NC_021820	CGT	2	6	36091	36096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218055
626	NC_021820	GAA	2	6	36128	36133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218055
627	NC_021820	GCC	2	6	36158	36163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218055
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629	NC_021820	ACG	2	6	36288	36293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218055
630	NC_021820	CGA	2	6	36416	36421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218056
631	NC_021820	GTG	2	6	36427	36432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218056
632	NC_021820	GTC	2	6	36520	36525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218056
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640	NC_021820	CAA	2	6	36954	36959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221722
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731	NC_021820	GCC	2	6	48695	48700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221723
732	NC_021820	TCA	2	6	48706	48711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221723
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738	NC_021820	AGG	2	6	49386	49391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218060
739	NC_021820	GAC	2	6	49449	49454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218060
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745	NC_021820	TCATC	2	10	49671	49680	20 %	40 %	0 %	40 %	526218060
746	NC_021820	ATCA	2	8	49828	49835	50 %	25 %	0 %	25 %	526218060
747	NC_021820	GCG	2	6	49836	49841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218060
748	NC_021820	CGT	2	6	49860	49865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218060
749	NC_021820	CACG	2	8	49893	49900	25 %	0 %	25 %	50 %	526218060
750	NC_021820	CG	3	6	50151	50156	0 %	0 %	50 %	50 %	526218060
751	NC_021820	CGC	2	6	50175	50180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218060
752	NC_021820	AT	3	6	50222	50227	50 %	50 %	0 %	0 %	526218060
753	NC_021820	CGG	2	6	50268	50273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218060
754	NC_021820	ACGC	2	8	50299	50306	25 %	0 %	25 %	50 %	526218060
755	NC_021820	TCAA	2	8	50309	50316	50 %	25 %	0 %	25 %	526218060
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786	NC_021820	GAA	2	6	52209	52214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218062
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999	NC_021820	CTGGG	2	10	63726	63735	0 %	20 %	60 %	20 %	526218071
1000	NC_021820	CCT	2	6	63764	63769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218071

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