MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_021820	CTT	2	6	485088	485093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218390
9003	NC_021820	TGA	2	6	485161	485166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218391
9004	NC_021820	TAA	3	9	485170	485178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218391
9005	NC_021820	TGA	2	6	485179	485184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218391
9006	NC_021820	TGA	2	6	485212	485217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218391
9007	NC_021820	AAT	2	6	485267	485272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218391
9008	NC_021820	CGCT	2	8	485277	485284	0 %	25 %	25 %	50 %	526218391
9009	NC_021820	ATT	2	6	485291	485296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218391
9010	NC_021820	AT	3	6	485326	485331	50 %	50 %	0 %	0 %	526218391
9011	NC_021820	TTA	2	6	485376	485381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218391
9012	NC_021820	AAG	2	6	485468	485473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218391
9013	NC_021820	TGT	2	6	485503	485508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218391
9014	NC_021820	AGA	2	6	485553	485558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218391
9015	NC_021820	TCCA	2	8	485585	485592	25 %	25 %	0 %	50 %	526218391
9016	NC_021820	GA	3	6	485606	485611	50 %	0 %	50 %	0 %	526218391
9017	NC_021820	GGT	2	6	485633	485638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218391
9018	NC_021820	A	6	6	485858	485863	100 %	0 %	0 %	0 %	526218391
9019	NC_021820	TAAT	2	8	485874	485881	50 %	50 %	0 %	0 %	526218391
9020	NC_021820	ATA	2	6	485883	485888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218391
9021	NC_021820	TAT	2	6	485957	485962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218391
9022	NC_021820	AAG	2	6	486032	486037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218391
9023	NC_021820	TCT	2	6	486049	486054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218391
9024	NC_021820	ATT	2	6	486066	486071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218391
9025	NC_021820	CTGG	2	8	486083	486090	0 %	25 %	50 %	25 %	526218391
9026	NC_021820	AAT	2	6	486123	486128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218391
9027	NC_021820	ATT	2	6	486153	486158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221794
9028	NC_021820	A	7	7	486160	486166	100 %	0 %	0 %	0 %	526221794
9029	NC_021820	A	6	6	486192	486197	100 %	0 %	0 %	0 %	526221794
9030	NC_021820	ATC	2	6	486244	486249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221794
9031	NC_021820	TTA	2	6	486253	486258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221794
9032	NC_021820	AGA	2	6	486275	486280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221794
9033	NC_021820	AT	3	6	486317	486322	50 %	50 %	0 %	0 %	526221794
9034	NC_021820	A	6	6	486347	486352	100 %	0 %	0 %	0 %	526221794
9035	NC_021820	TAC	2	6	486390	486395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221794
9036	NC_021820	TCA	2	6	486407	486412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221794
9037	NC_021820	GCG	2	6	486425	486430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221794
9038	NC_021820	GCG	2	6	486441	486446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221794
9039	NC_021820	CTG	2	6	486462	486467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221794
9040	NC_021820	TGA	2	6	486505	486510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221794
9041	NC_021820	TTG	2	6	486538	486543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221794
9042	NC_021820	AT	3	6	486591	486596	50 %	50 %	0 %	0 %	526221794
9043	NC_021820	ATGGT	2	10	486610	486619	20 %	40 %	40 %	0 %	526221794
9044	NC_021820	GA	3	6	486764	486769	50 %	0 %	50 %	0 %	526221794
9045	NC_021820	A	6	6	486798	486803	100 %	0 %	0 %	0 %	526221794
9046	NC_021820	CGT	2	6	486819	486824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221794
9047	NC_021820	TAT	2	6	487069	487074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218392
9048	NC_021820	TTTC	2	8	487076	487083	0 %	75 %	0 %	25 %	526218392
9049	NC_021820	CGC	2	6	487104	487109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218392
9050	NC_021820	TCC	2	6	487215	487220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218392
9051	NC_021820	TCG	2	6	487222	487227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218392
9052	NC_021820	CAGT	2	8	487258	487265	25 %	25 %	25 %	25 %	526218392
9053	NC_021820	GAT	2	6	487307	487312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218392
9054	NC_021820	AT	3	6	487318	487323	50 %	50 %	0 %	0 %	526218392
9055	NC_021820	GAA	2	6	487325	487330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218392
9056	NC_021820	ATT	2	6	487340	487345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218392
9057	NC_021820	AAATT	2	10	487386	487395	60 %	40 %	0 %	0 %	526218392
9058	NC_021820	CTGG	2	8	487460	487467	0 %	25 %	50 %	25 %	526218392
9059	NC_021820	TAT	2	6	487558	487563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218392
9060	NC_021820	T	6	6	487667	487672	0 %	100 %	0 %	0 %	526218392
9061	NC_021820	A	6	6	487684	487689	100 %	0 %	0 %	0 %	526218392
9062	NC_021820	GAT	2	6	487721	487726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218392
9063	NC_021820	ATT	2	6	487745	487750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218392
9064	NC_021820	AT	3	6	487753	487758	50 %	50 %	0 %	0 %	526218392
9065	NC_021820	AT	3	6	487784	487789	50 %	50 %	0 %	0 %	526218392
9066	NC_021820	TAT	2	6	487904	487909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218393
9067	NC_021820	A	7	7	487914	487920	100 %	0 %	0 %	0 %	526218393
9068	NC_021820	TCC	2	6	487952	487957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218393
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9071	NC_021820	ATA	2	6	488224	488229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218393
9072	NC_021820	AG	3	6	488253	488258	50 %	0 %	50 %	0 %	526218393
9073	NC_021820	ATG	2	6	488323	488328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218393
9074	NC_021820	CAGT	2	8	488345	488352	25 %	25 %	25 %	25 %	526218393
9075	NC_021820	GAA	2	6	488370	488375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218393
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9080	NC_021820	CGC	2	6	488657	488662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218393
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9083	NC_021820	GAA	2	6	488766	488771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218393
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9087	NC_021820	G	6	6	488835	488840	0 %	0 %	100 %	0 %	526218393
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9091	NC_021820	CAG	2	6	489128	489133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218394
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9093	NC_021820	CGA	2	6	489202	489207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218394
9094	NC_021820	GCTG	2	8	489269	489276	0 %	25 %	50 %	25 %	526218394
9095	NC_021820	TGA	2	6	489283	489288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218394
9096	NC_021820	TAT	2	6	489358	489363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218394
9097	NC_021820	TAT	2	6	489415	489420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218394
9098	NC_021820	CAT	2	6	489427	489432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218394
9099	NC_021820	CAT	2	6	489436	489441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218394
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9101	NC_021820	TTA	2	6	489573	489578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218394
9102	NC_021820	TAA	2	6	489611	489616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218394
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9104	NC_021820	A	7	7	489750	489756	100 %	0 %	0 %	0 %	526218394
9105	NC_021820	T	6	6	489771	489776	0 %	100 %	0 %	0 %	526218394
9106	NC_021820	AAT	2	6	489795	489800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218394
9107	NC_021820	TAT	2	6	489871	489876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218394
9108	NC_021820	CT	3	6	489897	489902	0 %	50 %	0 %	50 %	526218394
9109	NC_021820	TAA	2	6	489995	490000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218394
9110	NC_021820	TA	3	6	490003	490008	50 %	50 %	0 %	0 %	526218394
9111	NC_021820	AAG	2	6	490011	490016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218394
9112	NC_021820	CTTT	2	8	490050	490057	0 %	75 %	0 %	25 %	526218394
9113	NC_021820	ATA	2	6	490099	490104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218394
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9117	NC_021820	ATG	2	6	490309	490314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218394
9118	NC_021820	GTTCT	2	10	490409	490418	0 %	60 %	20 %	20 %	526218395
9119	NC_021820	AGC	2	6	490423	490428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218395
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9122	NC_021820	GCCA	2	8	490559	490566	25 %	0 %	25 %	50 %	526218395
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9124	NC_021820	CCT	2	6	490648	490653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218395
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9248	NC_021820	GCT	2	6	497910	497915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218400
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9251	NC_021820	GCG	2	6	498032	498037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218400
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9357	NC_021820	A	6	6	503528	503533	100 %	0 %	0 %	0 %	526221797
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9363	NC_021820	CACGC	2	10	503768	503777	20 %	0 %	20 %	60 %	526218405
9364	NC_021820	CAT	2	6	503842	503847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218405
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9366	NC_021820	AGT	2	6	503869	503874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218405
9367	NC_021820	GAA	2	6	503876	503881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218405
9368	NC_021820	GCC	2	6	503888	503893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218405
9369	NC_021820	CGG	2	6	503952	503957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218405
9370	NC_021820	CGC	2	6	503973	503978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218405
9371	NC_021820	CGC	2	6	504047	504052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218405
9372	NC_021820	GC	3	6	504051	504056	0 %	0 %	50 %	50 %	526218405
9373	NC_021820	TGG	2	6	504162	504167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218405
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9380	NC_021820	CGT	2	6	504346	504351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218405
9381	NC_021820	CGC	2	6	504366	504371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218405
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9398	NC_021820	AT	3	6	505435	505440	50 %	50 %	0 %	0 %	526218406
9399	NC_021820	ATT	2	6	505479	505484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218406
9400	NC_021820	AGGC	2	8	505523	505530	25 %	0 %	50 %	25 %	526218406
9401	NC_021820	CAG	2	6	505548	505553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218406
9402	NC_021820	AGAT	2	8	505591	505598	50 %	25 %	25 %	0 %	526218406
9403	NC_021820	CAAT	2	8	505631	505638	50 %	25 %	0 %	25 %	526218406
9404	NC_021820	CCG	2	6	505684	505689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218406
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9484	NC_021820	GCTG	2	8	510257	510264	0 %	25 %	50 %	25 %	526218410
9485	NC_021820	AAT	2	6	510269	510274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218410
9486	NC_021820	TCA	2	6	510350	510355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218411
9487	NC_021820	GTG	2	6	510368	510373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218411
9488	NC_021820	CAT	2	6	510394	510399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218411
9489	NC_021820	CG	3	6	510407	510412	0 %	0 %	50 %	50 %	526218411
9490	NC_021820	GTT	2	6	510456	510461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218411
9491	NC_021820	ATAC	2	8	510493	510500	50 %	25 %	0 %	25 %	526218411
9492	NC_021820	GGA	2	6	510520	510525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218411
9493	NC_021820	GAA	2	6	510538	510543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218411
9494	NC_021820	CAC	2	6	510565	510570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218411
9495	NC_021820	GGC	2	6	510700	510705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218411
9496	NC_021820	TGGCG	2	10	510729	510738	0 %	20 %	60 %	20 %	526218411
9497	NC_021820	TGC	2	6	510827	510832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218411
9498	NC_021820	CGC	3	9	510849	510857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218411
9499	NC_021820	GAC	2	6	510858	510863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218411
9500	NC_021820	CGG	2	6	510951	510956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218411

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