MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021820	CCA	2	6	302878	302883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218253
5502	NC_021820	TGC	2	6	302966	302971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218253
5503	NC_021820	TTA	2	6	303133	303138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221760
5504	NC_021820	TGA	2	6	303144	303149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221760
5505	NC_021820	ACC	2	6	303317	303322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221760
5506	NC_021820	GC	3	6	303353	303358	0 %	0 %	50 %	50 %	526221760
5507	NC_021820	CAG	2	6	303465	303470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221760
5508	NC_021820	GCTG	2	8	303471	303478	0 %	25 %	50 %	25 %	526221760
5509	NC_021820	GGC	2	6	303499	303504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221760
5510	NC_021820	CTG	2	6	303511	303516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221760
5511	NC_021820	CGC	2	6	303538	303543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221760
5512	NC_021820	T	6	6	303595	303600	0 %	100 %	0 %	0 %	526221760
5513	NC_021820	GAC	2	6	303658	303663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221760
5514	NC_021820	AGTC	2	8	303750	303757	25 %	25 %	25 %	25 %	526221760
5515	NC_021820	CAG	2	6	303766	303771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221760
5516	NC_021820	GTT	2	6	303826	303831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221760
5517	NC_021820	CAC	2	6	303844	303849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221760
5518	NC_021820	GAA	2	6	303904	303909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221760
5519	NC_021820	ATT	2	6	303913	303918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221760
5520	NC_021820	CAG	2	6	303990	303995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221760
5521	NC_021820	T	6	6	304012	304017	0 %	100 %	0 %	0 %	526221760
5522	NC_021820	GTT	2	6	304047	304052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218254
5523	NC_021820	TGT	2	6	304062	304067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218254
5524	NC_021820	CAC	2	6	304090	304095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218254
5525	NC_021820	ATC	2	6	304106	304111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218254
5526	NC_021820	AGG	2	6	304119	304124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218254
5527	NC_021820	ATT	2	6	304147	304152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218254
5528	NC_021820	CAA	2	6	304188	304193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218254
5529	NC_021820	ACC	2	6	304204	304209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218254
5530	NC_021820	GCC	2	6	304222	304227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218254
5531	NC_021820	CAC	2	6	304231	304236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218254
5532	NC_021820	GGC	2	6	304237	304242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218254
5533	NC_021820	CCG	2	6	304269	304274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218254
5534	NC_021820	AG	3	6	304288	304293	50 %	0 %	50 %	0 %	526218254
5535	NC_021820	GC	3	6	304294	304299	0 %	0 %	50 %	50 %	526218254
5536	NC_021820	ATG	2	6	304307	304312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218254
5537	NC_021820	CAGA	2	8	304380	304387	50 %	0 %	25 %	25 %	526218254
5538	NC_021820	CGC	2	6	304393	304398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218254
5539	NC_021820	GCA	2	6	304446	304451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218254
5540	NC_021820	GGC	2	6	304459	304464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218254
5541	NC_021820	GAC	2	6	304512	304517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218254
5542	NC_021820	CACGC	2	10	304597	304606	20 %	0 %	20 %	60 %	526218254
5543	NC_021820	AGC	2	6	304610	304615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218254
5544	NC_021820	ATC	2	6	304616	304621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218254
5545	NC_021820	CGA	2	6	304659	304664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218254
5546	NC_021820	CAGCGC	2	12	304696	304707	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526218254
5547	NC_021820	GGC	2	6	304708	304713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218254
5548	NC_021820	CGA	2	6	304743	304748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218254
5549	NC_021820	CAG	2	6	304777	304782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218254
5550	NC_021820	GATC	2	8	304797	304804	25 %	25 %	25 %	25 %	526218254
5551	NC_021820	GAA	2	6	304866	304871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218254
5552	NC_021820	ATT	2	6	304882	304887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218254
5553	NC_021820	A	6	6	304894	304899	100 %	0 %	0 %	0 %	526218254
5554	NC_021820	CAG	2	6	304936	304941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218254
5555	NC_021820	AAG	2	6	304963	304968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218254
5556	NC_021820	T	6	6	305018	305023	0 %	100 %	0 %	0 %	526218255
5557	NC_021820	CATG	2	8	305120	305127	25 %	25 %	25 %	25 %	526218255
5558	NC_021820	GAT	2	6	305130	305135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218255
5559	NC_021820	ATG	2	6	305182	305187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218255
5560	NC_021820	TCTT	2	8	305230	305237	0 %	75 %	0 %	25 %	526218255
5561	NC_021820	CGC	2	6	305252	305257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218255
5562	NC_021820	TCG	2	6	305266	305271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218255
5563	NC_021820	TCA	2	6	305294	305299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218255
5564	NC_021820	ACC	2	6	305331	305336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218255
5565	NC_021820	CTG	2	6	305409	305414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218255
5566	NC_021820	CAC	2	6	305577	305582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218255
5567	NC_021820	TCA	2	6	305642	305647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218255
5568	NC_021820	GCA	2	6	305702	305707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218255
5569	NC_021820	CAT	2	6	305717	305722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218255
5570	NC_021820	CAT	2	6	305817	305822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218255
5571	NC_021820	CGTCA	2	10	305892	305901	20 %	20 %	20 %	40 %	526218255
5572	NC_021820	AG	3	6	305989	305994	50 %	0 %	50 %	0 %	526218255
5573	NC_021820	TCGG	2	8	306019	306026	0 %	25 %	50 %	25 %	526218255
5574	NC_021820	ATG	2	6	306037	306042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218255
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5576	NC_021820	AG	3	6	306099	306104	50 %	0 %	50 %	0 %	526218255
5577	NC_021820	CCA	2	6	306110	306115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218255
5578	NC_021820	GGT	2	6	306155	306160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218255
5579	NC_021820	TGA	2	6	306271	306276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218255
5580	NC_021820	GGT	2	6	306321	306326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218255
5581	NC_021820	AAC	2	6	306343	306348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218255
5582	NC_021820	TCA	2	6	306386	306391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218255
5583	NC_021820	TGG	2	6	306392	306397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218255
5584	NC_021820	CCA	2	6	306419	306424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218255
5585	NC_021820	GA	3	6	306466	306471	50 %	0 %	50 %	0 %	526218255
5586	NC_021820	T	6	6	306622	306627	0 %	100 %	0 %	0 %	526218256
5587	NC_021820	GT	3	6	306637	306642	0 %	50 %	50 %	0 %	526218256
5588	NC_021820	TGC	2	6	306677	306682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218256
5589	NC_021820	GTGA	2	8	306694	306701	25 %	25 %	50 %	0 %	526218256
5590	NC_021820	TGT	2	6	306728	306733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218256
5591	NC_021820	CGC	2	6	306754	306759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218256
5592	NC_021820	CCA	2	6	306789	306794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218256
5593	NC_021820	AAG	2	6	306804	306809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218256
5594	NC_021820	CG	3	6	306839	306844	0 %	0 %	50 %	50 %	526218256
5595	NC_021820	CGA	2	6	306916	306921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218256
5596	NC_021820	TTC	2	6	306947	306952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218256
5597	NC_021820	GC	4	8	307213	307220	0 %	0 %	50 %	50 %	526218257
5598	NC_021820	GCGTT	2	10	307224	307233	0 %	40 %	40 %	20 %	526218257
5599	NC_021820	CAA	3	9	307235	307243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218257
5600	NC_021820	ACG	2	6	307315	307320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218257
5601	NC_021820	CAT	2	6	307325	307330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218257
5602	NC_021820	CCA	2	6	307408	307413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218257
5603	NC_021820	TGT	2	6	307525	307530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218257
5604	NC_021820	GC	4	8	307570	307577	0 %	0 %	50 %	50 %	526218257
5605	NC_021820	CGG	2	6	307610	307615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218257
5606	NC_021820	ATC	2	6	307635	307640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218257
5607	NC_021820	ACG	2	6	307670	307675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218257
5608	NC_021820	CGCT	2	8	307689	307696	0 %	25 %	25 %	50 %	526218257
5609	NC_021820	GGT	2	6	307703	307708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218257
5610	NC_021820	CCG	2	6	307752	307757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218257
5611	NC_021820	ACA	2	6	307759	307764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218257
5612	NC_021820	AGAA	2	8	307874	307881	75 %	0 %	25 %	0 %	526218257
5613	NC_021820	GCC	3	9	307923	307931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218257
5614	NC_021820	TAACAA	2	12	307954	307965	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	526218257
5615	NC_021820	AGC	2	6	307983	307988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218257
5616	NC_021820	CAG	2	6	308150	308155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218257
5617	NC_021820	GAA	2	6	308186	308191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218257
5618	NC_021820	AGT	2	6	308242	308247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218257
5619	NC_021820	ACG	2	6	308257	308262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218257
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5621	NC_021820	A	6	6	308400	308405	100 %	0 %	0 %	0 %	526218257
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5736	NC_021820	TGA	2	6	315178	315183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218263
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5739	NC_021820	GCG	2	6	315337	315342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218263
5740	NC_021820	CCAT	2	8	315360	315367	25 %	25 %	0 %	50 %	526218263
5741	NC_021820	GCC	2	6	315409	315414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218263
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5743	NC_021820	TAA	2	6	315593	315598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218263
5744	NC_021820	TCGA	2	8	315660	315667	25 %	25 %	25 %	25 %	526218263
5745	NC_021820	CCA	2	6	315763	315768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218263
5746	NC_021820	TGCAGA	2	12	315784	315795	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526218263
5747	NC_021820	TTC	2	6	315864	315869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218263
5748	NC_021820	CG	3	6	315874	315879	0 %	0 %	50 %	50 %	526218263
5749	NC_021820	TAC	2	6	315944	315949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218263
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5751	NC_021820	CG	3	6	315998	316003	0 %	0 %	50 %	50 %	526218263
5752	NC_021820	CCG	2	6	316009	316014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218263
5753	NC_021820	TGG	2	6	316063	316068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218263
5754	NC_021820	CTGA	2	8	316167	316174	25 %	25 %	25 %	25 %	526218263
5755	NC_021820	TGG	2	6	316195	316200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218263
5756	NC_021820	ATG	2	6	316201	316206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218263
5757	NC_021820	GC	3	6	316215	316220	0 %	0 %	50 %	50 %	526218263
5758	NC_021820	CGAACG	2	12	316244	316255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218263
5759	NC_021820	CCG	2	6	316297	316302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218263
5760	NC_021820	CT	3	6	316330	316335	0 %	50 %	0 %	50 %	526218263
5761	NC_021820	GCG	2	6	316348	316353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218263
5762	NC_021820	CGT	2	6	316365	316370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218263
5763	NC_021820	TCGC	2	8	316480	316487	0 %	25 %	25 %	50 %	526218263
5764	NC_021820	CAG	2	6	316488	316493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218263
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5767	NC_021820	CTG	2	6	316668	316673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218263
5768	NC_021820	A	6	6	316683	316688	100 %	0 %	0 %	0 %	526218263
5769	NC_021820	TGC	2	6	316696	316701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218263
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5772	NC_021820	CTG	2	6	316839	316844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218264
5773	NC_021820	GCT	2	6	316883	316888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218264
5774	NC_021820	TGC	2	6	316906	316911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218264
5775	NC_021820	CCG	2	6	317208	317213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218264
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5780	NC_021820	TGT	2	6	318211	318216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221761
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5782	NC_021820	TGG	2	6	318391	318396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221761
5783	NC_021820	AAC	2	6	318423	318428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221761
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5787	NC_021820	C	6	6	318544	318549	0 %	0 %	0 %	100 %	526218265
5788	NC_021820	TTC	2	6	318584	318589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218265
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5808	NC_021820	CTG	2	6	319449	319454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221762
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5811	NC_021820	GGTCTG	2	12	319512	319523	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	526221762
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5817	NC_021820	CTG	2	6	319743	319748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218266
5818	NC_021820	CGAC	2	8	319788	319795	25 %	0 %	25 %	50 %	526218266
5819	NC_021820	A	6	6	319802	319807	100 %	0 %	0 %	0 %	526218266
5820	NC_021820	ATC	2	6	319829	319834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218266
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5822	NC_021820	CGC	2	6	319850	319855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218266
5823	NC_021820	AGCAG	2	10	319885	319894	40 %	0 %	40 %	20 %	526218266
5824	NC_021820	GGCGCA	2	12	319912	319923	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	526218266
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5830	NC_021820	GAAC	2	8	320211	320218	50 %	0 %	25 %	25 %	526218267
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5832	NC_021820	GC	3	6	320240	320245	0 %	0 %	50 %	50 %	526218267
5833	NC_021820	CGCT	2	8	320258	320265	0 %	25 %	25 %	50 %	526218267
5834	NC_021820	AAT	2	6	320338	320343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218267
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5839	NC_021820	AGC	2	6	320675	320680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218268
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5842	NC_021820	ATC	2	6	321136	321141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218268
5843	NC_021820	CAT	2	6	321183	321188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218268
5844	NC_021820	CCA	2	6	321245	321250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218268
5845	NC_021820	GTG	2	6	321259	321264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218268
5846	NC_021820	GC	3	6	321284	321289	0 %	0 %	50 %	50 %	526218268
5847	NC_021820	TTG	2	6	321302	321307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218268
5848	NC_021820	TGG	2	6	321308	321313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218268
5849	NC_021820	CGCTG	2	10	321330	321339	0 %	20 %	40 %	40 %	526218268
5850	NC_021820	CTG	2	6	321460	321465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218268
5851	NC_021820	CGT	2	6	321469	321474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218268
5852	NC_021820	CTG	2	6	321526	321531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218268
5853	NC_021820	TGC	2	6	321537	321542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218268
5854	NC_021820	GTGAA	2	10	321581	321590	40 %	20 %	40 %	0 %	526218268
5855	NC_021820	ACTG	2	8	321606	321613	25 %	25 %	25 %	25 %	526218268
5856	NC_021820	GCAG	2	8	321633	321640	25 %	0 %	50 %	25 %	526218268
5857	NC_021820	CGTT	2	8	321653	321660	0 %	50 %	25 %	25 %	526218268
5858	NC_021820	A	6	6	321796	321801	100 %	0 %	0 %	0 %	526218268
5859	NC_021820	GGT	2	6	321808	321813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218268
5860	NC_021820	GGC	2	6	321846	321851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218268
5861	NC_021820	TC	3	6	321854	321859	0 %	50 %	0 %	50 %	526218268
5862	NC_021820	CTG	2	6	321925	321930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218268
5863	NC_021820	AAACAG	2	12	321931	321942	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	526218268
5864	NC_021820	GCA	2	6	321963	321968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218268
5865	NC_021820	GCA	2	6	321985	321990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218268
5866	NC_021820	CTG	2	6	322048	322053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218268
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5870	NC_021820	GGC	2	6	322346	322351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218269
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5872	NC_021820	GCT	2	6	322523	322528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218269
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5964	NC_021820	ACCT	2	8	327282	327289	25 %	25 %	0 %	50 %	526218273
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5972	NC_021820	TTG	2	6	327759	327764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221763
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5984	NC_021820	CTGG	2	8	328817	328824	0 %	25 %	50 %	25 %	526221763
5985	NC_021820	CT	3	6	328858	328863	0 %	50 %	0 %	50 %	526221763
5986	NC_021820	TGA	2	6	328917	328922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221763
5987	NC_021820	CAC	2	6	328966	328971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221763
5988	NC_021820	TGG	2	6	328995	329000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221763
5989	NC_021820	GCT	2	6	329116	329121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221763
5990	NC_021820	AGA	2	6	329125	329130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221763
5991	NC_021820	GC	3	6	329196	329201	0 %	0 %	50 %	50 %	526221763
5992	NC_021820	TGC	2	6	329242	329247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221763
5993	NC_021820	TGG	2	6	329304	329309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221763
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6000	NC_021820	CTG	2	6	329495	329500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221763

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