MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 88514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021820	ATT	2	6	247895	247900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218218
4502	NC_021820	TGGC	2	8	247928	247935	0 %	25 %	50 %	25 %	526218218
4503	NC_021820	GGC	2	6	247946	247951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218218
4504	NC_021820	CGA	2	6	247972	247977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218218
4505	NC_021820	GCG	2	6	247995	248000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218218
4506	NC_021820	CTG	2	6	248015	248020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218218
4507	NC_021820	GGC	2	6	248026	248031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218218
4508	NC_021820	CAA	2	6	248036	248041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218218
4509	NC_021820	AG	3	6	248589	248594	50 %	0 %	50 %	0 %	526221751
4510	NC_021820	TCA	2	6	248599	248604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221751
4511	NC_021820	AAT	2	6	248628	248633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221751
4512	NC_021820	ATT	2	6	248642	248647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221751
4513	NC_021820	TAT	2	6	248719	248724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221751
4514	NC_021820	TG	3	6	248783	248788	0 %	50 %	50 %	0 %	526221751
4515	NC_021820	CTCC	2	8	248797	248804	0 %	25 %	0 %	75 %	526221751
4516	NC_021820	GAG	2	6	248873	248878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526221751
4517	NC_021820	A	7	7	248883	248889	100 %	0 %	0 %	0 %	526221751
4518	NC_021820	CA	3	6	248890	248895	50 %	0 %	0 %	50 %	526221751
4519	NC_021820	ATA	2	6	248907	248912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221751
4520	NC_021820	TCA	2	6	248932	248937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221751
4521	NC_021820	GTT	2	6	249014	249019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221751
4522	NC_021820	GCC	2	6	249246	249251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221752
4523	NC_021820	AAT	2	6	249295	249300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221752
4524	NC_021820	TCCCA	2	10	249356	249365	20 %	20 %	0 %	60 %	526221752
4525	NC_021820	GAT	2	6	249397	249402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221752
4526	NC_021820	CAG	2	6	249501	249506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221752
4527	NC_021820	TTAT	2	8	249524	249531	25 %	75 %	0 %	0 %	526221752
4528	NC_021820	CTG	2	6	249714	249719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4529	NC_021820	GCG	2	6	249725	249730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218219
4530	NC_021820	GGC	2	6	249751	249756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218219
4531	NC_021820	GC	3	6	249794	249799	0 %	0 %	50 %	50 %	526218219
4532	NC_021820	TTC	2	6	249915	249920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218219
4533	NC_021820	GTG	2	6	249936	249941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218219
4534	NC_021820	AGA	2	6	250013	250018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218219
4535	NC_021820	CCA	2	6	250049	250054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218219
4536	NC_021820	TGGT	2	8	250072	250079	0 %	50 %	50 %	0 %	526218219
4537	NC_021820	GAA	2	6	250179	250184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218219
4538	NC_021820	TGC	2	6	250282	250287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4539	NC_021820	CGG	2	6	250347	250352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218219
4540	NC_021820	ATC	2	6	250399	250404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218219
4541	NC_021820	CGC	2	6	250554	250559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218219
4542	NC_021820	TAA	2	6	250721	250726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218219
4543	NC_021820	CAG	2	6	250746	250751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4544	NC_021820	CCACGC	2	12	250761	250772	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	526218219
4545	NC_021820	TTA	2	6	250780	250785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218219
4546	NC_021820	TGA	2	6	250817	250822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218219
4547	NC_021820	GC	3	6	250838	250843	0 %	0 %	50 %	50 %	526218219
4548	NC_021820	CGG	2	6	250881	250886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218219
4549	NC_021820	GTT	2	6	251034	251039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218219
4550	NC_021820	CAT	2	6	251076	251081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218219
4551	NC_021820	CG	3	6	251158	251163	0 %	0 %	50 %	50 %	526218219
4552	NC_021820	AGC	2	6	251264	251269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4553	NC_021820	CAT	2	6	251334	251339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218219
4554	NC_021820	ACGAT	2	10	251360	251369	40 %	20 %	20 %	20 %	526218219
4555	NC_021820	GTT	2	6	251387	251392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218219
4556	NC_021820	CAG	2	6	251406	251411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4557	NC_021820	CAG	3	9	251445	251453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4558	NC_021820	CGG	2	6	251528	251533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218219
4559	NC_021820	C	6	6	251548	251553	0 %	0 %	0 %	100 %	526218219
4560	NC_021820	GTC	2	6	251610	251615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4561	NC_021820	CTT	2	6	251624	251629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218219
4562	NC_021820	TCA	2	6	251695	251700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218219
4563	NC_021820	TGC	2	6	251713	251718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4564	NC_021820	TCG	2	6	251776	251781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4565	NC_021820	GAA	2	6	251787	251792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218219
4566	NC_021820	GGC	2	6	251814	251819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218219
4567	NC_021820	CAG	2	6	251829	251834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4568	NC_021820	GCA	2	6	251849	251854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4569	NC_021820	AGC	2	6	251915	251920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4570	NC_021820	GAG	2	6	251932	251937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218219
4571	NC_021820	TGC	2	6	251939	251944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4572	NC_021820	CGG	2	6	251982	251987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218219
4573	NC_021820	GCG	2	6	251993	251998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218219
4574	NC_021820	GTTC	2	8	252020	252027	0 %	50 %	25 %	25 %	526218219
4575	NC_021820	TCA	2	6	252046	252051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218219
4576	NC_021820	AAT	2	6	252124	252129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218219
4577	NC_021820	AGA	2	6	252136	252141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218219
4578	NC_021820	CTG	2	6	252150	252155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4579	NC_021820	GCA	2	6	252172	252177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218219
4580	NC_021820	GC	3	6	252179	252184	0 %	0 %	50 %	50 %	526218219
4581	NC_021820	GGCA	2	8	252677	252684	25 %	0 %	50 %	25 %	526218220
4582	NC_021820	TGTT	2	8	252806	252813	0 %	75 %	25 %	0 %	526218220
4583	NC_021820	GCT	2	6	252831	252836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218220
4584	NC_021820	CGGTCT	2	12	252897	252908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218220
4585	NC_021820	CG	3	6	252935	252940	0 %	0 %	50 %	50 %	526218220
4586	NC_021820	AATA	2	8	252955	252962	75 %	25 %	0 %	0 %	526218220
4587	NC_021820	GTA	2	6	252989	252994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218220
4588	NC_021820	TCG	2	6	252995	253000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218220
4589	NC_021820	CGT	2	6	253015	253020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218220
4590	NC_021820	CGTT	2	8	253060	253067	0 %	50 %	25 %	25 %	526218220
4591	NC_021820	TGGCCG	2	12	253130	253141	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526218220
4592	NC_021820	GCC	2	6	253185	253190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218220
4593	NC_021820	GTC	2	6	253238	253243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218220
4594	NC_021820	GAC	2	6	253246	253251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218220
4595	NC_021820	GCT	2	6	253266	253271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218220
4596	NC_021820	CGG	2	6	253310	253315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218220
4597	NC_021820	ATC	2	6	253378	253383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218220
4598	NC_021820	CG	3	6	253402	253407	0 %	0 %	50 %	50 %	526218220
4599	NC_021820	GC	3	6	253415	253420	0 %	0 %	50 %	50 %	526218220
4600	NC_021820	GCG	2	6	253442	253447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218220
4601	NC_021820	CGT	2	6	253450	253455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218220
4602	NC_021820	CTG	2	6	253504	253509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218220
4603	NC_021820	CG	3	6	253522	253527	0 %	0 %	50 %	50 %	526218220
4604	NC_021820	GC	3	6	253619	253624	0 %	0 %	50 %	50 %	526218221
4605	NC_021820	ACCC	2	8	253682	253689	25 %	0 %	0 %	75 %	526218221
4606	NC_021820	CAC	2	6	253829	253834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218221
4607	NC_021820	CG	3	6	253944	253949	0 %	0 %	50 %	50 %	526218221
4608	NC_021820	GGC	2	6	253968	253973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218221
4609	NC_021820	CTG	2	6	253980	253985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218221
4610	NC_021820	GC	3	6	254001	254006	0 %	0 %	50 %	50 %	526218221
4611	NC_021820	GAA	2	6	254067	254072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218221
4612	NC_021820	AAC	2	6	254099	254104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218221
4613	NC_021820	TTG	2	6	254107	254112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218221
4614	NC_021820	GCG	2	6	254119	254124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218221
4615	NC_021820	TAC	2	6	254179	254184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218221
4616	NC_021820	GTC	2	6	254199	254204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218221
4617	NC_021820	GC	3	6	254288	254293	0 %	0 %	50 %	50 %	526218221
4618	NC_021820	TCC	2	6	254343	254348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221753
4619	NC_021820	TGA	2	6	254357	254362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221753
4620	NC_021820	A	7	7	254409	254415	100 %	0 %	0 %	0 %	526221753
4621	NC_021820	GCGATT	2	12	254451	254462	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526221753
4622	NC_021820	GGC	2	6	254468	254473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221753
4623	NC_021820	AGCA	2	8	254503	254510	50 %	0 %	25 %	25 %	526221753
4624	NC_021820	A	6	6	254607	254612	100 %	0 %	0 %	0 %	526221753
4625	NC_021820	GCG	2	6	254616	254621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221753
4626	NC_021820	GGC	2	6	254648	254653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221753
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4727	NC_021820	T	6	6	259181	259186	0 %	100 %	0 %	0 %	526218222
4728	NC_021820	GCA	2	6	259437	259442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218223
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4730	NC_021820	AT	3	6	259574	259579	50 %	50 %	0 %	0 %	526218223
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4736	NC_021820	GCCA	2	8	259864	259871	25 %	0 %	25 %	50 %	526218223
4737	NC_021820	CCTGCG	2	12	259881	259892	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	526218223
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4864	NC_021820	CAC	2	6	264923	264928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218227
4865	NC_021820	CGG	2	6	264929	264934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218227
4866	NC_021820	TGT	2	6	264952	264957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218227
4867	NC_021820	TGTA	2	8	265003	265010	25 %	50 %	25 %	0 %	526218228
4868	NC_021820	GCG	2	6	265021	265026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218228
4869	NC_021820	CGC	2	6	265089	265094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218228
4870	NC_021820	CGC	2	6	265115	265120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218228
4871	NC_021820	GC	3	6	265140	265145	0 %	0 %	50 %	50 %	526218228
4872	NC_021820	GC	3	6	265298	265303	0 %	0 %	50 %	50 %	526218228
4873	NC_021820	T	6	6	265668	265673	0 %	100 %	0 %	0 %	526221755
4874	NC_021820	GGC	2	6	265684	265689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221755
4875	NC_021820	CAT	3	9	265701	265709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221755
4876	NC_021820	CCAG	2	8	265710	265717	25 %	0 %	25 %	50 %	526221755
4877	NC_021820	TCC	2	6	265736	265741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221755
4878	NC_021820	CGC	2	6	265776	265781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221755
4879	NC_021820	ATG	2	6	265823	265828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221755
4880	NC_021820	CCA	2	6	265923	265928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218229
4881	NC_021820	GCG	2	6	265988	265993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218229
4882	NC_021820	CCAGC	2	10	265995	266004	20 %	0 %	20 %	60 %	526218229
4883	NC_021820	TCG	2	6	266059	266064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218229
4884	NC_021820	CAC	2	6	266091	266096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218229
4885	NC_021820	TCC	2	6	266122	266127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218229
4886	NC_021820	CGTT	2	8	266167	266174	0 %	50 %	25 %	25 %	526218229
4887	NC_021820	CCG	2	6	266179	266184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218229
4888	NC_021820	CACC	2	8	266198	266205	25 %	0 %	0 %	75 %	526218229
4889	NC_021820	CAC	2	6	266217	266222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218229
4890	NC_021820	TCC	2	6	266245	266250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218229
4891	NC_021820	ATC	2	6	266323	266328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218229
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4893	NC_021820	GCT	2	6	266436	266441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218229
4894	NC_021820	GCT	2	6	266463	266468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218229
4895	NC_021820	GAA	2	6	266493	266498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218229
4896	NC_021820	TGG	2	6	266545	266550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218229
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4899	NC_021820	CCG	2	6	266687	266692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218229
4900	NC_021820	CTG	2	6	266721	266726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218229
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4904	NC_021820	GCC	2	6	266910	266915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218229
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4910	NC_021820	T	6	6	267089	267094	0 %	100 %	0 %	0 %	526218230
4911	NC_021820	CGA	2	6	267118	267123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218230
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4918	NC_021820	CTG	2	6	267356	267361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218230
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4920	NC_021820	ATTC	2	8	267514	267521	25 %	50 %	0 %	25 %	526218230
4921	NC_021820	GC	3	6	267628	267633	0 %	0 %	50 %	50 %	526218230
4922	NC_021820	CCA	2	6	267694	267699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218230
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4925	NC_021820	GCCA	4	16	267798	267813	25 %	0 %	25 %	50 %	526218230
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4929	NC_021820	GTC	3	9	267984	267992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218230
4930	NC_021820	GCC	2	6	268004	268009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218230
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4933	NC_021820	GC	4	8	268234	268241	0 %	0 %	50 %	50 %	526218231
4934	NC_021820	TCG	2	6	268298	268303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218231
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4937	NC_021820	CCG	2	6	268451	268456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218231
4938	NC_021820	TCA	2	6	268485	268490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218231
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4940	NC_021820	CGG	2	6	268623	268628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218231
4941	NC_021820	ATC	2	6	268703	268708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218231
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4943	NC_021820	GTG	2	6	269033	269038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218231
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4952	NC_021820	A	7	7	269655	269661	100 %	0 %	0 %	0 %	526218232
4953	NC_021820	CCG	2	6	269683	269688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218232
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4960	NC_021820	GCA	2	6	269902	269907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218232
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4967	NC_021820	CATC	2	8	270133	270140	25 %	25 %	0 %	50 %	526218232
4968	NC_021820	AGA	2	6	270155	270160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218232
4969	NC_021820	CTG	3	9	270197	270205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218232
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4972	NC_021820	A	6	6	270278	270283	100 %	0 %	0 %	0 %	526218232
4973	NC_021820	AAC	2	6	270360	270365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218232
4974	NC_021820	CG	3	6	270398	270403	0 %	0 %	50 %	50 %	526218232
4975	NC_021820	TAA	2	6	270498	270503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218233
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4979	NC_021820	ATG	2	6	270697	270702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218233
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4981	NC_021820	CGT	2	6	270838	270843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218233
4982	NC_021820	TAC	2	6	270882	270887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218233
4983	NC_021820	CGC	2	6	270914	270919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218233
4984	NC_021820	CAC	2	6	270977	270982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218233
4985	NC_021820	CGC	2	6	271027	271032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218233
4986	NC_021820	ACCC	2	8	271050	271057	25 %	0 %	0 %	75 %	526218233
4987	NC_021820	CCA	2	6	271077	271082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218233
4988	NC_021820	CGC	2	6	271099	271104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218233
4989	NC_021820	CAT	2	6	271207	271212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218233
4990	NC_021820	CATC	2	8	271272	271279	25 %	25 %	0 %	50 %	526218233
4991	NC_021820	CAA	2	6	271284	271289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218233
4992	NC_021820	GTA	2	6	271336	271341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218233
4993	NC_021820	CCG	2	6	271388	271393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218233
4994	NC_021820	AAAAAT	2	12	271477	271488	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	526218233
4995	NC_021820	A	7	7	271499	271505	100 %	0 %	0 %	0 %	526218233
4996	NC_021820	TCA	2	6	271783	271788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218234
4997	NC_021820	GTC	2	6	271799	271804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218234
4998	NC_021820	GGAT	2	8	271866	271873	25 %	25 %	50 %	0 %	526218234
4999	NC_021820	GTG	2	6	271914	271919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218234
5000	NC_021820	AGC	2	6	271920	271925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218234

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