MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 1876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021819	ATG	2	6	64727	64732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842637
1002	NC_021819	AGA	2	6	64745	64750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842637
1003	NC_021819	AG	3	6	64756	64761	50 %	0 %	50 %	0 %	525842637
1004	NC_021819	CAT	2	6	64774	64779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842637
1005	NC_021819	ATGG	2	8	65146	65153	25 %	25 %	50 %	0 %	525842638
1006	NC_021819	GCGT	2	8	65190	65197	0 %	25 %	50 %	25 %	525842638
1007	NC_021819	ATT	2	6	65209	65214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842639
1008	NC_021819	GCA	2	6	65283	65288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842639
1009	NC_021819	ACC	2	6	65327	65332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842639
1010	NC_021819	TGG	2	6	65454	65459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842639
1011	NC_021819	AGC	2	6	65523	65528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842639
1012	NC_021819	AATC	2	8	65534	65541	50 %	25 %	0 %	25 %	525842639
1013	NC_021819	TACA	2	8	65582	65589	50 %	25 %	0 %	25 %	525842639
1014	NC_021819	ATC	2	6	65653	65658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842639
1015	NC_021819	ATC	2	6	65956	65961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842640
1016	NC_021819	CAA	2	6	66078	66083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842640
1017	NC_021819	CTG	2	6	66113	66118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842640
1018	NC_021819	CTC	2	6	66146	66151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842640
1019	NC_021819	ATT	2	6	66184	66189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842640
1020	NC_021819	CGG	2	6	66215	66220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842640
1021	NC_021819	TGG	2	6	66236	66241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842640
1022	NC_021819	TCA	2	6	66246	66251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842640
1023	NC_021819	GAT	2	6	66255	66260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842640
1024	NC_021819	CCGTC	2	10	66284	66293	0 %	20 %	20 %	60 %	525842640
1025	NC_021819	ATGA	2	8	66310	66317	50 %	25 %	25 %	0 %	525842640
1026	NC_021819	AGC	2	6	66327	66332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842640
1027	NC_021819	CCG	2	6	66396	66401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842640
1028	NC_021819	GCCA	2	8	66608	66615	25 %	0 %	25 %	50 %	525842641
1029	NC_021819	CTG	2	6	66619	66624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842641
1030	NC_021819	CAT	2	6	66664	66669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842641
1031	NC_021819	AT	3	6	66677	66682	50 %	50 %	0 %	0 %	525842641
1032	NC_021819	A	6	6	66706	66711	100 %	0 %	0 %	0 %	525842641
1033	NC_021819	GCC	2	6	66717	66722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842641
1034	NC_021819	AATCC	2	10	66730	66739	40 %	20 %	0 %	40 %	525842641
1035	NC_021819	CAT	2	6	66851	66856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842641
1036	NC_021819	CAA	2	6	67095	67100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842642
1037	NC_021819	GAT	2	6	67165	67170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842642
1038	NC_021819	ATT	2	6	67241	67246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842642
1039	NC_021819	T	7	7	67245	67251	0 %	100 %	0 %	0 %	525842642
1040	NC_021819	TTC	2	6	67294	67299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842642
1041	NC_021819	GAA	2	6	67348	67353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842642
1042	NC_021819	TCC	2	6	67367	67372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842642
1043	NC_021819	CTT	2	6	67374	67379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842642
1044	NC_021819	T	6	6	67378	67383	0 %	100 %	0 %	0 %	525842642
1045	NC_021819	CCT	2	6	67508	67513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842642
1046	NC_021819	TCC	2	6	67538	67543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842642
1047	NC_021819	AG	3	6	67544	67549	50 %	0 %	50 %	0 %	525842642
1048	NC_021819	GCA	2	6	67662	67667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842642
1049	NC_021819	CTTC	2	8	67686	67693	0 %	50 %	0 %	50 %	525842642
1050	NC_021819	TAC	2	6	67717	67722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842642
1051	NC_021819	GTG	2	6	67799	67804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842642
1052	NC_021819	TGCCAG	2	12	67831	67842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525842642
1053	NC_021819	TCA	2	6	67851	67856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842642
1054	NC_021819	CAT	2	6	67858	67863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842642
1055	NC_021819	CTC	2	6	67894	67899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842642
1056	NC_021819	A	6	6	67958	67963	100 %	0 %	0 %	0 %	525842642
1057	NC_021819	CCT	2	6	67978	67983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842642
1058	NC_021819	GCAGC	2	10	68187	68196	20 %	0 %	40 %	40 %	525842642
1059	NC_021819	CTG	2	6	68215	68220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842642
1060	NC_021819	GCT	2	6	68251	68256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842642
1061	NC_021819	GCA	2	6	68289	68294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842642
1062	NC_021819	GCG	2	6	68381	68386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842642
1063	NC_021819	T	7	7	68438	68444	0 %	100 %	0 %	0 %	525842642
1064	NC_021819	CTT	2	6	68448	68453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842642
1065	NC_021819	CTC	2	6	68506	68511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842642
1066	NC_021819	GATG	2	8	68517	68524	25 %	25 %	50 %	0 %	525842642
1067	NC_021819	TTCA	2	8	68599	68606	25 %	50 %	0 %	25 %	525842642
1068	NC_021819	GTC	2	6	68641	68646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842642
1069	NC_021819	TCA	2	6	68669	68674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842642
1070	NC_021819	A	8	8	68764	68771	100 %	0 %	0 %	0 %	525842642
1071	NC_021819	CGAC	2	8	68813	68820	25 %	0 %	25 %	50 %	525842642
1072	NC_021819	TCA	2	6	68837	68842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842642
1073	NC_021819	CTGG	2	8	69486	69493	0 %	25 %	50 %	25 %	525842643
1074	NC_021819	GAA	2	6	69498	69503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842643
1075	NC_021819	AAAC	2	8	69596	69603	75 %	0 %	0 %	25 %	525842643
1076	NC_021819	GAA	2	6	70137	70142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842644
1077	NC_021819	AAT	2	6	70236	70241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842644
1078	NC_021819	TAA	2	6	70287	70292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842644
1079	NC_021819	CTCA	2	8	70318	70325	25 %	25 %	0 %	50 %	525842644
1080	NC_021819	ACT	2	6	70351	70356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842644
1081	NC_021819	TAA	2	6	70384	70389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842644
1082	NC_021819	AATA	2	8	70490	70497	75 %	25 %	0 %	0 %	525842644
1083	NC_021819	AAAC	2	8	70613	70620	75 %	0 %	0 %	25 %	525842644
1084	NC_021819	AAC	2	6	70661	70666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842644
1085	NC_021819	AAT	2	6	70711	70716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842644
1086	NC_021819	ATT	2	6	70780	70785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842644
1087	NC_021819	AGA	2	6	70828	70833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842644
1088	NC_021819	TA	3	6	70858	70863	50 %	50 %	0 %	0 %	525842644
1089	NC_021819	AT	4	8	70888	70895	50 %	50 %	0 %	0 %	525842644
1090	NC_021819	ATCA	2	8	70921	70928	50 %	25 %	0 %	25 %	525842644
1091	NC_021819	AGA	2	6	71021	71026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842644
1092	NC_021819	TTA	2	6	72675	72680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842645
1093	NC_021819	TTTTC	2	10	72730	72739	0 %	80 %	0 %	20 %	525842645
1094	NC_021819	TCG	2	6	72786	72791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842645
1095	NC_021819	AG	3	6	72923	72928	50 %	0 %	50 %	0 %	525842645
1096	NC_021819	TCC	2	6	72984	72989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842645
1097	NC_021819	C	6	6	73075	73080	0 %	0 %	0 %	100 %	525842645
1098	NC_021819	ATC	2	6	73086	73091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842645
1099	NC_021819	CCAAT	2	10	73096	73105	40 %	20 %	0 %	40 %	525842645
1100	NC_021819	AAT	2	6	73125	73130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842645
1101	NC_021819	TCA	2	6	73143	73148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842645
1102	NC_021819	ATAA	2	8	73186	73193	75 %	25 %	0 %	0 %	525842645
1103	NC_021819	ACC	2	6	73250	73255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842645
1104	NC_021819	GAT	2	6	73309	73314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842645
1105	NC_021819	A	6	6	73321	73326	100 %	0 %	0 %	0 %	525842645
1106	NC_021819	A	6	6	73362	73367	100 %	0 %	0 %	0 %	525842645
1107	NC_021819	TCAA	2	8	73368	73375	50 %	25 %	0 %	25 %	525842645
1108	NC_021819	TCA	2	6	73419	73424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842645
1109	NC_021819	ATG	2	6	73444	73449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842645
1110	NC_021819	GTTC	2	8	73506	73513	0 %	50 %	25 %	25 %	525842645
1111	NC_021819	CAT	2	6	73525	73530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842645
1112	NC_021819	TC	3	6	73560	73565	0 %	50 %	0 %	50 %	525842645
1113	NC_021819	GCT	2	6	73640	73645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842645
1114	NC_021819	CT	3	6	73934	73939	0 %	50 %	0 %	50 %	525842645
1115	NC_021819	T	6	6	73966	73971	0 %	100 %	0 %	0 %	525842645
1116	NC_021819	TA	3	6	74083	74088	50 %	50 %	0 %	0 %	525842645
1117	NC_021819	ATT	2	6	74115	74120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842645
1118	NC_021819	TCT	3	9	74133	74141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842646
1119	NC_021819	TCC	2	6	74165	74170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842646
1120	NC_021819	ATC	2	6	74350	74355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842646
1121	NC_021819	TAT	2	6	74358	74363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842646
1122	NC_021819	TAAA	2	8	74388	74395	75 %	25 %	0 %	0 %	525842646
1123	NC_021819	AT	3	6	74463	74468	50 %	50 %	0 %	0 %	525842646
1124	NC_021819	AT	4	8	74524	74531	50 %	50 %	0 %	0 %	525842646
1125	NC_021819	TTC	2	6	74571	74576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842646
1126	NC_021819	A	6	6	74619	74624	100 %	0 %	0 %	0 %	525842646
1127	NC_021819	ATT	2	6	74626	74631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842646
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1252	NC_021819	TAA	2	6	81834	81839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842652
1253	NC_021819	TGT	2	6	81865	81870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525842652
1254	NC_021819	GAA	2	6	81921	81926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842652
1255	NC_021819	GAC	2	6	82212	82217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842653
1256	NC_021819	CAA	2	6	82288	82293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842653
1257	NC_021819	CTT	2	6	82324	82329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842653
1258	NC_021819	TTTA	2	8	82430	82437	25 %	75 %	0 %	0 %	525842654
1259	NC_021819	GTC	2	6	82513	82518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842654
1260	NC_021819	ATC	3	9	82548	82556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842654
1261	NC_021819	CGTT	2	8	82661	82668	0 %	50 %	25 %	25 %	525842654
1262	NC_021819	CTT	2	6	82682	82687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842654
1263	NC_021819	ACA	2	6	82744	82749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842654
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1265	NC_021819	CCA	2	6	82955	82960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842654
1266	NC_021819	CGA	2	6	82979	82984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842654
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1268	NC_021819	CAT	2	6	83039	83044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842654
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1270	NC_021819	TCAC	2	8	83137	83144	25 %	25 %	0 %	50 %	525842654
1271	NC_021819	TAA	2	6	83237	83242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842654
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1274	NC_021819	TCA	2	6	83362	83367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842655
1275	NC_021819	CGC	2	6	83368	83373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842655
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1280	NC_021819	TCA	2	6	84321	84326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842656
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1282	NC_021819	GTC	2	6	84414	84419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842656
1283	NC_021819	CAA	2	6	84457	84462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842656
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1286	NC_021819	CAT	2	6	84835	84840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842657
1287	NC_021819	GCAT	2	8	85018	85025	25 %	25 %	25 %	25 %	525842657
1288	NC_021819	TCA	2	6	85034	85039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842657
1289	NC_021819	TG	3	6	85079	85084	0 %	50 %	50 %	0 %	525842657
1290	NC_021819	GCCAC	2	10	85174	85183	20 %	0 %	20 %	60 %	525842657
1291	NC_021819	TGG	2	6	85253	85258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842657
1292	NC_021819	TGC	2	6	85305	85310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842657
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1294	NC_021819	TCT	2	6	85783	85788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842658
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1300	NC_021819	TCT	2	6	86220	86225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842659
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1362	NC_021819	AG	3	6	90195	90200	50 %	0 %	50 %	0 %	525842663
1363	NC_021819	GAAG	2	8	90205	90212	50 %	0 %	50 %	0 %	525842663
1364	NC_021819	TGC	3	9	90241	90249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842663
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1366	NC_021819	T	6	6	90327	90332	0 %	100 %	0 %	0 %	525842663
1367	NC_021819	ACTGA	2	10	90579	90588	40 %	20 %	20 %	20 %	525842664
1368	NC_021819	ATA	2	6	90640	90645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842664
1369	NC_021819	TCA	2	6	90653	90658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842664
1370	NC_021819	GATAT	2	10	90659	90668	40 %	40 %	20 %	0 %	525842664
1371	NC_021819	C	6	6	90673	90678	0 %	0 %	0 %	100 %	525842664
1372	NC_021819	CTTG	2	8	90687	90694	0 %	50 %	25 %	25 %	525842664
1373	NC_021819	G	6	6	90847	90852	0 %	0 %	100 %	0 %	525842664
1374	NC_021819	AAT	2	6	90864	90869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842664
1375	NC_021819	GAAT	2	8	90969	90976	50 %	25 %	25 %	0 %	525842664
1376	NC_021819	GAT	2	6	91011	91016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842664
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1378	NC_021819	GCT	2	6	91048	91053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842664
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