MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 1876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021819	GA	3	6	30666	30671	50 %	0 %	50 %	0 %	525842610
502	NC_021819	GCAA	2	8	30690	30697	50 %	0 %	25 %	25 %	525842610
503	NC_021819	ATA	2	6	30726	30731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842610
504	NC_021819	ATT	2	6	30749	30754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842611
505	NC_021819	GC	3	6	30772	30777	0 %	0 %	50 %	50 %	525842611
506	NC_021819	GGT	2	6	30816	30821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842611
507	NC_021819	G	6	6	30824	30829	0 %	0 %	100 %	0 %	525842611
508	NC_021819	CAG	2	6	30866	30871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842611
509	NC_021819	ATC	2	6	30909	30914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842611
510	NC_021819	GTA	2	6	31026	31031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842611
511	NC_021819	TTC	2	6	31039	31044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842611
512	NC_021819	CGG	2	6	31076	31081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842611
513	NC_021819	CGC	2	6	31115	31120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842611
514	NC_021819	GTCAC	2	10	31147	31156	20 %	20 %	20 %	40 %	525842611
515	NC_021819	GGC	2	6	31185	31190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842611
516	NC_021819	TGTCC	2	10	31343	31352	0 %	40 %	20 %	40 %	525842612
517	NC_021819	CTC	2	6	31377	31382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842612
518	NC_021819	TCA	2	6	31409	31414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842612
519	NC_021819	AAC	2	6	31484	31489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842612
520	NC_021819	CGT	2	6	31490	31495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842612
521	NC_021819	ATC	2	6	31578	31583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842612
522	NC_021819	GTC	2	6	31587	31592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842612
523	NC_021819	AAT	2	6	31638	31643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842612
524	NC_021819	CTT	2	6	31752	31757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842613
525	NC_021819	TGC	2	6	31783	31788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842613
526	NC_021819	CTG	2	6	31851	31856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842613
527	NC_021819	TGC	2	6	31905	31910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842613
528	NC_021819	CCA	2	6	31968	31973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842613
529	NC_021819	GCT	2	6	32041	32046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842613
530	NC_021819	GCCAG	2	10	32058	32067	20 %	0 %	40 %	40 %	525842613
531	NC_021819	TGG	2	6	32105	32110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842613
532	NC_021819	GCG	2	6	32122	32127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842613
533	NC_021819	TGA	2	6	32223	32228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842613
534	NC_021819	CGA	3	9	32420	32428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842613
535	NC_021819	AGT	2	6	32492	32497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842613
536	NC_021819	GCT	2	6	32505	32510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842613
537	NC_021819	CCA	2	6	32512	32517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842613
538	NC_021819	CGC	2	6	32536	32541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842613
539	NC_021819	CAG	2	6	32644	32649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842613
540	NC_021819	GCA	2	6	32678	32683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842613
541	NC_021819	AAT	2	6	32709	32714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842613
542	NC_021819	GCCC	2	8	32815	32822	0 %	0 %	25 %	75 %	525842613
543	NC_021819	TC	3	6	32863	32868	0 %	50 %	0 %	50 %	525842613
544	NC_021819	CAT	2	6	32893	32898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842613
545	NC_021819	AGC	2	6	32936	32941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842613
546	NC_021819	ATC	2	6	33038	33043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842613
547	NC_021819	CAT	2	6	33046	33051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842613
548	NC_021819	TGG	2	6	33233	33238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842572
549	NC_021819	CGG	2	6	33245	33250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842572
550	NC_021819	GAC	2	6	33283	33288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842572
551	NC_021819	CTG	2	6	33364	33369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842572
552	NC_021819	TGC	2	6	33377	33382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842572
553	NC_021819	AAC	2	6	33432	33437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842572
554	NC_021819	GAC	2	6	33505	33510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842572
555	NC_021819	CGG	2	6	33560	33565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842572
556	NC_021819	TGA	2	6	33614	33619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842572
557	NC_021819	GGA	2	6	33741	33746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525842572
558	NC_021819	A	6	6	33897	33902	100 %	0 %	0 %	0 %	525842614
559	NC_021819	TGG	2	6	33969	33974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842614
560	NC_021819	ATGAA	2	10	33981	33990	60 %	20 %	20 %	0 %	525842614
561	NC_021819	GAA	2	6	34013	34018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842614
562	NC_021819	ATCT	2	8	34268	34275	25 %	50 %	0 %	25 %	525842614
563	NC_021819	TGG	2	6	34382	34387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842614
564	NC_021819	GGT	2	6	34411	34416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842614
565	NC_021819	CGCGG	2	10	34442	34451	0 %	0 %	60 %	40 %	525842614
566	NC_021819	TGT	2	6	34465	34470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525842614
567	NC_021819	AGA	2	6	34471	34476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842614
568	NC_021819	GCT	2	6	34522	34527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842614
569	NC_021819	GAT	2	6	34649	34654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842614
570	NC_021819	ATG	2	6	34665	34670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842614
571	NC_021819	GAA	2	6	34682	34687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842614
572	NC_021819	TC	3	6	34699	34704	0 %	50 %	0 %	50 %	525842614
573	NC_021819	CAG	2	6	34769	34774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842614
574	NC_021819	GAT	2	6	34795	34800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842614
575	NC_021819	GTT	2	6	34835	34840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525842614
576	NC_021819	GCTC	2	8	35023	35030	0 %	25 %	25 %	50 %	525842614
577	NC_021819	TGC	2	6	35216	35221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842615
578	NC_021819	CAT	2	6	35229	35234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842615
579	NC_021819	TCCA	2	8	35268	35275	25 %	25 %	0 %	50 %	525842615
580	NC_021819	TTC	2	6	35320	35325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842615
581	NC_021819	GCC	2	6	35326	35331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842615
582	NC_021819	GA	3	6	35339	35344	50 %	0 %	50 %	0 %	525842615
583	NC_021819	CTAT	2	8	35433	35440	25 %	50 %	0 %	25 %	525842615
584	NC_021819	GGT	2	6	35511	35516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842615
585	NC_021819	ATT	2	6	35540	35545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842615
586	NC_021819	ACC	2	6	35588	35593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842615
587	NC_021819	CTT	2	6	35614	35619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842615
588	NC_021819	ACAA	2	8	35723	35730	75 %	0 %	0 %	25 %	525842615
589	NC_021819	ATG	2	6	35785	35790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842615
590	NC_021819	GTGG	2	8	35835	35842	0 %	25 %	75 %	0 %	525842615
591	NC_021819	GGCGCT	2	12	35845	35856	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525842615
592	NC_021819	TCA	2	6	35873	35878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842615
593	NC_021819	TGA	2	6	35885	35890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842615
594	NC_021819	CT	3	6	35895	35900	0 %	50 %	0 %	50 %	525842615
595	NC_021819	GTT	2	6	35911	35916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525842615
596	NC_021819	GCA	2	6	35929	35934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842615
597	NC_021819	GAA	2	6	35953	35958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842615
598	NC_021819	CGC	2	6	35966	35971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842615
599	NC_021819	AAC	2	6	36053	36058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842615
600	NC_021819	AG	3	6	36085	36090	50 %	0 %	50 %	0 %	525842615
601	NC_021819	CGA	2	6	36156	36161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842615
602	NC_021819	TATG	2	8	36213	36220	25 %	50 %	25 %	0 %	525842615
603	NC_021819	AAGA	2	8	36262	36269	75 %	0 %	25 %	0 %	525842615
604	NC_021819	CGA	2	6	36298	36303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842615
605	NC_021819	GCA	2	6	36589	36594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842616
606	NC_021819	GCC	2	6	36613	36618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842616
607	NC_021819	GGC	2	6	36906	36911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842616
608	NC_021819	GCG	2	6	36916	36921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842616
609	NC_021819	TA	3	6	37084	37089	50 %	50 %	0 %	0 %	525842616
610	NC_021819	GCT	2	6	37105	37110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842616
611	NC_021819	TTC	2	6	37427	37432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842617
612	NC_021819	CAA	2	6	37435	37440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842617
613	NC_021819	ATG	3	9	37488	37496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842617
614	NC_021819	CGG	2	6	37596	37601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842617
615	NC_021819	CCGG	2	8	37665	37672	0 %	0 %	50 %	50 %	525842617
616	NC_021819	CAT	2	6	37919	37924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842617
617	NC_021819	TCA	2	6	37938	37943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842617
618	NC_021819	GCTG	2	8	38037	38044	0 %	25 %	50 %	25 %	525842617
619	NC_021819	GCTG	2	8	38073	38080	0 %	25 %	50 %	25 %	525842617
620	NC_021819	CTG	2	6	38135	38140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842617
621	NC_021819	GC	3	6	38181	38186	0 %	0 %	50 %	50 %	525842617
622	NC_021819	GC	3	6	38225	38230	0 %	0 %	50 %	50 %	525842617
623	NC_021819	ACT	2	6	38248	38253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842617
624	NC_021819	CCTG	2	8	38367	38374	0 %	25 %	25 %	50 %	525842617
625	NC_021819	GGA	2	6	38383	38388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525842617
626	NC_021819	CCA	2	6	38421	38426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842617
627	NC_021819	CTG	2	6	38459	38464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842617
628	NC_021819	TGA	2	6	38583	38588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842617
629	NC_021819	TGA	2	6	38598	38603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842617
630	NC_021819	CGC	2	6	38608	38613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842617
631	NC_021819	GAA	3	9	38671	38679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842617
632	NC_021819	CCGC	2	8	38697	38704	0 %	0 %	25 %	75 %	525842617
633	NC_021819	G	6	6	38746	38751	0 %	0 %	100 %	0 %	525842617
634	NC_021819	CAT	2	6	38794	38799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842617
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639	NC_021819	GCA	2	6	39535	39540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842573
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641	NC_021819	ATC	2	6	39698	39703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842573
642	NC_021819	ACC	2	6	39777	39782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842573
643	NC_021819	CCAT	2	8	39819	39826	25 %	25 %	0 %	50 %	525842573
644	NC_021819	ACC	2	6	39836	39841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842573
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666	NC_021819	CAT	2	6	41167	41172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842619
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1000	NC_021819	CAG	2	6	64690	64695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842637

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