MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 plasmid unnamed

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021817	AT	3	6	381	386	50 %	50 %	0 %	0 %	525833509
2	NC_021817	GC	3	6	7717	7722	0 %	0 %	50 %	50 %	525833517
3	NC_021817	GA	3	6	8298	8303	50 %	0 %	50 %	0 %	525833517
4	NC_021817	TG	3	6	9269	9274	0 %	50 %	50 %	0 %	525833517
5	NC_021817	CG	3	6	9637	9642	0 %	0 %	50 %	50 %	525833517
6	NC_021817	TC	3	6	10708	10713	0 %	50 %	0 %	50 %	525833517
7	NC_021817	GC	3	6	10914	10919	0 %	0 %	50 %	50 %	525833517
8	NC_021817	AC	3	6	12015	12020	50 %	0 %	0 %	50 %	525833517
9	NC_021817	AG	3	6	15336	15341	50 %	0 %	50 %	0 %	525833519
10	NC_021817	AT	3	6	15638	15643	50 %	50 %	0 %	0 %	525833520
11	NC_021817	TC	3	6	15799	15804	0 %	50 %	0 %	50 %	525833520
12	NC_021817	TG	3	6	17653	17658	0 %	50 %	50 %	0 %	525833521
13	NC_021817	GC	3	6	18623	18628	0 %	0 %	50 %	50 %	525833521
14	NC_021817	CG	3	6	19196	19201	0 %	0 %	50 %	50 %	525833522
15	NC_021817	GA	3	6	19385	19390	50 %	0 %	50 %	0 %	525833522
16	NC_021817	GC	3	6	20218	20223	0 %	0 %	50 %	50 %	525833522
17	NC_021817	AC	3	6	22097	22102	50 %	0 %	0 %	50 %	525833525
18	NC_021817	CA	3	6	22682	22687	50 %	0 %	0 %	50 %	525833525
19	NC_021817	CT	3	6	23876	23881	0 %	50 %	0 %	50 %	525833526
20	NC_021817	AC	3	6	24847	24852	50 %	0 %	0 %	50 %	525833528
21	NC_021817	GC	3	6	28934	28939	0 %	0 %	50 %	50 %	525833531
22	NC_021817	TG	4	8	30146	30153	0 %	50 %	50 %	0 %	525833533
23	NC_021817	TG	3	6	30772	30777	0 %	50 %	50 %	0 %	525833534
24	NC_021817	CG	4	8	30921	30928	0 %	0 %	50 %	50 %	525833534
25	NC_021817	AG	3	6	31041	31046	50 %	0 %	50 %	0 %	525833534
26	NC_021817	GA	3	6	31740	31745	50 %	0 %	50 %	0 %	525833534
27	NC_021817	GA	3	6	34254	34259	50 %	0 %	50 %	0 %	525833539
28	NC_021817	TC	3	6	34445	34450	0 %	50 %	0 %	50 %	525833539
29	NC_021817	GA	3	6	34690	34695	50 %	0 %	50 %	0 %	525833540
30	NC_021817	TA	3	6	34745	34750	50 %	50 %	0 %	0 %	525833540
31	NC_021817	AT	4	8	34759	34766	50 %	50 %	0 %	0 %	525833540
32	NC_021817	CT	3	6	34854	34859	0 %	50 %	0 %	50 %	525833540
33	NC_021817	CT	3	6	35439	35444	0 %	50 %	0 %	50 %	525833541
34	NC_021817	TC	3	6	35611	35616	0 %	50 %	0 %	50 %	525833541
35	NC_021817	AT	3	6	36965	36970	50 %	50 %	0 %	0 %	525833543
36	NC_021817	TG	3	6	37234	37239	0 %	50 %	50 %	0 %	525833543
37	NC_021817	GC	3	6	38252	38257	0 %	0 %	50 %	50 %	525833544
38	NC_021817	CA	3	6	38368	38373	50 %	0 %	0 %	50 %	525833544
39	NC_021817	CT	4	8	38667	38674	0 %	50 %	0 %	50 %	525833544
40	NC_021817	CG	3	6	39466	39471	0 %	0 %	50 %	50 %	525833547
41	NC_021817	TG	3	6	39799	39804	0 %	50 %	50 %	0 %	525833547
42	NC_021817	GA	3	6	42153	42158	50 %	0 %	50 %	0 %	525833550
43	NC_021817	GC	3	6	42920	42925	0 %	0 %	50 %	50 %	525833552
44	NC_021817	GC	3	6	43697	43702	0 %	0 %	50 %	50 %	525833552
45	NC_021817	CT	3	6	45558	45563	0 %	50 %	0 %	50 %	525833504
46	NC_021817	TC	3	6	45623	45628	0 %	50 %	0 %	50 %	525833504
47	NC_021817	CG	3	6	48735	48740	0 %	0 %	50 %	50 %	525833558
48	NC_021817	GC	3	6	48763	48768	0 %	0 %	50 %	50 %	525833558
49	NC_021817	CG	3	6	49134	49139	0 %	0 %	50 %	50 %	525833558
50	NC_021817	AC	3	6	49452	49457	50 %	0 %	0 %	50 %	525833559
51	NC_021817	CA	3	6	49825	49830	50 %	0 %	0 %	50 %	525833560
52	NC_021817	TG	3	6	50081	50086	0 %	50 %	50 %	0 %	525833561
53	NC_021817	TC	3	6	52285	52290	0 %	50 %	0 %	50 %	525833506
54	NC_021817	CG	3	6	52476	52481	0 %	0 %	50 %	50 %	525833506
55	NC_021817	GC	3	6	52641	52646	0 %	0 %	50 %	50 %	525833506
56	NC_021817	GA	3	6	52868	52873	50 %	0 %	50 %	0 %	525833506
57	NC_021817	TC	3	6	53570	53575	0 %	50 %	0 %	50 %	525833507
58	NC_021817	GC	3	6	53669	53674	0 %	0 %	50 %	50 %	525833507
59	NC_021817	GT	3	6	54824	54829	0 %	50 %	50 %	0 %	525833562
60	NC_021817	CA	3	6	55074	55079	50 %	0 %	0 %	50 %	525833562
61	NC_021817	TA	3	6	55593	55598	50 %	50 %	0 %	0 %	525833562
62	NC_021817	AT	3	6	57535	57540	50 %	50 %	0 %	0 %	525833508
63	NC_021817	TA	3	6	57953	57958	50 %	50 %	0 %	0 %	525833508
64	NC_021817	AG	3	6	58978	58983	50 %	0 %	50 %	0 %	525833565
65	NC_021817	TA	3	6	59152	59157	50 %	50 %	0 %	0 %	525833565
66	NC_021817	CA	3	6	61511	61516	50 %	0 %	0 %	50 %	525833570
67	NC_021817	AT	3	6	61528	61533	50 %	50 %	0 %	0 %	525833570
68	NC_021817	CT	3	6	62092	62097	0 %	50 %	0 %	50 %	525833571
69	NC_021817	TA	3	6	62249	62254	50 %	50 %	0 %	0 %	525833571
70	NC_021817	AC	3	6	62366	62371	50 %	0 %	0 %	50 %	525833571
71	NC_021817	TC	3	6	62521	62526	0 %	50 %	0 %	50 %	525833571
72	NC_021817	AT	4	8	64944	64951	50 %	50 %	0 %	0 %	525833573
73	NC_021817	AT	4	8	67541	67548	50 %	50 %	0 %	0 %	525833574
74	NC_021817	AT	3	6	69735	69740	50 %	50 %	0 %	0 %	525833576
75	NC_021817	AC	3	6	70141	70146	50 %	0 %	0 %	50 %	525833576
76	NC_021817	AT	4	8	70505	70512	50 %	50 %	0 %	0 %	525833577
77	NC_021817	AT	3	6	71615	71620	50 %	50 %	0 %	0 %	525833577
78	NC_021817	AT	3	6	71714	71719	50 %	50 %	0 %	0 %	525833577
79	NC_021817	AT	3	6	71803	71808	50 %	50 %	0 %	0 %	525833577

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.