MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 plasmid unnamed

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021817	CTTCA	2	10	1199	1208	20 %	40 %	0 %	40 %	525833510
2	NC_021817	TCCTG	2	10	2087	2096	0 %	40 %	20 %	40 %	525833511
3	NC_021817	CAGTT	2	10	6820	6829	20 %	40 %	20 %	20 %	525833516
4	NC_021817	CCCGG	2	10	13424	13433	0 %	0 %	40 %	60 %	525833518
5	NC_021817	ATCGC	2	10	13454	13463	20 %	20 %	20 %	40 %	525833518
6	NC_021817	CTGCC	2	10	13669	13678	0 %	20 %	20 %	60 %	525833518
7	NC_021817	AGTCG	2	10	21943	21952	20 %	20 %	40 %	20 %	525833525
8	NC_021817	TGCAG	2	10	22871	22880	20 %	20 %	40 %	20 %	525833525
9	NC_021817	CGGTA	2	10	23066	23075	20 %	20 %	40 %	20 %	525833525
10	NC_021817	AGGTC	2	10	23748	23757	20 %	20 %	40 %	20 %	525833526
11	NC_021817	ACCAG	2	10	23885	23894	40 %	0 %	20 %	40 %	525833526
12	NC_021817	TGCCG	2	10	25585	25594	0 %	20 %	40 %	40 %	525833528
13	NC_021817	CCGGG	2	10	25722	25731	0 %	0 %	60 %	40 %	525833529
14	NC_021817	TGTTC	2	10	26832	26841	0 %	60 %	20 %	20 %	525833531
15	NC_021817	TGAAC	2	10	26878	26887	40 %	20 %	20 %	20 %	525833531
16	NC_021817	GACCA	2	10	27862	27871	40 %	0 %	20 %	40 %	525833531
17	NC_021817	TGGCA	2	10	30858	30867	20 %	20 %	40 %	20 %	525833534
18	NC_021817	GCACG	2	10	32415	32424	20 %	0 %	40 %	40 %	525833535
19	NC_021817	TTTCG	2	10	33218	33227	0 %	60 %	20 %	20 %	525833536
20	NC_021817	GCCAT	2	10	34017	34026	20 %	20 %	20 %	40 %	525833538
21	NC_021817	ATGCC	2	10	43669	43678	20 %	20 %	20 %	40 %	525833552
22	NC_021817	CCTTC	2	10	44517	44526	0 %	40 %	0 %	60 %	525833552
23	NC_021817	ATTCC	2	10	49536	49545	20 %	40 %	0 %	40 %	525833559
24	NC_021817	CCAGC	2	10	50158	50167	20 %	0 %	20 %	60 %	525833561
25	NC_021817	GAAGC	2	10	52325	52334	40 %	0 %	40 %	20 %	525833506
26	NC_021817	ATTAT	2	10	62062	62071	40 %	60 %	0 %	0 %	525833571
27	NC_021817	CTGCT	2	10	62605	62614	0 %	40 %	20 %	40 %	525833571
28	NC_021817	TATGT	2	10	62680	62689	20 %	60 %	20 %	0 %	525833571
29	NC_021817	AATAA	2	10	63060	63069	80 %	20 %	0 %	0 %	525833572
30	NC_021817	GCCAT	2	10	64956	64965	20 %	20 %	20 %	40 %	525833573
31	NC_021817	TTTTA	2	10	64976	64985	20 %	80 %	0 %	0 %	525833573
32	NC_021817	TTCCA	2	10	65613	65622	20 %	40 %	0 %	40 %	525833573
33	NC_021817	CTTTT	2	10	65831	65840	0 %	80 %	0 %	20 %	525833573
34	NC_021817	CTGAA	2	10	65883	65892	40 %	20 %	20 %	20 %	525833573
35	NC_021817	AGCTG	2	10	66626	66635	20 %	20 %	40 %	20 %	525833573
36	NC_021817	TCATT	2	10	66694	66703	20 %	60 %	0 %	20 %	525833573
37	NC_021817	CGATT	2	10	68241	68250	20 %	40 %	20 %	20 %	525833575
38	NC_021817	AAAGT	2	10	69988	69997	60 %	20 %	20 %	0 %	525833576
39	NC_021817	GTCAG	2	10	70931	70940	20 %	20 %	40 %	20 %	525833577

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.