MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 plasmid unnamed

Total Repeats: 1176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021817	CTG	2	6	62972	62977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833572
1002	NC_021817	TAAA	2	8	63016	63023	75 %	25 %	0 %	0 %	525833572
1003	NC_021817	AATAA	2	10	63060	63069	80 %	20 %	0 %	0 %	525833572
1004	NC_021817	TTAC	2	8	63115	63122	25 %	50 %	0 %	25 %	525833572
1005	NC_021817	CAT	2	6	63167	63172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833572
1006	NC_021817	TAC	2	6	63384	63389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833572
1007	NC_021817	ATC	2	6	63417	63422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833572
1008	NC_021817	TTC	2	6	63469	63474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833572
1009	NC_021817	ATC	2	6	63540	63545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833572
1010	NC_021817	ACT	2	6	63783	63788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833572
1011	NC_021817	GCC	2	6	63789	63794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833572
1012	NC_021817	AAT	2	6	63891	63896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833572
1013	NC_021817	CAG	2	6	63924	63929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833572
1014	NC_021817	ATA	2	6	64061	64066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833573
1015	NC_021817	CTC	2	6	64159	64164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833573
1016	NC_021817	GTT	2	6	64182	64187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833573
1017	NC_021817	CAG	2	6	64252	64257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833573
1018	NC_021817	CCT	2	6	64311	64316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833573
1019	NC_021817	ACA	2	6	64338	64343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525833573
1020	NC_021817	GAT	2	6	64350	64355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833573
1021	NC_021817	CAT	2	6	64387	64392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833573
1022	NC_021817	TGAC	2	8	64409	64416	25 %	25 %	25 %	25 %	525833573
1023	NC_021817	CATA	2	8	64425	64432	50 %	25 %	0 %	25 %	525833573
1024	NC_021817	TAT	2	6	64453	64458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833573
1025	NC_021817	T	6	6	64580	64585	0 %	100 %	0 %	0 %	525833573
1026	NC_021817	CTG	2	6	64704	64709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833573
1027	NC_021817	TGG	2	6	64873	64878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833573
1028	NC_021817	AT	4	8	64944	64951	50 %	50 %	0 %	0 %	525833573
1029	NC_021817	GCCAT	2	10	64956	64965	20 %	20 %	20 %	40 %	525833573
1030	NC_021817	CTGT	2	8	64968	64975	0 %	50 %	25 %	25 %	525833573
1031	NC_021817	TTTTA	2	10	64976	64985	20 %	80 %	0 %	0 %	525833573
1032	NC_021817	TCC	2	6	65028	65033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833573
1033	NC_021817	TAAA	2	8	65063	65070	75 %	25 %	0 %	0 %	525833573
1034	NC_021817	ATTA	2	8	65114	65121	50 %	50 %	0 %	0 %	525833573
1035	NC_021817	ATT	2	6	65267	65272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833573
1036	NC_021817	CCT	2	6	65287	65292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833573
1037	NC_021817	TAA	2	6	65302	65307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833573
1038	NC_021817	TCA	2	6	65358	65363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833573
1039	NC_021817	TAT	2	6	65378	65383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833573
1040	NC_021817	TCA	2	6	65409	65414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833573
1041	NC_021817	CTGT	2	8	65559	65566	0 %	50 %	25 %	25 %	525833573
1042	NC_021817	GTG	2	6	65580	65585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833573
1043	NC_021817	TTCCA	2	10	65613	65622	20 %	40 %	0 %	40 %	525833573
1044	NC_021817	CAG	2	6	65695	65700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833573
1045	NC_021817	TGA	2	6	65713	65718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833573
1046	NC_021817	TAT	2	6	65726	65731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833573
1047	NC_021817	T	7	7	65751	65757	0 %	100 %	0 %	0 %	525833573
1048	NC_021817	TTA	2	6	65814	65819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833573
1049	NC_021817	CTTTT	2	10	65831	65840	0 %	80 %	0 %	20 %	525833573
1050	NC_021817	CTGAA	2	10	65883	65892	40 %	20 %	20 %	20 %	525833573
1051	NC_021817	CCTG	2	8	65895	65902	0 %	25 %	25 %	50 %	525833573
1052	NC_021817	AGC	2	6	65949	65954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833573
1053	NC_021817	TAAT	2	8	65967	65974	50 %	50 %	0 %	0 %	525833573
1054	NC_021817	GAT	2	6	65979	65984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833573
1055	NC_021817	ATA	2	6	65985	65990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833573
1056	NC_021817	T	7	7	66008	66014	0 %	100 %	0 %	0 %	525833573
1057	NC_021817	GTA	2	6	66041	66046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833573
1058	NC_021817	TGA	2	6	66194	66199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833573
1059	NC_021817	C	6	6	66251	66256	0 %	0 %	0 %	100 %	525833573
1060	NC_021817	CTG	2	6	66437	66442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833573
1061	NC_021817	CATAAC	2	12	66475	66486	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525833573
1062	NC_021817	GTC	2	6	66570	66575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833573
1063	NC_021817	AGCTG	2	10	66626	66635	20 %	20 %	40 %	20 %	525833573
1064	NC_021817	ATA	2	6	66664	66669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833573
1065	NC_021817	A	6	6	66680	66685	100 %	0 %	0 %	0 %	525833573
1066	NC_021817	TCATT	2	10	66694	66703	20 %	60 %	0 %	20 %	525833573
1067	NC_021817	TCA	3	9	66721	66729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833573
1068	NC_021817	TCT	2	6	66733	66738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833573
1069	NC_021817	TTA	2	6	66739	66744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833573
1070	NC_021817	TTG	3	9	67443	67451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833574
1071	NC_021817	GCT	2	6	67490	67495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833574
1072	NC_021817	AT	4	8	67541	67548	50 %	50 %	0 %	0 %	525833574
1073	NC_021817	AAT	2	6	67669	67674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833574
1074	NC_021817	TCA	2	6	67686	67691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833574
1075	NC_021817	CGG	2	6	67693	67698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833574
1076	NC_021817	A	6	6	67699	67704	100 %	0 %	0 %	0 %	525833574
1077	NC_021817	C	7	7	67715	67721	0 %	0 %	0 %	100 %	525833574
1078	NC_021817	CGG	2	6	67876	67881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833574
1079	NC_021817	G	8	8	67889	67896	0 %	0 %	100 %	0 %	525833574
1080	NC_021817	GGT	2	6	67919	67924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833574
1081	NC_021817	TGG	2	6	67936	67941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833574
1082	NC_021817	TAA	2	6	67963	67968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833574
1083	NC_021817	ATA	2	6	68086	68091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833575
1084	NC_021817	T	6	6	68136	68141	0 %	100 %	0 %	0 %	525833575
1085	NC_021817	ATAA	2	8	68163	68170	75 %	25 %	0 %	0 %	525833575
1086	NC_021817	CGATT	2	10	68241	68250	20 %	40 %	20 %	20 %	525833575
1087	NC_021817	TCGT	2	8	68251	68258	0 %	50 %	25 %	25 %	525833575
1088	NC_021817	CGG	2	6	68283	68288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833575
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1091	NC_021817	T	6	6	68601	68606	0 %	100 %	0 %	0 %	525833575
1092	NC_021817	GCCA	2	8	68653	68660	25 %	0 %	25 %	50 %	525833575
1093	NC_021817	ACG	2	6	68752	68757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833575
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1095	NC_021817	CGA	2	6	68888	68893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833575
1096	NC_021817	CTT	2	6	68967	68972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833575
1097	NC_021817	CAT	2	6	69032	69037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833575
1098	NC_021817	GTCA	2	8	69117	69124	25 %	25 %	25 %	25 %	525833575
1099	NC_021817	GCC	2	6	69220	69225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833575
1100	NC_021817	A	7	7	69638	69644	100 %	0 %	0 %	0 %	525833576
1101	NC_021817	TTATAT	2	12	69652	69663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833576
1102	NC_021817	GCC	2	6	69690	69695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833576
1103	NC_021817	TAT	2	6	69731	69736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833576
1104	NC_021817	AT	3	6	69735	69740	50 %	50 %	0 %	0 %	525833576
1105	NC_021817	AGG	2	6	69755	69760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525833576
1106	NC_021817	A	6	6	69776	69781	100 %	0 %	0 %	0 %	525833576
1107	NC_021817	AAAT	2	8	69785	69792	75 %	25 %	0 %	0 %	525833576
1108	NC_021817	TAAT	2	8	69817	69824	50 %	50 %	0 %	0 %	525833576
1109	NC_021817	TAA	2	6	69833	69838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833576
1110	NC_021817	T	6	6	69849	69854	0 %	100 %	0 %	0 %	525833576
1111	NC_021817	CCT	2	6	69864	69869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833576
1112	NC_021817	TAA	2	6	69920	69925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833576
1113	NC_021817	TCC	2	6	69980	69985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833576
1114	NC_021817	AAAGT	2	10	69988	69997	60 %	20 %	20 %	0 %	525833576
1115	NC_021817	AATG	2	8	70029	70036	50 %	25 %	25 %	0 %	525833576
1116	NC_021817	CAT	2	6	70057	70062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833576
1117	NC_021817	ATT	2	6	70073	70078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833576
1118	NC_021817	AC	3	6	70141	70146	50 %	0 %	0 %	50 %	525833576
1119	NC_021817	ATT	2	6	70173	70178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833576
1120	NC_021817	CCT	2	6	70212	70217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833576
1121	NC_021817	ATA	2	6	70270	70275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833576
1122	NC_021817	TGA	2	6	70280	70285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833576
1123	NC_021817	TGG	2	6	70289	70294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833576
1124	NC_021817	AAT	3	9	70330	70338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833576
1125	NC_021817	T	8	8	70364	70371	0 %	100 %	0 %	0 %	525833577
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1127	NC_021817	AT	4	8	70505	70512	50 %	50 %	0 %	0 %	525833577
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