MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 plasmid unnamed

Total Repeats: 1176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021817	GCC	2	6	29811	29816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833532
502	NC_021817	CAG	2	6	29918	29923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833532
503	NC_021817	CTGC	2	8	29928	29935	0 %	25 %	25 %	50 %	525833532
504	NC_021817	T	7	7	29950	29956	0 %	100 %	0 %	0 %	525833532
505	NC_021817	CTGG	2	8	29993	30000	0 %	25 %	50 %	25 %	525833533
506	NC_021817	CAG	2	6	30033	30038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833533
507	NC_021817	CATC	2	8	30084	30091	25 %	25 %	0 %	50 %	525833533
508	NC_021817	GCG	2	6	30099	30104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833533
509	NC_021817	TG	4	8	30146	30153	0 %	50 %	50 %	0 %	525833533
510	NC_021817	AAT	2	6	30174	30179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833533
511	NC_021817	GAT	2	6	30190	30195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833533
512	NC_021817	GGAT	2	8	30225	30232	25 %	25 %	50 %	0 %	525833533
513	NC_021817	AAC	2	6	30254	30259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525833533
514	NC_021817	GGA	2	6	30333	30338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525833533
515	NC_021817	TAA	2	6	30403	30408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833533
516	NC_021817	T	7	7	30446	30452	0 %	100 %	0 %	0 %	525833503
517	NC_021817	ACGC	2	8	30490	30497	25 %	0 %	25 %	50 %	525833503
518	NC_021817	TGT	2	6	30581	30586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833503
519	NC_021817	TCCTGC	2	12	30623	30634	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525833503
520	NC_021817	TGC	2	6	30674	30679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833503
521	NC_021817	TG	3	6	30772	30777	0 %	50 %	50 %	0 %	525833534
522	NC_021817	GTC	2	6	30790	30795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833534
523	NC_021817	GCT	2	6	30830	30835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833534
524	NC_021817	TGGCA	2	10	30858	30867	20 %	20 %	40 %	20 %	525833534
525	NC_021817	CG	4	8	30921	30928	0 %	0 %	50 %	50 %	525833534
526	NC_021817	CTT	2	6	30929	30934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833534
527	NC_021817	GGT	2	6	31007	31012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833534
528	NC_021817	GTA	2	6	31032	31037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833534
529	NC_021817	AG	3	6	31041	31046	50 %	0 %	50 %	0 %	525833534
530	NC_021817	ACC	2	6	31068	31073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833534
531	NC_021817	CCTG	2	8	31081	31088	0 %	25 %	25 %	50 %	525833534
532	NC_021817	GGA	2	6	31140	31145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525833534
533	NC_021817	CAG	2	6	31200	31205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833534
534	NC_021817	TCT	2	6	31277	31282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833534
535	NC_021817	GTC	2	6	31290	31295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833534
536	NC_021817	ACGA	2	8	31326	31333	50 %	0 %	25 %	25 %	525833534
537	NC_021817	C	6	6	31355	31360	0 %	0 %	0 %	100 %	525833534
538	NC_021817	CCA	2	6	31496	31501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833534
539	NC_021817	GAA	2	6	31525	31530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525833534
540	NC_021817	CAT	2	6	31590	31595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833534
541	NC_021817	TCA	2	6	31616	31621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833534
542	NC_021817	CCG	2	6	31642	31647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833534
543	NC_021817	CTG	2	6	31649	31654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833534
544	NC_021817	GA	3	6	31740	31745	50 %	0 %	50 %	0 %	525833534
545	NC_021817	TTC	2	6	31753	31758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833534
546	NC_021817	GCA	2	6	31778	31783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833534
547	NC_021817	T	6	6	31866	31871	0 %	100 %	0 %	0 %	525833534
548	NC_021817	TCTG	2	8	31876	31883	0 %	50 %	25 %	25 %	525833534
549	NC_021817	TTA	2	6	31891	31896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833534
550	NC_021817	GCGG	2	8	31999	32006	0 %	0 %	75 %	25 %	525833534
551	NC_021817	TTC	2	6	32011	32016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833534
552	NC_021817	GAC	2	6	32096	32101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833534
553	NC_021817	GAC	2	6	32106	32111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833534
554	NC_021817	TTA	2	6	32113	32118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833534
555	NC_021817	TTC	2	6	32169	32174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833535
556	NC_021817	GTT	2	6	32197	32202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833535
557	NC_021817	GCAC	2	8	32216	32223	25 %	0 %	25 %	50 %	525833535
558	NC_021817	C	6	6	32259	32264	0 %	0 %	0 %	100 %	525833535
559	NC_021817	CGCC	2	8	32310	32317	0 %	0 %	25 %	75 %	525833535
560	NC_021817	G	6	6	32328	32333	0 %	0 %	100 %	0 %	525833535
561	NC_021817	ACC	2	6	32344	32349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833535
562	NC_021817	GCACG	2	10	32415	32424	20 %	0 %	40 %	40 %	525833535
563	NC_021817	TGA	2	6	32433	32438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833535
564	NC_021817	TCA	2	6	32505	32510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833535
565	NC_021817	CGTG	2	8	32596	32603	0 %	25 %	50 %	25 %	525833535
566	NC_021817	GCC	2	6	32749	32754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833535
567	NC_021817	AAC	2	6	32806	32811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525833535
568	NC_021817	CAT	2	6	32812	32817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833535
569	NC_021817	CAT	2	6	33040	33045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833536
570	NC_021817	GGA	2	6	33073	33078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525833536
571	NC_021817	T	6	6	33080	33085	0 %	100 %	0 %	0 %	525833536
572	NC_021817	TCC	2	6	33090	33095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833536
573	NC_021817	AGGA	2	8	33177	33184	50 %	0 %	50 %	0 %	525833536
574	NC_021817	TCA	2	6	33190	33195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833536
575	NC_021817	TTTCG	2	10	33218	33227	0 %	60 %	20 %	20 %	525833536
576	NC_021817	GAC	2	6	33263	33268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833536
577	NC_021817	CAGC	2	8	33304	33311	25 %	0 %	25 %	50 %	525833536
578	NC_021817	AAT	2	6	33359	33364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833536
579	NC_021817	AAT	2	6	33371	33376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833536
580	NC_021817	TGG	2	6	33379	33384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833536
581	NC_021817	ATA	2	6	33408	33413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833536
582	NC_021817	ATTT	2	8	33427	33434	25 %	75 %	0 %	0 %	525833537
583	NC_021817	AAT	2	6	33484	33489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833537
584	NC_021817	CGC	2	6	33549	33554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833537
585	NC_021817	CCG	2	6	33575	33580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833537
586	NC_021817	AAT	2	6	33582	33587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833537
587	NC_021817	AAC	2	6	33630	33635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525833537
588	NC_021817	TCA	2	6	33652	33657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833537
589	NC_021817	AAT	2	6	33669	33674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833537
590	NC_021817	TGA	2	6	33741	33746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833538
591	NC_021817	CAG	2	6	33790	33795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833538
592	NC_021817	GAT	3	9	33850	33858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833538
593	NC_021817	CAT	2	6	33862	33867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833538
594	NC_021817	CAT	2	6	33900	33905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833538
595	NC_021817	CAG	2	6	33919	33924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833538
596	NC_021817	CAG	2	6	33961	33966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833538
597	NC_021817	T	6	6	33997	34002	0 %	100 %	0 %	0 %	525833538
598	NC_021817	CAC	2	6	34011	34016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833538
599	NC_021817	GCCAT	2	10	34017	34026	20 %	20 %	20 %	40 %	525833538
600	NC_021817	T	6	6	34049	34054	0 %	100 %	0 %	0 %	525833538
601	NC_021817	GCC	2	6	34069	34074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833538
602	NC_021817	T	8	8	34221	34228	0 %	100 %	0 %	0 %	525833539
603	NC_021817	TTC	2	6	34239	34244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833539
604	NC_021817	GA	3	6	34254	34259	50 %	0 %	50 %	0 %	525833539
605	NC_021817	TCC	2	6	34276	34281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833539
606	NC_021817	T	7	7	34301	34307	0 %	100 %	0 %	0 %	525833539
607	NC_021817	CTC	2	6	34309	34314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525833539
608	NC_021817	TCA	2	6	34345	34350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833539
609	NC_021817	CCA	2	6	34399	34404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833539
610	NC_021817	TC	3	6	34445	34450	0 %	50 %	0 %	50 %	525833539
611	NC_021817	A	7	7	34655	34661	100 %	0 %	0 %	0 %	525833540
612	NC_021817	A	7	7	34676	34682	100 %	0 %	0 %	0 %	525833540
613	NC_021817	GA	3	6	34690	34695	50 %	0 %	50 %	0 %	525833540
614	NC_021817	GTT	2	6	34717	34722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833540
615	NC_021817	TCA	2	6	34739	34744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833540
616	NC_021817	TA	3	6	34745	34750	50 %	50 %	0 %	0 %	525833540
617	NC_021817	AT	4	8	34759	34766	50 %	50 %	0 %	0 %	525833540
618	NC_021817	TTG	2	6	34782	34787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833540
619	NC_021817	CT	3	6	34854	34859	0 %	50 %	0 %	50 %	525833540
620	NC_021817	TTAT	2	8	34874	34881	25 %	75 %	0 %	0 %	525833540
621	NC_021817	T	6	6	34920	34925	0 %	100 %	0 %	0 %	525833540
622	NC_021817	TCA	2	6	34998	35003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833540
623	NC_021817	CATA	2	8	35067	35074	50 %	25 %	0 %	25 %	525833540
624	NC_021817	CAA	2	6	35088	35093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525833540
625	NC_021817	ATC	2	6	35406	35411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833541
626	NC_021817	TCA	2	6	35413	35418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833541
627	NC_021817	CT	3	6	35439	35444	0 %	50 %	0 %	50 %	525833541
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629	NC_021817	C	6	6	35605	35610	0 %	0 %	0 %	100 %	525833541
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752	NC_021817	T	6	6	44819	44824	0 %	100 %	0 %	0 %	525833552
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