MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 3643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021815	TGTT	2	8	211234	211241	0 %	75 %	25 %	0 %	525832565
3502	NC_021815	CCG	2	6	211246	211251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832565
3503	NC_021815	TGG	2	6	211280	211285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832565
3504	NC_021815	CGG	2	6	211346	211351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832565
3505	NC_021815	CAAG	2	8	211484	211491	50 %	0 %	25 %	25 %	525832565
3506	NC_021815	CAGC	2	8	211509	211516	25 %	0 %	25 %	50 %	525832565
3507	NC_021815	GTG	2	6	211537	211542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832565
3508	NC_021815	TCG	2	6	211737	211742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832565
3509	NC_021815	GAT	2	6	211809	211814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832565
3510	NC_021815	GCA	2	6	211920	211925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832565
3511	NC_021815	GCT	2	6	211935	211940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832565
3512	NC_021815	CTG	2	6	211972	211977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832565
3513	NC_021815	GGC	3	9	211995	212003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832565
3514	NC_021815	TCA	2	6	212049	212054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832565
3515	NC_021815	CAA	2	6	212269	212274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832565
3516	NC_021815	GGT	2	6	212331	212336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832565
3517	NC_021815	GCCGC	2	10	212391	212400	0 %	0 %	40 %	60 %	525832565
3518	NC_021815	GGC	2	6	212417	212422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832565
3519	NC_021815	GCA	2	6	212475	212480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832565
3520	NC_021815	GTG	2	6	212596	212601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832565
3521	NC_021815	CAGGT	2	10	212650	212659	20 %	20 %	40 %	20 %	525832565
3522	NC_021815	CTGAA	2	10	212854	212863	40 %	20 %	20 %	20 %	525832565
3523	NC_021815	A	6	6	212862	212867	100 %	0 %	0 %	0 %	525832565
3524	NC_021815	TGG	2	6	212993	212998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832565
3525	NC_021815	AAC	2	6	213058	213063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832565
3526	NC_021815	GCT	2	6	213177	213182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832565
3527	NC_021815	ATG	2	6	213193	213198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832565
3528	NC_021815	GCA	2	6	213282	213287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832565
3529	NC_021815	TGG	3	9	213311	213319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832565
3530	NC_021815	GCA	2	6	213326	213331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832565
3531	NC_021815	TGA	2	6	213350	213355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832565
3532	NC_021815	CTGA	2	8	213399	213406	25 %	25 %	25 %	25 %	525832565
3533	NC_021815	GAT	2	6	213518	213523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832565
3534	NC_021815	AGG	2	6	213527	213532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832565
3535	NC_021815	TTCT	2	8	213541	213548	0 %	75 %	0 %	25 %	525832565
3536	NC_021815	ACA	2	6	213649	213654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832565
3537	NC_021815	GTTT	2	8	213776	213783	0 %	75 %	25 %	0 %	525832566
3538	NC_021815	T	7	7	213781	213787	0 %	100 %	0 %	0 %	525832566
3539	NC_021815	GGT	2	6	213800	213805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832566
3540	NC_021815	TCCC	2	8	213900	213907	0 %	25 %	0 %	75 %	525832566
3541	NC_021815	CAG	2	6	213918	213923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832566
3542	NC_021815	GT	3	6	214005	214010	0 %	50 %	50 %	0 %	525832566
3543	NC_021815	CAT	2	6	214015	214020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832566
3544	NC_021815	CAG	2	6	214045	214050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832566
3545	NC_021815	AGA	2	6	214830	214835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832356
3546	NC_021815	GGT	2	6	214918	214923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832356
3547	NC_021815	ACG	2	6	215016	215021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832356
3548	NC_021815	AGG	2	6	215049	215054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832356
3549	NC_021815	TGA	2	6	215060	215065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832356
3550	NC_021815	TCTG	2	8	215088	215095	0 %	50 %	25 %	25 %	525832567
3551	NC_021815	TCA	2	6	215107	215112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832567
3552	NC_021815	AGC	2	6	215154	215159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832567
3553	NC_021815	CCTTGG	2	12	215245	215256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832567
3554	NC_021815	CAG	3	9	215329	215337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832567
3555	NC_021815	TCT	2	6	215401	215406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832567
3556	NC_021815	CAG	2	6	215408	215413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832567
3557	NC_021815	TCT	2	6	215415	215420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832567
3558	NC_021815	CTAT	2	8	215567	215574	25 %	50 %	0 %	25 %	525832567
3559	NC_021815	ATT	2	6	215621	215626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832568
3560	NC_021815	AAG	3	9	215661	215669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832568
3561	NC_021815	GAT	2	6	215741	215746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832568
3562	NC_021815	CAG	2	6	215859	215864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832568
3563	NC_021815	CAT	2	6	215872	215877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832568
3564	NC_021815	CT	3	6	215885	215890	0 %	50 %	0 %	50 %	525832568
3565	NC_021815	TGA	2	6	215929	215934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832568
3566	NC_021815	TGC	2	6	215941	215946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832568
3567	NC_021815	GA	3	6	215977	215982	50 %	0 %	50 %	0 %	525832568
3568	NC_021815	GA	3	6	216016	216021	50 %	0 %	50 %	0 %	525832568
3569	NC_021815	TGG	2	6	216033	216038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832568
3570	NC_021815	ACAG	2	8	216047	216054	50 %	0 %	25 %	25 %	525832568
3571	NC_021815	AAC	2	6	216076	216081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832568
3572	NC_021815	CAT	2	6	216115	216120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832568
3573	NC_021815	GAA	2	6	216122	216127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832568
3574	NC_021815	AC	3	6	216155	216160	50 %	0 %	0 %	50 %	525832568
3575	NC_021815	A	6	6	216170	216175	100 %	0 %	0 %	0 %	525832568
3576	NC_021815	ATC	2	6	216289	216294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832569
3577	NC_021815	GTG	2	6	216395	216400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832569
3578	NC_021815	CA	3	6	216418	216423	50 %	0 %	0 %	50 %	525832569
3579	NC_021815	CT	3	6	216438	216443	0 %	50 %	0 %	50 %	525832569
3580	NC_021815	TGG	2	6	216468	216473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832569
3581	NC_021815	TTAT	2	8	216571	216578	25 %	75 %	0 %	0 %	525832570
3582	NC_021815	ACA	2	6	216711	216716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832570
3583	NC_021815	GAA	2	6	216748	216753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832570
3584	NC_021815	TTC	2	6	216764	216769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832570
3585	NC_021815	ATT	2	6	216805	216810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832570
3586	NC_021815	CAT	2	6	216828	216833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832570
3587	NC_021815	GAC	2	6	216891	216896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832570
3588	NC_021815	TTC	2	6	216899	216904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832570
3589	NC_021815	GT	3	6	216911	216916	0 %	50 %	50 %	0 %	525832570
3590	NC_021815	CTT	2	6	217053	217058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832570
3591	NC_021815	AT	3	6	217082	217087	50 %	50 %	0 %	0 %	525832570
3592	NC_021815	CGC	2	6	217140	217145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832570
3593	NC_021815	CTGC	2	8	217191	217198	0 %	25 %	25 %	50 %	525832570
3594	NC_021815	TGC	2	6	217223	217228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832570
3595	NC_021815	TGA	2	6	217244	217249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832570
3596	NC_021815	CCG	2	6	217272	217277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832570
3597	NC_021815	AT	3	6	217325	217330	50 %	50 %	0 %	0 %	525832570
3598	NC_021815	CTT	2	6	217342	217347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832570
3599	NC_021815	GT	3	6	217374	217379	0 %	50 %	50 %	0 %	525832570
3600	NC_021815	TCA	2	6	217404	217409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832570
3601	NC_021815	CAT	2	6	217425	217430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832570
3602	NC_021815	GCG	2	6	217434	217439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832570
3603	NC_021815	GCA	2	6	217450	217455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832570
3604	NC_021815	GGACG	2	10	217607	217616	20 %	0 %	60 %	20 %	525832570
3605	NC_021815	T	7	7	217657	217663	0 %	100 %	0 %	0 %	525832570
3606	NC_021815	GCT	2	6	217693	217698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832570
3607	NC_021815	CCAGTT	2	12	217701	217712	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525832570
3608	NC_021815	CAC	3	9	217746	217754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832570
3609	NC_021815	TCT	2	6	217772	217777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832570
3610	NC_021815	CGA	2	6	217823	217828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832570
3611	NC_021815	CTGTT	2	10	217892	217901	0 %	60 %	20 %	20 %	525832570
3612	NC_021815	CGT	2	6	217904	217909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832570
3613	NC_021815	CAG	2	6	217912	217917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832570
3614	NC_021815	ACG	2	6	217939	217944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832570
3615	NC_021815	TCT	2	6	218024	218029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832570
3616	NC_021815	TTC	2	6	218038	218043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832570
3617	NC_021815	GTT	2	6	218097	218102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832570
3618	NC_021815	AG	3	6	218134	218139	50 %	0 %	50 %	0 %	525832570
3619	NC_021815	ACA	2	6	218217	218222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832571
3620	NC_021815	GAG	2	6	218275	218280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832571
3621	NC_021815	TCC	2	6	218348	218353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832571
3622	NC_021815	CATCAG	2	12	218379	218390	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525832571
3623	NC_021815	ATC	2	6	218561	218566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832571
3624	NC_021815	AGC	2	6	218602	218607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832572
3625	NC_021815	AGT	2	6	218676	218681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832572
3626	NC_021815	AGC	2	6	218706	218711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832572
3627	NC_021815	TAA	2	6	218751	218756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832572
3628	NC_021815	AGA	2	6	218772	218777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832572
3629	NC_021815	GTT	2	6	218779	218784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832572
3630	NC_021815	CGC	2	6	218794	218799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832572
3631	NC_021815	CA	3	6	218883	218888	50 %	0 %	0 %	50 %	525832572
3632	NC_021815	ATTC	2	8	218930	218937	25 %	50 %	0 %	25 %	525832572
3633	NC_021815	T	7	7	219351	219357	0 %	100 %	0 %	0 %	525832573
3634	NC_021815	CTT	2	6	219359	219364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832573
3635	NC_021815	ATT	2	6	219546	219551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832573
3636	NC_021815	CTTTT	2	10	219569	219578	0 %	80 %	0 %	20 %	525832573
3637	NC_021815	TCT	4	12	219579	219590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832573
3638	NC_021815	TCC	2	6	219606	219611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832573
3639	NC_021815	ATT	2	6	219717	219722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832573
3640	NC_021815	CT	3	6	219725	219730	0 %	50 %	0 %	50 %	525832573
3641	NC_021815	CTC	2	6	219758	219763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832573
3642	NC_021815	CT	3	6	219874	219879	0 %	50 %	0 %	50 %	525832574
3643	NC_021815	TGC	2	6	219976	219981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832574

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