MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 3643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021815	TGGC	2	8	154062	154069	0 %	25 %	50 %	25 %	525832536
2502	NC_021815	CAT	2	6	154220	154225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832536
2503	NC_021815	GTC	2	6	156764	156769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832537
2504	NC_021815	CCG	2	6	156837	156842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832537
2505	NC_021815	AATCG	2	10	156875	156884	40 %	20 %	20 %	20 %	525832537
2506	NC_021815	A	6	6	156984	156989	100 %	0 %	0 %	0 %	525832537
2507	NC_021815	GGC	2	6	157012	157017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832537
2508	NC_021815	TAT	2	6	157034	157039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832537
2509	NC_021815	CTTA	2	8	157153	157160	25 %	50 %	0 %	25 %	525832538
2510	NC_021815	GAT	2	6	157256	157261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832538
2511	NC_021815	ATG	2	6	157475	157480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832538
2512	NC_021815	TTG	2	6	157508	157513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832538
2513	NC_021815	TG	3	6	157512	157517	0 %	50 %	50 %	0 %	525832538
2514	NC_021815	TTC	2	6	157526	157531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832538
2515	NC_021815	T	7	7	157630	157636	0 %	100 %	0 %	0 %	525832538
2516	NC_021815	ATGC	2	8	157642	157649	25 %	25 %	25 %	25 %	525832538
2517	NC_021815	CTG	2	6	157657	157662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832538
2518	NC_021815	AGA	2	6	157746	157751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832538
2519	NC_021815	GCA	2	6	157782	157787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832538
2520	NC_021815	CAC	2	6	157800	157805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832538
2521	NC_021815	GGA	2	6	157920	157925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832538
2522	NC_021815	GGC	3	9	158186	158194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832539
2523	NC_021815	ATC	2	6	159629	159634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832349
2524	NC_021815	AT	3	6	159693	159698	50 %	50 %	0 %	0 %	525832349
2525	NC_021815	T	6	6	159744	159749	0 %	100 %	0 %	0 %	525832349
2526	NC_021815	CAG	2	6	159823	159828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832349
2527	NC_021815	CCAT	2	8	159936	159943	25 %	25 %	0 %	50 %	525832349
2528	NC_021815	CGA	2	6	159956	159961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832349
2529	NC_021815	AG	3	6	160012	160017	50 %	0 %	50 %	0 %	525832349
2530	NC_021815	GCG	2	6	160050	160055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832349
2531	NC_021815	A	7	7	160069	160075	100 %	0 %	0 %	0 %	525832349
2532	NC_021815	TGA	2	6	160114	160119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832349
2533	NC_021815	TTA	2	6	160154	160159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832349
2534	NC_021815	ATT	2	6	160226	160231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832349
2535	NC_021815	GCT	2	6	160258	160263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832349
2536	NC_021815	AAC	2	6	160266	160271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832349
2537	NC_021815	TAT	2	6	160292	160297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832349
2538	NC_021815	TGA	2	6	160317	160322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832349
2539	NC_021815	CCA	2	6	160325	160330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832349
2540	NC_021815	GTT	2	6	160357	160362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832349
2541	NC_021815	TAC	2	6	160442	160447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832349
2542	NC_021815	CGG	2	6	160527	160532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832349
2543	NC_021815	GCT	2	6	160543	160548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832349
2544	NC_021815	GCG	2	6	160627	160632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832349
2545	NC_021815	TGG	2	6	160647	160652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832349
2546	NC_021815	ATC	2	6	160663	160668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832349
2547	NC_021815	TAA	2	6	160797	160802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
2548	NC_021815	CAG	2	6	160815	160820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832350
2549	NC_021815	CAG	2	6	160830	160835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832350
2550	NC_021815	AAT	2	6	160902	160907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
2551	NC_021815	CGAAA	2	10	160966	160975	60 %	0 %	20 %	20 %	525832350
2552	NC_021815	ATA	2	6	161053	161058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
2553	NC_021815	TAAA	2	8	161106	161113	75 %	25 %	0 %	0 %	525832350
2554	NC_021815	CTT	2	6	161240	161245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832350
2555	NC_021815	ACGAGA	2	12	161267	161278	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525832350
2556	NC_021815	AAT	2	6	161286	161291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
2557	NC_021815	GTGC	2	8	161319	161326	0 %	25 %	50 %	25 %	525832350
2558	NC_021815	TGAA	2	8	161401	161408	50 %	25 %	25 %	0 %	525832350
2559	NC_021815	AAG	2	6	161419	161424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832350
2560	NC_021815	GAAA	2	8	161453	161460	75 %	0 %	25 %	0 %	525832350
2561	NC_021815	GCG	2	6	161467	161472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832350
2562	NC_021815	ATC	2	6	161509	161514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832350
2563	NC_021815	CAC	2	6	161547	161552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832350
2564	NC_021815	ATA	2	6	161576	161581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
2565	NC_021815	CCG	2	6	161590	161595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832350
2566	NC_021815	ATA	2	6	161638	161643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
2567	NC_021815	TA	3	6	161682	161687	50 %	50 %	0 %	0 %	525832350
2568	NC_021815	TAAA	2	8	161719	161726	75 %	25 %	0 %	0 %	525832350
2569	NC_021815	ATA	2	6	161800	161805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
2570	NC_021815	GAT	2	6	161886	161891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832350
2571	NC_021815	TAA	2	6	161900	161905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832350
2572	NC_021815	GTC	2	6	162069	162074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832350
2573	NC_021815	GCT	2	6	162201	162206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832351
2574	NC_021815	AAT	2	6	162233	162238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832351
2575	NC_021815	GGA	2	6	162271	162276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832351
2576	NC_021815	GT	3	6	162326	162331	0 %	50 %	50 %	0 %	525832351
2577	NC_021815	GAG	2	6	162383	162388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832351
2578	NC_021815	ATC	2	6	162408	162413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832351
2579	NC_021815	GCC	2	6	162431	162436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832351
2580	NC_021815	TTC	2	6	162548	162553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832351
2581	NC_021815	ATT	2	6	162578	162583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832351
2582	NC_021815	CGC	2	6	162619	162624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832351
2583	NC_021815	GCC	2	6	162659	162664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832351
2584	NC_021815	CAA	2	6	162682	162687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832351
2585	NC_021815	TGA	2	6	162700	162705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832351
2586	NC_021815	AAT	2	6	162719	162724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832351
2587	NC_021815	GCT	2	6	162805	162810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832351
2588	NC_021815	TAT	2	6	162832	162837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832351
2589	NC_021815	CCA	2	6	162838	162843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832351
2590	NC_021815	TAA	2	6	162845	162850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832351
2591	NC_021815	CGC	3	9	162872	162880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832351
2592	NC_021815	ACT	2	6	162933	162938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832351
2593	NC_021815	CGA	2	6	162988	162993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832351
2594	NC_021815	TG	3	6	163024	163029	0 %	50 %	50 %	0 %	525832351
2595	NC_021815	GTT	2	6	163107	163112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832351
2596	NC_021815	T	6	6	163175	163180	0 %	100 %	0 %	0 %	525832351
2597	NC_021815	GCGG	2	8	163247	163254	0 %	0 %	75 %	25 %	525832351
2598	NC_021815	GC	3	6	163312	163317	0 %	0 %	50 %	50 %	525832351
2599	NC_021815	ATG	2	6	163681	163686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832540
2600	NC_021815	CG	3	6	165058	165063	0 %	0 %	50 %	50 %	525832352
2601	NC_021815	ATC	2	6	165077	165082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832352
2602	NC_021815	A	6	6	165191	165196	100 %	0 %	0 %	0 %	525832352
2603	NC_021815	TGA	2	6	165243	165248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832352
2604	NC_021815	GAGC	2	8	165253	165260	25 %	0 %	50 %	25 %	525832352
2605	NC_021815	GCA	2	6	165293	165298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832352
2606	NC_021815	AAC	2	6	165349	165354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832352
2607	NC_021815	TCC	2	6	165369	165374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832352
2608	NC_021815	GCC	2	6	165412	165417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832352
2609	NC_021815	TGT	2	6	165456	165461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832352
2610	NC_021815	GAA	2	6	165485	165490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832352
2611	NC_021815	ACG	2	6	165530	165535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832352
2612	NC_021815	TTG	2	6	165620	165625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832352
2613	NC_021815	ATG	2	6	165728	165733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832352
2614	NC_021815	AAC	2	6	165750	165755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832352
2615	NC_021815	AGA	2	6	166157	166162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832541
2616	NC_021815	GCT	2	6	166218	166223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832541
2617	NC_021815	ACG	2	6	166251	166256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832541
2618	NC_021815	GCT	2	6	166317	166322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832541
2619	NC_021815	AAT	2	6	166370	166375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832541
2620	NC_021815	ATCA	2	8	166428	166435	50 %	25 %	0 %	25 %	525832541
2621	NC_021815	GCT	2	6	166446	166451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832541
2622	NC_021815	CGA	2	6	166754	166759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832541
2623	NC_021815	TGT	2	6	166793	166798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832541
2624	NC_021815	GTC	2	6	166845	166850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832541
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2634	NC_021815	GTC	2	6	167298	167303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832541
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2654	NC_021815	TTG	2	6	168176	168181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832541
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2740	NC_021815	TCAG	2	8	172023	172030	25 %	25 %	25 %	25 %	525832544
2741	NC_021815	GCA	2	6	172036	172041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832544
2742	NC_021815	TGT	2	6	172051	172056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832544
2743	NC_021815	GCTG	2	8	172138	172145	0 %	25 %	50 %	25 %	525832544
2744	NC_021815	CTG	2	6	172154	172159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
2745	NC_021815	TTC	2	6	172193	172198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832544
2746	NC_021815	GCA	2	6	172210	172215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832544
2747	NC_021815	GCC	2	6	172218	172223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832544
2748	NC_021815	CGC	2	6	172316	172321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832544
2749	NC_021815	GCT	2	6	172369	172374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
2750	NC_021815	ATC	2	6	172404	172409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832544
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2752	NC_021815	TTGC	2	8	172441	172448	0 %	50 %	25 %	25 %	525832544
2753	NC_021815	GC	3	6	172471	172476	0 %	0 %	50 %	50 %	525832544
2754	NC_021815	GCC	2	6	172587	172592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832544
2755	NC_021815	CGC	2	6	172708	172713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832544
2756	NC_021815	CAG	2	6	172754	172759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832544
2757	NC_021815	C	6	6	172802	172807	0 %	0 %	0 %	100 %	525832544
2758	NC_021815	TGC	2	6	172857	172862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
2759	NC_021815	GCT	2	6	172921	172926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
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2761	NC_021815	CAG	3	9	172982	172990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832544
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2763	NC_021815	CCT	2	6	173062	173067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832544
2764	NC_021815	CGG	3	9	173103	173111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832544
2765	NC_021815	CCG	2	6	173205	173210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832544
2766	NC_021815	GAC	2	6	173246	173251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832544
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2770	NC_021815	TGC	2	6	173598	173603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
2771	NC_021815	CGT	2	6	173650	173655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
2772	NC_021815	CT	3	6	173789	173794	0 %	50 %	0 %	50 %	525832544
2773	NC_021815	GCA	2	6	173821	173826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832544
2774	NC_021815	CCAG	2	8	173953	173960	25 %	0 %	25 %	50 %	525832544
2775	NC_021815	TCA	2	6	173979	173984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832544
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2779	NC_021815	GTCT	2	8	174182	174189	0 %	50 %	25 %	25 %	525832544
2780	NC_021815	TGA	2	6	174387	174392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832544
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2782	NC_021815	GCG	2	6	174406	174411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832544
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2815	NC_021815	CGT	2	6	175595	175600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
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2821	NC_021815	TCA	2	6	175863	175868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832544
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2823	NC_021815	GGC	2	6	175889	175894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832544
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2828	NC_021815	CTG	2	6	176150	176155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
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2835	NC_021815	TCA	2	6	176331	176336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832544
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2839	NC_021815	GCCC	2	8	176473	176480	0 %	0 %	25 %	75 %	525832544
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2844	NC_021815	GGC	2	6	176783	176788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832544
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2846	NC_021815	AG	3	6	176855	176860	50 %	0 %	50 %	0 %	525832544
2847	NC_021815	CG	3	6	176885	176890	0 %	0 %	50 %	50 %	525832544
2848	NC_021815	CAAT	2	8	176902	176909	50 %	25 %	0 %	25 %	525832544
2849	NC_021815	GCT	2	6	176931	176936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
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2851	NC_021815	ATC	2	6	176982	176987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832544
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2853	NC_021815	TCG	2	6	177036	177041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
2854	NC_021815	GC	3	6	177044	177049	0 %	0 %	50 %	50 %	525832544
2855	NC_021815	GCG	2	6	177153	177158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832544
2856	NC_021815	CCT	2	6	177334	177339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832544
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2858	NC_021815	GTC	2	6	177524	177529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
2859	NC_021815	GCCAC	2	10	177538	177547	20 %	0 %	20 %	60 %	525832544
2860	NC_021815	GGC	2	6	177565	177570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832544
2861	NC_021815	TGC	2	6	177576	177581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832544
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2984	NC_021815	CTG	2	6	182969	182974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
2985	NC_021815	GTT	2	6	183028	183033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832545
2986	NC_021815	GGC	2	6	183062	183067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
2987	NC_021815	GAT	2	6	183085	183090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832545
2988	NC_021815	CCTG	2	8	183120	183127	0 %	25 %	25 %	50 %	525832545
2989	NC_021815	CAG	2	6	183155	183160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
2990	NC_021815	CGC	2	6	183166	183171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
2991	NC_021815	GAA	2	6	183179	183184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832545
2992	NC_021815	TGC	2	6	183222	183227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
2993	NC_021815	GGC	2	6	183233	183238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
2994	NC_021815	GAC	2	6	183304	183309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
2995	NC_021815	GGC	2	6	183413	183418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
2996	NC_021815	GGC	2	6	183515	183520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
2997	NC_021815	CGC	2	6	183533	183538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
2998	NC_021815	GCA	2	6	183556	183561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
2999	NC_021815	AGC	2	6	183642	183647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3000	NC_021815	GC	3	6	183646	183651	0 %	0 %	50 %	50 %	525832545

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