MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 3643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021815	ATG	2	6	123039	123044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832507
2002	NC_021815	TAC	2	6	123261	123266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832508
2003	NC_021815	GGC	2	6	123317	123322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832508
2004	NC_021815	GTC	2	6	123361	123366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832508
2005	NC_021815	CGG	2	6	123386	123391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832508
2006	NC_021815	TGG	2	6	123431	123436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832508
2007	NC_021815	ATG	2	6	123466	123471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832508
2008	NC_021815	GCT	2	6	123479	123484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832508
2009	NC_021815	CAA	2	6	123570	123575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832508
2010	NC_021815	A	6	6	123672	123677	100 %	0 %	0 %	0 %	525832508
2011	NC_021815	GTC	2	6	123885	123890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832508
2012	NC_021815	TGT	2	6	123917	123922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832508
2013	NC_021815	GA	3	6	123923	123928	50 %	0 %	50 %	0 %	525832508
2014	NC_021815	CTGG	2	8	123956	123963	0 %	25 %	50 %	25 %	525832508
2015	NC_021815	CGCT	2	8	123998	124005	0 %	25 %	25 %	50 %	525832508
2016	NC_021815	GGT	2	6	124011	124016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832508
2017	NC_021815	ACA	2	6	124091	124096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832508
2018	NC_021815	CA	3	6	124103	124108	50 %	0 %	0 %	50 %	525832508
2019	NC_021815	AGC	2	6	124122	124127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832508
2020	NC_021815	GTT	2	6	124143	124148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832508
2021	NC_021815	AAC	2	6	124162	124167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832508
2022	NC_021815	GCT	2	6	124178	124183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832508
2023	NC_021815	AAG	2	6	124192	124197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832508
2024	NC_021815	GAGAA	2	10	124203	124212	60 %	0 %	40 %	0 %	525832508
2025	NC_021815	TGA	2	6	124349	124354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832508
2026	NC_021815	A	6	6	124360	124365	100 %	0 %	0 %	0 %	525832508
2027	NC_021815	CTA	2	6	124397	124402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832508
2028	NC_021815	CGA	2	6	124403	124408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832508
2029	NC_021815	A	6	6	124512	124517	100 %	0 %	0 %	0 %	525832508
2030	NC_021815	AAG	2	6	124536	124541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832508
2031	NC_021815	ATG	2	6	124542	124547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832508
2032	NC_021815	GT	3	6	124825	124830	0 %	50 %	50 %	0 %	525832508
2033	NC_021815	CTG	2	6	124836	124841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832508
2034	NC_021815	TGA	2	6	124894	124899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832508
2035	NC_021815	ACG	2	6	125012	125017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832509
2036	NC_021815	ATG	2	6	125119	125124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832509
2037	NC_021815	CCT	2	6	125132	125137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832509
2038	NC_021815	AAG	2	6	125142	125147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832509
2039	NC_021815	TGA	2	6	125178	125183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832509
2040	NC_021815	CGA	2	6	125186	125191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832509
2041	NC_021815	TC	3	6	125363	125368	0 %	50 %	0 %	50 %	525832510
2042	NC_021815	AAG	2	6	125374	125379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832510
2043	NC_021815	AAG	2	6	125480	125485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832510
2044	NC_021815	T	7	7	125606	125612	0 %	100 %	0 %	0 %	525832511
2045	NC_021815	GTC	2	6	125617	125622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832511
2046	NC_021815	GGC	2	6	125626	125631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832511
2047	NC_021815	A	7	7	125663	125669	100 %	0 %	0 %	0 %	525832511
2048	NC_021815	T	7	7	125801	125807	0 %	100 %	0 %	0 %	525832512
2049	NC_021815	ATCT	2	8	125842	125849	25 %	50 %	0 %	25 %	525832512
2050	NC_021815	GCT	2	6	125857	125862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832512
2051	NC_021815	TAA	2	6	125967	125972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832512
2052	NC_021815	CAG	2	6	125981	125986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832512
2053	NC_021815	ATG	2	6	126294	126299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832513
2054	NC_021815	ACT	2	6	126306	126311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832513
2055	NC_021815	GAA	2	6	126317	126322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832513
2056	NC_021815	TAA	2	6	126329	126334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832513
2057	NC_021815	GAG	2	6	126408	126413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832513
2058	NC_021815	T	6	6	126469	126474	0 %	100 %	0 %	0 %	525832513
2059	NC_021815	AG	3	6	126477	126482	50 %	0 %	50 %	0 %	525832513
2060	NC_021815	GGTGCT	2	12	126486	126497	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525832513
2061	NC_021815	TGG	2	6	126508	126513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832513
2062	NC_021815	CCA	2	6	126553	126558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832513
2063	NC_021815	CTA	2	6	126610	126615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832513
2064	NC_021815	CTC	2	6	126672	126677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832513
2065	NC_021815	CAAG	2	8	126686	126693	50 %	0 %	25 %	25 %	525832513
2066	NC_021815	A	6	6	126801	126806	100 %	0 %	0 %	0 %	525832513
2067	NC_021815	ACG	2	6	126967	126972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832513
2068	NC_021815	CAT	2	6	127295	127300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832514
2069	NC_021815	GAA	2	6	127319	127324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832514
2070	NC_021815	GAG	2	6	127338	127343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832514
2071	NC_021815	AAGGG	2	10	127345	127354	40 %	0 %	60 %	0 %	525832514
2072	NC_021815	CAA	2	6	127564	127569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832514
2073	NC_021815	TG	3	6	127576	127581	0 %	50 %	50 %	0 %	525832514
2074	NC_021815	TAC	2	6	127674	127679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832514
2075	NC_021815	TGA	2	6	127694	127699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832514
2076	NC_021815	CGG	2	6	127706	127711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832514
2077	NC_021815	GGC	2	6	127714	127719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832514
2078	NC_021815	CAA	2	6	127797	127802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832514
2079	NC_021815	GAT	2	6	127851	127856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832514
2080	NC_021815	ATG	2	6	127918	127923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832514
2081	NC_021815	GAC	2	6	127930	127935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832514
2082	NC_021815	ATCAC	2	10	127963	127972	40 %	20 %	0 %	40 %	525832514
2083	NC_021815	CTG	2	6	128074	128079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832514
2084	NC_021815	CAGTAC	2	12	128091	128102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525832514
2085	NC_021815	CT	3	6	128190	128195	0 %	50 %	0 %	50 %	525832514
2086	NC_021815	TGG	2	6	128200	128205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832514
2087	NC_021815	ATG	2	6	128239	128244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832514
2088	NC_021815	AGA	2	6	128287	128292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832514
2089	NC_021815	TGT	2	6	128396	128401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832514
2090	NC_021815	ACC	2	6	128535	128540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832514
2091	NC_021815	CGAC	2	8	128569	128576	25 %	0 %	25 %	50 %	525832514
2092	NC_021815	CTTC	2	8	128580	128587	0 %	50 %	0 %	50 %	525832514
2093	NC_021815	AACC	2	8	128614	128621	50 %	0 %	0 %	50 %	525832514
2094	NC_021815	ACA	2	6	128832	128837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832514
2095	NC_021815	ACG	2	6	128872	128877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832514
2096	NC_021815	ATG	2	6	128995	129000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832514
2097	NC_021815	CCT	2	6	129008	129013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832514
2098	NC_021815	ACG	2	6	129058	129063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832514
2099	NC_021815	TGG	2	6	129076	129081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832514
2100	NC_021815	AGA	2	6	129143	129148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832514
2101	NC_021815	GGCT	2	8	129210	129217	0 %	25 %	50 %	25 %	525832514
2102	NC_021815	TGG	2	6	129268	129273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832514
2103	NC_021815	AC	4	8	129307	129314	50 %	0 %	0 %	50 %	525832514
2104	NC_021815	ACG	2	6	129325	129330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832514
2105	NC_021815	CTA	2	6	129440	129445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832514
2106	NC_021815	CAC	2	6	129497	129502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832514
2107	NC_021815	AGCTAC	2	12	129567	129578	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525832514
2108	NC_021815	ATC	2	6	129594	129599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832514
2109	NC_021815	ACG	2	6	129646	129651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832514
2110	NC_021815	GAT	2	6	129693	129698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832514
2111	NC_021815	TAC	2	6	129779	129784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832514
2112	NC_021815	TCA	2	6	129811	129816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832514
2113	NC_021815	CAC	2	6	129905	129910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832514
2114	NC_021815	CGAG	2	8	129932	129939	25 %	0 %	50 %	25 %	525832514
2115	NC_021815	CTA	2	6	130033	130038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832514
2116	NC_021815	GAC	2	6	130092	130097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832514
2117	NC_021815	GTC	2	6	130106	130111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832514
2118	NC_021815	GCT	2	6	130190	130195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832515
2119	NC_021815	GCG	2	6	130240	130245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832515
2120	NC_021815	CAA	2	6	130256	130261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832515
2121	NC_021815	GTC	2	6	130265	130270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832515
2122	NC_021815	GCCGT	2	10	130275	130284	0 %	20 %	40 %	40 %	525832515
2123	NC_021815	TGG	2	6	130300	130305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832515
2124	NC_021815	GCC	2	6	130341	130346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832515
2125	NC_021815	GCT	3	9	130378	130386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832515
2126	NC_021815	AGA	3	9	130420	130428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832515
2127	NC_021815	GC	3	6	130448	130453	0 %	0 %	50 %	50 %	525832515
2128	NC_021815	CGG	2	6	130482	130487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832515
2129	NC_021815	GCA	2	6	130600	130605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832515
2130	NC_021815	CTTG	2	8	130627	130634	0 %	50 %	25 %	25 %	525832515
2131	NC_021815	GCT	2	6	130700	130705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832515
2132	NC_021815	ATC	2	6	130707	130712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832515
2133	NC_021815	GGC	2	6	130730	130735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832515
2134	NC_021815	GCGAA	2	10	130788	130797	40 %	0 %	40 %	20 %	525832515
2135	NC_021815	CAG	2	6	130889	130894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832515
2136	NC_021815	ACC	2	6	130935	130940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832515
2137	NC_021815	GTCC	2	8	130986	130993	0 %	25 %	25 %	50 %	525832515
2138	NC_021815	TGC	2	6	131041	131046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832515
2139	NC_021815	CGA	2	6	131069	131074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832515
2140	NC_021815	GTG	2	6	131079	131084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832515
2141	NC_021815	GGT	2	6	131204	131209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832515
2142	NC_021815	TCG	2	6	131266	131271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832515
2143	NC_021815	GT	3	6	131315	131320	0 %	50 %	50 %	0 %	525832515
2144	NC_021815	GCA	3	9	131386	131394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832515
2145	NC_021815	GCG	2	6	131421	131426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832515
2146	NC_021815	GCG	2	6	131446	131451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832515
2147	NC_021815	GGT	2	6	131471	131476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832515
2148	NC_021815	GAT	2	6	131477	131482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832515
2149	NC_021815	CAA	2	6	131540	131545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832515
2150	NC_021815	TCG	2	6	131649	131654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832515
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2153	NC_021815	GTA	2	6	131738	131743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832515
2154	NC_021815	CGT	2	6	131758	131763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832515
2155	NC_021815	TGA	2	6	131794	131799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832515
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2158	NC_021815	GCA	2	6	131854	131859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832515
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2161	NC_021815	GCG	2	6	131936	131941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832515
2162	NC_021815	GGC	2	6	132023	132028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832515
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2195	NC_021815	A	6	6	136772	136777	100 %	0 %	0 %	0 %	525832518
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2222	NC_021815	TAAT	2	8	138510	138517	50 %	50 %	0 %	0 %	525832520
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2230	NC_021815	AC	3	6	138976	138981	50 %	0 %	0 %	50 %	525832521
2231	NC_021815	GGA	2	6	139008	139013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832521
2232	NC_021815	AGG	2	6	139016	139021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832521
2233	NC_021815	TGG	2	6	139025	139030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832521
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2235	NC_021815	CGG	2	6	139079	139084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832521
2236	NC_021815	TGG	2	6	139088	139093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832521
2237	NC_021815	TGG	2	6	139097	139102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832521
2238	NC_021815	GGT	2	6	139107	139112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832521
2239	NC_021815	GCT	2	6	139125	139130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832521
2240	NC_021815	G	7	7	139172	139178	0 %	0 %	100 %	0 %	525832522
2241	NC_021815	GGA	2	6	139227	139232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832522
2242	NC_021815	TTTGA	2	10	139239	139248	20 %	60 %	20 %	0 %	525832522
2243	NC_021815	GGA	2	6	139368	139373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832523
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2365	NC_021815	ATT	2	6	145748	145753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832527
2366	NC_021815	CAT	2	6	145771	145776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832527
2367	NC_021815	GAC	2	6	145834	145839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832527
2368	NC_021815	TTC	2	6	145842	145847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832527
2369	NC_021815	GT	3	6	145854	145859	0 %	50 %	50 %	0 %	525832527
2370	NC_021815	CTT	2	6	145996	146001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832527
2371	NC_021815	AT	3	6	146025	146030	50 %	50 %	0 %	0 %	525832527
2372	NC_021815	CGC	2	6	146083	146088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832527
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2374	NC_021815	TGC	2	6	146166	146171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832527
2375	NC_021815	TGA	2	6	146187	146192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832527
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2379	NC_021815	GT	3	6	146317	146322	0 %	50 %	50 %	0 %	525832527
2380	NC_021815	TCA	2	6	146347	146352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832527
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2385	NC_021815	T	7	7	146600	146606	0 %	100 %	0 %	0 %	525832527
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2387	NC_021815	CCAGTT	2	12	146644	146655	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525832527
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2392	NC_021815	CGT	2	6	146847	146852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832527
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2398	NC_021815	AG	3	6	147077	147082	50 %	0 %	50 %	0 %	525832527
2399	NC_021815	ACA	2	6	147160	147165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832528
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2402	NC_021815	CATCAG	2	12	147322	147333	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525832528
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2452	NC_021815	ATGAC	2	10	150846	150855	40 %	20 %	20 %	20 %	525832533
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2472	NC_021815	CCT	2	6	152298	152303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832534
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2474	NC_021815	TTC	2	6	152332	152337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832534
2475	NC_021815	CTGT	2	8	152349	152356	0 %	50 %	25 %	25 %	525832534
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2477	NC_021815	TTCC	2	8	152478	152485	0 %	50 %	0 %	50 %	525832534
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2481	NC_021815	GGTG	2	8	152619	152626	0 %	25 %	75 %	0 %	525832534
2482	NC_021815	CAGC	2	8	152634	152641	25 %	0 %	25 %	50 %	525832534
2483	NC_021815	CTT	2	6	152661	152666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832534
2484	NC_021815	TGT	2	6	152714	152719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832534
2485	NC_021815	TCC	2	6	152805	152810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832534
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2487	NC_021815	CAG	2	6	153079	153084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832535
2488	NC_021815	ATC	2	6	153098	153103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832535
2489	NC_021815	ACC	2	6	153136	153141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832535
2490	NC_021815	GAA	2	6	153150	153155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832535
2491	NC_021815	GCT	2	6	153162	153167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832535
2492	NC_021815	GTG	2	6	153182	153187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832535
2493	NC_021815	GGC	2	6	153488	153493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832536
2494	NC_021815	AACT	2	8	153586	153593	50 %	25 %	0 %	25 %	525832536
2495	NC_021815	ACC	2	6	153595	153600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832536
2496	NC_021815	GAT	2	6	153675	153680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832536
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2499	NC_021815	ACG	2	6	153844	153849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832536
2500	NC_021815	TCG	2	6	153964	153969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832536

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