MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 3643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021815	CT	4	8	29282	29289	0 %	50 %	0 %	50 %	525832403
502	NC_021815	ACC	2	6	29323	29328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832403
503	NC_021815	TG	3	6	29348	29353	0 %	50 %	50 %	0 %	525832403
504	NC_021815	TG	3	6	29367	29372	0 %	50 %	50 %	0 %	525832403
505	NC_021815	ACA	2	6	29427	29432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832403
506	NC_021815	TTG	3	9	29721	29729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832403
507	NC_021815	CAT	2	6	29800	29805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832403
508	NC_021815	AGC	2	6	29875	29880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832403
509	NC_021815	TAT	2	6	29930	29935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832404
510	NC_021815	ATT	2	6	29961	29966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832404
511	NC_021815	CTT	2	6	29982	29987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832404
512	NC_021815	AT	3	6	29996	30001	50 %	50 %	0 %	0 %	525832404
513	NC_021815	CTA	2	6	30002	30007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832404
514	NC_021815	ACA	2	6	30017	30022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832404
515	NC_021815	CAG	2	6	30024	30029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832404
516	NC_021815	GCA	2	6	30030	30035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832404
517	NC_021815	ATTG	2	8	30084	30091	25 %	50 %	25 %	0 %	525832404
518	NC_021815	G	6	6	30123	30128	0 %	0 %	100 %	0 %	525832404
519	NC_021815	ATT	2	6	30132	30137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832404
520	NC_021815	GT	3	6	30156	30161	0 %	50 %	50 %	0 %	525832404
521	NC_021815	GAA	2	6	30318	30323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832404
522	NC_021815	A	6	6	30328	30333	100 %	0 %	0 %	0 %	525832404
523	NC_021815	T	6	6	30986	30991	0 %	100 %	0 %	0 %	525832405
524	NC_021815	CTG	2	6	31003	31008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832405
525	NC_021815	GTCAAA	2	12	31015	31026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525832405
526	NC_021815	TTGTG	2	10	31099	31108	0 %	60 %	40 %	0 %	525832405
527	NC_021815	TG	3	6	31149	31154	0 %	50 %	50 %	0 %	525832405
528	NC_021815	ATGAG	2	10	31245	31254	40 %	20 %	40 %	0 %	525832405
529	NC_021815	AG	3	6	31309	31314	50 %	0 %	50 %	0 %	525832405
530	NC_021815	CTT	2	6	31350	31355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832405
531	NC_021815	T	6	6	31354	31359	0 %	100 %	0 %	0 %	525832405
532	NC_021815	ACAGA	2	10	31525	31534	60 %	0 %	20 %	20 %	525832405
533	NC_021815	GGA	2	6	31538	31543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832405
534	NC_021815	TAA	2	6	31555	31560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832405
535	NC_021815	A	6	6	31581	31586	100 %	0 %	0 %	0 %	525832405
536	NC_021815	GTA	2	6	31669	31674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832405
537	NC_021815	ACAA	2	8	31675	31682	75 %	0 %	0 %	25 %	525832405
538	NC_021815	A	6	6	31681	31686	100 %	0 %	0 %	0 %	525832405
539	NC_021815	TAT	2	6	31727	31732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832406
540	NC_021815	CCTT	2	8	31767	31774	0 %	50 %	0 %	50 %	525832406
541	NC_021815	TCA	2	6	31808	31813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832406
542	NC_021815	GAC	2	6	31882	31887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832406
543	NC_021815	TGA	2	6	31920	31925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832406
544	NC_021815	GTA	2	6	32222	32227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832407
545	NC_021815	TAA	2	6	32276	32281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832407
546	NC_021815	AAT	2	6	32385	32390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832407
547	NC_021815	TG	3	6	32467	32472	0 %	50 %	50 %	0 %	525832407
548	NC_021815	TGA	2	6	32523	32528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832407
549	NC_021815	CAT	2	6	32603	32608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832407
550	NC_021815	TC	3	6	32631	32636	0 %	50 %	0 %	50 %	525832407
551	NC_021815	TTA	2	6	32695	32700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832407
552	NC_021815	GGT	2	6	32977	32982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832407
553	NC_021815	ATA	2	6	33007	33012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832407
554	NC_021815	CT	3	6	33126	33131	0 %	50 %	0 %	50 %	525832407
555	NC_021815	TAA	2	6	33135	33140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832407
556	NC_021815	AGC	2	6	33189	33194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832407
557	NC_021815	CGT	2	6	33267	33272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832407
558	NC_021815	CTT	2	6	33345	33350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832407
559	NC_021815	GTT	2	6	33417	33422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832407
560	NC_021815	AAC	2	6	33469	33474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832407
561	NC_021815	GAT	2	6	33485	33490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832407
562	NC_021815	TGT	2	6	33527	33532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832407
563	NC_021815	ATG	2	6	33801	33806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832407
564	NC_021815	GCT	2	6	33818	33823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832407
565	NC_021815	TCT	2	6	34282	34287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832408
566	NC_021815	TCC	2	6	34347	34352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832408
567	NC_021815	GCG	2	6	34445	34450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832408
568	NC_021815	TGC	2	6	34453	34458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832408
569	NC_021815	GCA	2	6	34480	34485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832408
570	NC_021815	GCC	2	6	34530	34535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832408
571	NC_021815	AATT	2	8	34567	34574	50 %	50 %	0 %	0 %	525832408
572	NC_021815	GCGCG	2	10	34716	34725	0 %	0 %	60 %	40 %	525832409
573	NC_021815	GCC	2	6	34744	34749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832409
574	NC_021815	CTG	2	6	34764	34769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832409
575	NC_021815	GCG	2	6	34805	34810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832409
576	NC_021815	GGC	2	6	34827	34832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832409
577	NC_021815	CCG	2	6	34893	34898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832409
578	NC_021815	CGT	2	6	34961	34966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832409
579	NC_021815	CTA	2	6	35040	35045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832409
580	NC_021815	A	6	6	35063	35068	100 %	0 %	0 %	0 %	525832410
581	NC_021815	CTTGCC	2	12	35081	35092	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525832410
582	NC_021815	GCC	2	6	35117	35122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832410
583	NC_021815	ATC	2	6	35174	35179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832410
584	NC_021815	AAG	2	6	35183	35188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832410
585	NC_021815	GAT	2	6	35261	35266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832410
586	NC_021815	GAT	2	6	35354	35359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832410
587	NC_021815	CGTC	2	8	35386	35393	0 %	25 %	25 %	50 %	525832411
588	NC_021815	GGC	2	6	35456	35461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832411
589	NC_021815	CG	3	6	35651	35656	0 %	0 %	50 %	50 %	525832411
590	NC_021815	TCG	2	6	35690	35695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832411
591	NC_021815	CACG	2	8	35697	35704	25 %	0 %	25 %	50 %	525832411
592	NC_021815	GAC	2	6	35718	35723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832411
593	NC_021815	CCG	2	6	35744	35749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832411
594	NC_021815	CA	4	8	35766	35773	50 %	0 %	0 %	50 %	525832411
595	NC_021815	CGC	3	9	35861	35869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832411
596	NC_021815	CGA	2	6	35876	35881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832411
597	NC_021815	GC	3	6	35897	35902	0 %	0 %	50 %	50 %	525832411
598	NC_021815	ATGGA	2	10	35958	35967	40 %	20 %	40 %	0 %	525832411
599	NC_021815	AAG	2	6	35969	35974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832411
600	NC_021815	CAT	2	6	35998	36003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832412
601	NC_021815	CGT	2	6	36049	36054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832412
602	NC_021815	AGAA	2	8	36310	36317	75 %	0 %	25 %	0 %	525832413
603	NC_021815	TAT	2	6	36329	36334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832413
604	NC_021815	GGC	2	6	36336	36341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832413
605	NC_021815	TGC	2	6	36369	36374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832413
606	NC_021815	GTT	2	6	36389	36394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832413
607	NC_021815	GCT	2	6	36395	36400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832413
608	NC_021815	CTG	2	6	36465	36470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832413
609	NC_021815	ACTG	2	8	36596	36603	25 %	25 %	25 %	25 %	525832413
610	NC_021815	ATT	2	6	36625	36630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832413
611	NC_021815	ATG	2	6	36703	36708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832414
612	NC_021815	TTG	2	6	36721	36726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832414
613	NC_021815	TGC	2	6	36759	36764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832414
614	NC_021815	TG	3	6	36802	36807	0 %	50 %	50 %	0 %	525832414
615	NC_021815	A	6	6	36837	36842	100 %	0 %	0 %	0 %	525832414
616	NC_021815	CGA	3	9	36903	36911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832414
617	NC_021815	A	6	6	36911	36916	100 %	0 %	0 %	0 %	525832414
618	NC_021815	CCA	2	6	36941	36946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832414
619	NC_021815	AGC	2	6	37036	37041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832415
620	NC_021815	T	6	6	37094	37099	0 %	100 %	0 %	0 %	525832415
621	NC_021815	TGA	3	9	37119	37127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832415
622	NC_021815	GCTGT	2	10	37130	37139	0 %	40 %	40 %	20 %	525832415
623	NC_021815	AAG	2	6	37236	37241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832416
624	NC_021815	CAC	2	6	37306	37311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832416
625	NC_021815	GGT	2	6	37520	37525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832416
626	NC_021815	GGC	2	6	37562	37567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832416
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628	NC_021815	CAG	2	6	37628	37633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832416
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759	NC_021815	CGGC	2	8	44053	44060	0 %	0 %	50 %	50 %	525832422
760	NC_021815	GAA	2	6	44134	44139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832422
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786	NC_021815	CGA	2	6	45264	45269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832423
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