MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021814	GAAATC	2	12	211569	211580	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525836957
4002	NC_021814	GCT	2	6	211661	211666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836957
4003	NC_021814	GAA	2	6	211744	211749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836957
4004	NC_021814	GAT	2	6	211752	211757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836957
4005	NC_021814	GTC	2	6	211761	211766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836957
4006	NC_021814	CTG	2	6	211863	211868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836957
4007	NC_021814	GC	3	6	211916	211921	0 %	0 %	50 %	50 %	525836957
4008	NC_021814	AGC	2	6	211924	211929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836957
4009	NC_021814	CTA	2	6	211973	211978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836957
4010	NC_021814	TCT	2	6	212038	212043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836957
4011	NC_021814	GCA	2	6	212069	212074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836957
4012	NC_021814	CG	3	6	212126	212131	0 %	0 %	50 %	50 %	525836957
4013	NC_021814	CAT	2	6	212160	212165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836957
4014	NC_021814	TTG	2	6	212248	212253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836957
4015	NC_021814	CGT	2	6	212270	212275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836957
4016	NC_021814	CCA	2	6	212295	212300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836957
4017	NC_021814	CGCC	2	8	212363	212370	0 %	0 %	25 %	75 %	525836957
4018	NC_021814	GCG	2	6	212435	212440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836957
4019	NC_021814	TAA	2	6	212495	212500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836957
4020	NC_021814	CAC	2	6	212568	212573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836957
4021	NC_021814	GTT	2	6	212622	212627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836957
4022	NC_021814	ATA	2	6	212755	212760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836957
4023	NC_021814	CCA	2	6	212774	212779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836957
4024	NC_021814	ATA	2	6	213363	213368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840487
4025	NC_021814	TGG	2	6	213379	213384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840487
4026	NC_021814	TAG	2	6	213385	213390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840487
4027	NC_021814	CGAA	2	8	213459	213466	50 %	0 %	25 %	25 %	525840487
4028	NC_021814	TGA	2	6	213499	213504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840487
4029	NC_021814	ATG	2	6	213628	213633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836958
4030	NC_021814	GATC	2	8	213674	213681	25 %	25 %	25 %	25 %	525836958
4031	NC_021814	CCA	2	6	213719	213724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836958
4032	NC_021814	GCC	2	6	213739	213744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836958
4033	NC_021814	GCC	2	6	213751	213756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836958
4034	NC_021814	CGC	2	6	213803	213808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836958
4035	NC_021814	A	6	6	213842	213847	100 %	0 %	0 %	0 %	525836958
4036	NC_021814	TGC	2	6	213959	213964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836958
4037	NC_021814	GCT	2	6	214061	214066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836958
4038	NC_021814	T	6	6	214070	214075	0 %	100 %	0 %	0 %	525836958
4039	NC_021814	ATA	2	6	214141	214146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836958
4040	NC_021814	GCG	2	6	214192	214197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836958
4041	NC_021814	GCA	2	6	214199	214204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836958
4042	NC_021814	AGC	2	6	214222	214227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836958
4043	NC_021814	GCG	2	6	214237	214242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836958
4044	NC_021814	GGC	2	6	214317	214322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836958
4045	NC_021814	CAT	2	6	214495	214500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836959
4046	NC_021814	GGC	2	6	214584	214589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836959
4047	NC_021814	GTG	3	9	214625	214633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836959
4048	NC_021814	TCCCGT	2	12	214789	214800	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525836959
4049	NC_021814	AAG	2	6	214812	214817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836959
4050	NC_021814	CGG	2	6	214914	214919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836959
4051	NC_021814	TGG	2	6	214977	214982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836959
4052	NC_021814	GCG	2	6	215051	215056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836959
4053	NC_021814	TGTA	2	8	215187	215194	25 %	50 %	25 %	0 %	525836959
4054	NC_021814	TGT	2	6	215265	215270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836959
4055	NC_021814	GA	3	6	215383	215388	50 %	0 %	50 %	0 %	525836960
4056	NC_021814	CGG	2	6	215429	215434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836960
4057	NC_021814	CAGC	2	8	215448	215455	25 %	0 %	25 %	50 %	525836960
4058	NC_021814	AAT	2	6	215568	215573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836960
4059	NC_021814	CAA	2	6	215703	215708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836960
4060	NC_021814	CCAG	2	8	215744	215751	25 %	0 %	25 %	50 %	525836960
4061	NC_021814	TGG	2	6	215774	215779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836960
4062	NC_021814	GCA	2	6	215792	215797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836960
4063	NC_021814	TCG	2	6	215884	215889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836960
4064	NC_021814	CAG	2	6	215977	215982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836960
4065	NC_021814	GCA	2	6	215990	215995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836960
4066	NC_021814	TGATC	2	10	216095	216104	20 %	40 %	20 %	20 %	525836960
4067	NC_021814	CGC	2	6	216129	216134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836960
4068	NC_021814	ATT	2	6	216162	216167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836960
4069	NC_021814	AGC	2	6	216172	216177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836960
4070	NC_021814	GTT	2	6	216230	216235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836960
4071	NC_021814	TCA	2	6	216293	216298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836960
4072	NC_021814	CTA	2	6	216323	216328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836960
4073	NC_021814	CGG	2	6	216353	216358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836960
4074	NC_021814	TAA	2	6	216400	216405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836960
4075	NC_021814	CATA	2	8	216431	216438	50 %	25 %	0 %	25 %	525836960
4076	NC_021814	GCC	2	6	216521	216526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836961
4077	NC_021814	CCG	2	6	216597	216602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836961
4078	NC_021814	GTT	2	6	216612	216617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836961
4079	NC_021814	GTG	2	6	216618	216623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836961
4080	NC_021814	GCGCC	2	10	216676	216685	0 %	0 %	40 %	60 %	525836961
4081	NC_021814	GCC	3	9	216776	216784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836961
4082	NC_021814	CAT	2	6	216797	216802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836961
4083	NC_021814	TTG	2	6	216842	216847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836961
4084	NC_021814	CGC	2	6	217022	217027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836961
4085	NC_021814	TCA	2	6	217035	217040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836961
4086	NC_021814	T	6	6	217072	217077	0 %	100 %	0 %	0 %	525836961
4087	NC_021814	CAGC	3	12	217080	217091	25 %	0 %	25 %	50 %	525836961
4088	NC_021814	CG	3	6	217134	217139	0 %	0 %	50 %	50 %	525836961
4089	NC_021814	ATG	2	6	217156	217161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836961
4090	NC_021814	GATG	2	8	217165	217172	25 %	25 %	50 %	0 %	525836961
4091	NC_021814	GCG	2	6	217442	217447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836962
4092	NC_021814	CTG	2	6	217458	217463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836962
4093	NC_021814	GCG	2	6	217466	217471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836962
4094	NC_021814	GCA	2	6	217496	217501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836962
4095	NC_021814	CG	3	6	217646	217651	0 %	0 %	50 %	50 %	525836962
4096	NC_021814	TGC	2	6	217661	217666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836962
4097	NC_021814	CAT	2	6	217671	217676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836962
4098	NC_021814	GTG	3	9	217682	217690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836962
4099	NC_021814	CAA	2	6	217704	217709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836962
4100	NC_021814	ACCG	2	8	217720	217727	25 %	0 %	25 %	50 %	525836962
4101	NC_021814	TGC	2	6	217794	217799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836962
4102	NC_021814	GAA	2	6	217826	217831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836962
4103	NC_021814	CAC	2	6	217843	217848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836962
4104	NC_021814	GC	3	6	217857	217862	0 %	0 %	50 %	50 %	525836962
4105	NC_021814	CGA	2	6	217884	217889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836962
4106	NC_021814	TCG	2	6	217988	217993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836962
4107	NC_021814	CG	3	6	218103	218108	0 %	0 %	50 %	50 %	525836962
4108	NC_021814	CTTC	2	8	218160	218167	0 %	50 %	0 %	50 %	525836962
4109	NC_021814	TAA	2	6	218237	218242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836962
4110	NC_021814	GTT	2	6	218284	218289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836962
4111	NC_021814	GCGG	2	8	218290	218297	0 %	0 %	75 %	25 %	525836962
4112	NC_021814	CGT	2	6	218383	218388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836962
4113	NC_021814	CTG	2	6	218497	218502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836962
4114	NC_021814	CTG	2	6	218532	218537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836962
4115	NC_021814	T	6	6	218715	218720	0 %	100 %	0 %	0 %	525836962
4116	NC_021814	GCA	2	6	218726	218731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836962
4117	NC_021814	TGCT	2	8	218776	218783	0 %	50 %	25 %	25 %	525836962
4118	NC_021814	TTC	2	6	218864	218869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836962
4119	NC_021814	ATT	2	6	219129	219134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836963
4120	NC_021814	T	8	8	219158	219165	0 %	100 %	0 %	0 %	525836963
4121	NC_021814	CGC	2	6	219251	219256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836963
4122	NC_021814	CGA	2	6	219284	219289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836963
4123	NC_021814	GGT	2	6	219290	219295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836963
4124	NC_021814	GCT	2	6	219347	219352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836963
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4126	NC_021814	CGG	2	6	219405	219410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836963
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4130	NC_021814	AGCG	2	8	219489	219496	25 %	0 %	50 %	25 %	525836963
4131	NC_021814	TGG	2	6	219508	219513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836963
4132	NC_021814	GGTA	2	8	219536	219543	25 %	25 %	50 %	0 %	525836963
4133	NC_021814	AGA	2	6	219617	219622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836963
4134	NC_021814	CAT	2	6	219675	219680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836963
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4152	NC_021814	CAC	2	6	220643	220648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836965
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4154	NC_021814	CTG	2	6	220802	220807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836965
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4157	NC_021814	CTGG	2	8	221052	221059	0 %	25 %	50 %	25 %	525836966
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4201	NC_021814	CG	3	6	223120	223125	0 %	0 %	50 %	50 %	525836967
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4232	NC_021814	CGA	2	6	224868	224873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836970
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4239	NC_021814	TCG	2	6	225188	225193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836970
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4241	NC_021814	CAT	2	6	225289	225294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836970
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4243	NC_021814	GCG	2	6	225372	225377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836970
4244	NC_021814	T	6	6	225418	225423	0 %	100 %	0 %	0 %	525836970
4245	NC_021814	TAA	2	6	225454	225459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836970
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4247	NC_021814	GAAGG	2	10	225472	225481	40 %	0 %	60 %	0 %	525836970
4248	NC_021814	GCC	2	6	225506	225511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836970
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4252	NC_021814	GCGATA	2	12	225652	225663	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525836970
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4257	NC_021814	TCG	2	6	225866	225871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836970
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4351	NC_021814	GATT	2	8	230452	230459	25 %	50 %	25 %	0 %	525836973
4352	NC_021814	CGC	2	6	230460	230465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836973
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4354	NC_021814	CCG	2	6	230926	230931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836974
4355	NC_021814	CTAT	2	8	230953	230960	25 %	50 %	0 %	25 %	525836974
4356	NC_021814	AAT	2	6	230976	230981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836974
4357	NC_021814	CGG	2	6	230995	231000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836974
4358	NC_021814	GCC	2	6	231014	231019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836974
4359	NC_021814	ACGGTG	2	12	231021	231032	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525836974
4360	NC_021814	A	7	7	231036	231042	100 %	0 %	0 %	0 %	525836974
4361	NC_021814	T	6	6	231060	231065	0 %	100 %	0 %	0 %	525836974
4362	NC_021814	TTGA	2	8	231096	231103	25 %	50 %	25 %	0 %	525836974
4363	NC_021814	TAA	2	6	231107	231112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836974
4364	NC_021814	CTG	2	6	231219	231224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836974
4365	NC_021814	AAC	2	6	231327	231332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836974
4366	NC_021814	TGC	2	6	231352	231357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836974
4367	NC_021814	GGC	2	6	231404	231409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836974
4368	NC_021814	A	6	6	231433	231438	100 %	0 %	0 %	0 %	525836974
4369	NC_021814	AGC	2	6	231491	231496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836974
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4371	NC_021814	TGC	2	6	231642	231647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836975
4372	NC_021814	CCG	2	6	231673	231678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836975
4373	NC_021814	GTT	2	6	231705	231710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836975
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4375	NC_021814	CG	4	8	231752	231759	0 %	0 %	50 %	50 %	525836975
4376	NC_021814	ATG	2	6	231919	231924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836975
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4378	NC_021814	ACCGC	2	10	232004	232013	20 %	0 %	20 %	60 %	525836975
4379	NC_021814	GCA	2	6	232014	232019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836975
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4383	NC_021814	GCT	2	6	232197	232202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836975
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4385	NC_021814	GTT	2	6	232260	232265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836975
4386	NC_021814	GCGA	2	8	232391	232398	25 %	0 %	50 %	25 %	525836975
4387	NC_021814	CGA	2	6	232428	232433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836975
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4392	NC_021814	CTG	2	6	232858	232863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836975
4393	NC_021814	CGT	2	6	232970	232975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836975
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4401	NC_021814	CGA	2	6	233327	233332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836976
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4403	NC_021814	TCATT	2	10	233393	233402	20 %	60 %	0 %	20 %	525836976
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4484	NC_021814	GGC	2	6	237496	237501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836979
4485	NC_021814	CAT	2	6	237537	237542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836979
4486	NC_021814	AGA	2	6	237555	237560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836979
4487	NC_021814	ATC	2	6	237565	237570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836979
4488	NC_021814	TGC	2	6	237656	237661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836979
4489	NC_021814	CGC	2	6	237671	237676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836979
4490	NC_021814	GTC	2	6	237692	237697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836979
4491	NC_021814	CGA	2	6	237752	237757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836979
4492	NC_021814	CGC	2	6	237769	237774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836979
4493	NC_021814	AGA	2	6	237840	237845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836979
4494	NC_021814	CAT	2	6	237874	237879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836979
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4500	NC_021814	GCT	2	6	238260	238265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836979

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