MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3503	NC_021814	TAC	2	6	185815	185820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836937
3504	NC_021814	CTG	2	6	185850	185855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836937
3505	NC_021814	CGG	3	9	185899	185907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836937
3506	NC_021814	CG	3	6	185939	185944	0 %	0 %	50 %	50 %	525836937
3507	NC_021814	GAA	2	6	185949	185954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836937
3508	NC_021814	GAA	2	6	185970	185975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836937
3509	NC_021814	CGG	2	6	185977	185982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836937
3510	NC_021814	CT	3	6	186048	186053	0 %	50 %	0 %	50 %	525836937
3511	NC_021814	GCC	2	6	186060	186065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836937
3512	NC_021814	GAT	2	6	186089	186094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836937
3513	NC_021814	ATC	2	6	186153	186158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836937
3514	NC_021814	CGG	2	6	186208	186213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836937
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3516	NC_021814	TTGA	2	8	186321	186328	25 %	50 %	25 %	0 %	525836937
3517	NC_021814	TGG	2	6	186364	186369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836937
3518	NC_021814	TGG	2	6	186397	186402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836937
3519	NC_021814	GATG	2	8	186416	186423	25 %	25 %	50 %	0 %	525836937
3520	NC_021814	CGC	2	6	186506	186511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836937
3521	NC_021814	CAA	2	6	186516	186521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836937
3522	NC_021814	GCC	2	6	186549	186554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836937
3523	NC_021814	GCG	2	6	186555	186560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836937
3524	NC_021814	GAAC	2	8	186566	186573	50 %	0 %	25 %	25 %	525836937
3525	NC_021814	TCCGCG	2	12	186607	186618	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525836937
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3530	NC_021814	TCA	2	6	186852	186857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840483
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3532	NC_021814	T	7	7	186889	186895	0 %	100 %	0 %	0 %	525840483
3533	NC_021814	CCGC	2	8	186896	186903	0 %	0 %	25 %	75 %	525840483
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3555	NC_021814	CGG	2	6	187897	187902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836938
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3557	NC_021814	TGG	2	6	187917	187922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836938
3558	NC_021814	CGT	3	9	187982	187990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836938
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3593	NC_021814	CAT	2	6	190206	190211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836940
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3604	NC_021814	TCT	2	6	190519	190524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836940
3605	NC_021814	CAG	2	6	190602	190607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836940
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3609	NC_021814	CAGC	2	8	190838	190845	25 %	0 %	25 %	50 %	525836940
3610	NC_021814	ATC	2	6	190851	190856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836940
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3621	NC_021814	GCA	2	6	191397	191402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836941
3622	NC_021814	GTA	2	6	191439	191444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836941
3623	NC_021814	GGC	2	6	191529	191534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836941
3624	NC_021814	CGGG	2	8	191612	191619	0 %	0 %	75 %	25 %	525836941
3625	NC_021814	CGC	2	6	191623	191628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836941
3626	NC_021814	ATC	2	6	191666	191671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836941
3627	NC_021814	TGC	2	6	191773	191778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836941
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3633	NC_021814	CGT	2	6	192010	192015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836941
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3652	NC_021814	CGA	2	6	192877	192882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836941
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3654	NC_021814	GCGT	2	8	193191	193198	0 %	25 %	50 %	25 %	525836942
3655	NC_021814	TTC	2	6	193213	193218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836942
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3657	NC_021814	GTC	2	6	193261	193266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836942
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3730	NC_021814	TCT	3	9	196866	196874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836946
3731	NC_021814	GAT	2	6	196875	196880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836946
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3734	NC_021814	CCA	2	6	197085	197090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836947
3735	NC_021814	TCG	2	6	197097	197102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836947
3736	NC_021814	CAGC	2	8	197134	197141	25 %	0 %	25 %	50 %	525836947
3737	NC_021814	GATCA	2	10	197299	197308	40 %	20 %	20 %	20 %	525836947
3738	NC_021814	CGCC	2	8	197391	197398	0 %	0 %	25 %	75 %	525836947
3739	NC_021814	ATG	2	6	197410	197415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836947
3740	NC_021814	GGC	2	6	197503	197508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836947
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3742	NC_021814	GGT	2	6	197662	197667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836947
3743	NC_021814	GCA	2	6	197795	197800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836947
3744	NC_021814	GA	3	6	197847	197852	50 %	0 %	50 %	0 %	525836947
3745	NC_021814	TCG	2	6	197918	197923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836947
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3863	NC_021814	TGA	2	6	203286	203291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836950
3864	NC_021814	CAC	2	6	203296	203301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836950
3865	NC_021814	GC	4	8	203355	203362	0 %	0 %	50 %	50 %	525836950
3866	NC_021814	GCG	2	6	203602	203607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836951
3867	NC_021814	TGA	2	6	203675	203680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836951
3868	NC_021814	CGC	2	6	203681	203686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836951
3869	NC_021814	GC	5	10	203685	203694	0 %	0 %	50 %	50 %	525836951
3870	NC_021814	CGA	2	6	203755	203760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836951
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3874	NC_021814	GC	3	6	203884	203889	0 %	0 %	50 %	50 %	525836951
3875	NC_021814	GC	3	6	203949	203954	0 %	0 %	50 %	50 %	525836951
3876	NC_021814	GGCG	2	8	203957	203964	0 %	0 %	75 %	25 %	525836951
3877	NC_021814	GCT	2	6	204020	204025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836951
3878	NC_021814	GCT	2	6	204164	204169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836951
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3880	NC_021814	ATG	2	6	204220	204225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836951
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3882	NC_021814	GGC	2	6	204272	204277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836951
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3886	NC_021814	GC	3	6	204451	204456	0 %	0 %	50 %	50 %	525836951
3887	NC_021814	CG	3	6	204536	204541	0 %	0 %	50 %	50 %	525836951
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3890	NC_021814	GTCG	2	8	204662	204669	0 %	25 %	50 %	25 %	525836951
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3894	NC_021814	CGG	2	6	204797	204802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836951
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3901	NC_021814	CGC	2	6	205562	205567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840485
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3976	NC_021814	GAAAG	2	10	210033	210042	60 %	0 %	40 %	0 %	525836955
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3984	NC_021814	TAA	2	6	210428	210433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836955
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3988	NC_021814	GCG	2	6	210663	210668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836956
3989	NC_021814	TAA	2	6	210682	210687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836956
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