MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021814	AGC	2	6	159624	159629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836914
3002	NC_021814	TCA	2	6	159654	159659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836914
3003	NC_021814	CGATC	2	10	159718	159727	20 %	20 %	20 %	40 %	525836914
3004	NC_021814	GAA	2	6	159781	159786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836914
3005	NC_021814	TGC	2	6	159889	159894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836914
3006	NC_021814	ACG	2	6	159933	159938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836914
3007	NC_021814	CGA	2	6	159964	159969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836914
3008	NC_021814	TTG	2	6	159982	159987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836914
3009	NC_021814	TTC	2	6	160022	160027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836914
3010	NC_021814	GC	5	10	160029	160038	0 %	0 %	50 %	50 %	525836914
3011	NC_021814	GGC	2	6	160073	160078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836914
3012	NC_021814	TGA	2	6	160081	160086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836914
3013	NC_021814	CTGG	2	8	160183	160190	0 %	25 %	50 %	25 %	525836914
3014	NC_021814	GC	3	6	160206	160211	0 %	0 %	50 %	50 %	525836914
3015	NC_021814	CAT	2	6	160216	160221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836914
3016	NC_021814	GGC	2	6	160324	160329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836914
3017	NC_021814	CGA	2	6	160375	160380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836914
3018	NC_021814	CAA	2	6	160432	160437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836914
3019	NC_021814	A	6	6	160488	160493	100 %	0 %	0 %	0 %	525836914
3020	NC_021814	CGT	2	6	160558	160563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836914
3021	NC_021814	AGA	2	6	160572	160577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836914
3022	NC_021814	CGC	2	6	160598	160603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836914
3023	NC_021814	GCG	2	6	160745	160750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836914
3024	NC_021814	AGA	2	6	160759	160764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836914
3025	NC_021814	TGCGG	2	10	160765	160774	0 %	20 %	60 %	20 %	525836914
3026	NC_021814	CTG	2	6	160793	160798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836914
3027	NC_021814	CAT	2	6	160811	160816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836914
3028	NC_021814	GCA	2	6	160837	160842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836914
3029	NC_021814	AATG	2	8	161146	161153	50 %	25 %	25 %	0 %	525836915
3030	NC_021814	ATCG	2	8	161168	161175	25 %	25 %	25 %	25 %	525836915
3031	NC_021814	GCG	2	6	161187	161192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836915
3032	NC_021814	ACG	2	6	161204	161209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836915
3033	NC_021814	ATCGCT	2	12	161233	161244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525836915
3034	NC_021814	CCG	2	6	161271	161276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836915
3035	NC_021814	CGC	2	6	161301	161306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836915
3036	NC_021814	AGG	2	6	161343	161348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525836915
3037	NC_021814	GCA	2	6	161355	161360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836915
3038	NC_021814	GC	3	6	161382	161387	0 %	0 %	50 %	50 %	525836915
3039	NC_021814	TGG	2	6	161391	161396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836915
3040	NC_021814	TTTC	2	8	161419	161426	0 %	75 %	0 %	25 %	525836915
3041	NC_021814	GC	3	6	161441	161446	0 %	0 %	50 %	50 %	525836915
3042	NC_021814	GGC	3	9	161519	161527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836915
3043	NC_021814	ACG	2	6	161562	161567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836915
3044	NC_021814	TG	3	6	161619	161624	0 %	50 %	50 %	0 %	525836915
3045	NC_021814	TGA	2	6	161652	161657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836915
3046	NC_021814	TGC	2	6	161766	161771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836915
3047	NC_021814	CGC	2	6	161792	161797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836915
3048	NC_021814	CTG	2	6	161816	161821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836915
3049	NC_021814	TC	3	6	161836	161841	0 %	50 %	0 %	50 %	525836915
3050	NC_021814	CGG	2	6	161907	161912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836915
3051	NC_021814	ATT	2	6	161954	161959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836915
3052	NC_021814	CGT	2	6	161990	161995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836915
3053	NC_021814	CTG	2	6	162026	162031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836915
3054	NC_021814	CGG	2	6	162033	162038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836915
3055	NC_021814	GGC	3	9	162127	162135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836915
3056	NC_021814	CTG	2	6	162149	162154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836915
3057	NC_021814	GGC	2	6	162155	162160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836915
3058	NC_021814	GCG	2	6	162182	162187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836915
3059	NC_021814	GCG	2	6	162296	162301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836915
3060	NC_021814	CG	3	6	162408	162413	0 %	0 %	50 %	50 %	525836915
3061	NC_021814	TTA	2	6	162662	162667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836916
3062	NC_021814	TGC	2	6	162706	162711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836916
3063	NC_021814	A	8	8	162724	162731	100 %	0 %	0 %	0 %	525836916
3064	NC_021814	CTAC	2	8	162735	162742	25 %	25 %	0 %	50 %	525836916
3065	NC_021814	TTC	2	6	162924	162929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836916
3066	NC_021814	CT	3	6	162968	162973	0 %	50 %	0 %	50 %	525836916
3067	NC_021814	TAT	2	6	162976	162981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836916
3068	NC_021814	TTA	2	6	163017	163022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836916
3069	NC_021814	GC	3	6	163107	163112	0 %	0 %	50 %	50 %	525836916
3070	NC_021814	TGG	2	6	163257	163262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836916
3071	NC_021814	GGC	2	6	163336	163341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836916
3072	NC_021814	TGG	2	6	163356	163361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836916
3073	NC_021814	GC	3	6	163386	163391	0 %	0 %	50 %	50 %	525836916
3074	NC_021814	GCC	2	6	163393	163398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836916
3075	NC_021814	CTG	2	6	163406	163411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836916
3076	NC_021814	ATT	2	6	163424	163429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836916
3077	NC_021814	TTTA	2	8	163456	163463	25 %	75 %	0 %	0 %	525836916
3078	NC_021814	CGC	2	6	163669	163674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836916
3079	NC_021814	GCG	2	6	163686	163691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836916
3080	NC_021814	GCTG	2	8	163697	163704	0 %	25 %	50 %	25 %	525836916
3081	NC_021814	CTT	2	6	163753	163758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836916
3082	NC_021814	TTTA	2	8	163764	163771	25 %	75 %	0 %	0 %	525836916
3083	NC_021814	TGA	2	6	163800	163805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836916
3084	NC_021814	CCG	2	6	163827	163832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836916
3085	NC_021814	AGA	2	6	163833	163838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836916
3086	NC_021814	TGG	2	6	163959	163964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836916
3087	NC_021814	TGGT	2	8	163982	163989	0 %	50 %	50 %	0 %	525836916
3088	NC_021814	ATT	3	9	164039	164047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836916
3089	NC_021814	CTG	2	6	164054	164059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836916
3090	NC_021814	AAAT	2	8	164131	164138	75 %	25 %	0 %	0 %	525836917
3091	NC_021814	GAA	2	6	164172	164177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836917
3092	NC_021814	CTGGCG	2	12	164214	164225	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525836917
3093	NC_021814	GCG	4	12	164229	164240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836917
3094	NC_021814	TGA	2	6	164293	164298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836917
3095	NC_021814	CGC	2	6	164351	164356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836917
3096	NC_021814	GCG	2	6	164524	164529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836917
3097	NC_021814	TCG	2	6	164551	164556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836917
3098	NC_021814	GAA	3	9	164628	164636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836917
3099	NC_021814	A	6	6	164635	164640	100 %	0 %	0 %	0 %	525836917
3100	NC_021814	AGG	2	6	164764	164769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525836917
3101	NC_021814	CTG	2	6	164832	164837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836917
3102	NC_021814	TC	3	6	164846	164851	0 %	50 %	0 %	50 %	525836917
3103	NC_021814	GCG	2	6	164877	164882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836917
3104	NC_021814	CTCCGG	2	12	164927	164938	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525836917
3105	NC_021814	TGG	2	6	164971	164976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836917
3106	NC_021814	GC	5	10	165012	165021	0 %	0 %	50 %	50 %	525836917
3107	NC_021814	CTAT	2	8	165043	165050	25 %	50 %	0 %	25 %	525836917
3108	NC_021814	CGG	2	6	165097	165102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836917
3109	NC_021814	CAG	2	6	165170	165175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836917
3110	NC_021814	GAT	2	6	165197	165202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836917
3111	NC_021814	CGG	2	6	165253	165258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836917
3112	NC_021814	GAT	2	6	165285	165290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836917
3113	NC_021814	CGG	2	6	165292	165297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836917
3114	NC_021814	GCA	2	6	165377	165382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836917
3115	NC_021814	ATC	2	6	165396	165401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836917
3116	NC_021814	TAA	3	9	165426	165434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836917
3117	NC_021814	CTT	2	6	165555	165560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840481
3118	NC_021814	GCG	2	6	165635	165640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840481
3119	NC_021814	CCT	2	6	165648	165653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840481
3120	NC_021814	TTC	2	6	165683	165688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840481
3121	NC_021814	T	6	6	165694	165699	0 %	100 %	0 %	0 %	525840481
3122	NC_021814	GC	3	6	165754	165759	0 %	0 %	50 %	50 %	525836918
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3152	NC_021814	CTG	2	6	167180	167185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836919
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3234	NC_021814	CTTTTG	2	12	170773	170784	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525836925
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3244	NC_021814	TCA	2	6	171505	171510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836926
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3365	NC_021814	CCGTT	2	10	178838	178847	0 %	40 %	20 %	40 %	525836933
3366	NC_021814	CCG	2	6	178868	178873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836933
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3368	NC_021814	CGCC	2	8	178927	178934	0 %	0 %	25 %	75 %	525836933
3369	NC_021814	GAA	2	6	179002	179007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836933
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3372	NC_021814	CCG	2	6	179243	179248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836934
3373	NC_021814	GCG	2	6	179270	179275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836934
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3379	NC_021814	ATC	2	6	179414	179419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836934
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3382	NC_021814	CG	3	6	179443	179448	0 %	0 %	50 %	50 %	525836934
3383	NC_021814	GGT	2	6	179461	179466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836934
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3390	NC_021814	GAT	2	6	179754	179759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836934
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3393	NC_021814	GTA	2	6	179893	179898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836934
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3402	NC_021814	TCGGCA	2	12	180233	180244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525836934
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3453	NC_021814	AGT	2	6	182615	182620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836935
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3470	NC_021814	GCTTG	2	10	183911	183920	0 %	40 %	40 %	20 %	525836936
3471	NC_021814	GCTG	2	8	183928	183935	0 %	25 %	50 %	25 %	525836936
3472	NC_021814	TAA	2	6	183998	184003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836936
3473	NC_021814	GAAC	2	8	184010	184017	50 %	0 %	25 %	25 %	525836936
3474	NC_021814	AC	3	6	184016	184021	50 %	0 %	0 %	50 %	525836936
3475	NC_021814	GGC	2	6	184130	184135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836936
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3477	NC_021814	GATG	2	8	184187	184194	25 %	25 %	50 %	0 %	525836936
3478	NC_021814	CAC	2	6	184229	184234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836936
3479	NC_021814	GCG	2	6	184281	184286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836936
3480	NC_021814	GCG	2	6	184293	184298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836936
3481	NC_021814	GCG	2	6	184374	184379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836936
3482	NC_021814	AATT	2	8	184393	184400	50 %	50 %	0 %	0 %	525836936
3483	NC_021814	CAA	2	6	184411	184416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836936
3484	NC_021814	CGC	2	6	184445	184450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836936
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3486	NC_021814	ACAG	2	8	184532	184539	50 %	0 %	25 %	25 %	525836936
3487	NC_021814	GCG	2	6	184599	184604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836936
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3490	NC_021814	GGA	2	6	184661	184666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525836936
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