MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_021814	TTA	2	6	106411	106416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840472
2003	NC_021814	GTTG	2	8	106446	106453	0 %	50 %	50 %	0 %	525840472
2004	NC_021814	GCTT	2	8	106461	106468	0 %	50 %	25 %	25 %	525840472
2005	NC_021814	CTT	2	6	106548	106553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840472
2006	NC_021814	GCA	2	6	106767	106772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840472
2007	NC_021814	TCT	2	6	106857	106862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840472
2008	NC_021814	GAA	2	6	106951	106956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840472
2009	NC_021814	ATTC	2	8	106957	106964	25 %	50 %	0 %	25 %	525840472
2010	NC_021814	ACA	2	6	106966	106971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840472
2011	NC_021814	TA	3	6	107017	107022	50 %	50 %	0 %	0 %	525840472
2012	NC_021814	ATG	2	6	107023	107028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840472
2013	NC_021814	TGT	2	6	107073	107078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840472
2014	NC_021814	AGT	2	6	107410	107415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836875
2015	NC_021814	CTGG	2	8	107456	107463	0 %	25 %	50 %	25 %	525836875
2016	NC_021814	GCA	2	6	107488	107493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836875
2017	NC_021814	CAG	2	6	107528	107533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836875
2018	NC_021814	GAC	2	6	107545	107550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836875
2019	NC_021814	GCA	2	6	107620	107625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836875
2020	NC_021814	ATG	2	6	107670	107675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836875
2021	NC_021814	GCC	2	6	107714	107719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836875
2022	NC_021814	CAT	2	6	107738	107743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836875
2023	NC_021814	CAT	2	6	107749	107754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836875
2024	NC_021814	ACC	2	6	108017	108022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836875
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2027	NC_021814	ACGGC	2	10	108195	108204	20 %	0 %	40 %	40 %	525836875
2028	NC_021814	GCG	2	6	108208	108213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836875
2029	NC_021814	TAT	2	6	108244	108249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836875
2030	NC_021814	CAAC	2	8	108286	108293	50 %	0 %	0 %	50 %	525836875
2031	NC_021814	CAAT	2	8	108303	108310	50 %	25 %	0 %	25 %	525836875
2032	NC_021814	CGA	2	6	108345	108350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836875
2033	NC_021814	TCATCC	2	12	108366	108377	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525836875
2034	NC_021814	CAG	2	6	108434	108439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836875
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2036	NC_021814	CTG	2	6	108490	108495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836875
2037	NC_021814	TCG	2	6	108511	108516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836875
2038	NC_021814	ATAGA	2	10	108519	108528	60 %	20 %	20 %	0 %	525836875
2039	NC_021814	GAT	2	6	109177	109182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836876
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2042	NC_021814	GAA	2	6	109436	109441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836876
2043	NC_021814	TTC	2	6	109452	109457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836876
2044	NC_021814	TGT	2	6	109648	109653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836877
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2046	NC_021814	CAA	2	6	109728	109733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836877
2047	NC_021814	A	6	6	109736	109741	100 %	0 %	0 %	0 %	525836877
2048	NC_021814	ATCG	2	8	109772	109779	25 %	25 %	25 %	25 %	525836877
2049	NC_021814	CCG	2	6	109804	109809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836877
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2051	NC_021814	CGA	2	6	109839	109844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836877
2052	NC_021814	GCG	2	6	109862	109867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836877
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2054	NC_021814	GTG	2	6	110048	110053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836877
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2056	NC_021814	TGC	2	6	110142	110147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836877
2057	NC_021814	CG	3	6	110148	110153	0 %	0 %	50 %	50 %	525836877
2058	NC_021814	GC	3	6	110217	110222	0 %	0 %	50 %	50 %	525836877
2059	NC_021814	GAA	2	6	110294	110299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836877
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2061	NC_021814	GCGCG	2	10	110404	110413	0 %	0 %	60 %	40 %	525836877
2062	NC_021814	CG	4	8	110410	110417	0 %	0 %	50 %	50 %	525836877
2063	NC_021814	GAT	2	6	110471	110476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836877
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2065	NC_021814	TGA	2	6	110665	110670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836877
2066	NC_021814	TGA	2	6	110737	110742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836877
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2069	NC_021814	TGA	2	6	110836	110841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836877
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2107	NC_021814	CGT	2	6	112262	112267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836878
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2110	NC_021814	CAT	2	6	112345	112350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836878
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2112	NC_021814	GCGG	2	8	112421	112428	0 %	0 %	75 %	25 %	525836878
2113	NC_021814	GAT	2	6	112474	112479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836878
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2116	NC_021814	GAAC	2	8	112693	112700	50 %	0 %	25 %	25 %	525836878
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2118	NC_021814	GTTC	2	8	112747	112754	0 %	50 %	25 %	25 %	525836878
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2120	NC_021814	CTG	2	6	112790	112795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836878
2121	NC_021814	CTG	2	6	112805	112810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836878
2122	NC_021814	GCGGT	2	10	112857	112866	0 %	20 %	60 %	20 %	525836878
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2124	NC_021814	TG	3	6	112953	112958	0 %	50 %	50 %	0 %	525836878
2125	NC_021814	CGTG	2	8	112975	112982	0 %	25 %	50 %	25 %	525836878
2126	NC_021814	CGT	2	6	113086	113091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836878
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2228	NC_021814	CG	3	6	117789	117794	0 %	0 %	50 %	50 %	525836882
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2231	NC_021814	ATCGAA	2	12	117819	117830	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525836882
2232	NC_021814	CGAC	2	8	117856	117863	25 %	0 %	25 %	50 %	525836882
2233	NC_021814	CGT	2	6	117888	117893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836882
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2238	NC_021814	AAG	2	6	118129	118134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836882
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2240	NC_021814	T	6	6	118314	118319	0 %	100 %	0 %	0 %	525836883
2241	NC_021814	CAG	2	6	118420	118425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836883
2242	NC_021814	ATTT	2	8	118615	118622	25 %	75 %	0 %	0 %	525836883
2243	NC_021814	GCAG	2	8	118626	118633	25 %	0 %	50 %	25 %	525836883
2244	NC_021814	TGC	2	6	118644	118649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836883
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2272	NC_021814	CTG	2	6	120404	120409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836884
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2344	NC_021814	GA	3	6	122979	122984	50 %	0 %	50 %	0 %	525836886
2345	NC_021814	TTA	2	6	123018	123023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836886
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2351	NC_021814	A	6	6	123224	123229	100 %	0 %	0 %	0 %	525836886
2352	NC_021814	ATG	2	6	123246	123251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836886
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2354	NC_021814	TAT	2	6	123434	123439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836887
2355	NC_021814	TTTTA	2	10	123456	123465	20 %	80 %	0 %	0 %	525836887
2356	NC_021814	TTAT	2	8	123562	123569	25 %	75 %	0 %	0 %	525836887
2357	NC_021814	TGG	2	6	123666	123671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836887
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2359	NC_021814	ATC	2	6	123761	123766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836887
2360	NC_021814	TGG	2	6	123905	123910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836887
2361	NC_021814	AGA	2	6	123932	123937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836887
2362	NC_021814	ATGA	2	8	123967	123974	50 %	25 %	25 %	0 %	525836887
2363	NC_021814	A	7	7	124052	124058	100 %	0 %	0 %	0 %	525836887
2364	NC_021814	CAA	2	6	124109	124114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836887
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2366	NC_021814	TGG	2	6	124161	124166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836888
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2368	NC_021814	CTG	2	6	124277	124282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836888
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2370	NC_021814	CTG	2	6	124379	124384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836888
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2372	NC_021814	ATA	2	6	124431	124436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836888
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2374	NC_021814	GGTAC	2	10	124490	124499	20 %	20 %	40 %	20 %	525836888
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2380	NC_021814	TCG	2	6	124750	124755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836888
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2382	NC_021814	GCA	2	6	124861	124866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836888
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2386	NC_021814	CGC	2	6	124934	124939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836888
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2388	NC_021814	GCCA	2	8	124971	124978	25 %	0 %	25 %	50 %	525836888
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2392	NC_021814	GC	3	6	125362	125367	0 %	0 %	50 %	50 %	525836889
2393	NC_021814	CTG	2	6	125528	125533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836889
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2397	NC_021814	CTT	2	6	125776	125781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836889
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2443	NC_021814	CGG	2	6	128221	128226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840474
2444	NC_021814	TA	3	6	128251	128256	50 %	50 %	0 %	0 %	525840474
2445	NC_021814	TGG	2	6	128374	128379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840474
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2448	NC_021814	TGC	2	6	128606	128611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840475
2449	NC_021814	ACG	2	6	128617	128622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840475
2450	NC_021814	GGT	2	6	128632	128637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840475
2451	NC_021814	CAGATA	2	12	128674	128685	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525840475
2452	NC_021814	AC	3	6	128754	128759	50 %	0 %	0 %	50 %	525836891
2453	NC_021814	TGGC	2	8	128777	128784	0 %	25 %	50 %	25 %	525836891
2454	NC_021814	ACA	2	6	128788	128793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836891
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2456	NC_021814	GAT	2	6	128891	128896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836891
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2458	NC_021814	GC	3	6	128972	128977	0 %	0 %	50 %	50 %	525836891
2459	NC_021814	CGC	2	6	129034	129039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836891
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2461	NC_021814	TGC	2	6	129078	129083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836891
2462	NC_021814	AAATT	2	10	129114	129123	60 %	40 %	0 %	0 %	525836891
2463	NC_021814	ACA	2	6	129129	129134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836891
2464	NC_021814	A	6	6	129149	129154	100 %	0 %	0 %	0 %	525836891
2465	NC_021814	CAG	2	6	129182	129187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836891
2466	NC_021814	GTC	2	6	129218	129223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836892
2467	NC_021814	CGA	3	9	129256	129264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836892
2468	NC_021814	TTC	2	6	129294	129299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836892
2469	NC_021814	ATA	2	6	129306	129311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836892
2470	NC_021814	CCG	2	6	129322	129327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836892
2471	NC_021814	CAA	2	6	129362	129367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836892
2472	NC_021814	CGC	2	6	129445	129450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836892
2473	NC_021814	TCG	2	6	129498	129503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836892
2474	NC_021814	TCA	2	6	129513	129518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836892
2475	NC_021814	T	7	7	129551	129557	0 %	100 %	0 %	0 %	525836892
2476	NC_021814	TGA	2	6	129592	129597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836892
2477	NC_021814	GGCC	2	8	129604	129611	0 %	0 %	50 %	50 %	525836892
2478	NC_021814	CTG	2	6	129622	129627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836892
2479	NC_021814	CGG	2	6	129860	129865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840476
2480	NC_021814	CTG	2	6	129870	129875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840476
2481	NC_021814	CGC	2	6	129892	129897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840476
2482	NC_021814	CGC	2	6	129911	129916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840476
2483	NC_021814	GACC	2	8	129998	130005	25 %	0 %	25 %	50 %	525840476
2484	NC_021814	T	6	6	130018	130023	0 %	100 %	0 %	0 %	525840476
2485	NC_021814	GCG	2	6	130062	130067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840476
2486	NC_021814	TGG	2	6	130090	130095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840476
2487	NC_021814	GCA	2	6	130130	130135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840476
2488	NC_021814	TGG	3	9	130138	130146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840476
2489	NC_021814	GGA	2	6	130208	130213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840476
2490	NC_021814	TGC	2	6	130264	130269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840476
2491	NC_021814	AAC	2	6	130280	130285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840476
2492	NC_021814	GCG	2	6	130286	130291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840476
2493	NC_021814	TGAA	2	8	130294	130301	50 %	25 %	25 %	0 %	525840476
2494	NC_021814	ATCG	2	8	130346	130353	25 %	25 %	25 %	25 %	525840476
2495	NC_021814	AAG	2	6	130405	130410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840476
2496	NC_021814	GGT	2	6	130545	130550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836893
2497	NC_021814	CGC	2	6	130562	130567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836893
2498	NC_021814	CTG	2	6	130586	130591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836893
2499	NC_021814	CAG	2	6	130623	130628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836893
2500	NC_021814	GGT	2	6	130647	130652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836893

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