MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021814	TTA	2	6	29764	29769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836809
502	NC_021814	GC	3	6	29824	29829	0 %	0 %	50 %	50 %	525836809
503	NC_021814	ACG	2	6	29889	29894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
504	NC_021814	CCG	2	6	29967	29972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836809
505	NC_021814	TAAA	2	8	30112	30119	75 %	25 %	0 %	0 %	525836809
506	NC_021814	TTA	2	6	30225	30230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836809
507	NC_021814	GAC	2	6	30263	30268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
508	NC_021814	CAA	2	6	30300	30305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836809
509	NC_021814	GC	3	6	30337	30342	0 %	0 %	50 %	50 %	525836809
510	NC_021814	TGGC	2	8	30345	30352	0 %	25 %	50 %	25 %	525836809
511	NC_021814	GCG	2	6	30369	30374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836809
512	NC_021814	CAG	2	6	30447	30452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
513	NC_021814	CGT	2	6	30467	30472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836809
514	NC_021814	GCT	2	6	30533	30538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836809
515	NC_021814	TGGC	2	8	30558	30565	0 %	25 %	50 %	25 %	525836809
516	NC_021814	TAC	2	6	30582	30587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836809
517	NC_021814	ACGC	2	8	30606	30613	25 %	0 %	25 %	50 %	525836809
518	NC_021814	TGGC	2	8	30668	30675	0 %	25 %	50 %	25 %	525836809
519	NC_021814	GAAC	2	8	30846	30853	50 %	0 %	25 %	25 %	525836809
520	NC_021814	GTA	2	6	30877	30882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836809
521	NC_021814	TTC	2	6	30903	30908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836809
522	NC_021814	TGA	2	6	30986	30991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836809
523	NC_021814	ACGC	2	8	31013	31020	25 %	0 %	25 %	50 %	525836809
524	NC_021814	GCT	2	6	31079	31084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836809
525	NC_021814	TGC	2	6	31099	31104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836809
526	NC_021814	TGG	2	6	31213	31218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836809
527	NC_021814	CGT	3	9	31266	31274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836809
528	NC_021814	CGC	3	9	31325	31333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836809
529	NC_021814	CGGCG	2	10	31355	31364	0 %	0 %	60 %	40 %	525836809
530	NC_021814	GCC	2	6	31371	31376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836809
531	NC_021814	CCGGT	2	10	31432	31441	0 %	20 %	40 %	40 %	525836809
532	NC_021814	AAAG	2	8	31482	31489	75 %	0 %	25 %	0 %	525836809
533	NC_021814	GCG	2	6	31677	31682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836810
534	NC_021814	AGA	2	6	31793	31798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836810
535	NC_021814	CAT	2	6	31802	31807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836810
536	NC_021814	ATA	2	6	31822	31827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836810
537	NC_021814	GGCGTT	2	12	31836	31847	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525836810
538	NC_021814	GCG	2	6	31858	31863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836810
539	NC_021814	A	6	6	31864	31869	100 %	0 %	0 %	0 %	525836810
540	NC_021814	CCT	2	6	31898	31903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525836810
541	NC_021814	GCAG	2	8	31922	31929	25 %	0 %	50 %	25 %	525836810
542	NC_021814	CGC	2	6	31976	31981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836810
543	NC_021814	ACC	2	6	32004	32009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836810
544	NC_021814	GCG	2	6	32073	32078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836810
545	NC_021814	GGC	2	6	32147	32152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836810
546	NC_021814	GGC	2	6	32168	32173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836810
547	NC_021814	GTCC	2	8	32178	32185	0 %	25 %	25 %	50 %	525836810
548	NC_021814	GAA	2	6	32217	32222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836810
549	NC_021814	GCG	2	6	32239	32244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836810
550	NC_021814	GCG	4	12	32248	32259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836810
551	NC_021814	AAG	2	6	32326	32331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836810
552	NC_021814	TC	3	6	32354	32359	0 %	50 %	0 %	50 %	525836810
553	NC_021814	GGT	2	6	32390	32395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836810
554	NC_021814	TGC	2	6	32422	32427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836810
555	NC_021814	CGT	2	6	32466	32471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836810
556	NC_021814	ATG	2	6	32547	32552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836810
557	NC_021814	GAT	2	6	32577	32582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836810
558	NC_021814	GCCAG	2	10	32591	32600	20 %	0 %	40 %	40 %	525836810
559	NC_021814	ATTG	2	8	32609	32616	25 %	50 %	25 %	0 %	525836810
560	NC_021814	CG	3	6	32657	32662	0 %	0 %	50 %	50 %	525836810
561	NC_021814	CGC	2	6	32764	32769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836810
562	NC_021814	GGC	2	6	32817	32822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836810
563	NC_021814	ACG	2	6	32898	32903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836810
564	NC_021814	GTAGGC	2	12	33030	33041	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525836810
565	NC_021814	GGC	2	6	33075	33080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836810
566	NC_021814	TTTC	2	8	33217	33224	0 %	75 %	0 %	25 %	525836811
567	NC_021814	GCA	2	6	33370	33375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836811
568	NC_021814	TTCCGG	2	12	33436	33447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836811
569	NC_021814	CAGC	2	8	33452	33459	25 %	0 %	25 %	50 %	525836811
570	NC_021814	TTCC	2	8	33520	33527	0 %	50 %	0 %	50 %	525836811
571	NC_021814	CCAG	2	8	33571	33578	25 %	0 %	25 %	50 %	525836811
572	NC_021814	CGG	2	6	33595	33600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836811
573	NC_021814	GGC	2	6	33638	33643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836811
574	NC_021814	CA	3	6	33645	33650	50 %	0 %	0 %	50 %	525836811
575	NC_021814	GC	3	6	33700	33705	0 %	0 %	50 %	50 %	525836811
576	NC_021814	CAC	2	6	33716	33721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836811
577	NC_021814	TAA	2	6	33797	33802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836811
578	NC_021814	GAA	2	6	33843	33848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836811
579	NC_021814	TTA	2	6	33879	33884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836811
580	NC_021814	GCT	2	6	33895	33900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836811
581	NC_021814	GCA	2	6	33922	33927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836811
582	NC_021814	ACG	2	6	33929	33934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836811
583	NC_021814	ATA	2	6	33944	33949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836811
584	NC_021814	TGC	2	6	33976	33981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836811
585	NC_021814	TGC	2	6	33985	33990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836811
586	NC_021814	GCG	2	6	34077	34082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836811
587	NC_021814	ATT	2	6	34140	34145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836811
588	NC_021814	GTG	2	6	34344	34349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836812
589	NC_021814	TTCC	2	8	34358	34365	0 %	50 %	0 %	50 %	525836812
590	NC_021814	T	6	6	34402	34407	0 %	100 %	0 %	0 %	525836812
591	NC_021814	TTG	2	6	34487	34492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836812
592	NC_021814	TTTA	2	8	34498	34505	25 %	75 %	0 %	0 %	525836812
593	NC_021814	CG	3	6	34646	34651	0 %	0 %	50 %	50 %	525836813
594	NC_021814	CG	3	6	34653	34658	0 %	0 %	50 %	50 %	525836813
595	NC_021814	GTC	2	6	34672	34677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836813
596	NC_021814	GCGGAA	2	12	34795	34806	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525836813
597	NC_021814	TAT	2	6	34819	34824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836813
598	NC_021814	GATC	2	8	34902	34909	25 %	25 %	25 %	25 %	525836813
599	NC_021814	AAC	2	6	34915	34920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836813
600	NC_021814	CG	3	6	34964	34969	0 %	0 %	50 %	50 %	525836813
601	NC_021814	CG	3	6	35005	35010	0 %	0 %	50 %	50 %	525836813
602	NC_021814	CTG	2	6	35012	35017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836813
603	NC_021814	TTA	2	6	35057	35062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836813
604	NC_021814	GCGT	2	8	35144	35151	0 %	25 %	50 %	25 %	525836813
605	NC_021814	CGC	2	6	35174	35179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836813
606	NC_021814	GCA	2	6	35183	35188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836813
607	NC_021814	GGC	2	6	35220	35225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836813
608	NC_021814	CAG	2	6	35241	35246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836813
609	NC_021814	CGA	2	6	35270	35275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836813
610	NC_021814	CGA	2	6	35334	35339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836813
611	NC_021814	GCA	2	6	35340	35345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836813
612	NC_021814	ACG	2	6	35368	35373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836813
613	NC_021814	CGT	2	6	35379	35384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836813
614	NC_021814	CTT	2	6	35424	35429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836813
615	NC_021814	ATT	2	6	35543	35548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836814
616	NC_021814	CGC	2	6	35575	35580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836814
617	NC_021814	CCG	2	6	35596	35601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836814
618	NC_021814	GGC	2	6	35609	35614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836814
619	NC_021814	GCC	2	6	35628	35633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836814
620	NC_021814	TAT	2	6	35681	35686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836814
621	NC_021814	CGC	2	6	35708	35713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836814
622	NC_021814	ATT	2	6	35721	35726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836814
623	NC_021814	CG	3	6	35739	35744	0 %	0 %	50 %	50 %	525836814
624	NC_021814	TGA	2	6	35752	35757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836814
625	NC_021814	GCT	2	6	35888	35893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836814
626	NC_021814	CGC	2	6	35896	35901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836814
627	NC_021814	CGC	2	6	35974	35979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836814
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755	NC_021814	GTG	2	6	43059	43064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836820
756	NC_021814	GAA	2	6	43097	43102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836820
757	NC_021814	GTA	2	6	43152	43157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836820
758	NC_021814	GCG	2	6	43159	43164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836820
759	NC_021814	GGC	2	6	43221	43226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836820
760	NC_021814	GGCA	2	8	43262	43269	25 %	0 %	50 %	25 %	525836820
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762	NC_021814	TGA	2	6	43357	43362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836820
763	NC_021814	TGCC	2	8	43507	43514	0 %	25 %	25 %	50 %	525836820
764	NC_021814	ATG	2	6	43518	43523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836820
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770	NC_021814	GTT	2	6	43948	43953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840460
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774	NC_021814	GCA	2	6	44097	44102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840460
775	NC_021814	GGCG	2	8	44116	44123	0 %	0 %	75 %	25 %	525840460
776	NC_021814	GTT	2	6	44127	44132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840460
777	NC_021814	TGA	2	6	44205	44210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840460
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780	NC_021814	CGG	2	6	44277	44282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840460
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782	NC_021814	A	6	6	44355	44360	100 %	0 %	0 %	0 %	525840460
783	NC_021814	CG	3	6	44449	44454	0 %	0 %	50 %	50 %	525840460
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785	NC_021814	TGA	2	6	44573	44578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840460
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789	NC_021814	CGG	2	6	44733	44738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836821
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796	NC_021814	ATT	2	6	45124	45129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836821
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