MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
89001	NC_021814	TGT	2	6	4840533	4840538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840437
89002	NC_021814	ATC	3	9	4840618	4840626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840437
89003	NC_021814	GCCA	2	8	4840653	4840660	25 %	0 %	25 %	50 %	525840437
89004	NC_021814	GTTG	2	8	4840716	4840723	0 %	50 %	50 %	0 %	525840437
89005	NC_021814	AGTATT	2	12	4840725	4840736	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525840437
89006	NC_021814	GTA	2	6	4840753	4840758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840437
89007	NC_021814	GTC	2	6	4840814	4840819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840437
89008	NC_021814	TGC	2	6	4840827	4840832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840437
89009	NC_021814	CA	3	6	4840839	4840844	50 %	0 %	0 %	50 %	525840437
89010	NC_021814	TAT	2	6	4840899	4840904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840437
89011	NC_021814	ACA	2	6	4840963	4840968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840437
89012	NC_021814	ATC	2	6	4841026	4841031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840437
89013	NC_021814	TTC	2	6	4841032	4841037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840437
89014	NC_021814	TCT	2	6	4841042	4841047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840437
89015	NC_021814	CAG	2	6	4841078	4841083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840437
89016	NC_021814	GAA	2	6	4841091	4841096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840437
89017	NC_021814	TGGT	2	8	4841177	4841184	0 %	50 %	50 %	0 %	525840437
89018	NC_021814	GTT	2	6	4841278	4841283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840437
89019	NC_021814	TGA	2	6	4841321	4841326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840437
89020	NC_021814	CAGT	2	8	4841331	4841338	25 %	25 %	25 %	25 %	525840437
89021	NC_021814	GAA	2	6	4841352	4841357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840437
89022	NC_021814	GAA	2	6	4841827	4841832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840438
89023	NC_021814	TCG	2	6	4841952	4841957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840438
89024	NC_021814	AAT	2	6	4842032	4842037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840438
89025	NC_021814	AAT	2	6	4842049	4842054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840439
89026	NC_021814	CTT	2	6	4842126	4842131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840439
89027	NC_021814	CAA	2	6	4842133	4842138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840439
89028	NC_021814	GGT	2	6	4842194	4842199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840439
89029	NC_021814	GCA	2	6	4842248	4842253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840439
89030	NC_021814	CTA	2	6	4842336	4842341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840439
89031	NC_021814	CGC	2	6	4842355	4842360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840439
89032	NC_021814	GTC	2	6	4842414	4842419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840439
89033	NC_021814	A	6	6	4842425	4842430	100 %	0 %	0 %	0 %	525840439
89034	NC_021814	CGT	2	6	4842512	4842517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840440
89035	NC_021814	CG	3	6	4842551	4842556	0 %	0 %	50 %	50 %	525840440
89036	NC_021814	GTCT	2	8	4842615	4842622	0 %	50 %	25 %	25 %	525840440
89037	NC_021814	CGC	2	6	4842659	4842664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840440
89038	NC_021814	ACT	2	6	4842696	4842701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840440
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89041	NC_021814	GTC	2	6	4842762	4842767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840440
89042	NC_021814	GTT	2	6	4842860	4842865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840440
89043	NC_021814	CTT	2	6	4842873	4842878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840440
89044	NC_021814	GTT	2	6	4842899	4842904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840440
89045	NC_021814	GAA	2	6	4842922	4842927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840440
89046	NC_021814	GCTG	2	8	4842955	4842962	0 %	25 %	50 %	25 %	525840440
89047	NC_021814	AGC	2	6	4842963	4842968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840440
89048	NC_021814	CTGG	2	8	4842982	4842989	0 %	25 %	50 %	25 %	525840440
89049	NC_021814	GTAC	2	8	4843014	4843021	25 %	25 %	25 %	25 %	525840440
89050	NC_021814	TCTG	2	8	4843045	4843052	0 %	50 %	25 %	25 %	525840440
89051	NC_021814	TCG	2	6	4843074	4843079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840440
89052	NC_021814	ACGC	2	8	4843185	4843192	25 %	0 %	25 %	50 %	525840441
89053	NC_021814	TAC	2	6	4843312	4843317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840441
89054	NC_021814	AAG	2	6	4843333	4843338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840441
89055	NC_021814	ATG	2	6	4843471	4843476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840441
89056	NC_021814	GCA	2	6	4843499	4843504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840441
89057	NC_021814	ATTC	2	8	4843596	4843603	25 %	50 %	0 %	25 %	525840441
89058	NC_021814	GAA	2	6	4843605	4843610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840441
89059	NC_021814	CTG	2	6	4843632	4843637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840441
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89061	NC_021814	TCG	2	6	4843772	4843777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840441
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89064	NC_021814	CGATC	2	10	4843868	4843877	20 %	20 %	20 %	40 %	525840441
89065	NC_021814	CTG	2	6	4843878	4843883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840441
89066	NC_021814	CTT	2	6	4843986	4843991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840441
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89068	NC_021814	GTC	2	6	4844171	4844176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840442
89069	NC_021814	CAG	2	6	4844190	4844195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840442
89070	NC_021814	ATC	2	6	4844248	4844253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840442
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89074	NC_021814	GCT	2	6	4844521	4844526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840442
89075	NC_021814	GAT	3	9	4844742	4844750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840443
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89082	NC_021814	GAT	2	6	4845096	4845101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840444
89083	NC_021814	GTAC	2	8	4845112	4845119	25 %	25 %	25 %	25 %	525840444
89084	NC_021814	CTCGA	2	10	4845202	4845211	20 %	20 %	20 %	40 %	525840444
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89087	NC_021814	ATG	2	6	4845353	4845358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840444
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89094	NC_021814	CGTAA	2	10	4845939	4845948	40 %	20 %	20 %	20 %	525840445
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89100	NC_021814	GAA	2	6	4846271	4846276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840446
89101	NC_021814	TAA	2	6	4846309	4846314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840446
89102	NC_021814	CAT	2	6	4846387	4846392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840446
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89105	NC_021814	GGC	2	6	4846425	4846430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840446
89106	NC_021814	CGA	2	6	4846537	4846542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840446
89107	NC_021814	TGG	2	6	4846579	4846584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840446
89108	NC_021814	CTG	2	6	4846586	4846591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840446
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89112	NC_021814	GCG	2	6	4846839	4846844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840446
89113	NC_021814	GTT	2	6	4846846	4846851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840446
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.