MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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88502	NC_021814	ACC	2	6	4814500	4814505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840400
88503	NC_021814	GCG	2	6	4814613	4814618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840400
88504	NC_021814	GCA	2	6	4814630	4814635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840400
88505	NC_021814	GAG	2	6	4815026	4815031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840401
88506	NC_021814	GAG	2	6	4815071	4815076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840401
88507	NC_021814	GAA	2	6	4815152	4815157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840401
88508	NC_021814	A	6	6	4815176	4815181	100 %	0 %	0 %	0 %	525840401
88509	NC_021814	TGA	2	6	4815211	4815216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840401
88510	NC_021814	ATT	2	6	4815229	4815234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840401
88511	NC_021814	ACG	2	6	4815243	4815248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840401
88512	NC_021814	AAAT	2	8	4815258	4815265	75 %	25 %	0 %	0 %	525840401
88513	NC_021814	TGC	2	6	4815314	4815319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841339
88514	NC_021814	CGG	2	6	4815419	4815424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841339
88515	NC_021814	CAT	2	6	4815453	4815458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841339
88516	NC_021814	CAT	2	6	4815684	4815689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840402
88517	NC_021814	GCT	2	6	4815698	4815703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840402
88518	NC_021814	GCCAT	2	10	4815716	4815725	20 %	20 %	20 %	40 %	525840402
88519	NC_021814	GCT	2	6	4815810	4815815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840402
88520	NC_021814	GTT	2	6	4815969	4815974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840402
88521	NC_021814	GTC	2	6	4816092	4816097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840402
88522	NC_021814	GTG	2	6	4816099	4816104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840402
88523	NC_021814	ACG	2	6	4816132	4816137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840402
88524	NC_021814	ATCA	2	8	4816155	4816162	50 %	25 %	0 %	25 %	525840402
88525	NC_021814	GGT	2	6	4816199	4816204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840402
88526	NC_021814	CAG	2	6	4816224	4816229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840402
88527	NC_021814	GC	3	6	4816266	4816271	0 %	0 %	50 %	50 %	525840402
88528	NC_021814	CGC	2	6	4816277	4816282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840402
88529	NC_021814	GCC	2	6	4816332	4816337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840402
88530	NC_021814	GCG	2	6	4816370	4816375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840402
88531	NC_021814	GC	3	6	4816411	4816416	0 %	0 %	50 %	50 %	525840402
88532	NC_021814	CGCC	2	8	4816499	4816506	0 %	0 %	25 %	75 %	525840402
88533	NC_021814	AGC	2	6	4816507	4816512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840402
88534	NC_021814	CAG	2	6	4816548	4816553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840402
88535	NC_021814	ATG	2	6	4816600	4816605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840402
88536	NC_021814	CAG	2	6	4816641	4816646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840402
88537	NC_021814	GC	3	6	4816667	4816672	0 %	0 %	50 %	50 %	525840402
88538	NC_021814	CTG	2	6	4816821	4816826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840402
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88540	NC_021814	GC	3	6	4816864	4816869	0 %	0 %	50 %	50 %	525840402
88541	NC_021814	TGT	2	6	4816915	4816920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840402
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88544	NC_021814	TCG	2	6	4817056	4817061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840402
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88548	NC_021814	GC	3	6	4817194	4817199	0 %	0 %	50 %	50 %	525840402
88549	NC_021814	GAAC	2	8	4817200	4817207	50 %	0 %	25 %	25 %	525840402
88550	NC_021814	CGT	2	6	4817261	4817266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840402
88551	NC_021814	CGTT	2	8	4817269	4817276	0 %	50 %	25 %	25 %	525840402
88552	NC_021814	CGT	2	6	4817279	4817284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840402
88553	NC_021814	GCTG	2	8	4817341	4817348	0 %	25 %	50 %	25 %	525840402
88554	NC_021814	T	6	6	4817434	4817439	0 %	100 %	0 %	0 %	525840402
88555	NC_021814	CAG	2	6	4817448	4817453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840402
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88557	NC_021814	CGC	2	6	4817543	4817548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840402
88558	NC_021814	GAG	2	6	4817563	4817568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840402
88559	NC_021814	CAGC	2	8	4817851	4817858	25 %	0 %	25 %	50 %	525840403
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88585	NC_021814	TTAT	2	8	4819083	4819090	25 %	75 %	0 %	0 %	525840404
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88600	NC_021814	GTC	2	6	4819608	4819613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840404
88601	NC_021814	TCGC	2	8	4819639	4819646	0 %	25 %	25 %	50 %	525840404
88602	NC_021814	GCT	2	6	4819760	4819765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840404
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88617	NC_021814	TGG	2	6	4820526	4820531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840406
88618	NC_021814	GTAC	2	8	4820549	4820556	25 %	25 %	25 %	25 %	525840406
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88621	NC_021814	TGA	2	6	4820575	4820580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840406
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