MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021814	CCT	2	6	439526	439531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837134
8002	NC_021814	CATA	2	8	439542	439549	50 %	25 %	0 %	25 %	525837134
8003	NC_021814	GCA	2	6	439559	439564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837134
8004	NC_021814	TAA	2	6	439577	439582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837134
8005	NC_021814	GTA	2	6	439696	439701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837134
8006	NC_021814	TGA	2	6	439802	439807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837134
8007	NC_021814	CGC	2	6	439835	439840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837134
8008	NC_021814	GCC	3	9	439866	439874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837134
8009	NC_021814	GCC	2	6	439912	439917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837134
8010	NC_021814	TTG	2	6	439935	439940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837134
8011	NC_021814	AAT	2	6	440037	440042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837134
8012	NC_021814	CGA	2	6	440198	440203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837134
8013	NC_021814	AGC	2	6	440245	440250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837134
8014	NC_021814	CGG	2	6	440255	440260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837134
8015	NC_021814	CGG	2	6	440309	440314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837134
8016	NC_021814	TTC	2	6	440337	440342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837134
8017	NC_021814	TTG	2	6	440368	440373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837134
8018	NC_021814	CAT	2	6	440379	440384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837134
8019	NC_021814	CAG	2	6	440406	440411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837134
8020	NC_021814	CT	3	6	440413	440418	0 %	50 %	0 %	50 %	525837134
8021	NC_021814	CG	3	6	440427	440432	0 %	0 %	50 %	50 %	525837134
8022	NC_021814	TCA	2	6	440530	440535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837134
8023	NC_021814	T	6	6	440540	440545	0 %	100 %	0 %	0 %	525837134
8024	NC_021814	CGG	2	6	440554	440559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837134
8025	NC_021814	CCAG	2	8	440597	440604	25 %	0 %	25 %	50 %	525837134
8026	NC_021814	AAG	2	6	440611	440616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837134
8027	NC_021814	CGC	2	6	440654	440659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837134
8028	NC_021814	GCA	2	6	440720	440725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837134
8029	NC_021814	TTC	2	6	440730	440735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837134
8030	NC_021814	TCG	2	6	440758	440763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837134
8031	NC_021814	GCC	2	6	440821	440826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837134
8032	NC_021814	TTC	2	6	440982	440987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837134
8033	NC_021814	GGC	2	6	440991	440996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837134
8034	NC_021814	TGA	2	6	441077	441082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837134
8035	NC_021814	GCC	2	6	441085	441090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837134
8036	NC_021814	ACG	2	6	441144	441149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837134
8037	NC_021814	ATCA	2	8	441153	441160	50 %	25 %	0 %	25 %	525837134
8038	NC_021814	T	7	7	441191	441197	0 %	100 %	0 %	0 %	525837134
8039	NC_021814	CGC	2	6	441241	441246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840532
8040	NC_021814	CGG	2	6	441306	441311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840532
8041	NC_021814	GCG	2	6	441326	441331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840532
8042	NC_021814	CCG	2	6	441365	441370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840532
8043	NC_021814	ATG	2	6	441374	441379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840532
8044	NC_021814	CAG	2	6	441493	441498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840532
8045	NC_021814	CCG	2	6	441509	441514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840532
8046	NC_021814	GGC	2	6	441559	441564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840532
8047	NC_021814	GCG	2	6	441576	441581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840532
8048	NC_021814	AAG	2	6	441623	441628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840532
8049	NC_021814	GGC	2	6	441655	441660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840532
8050	NC_021814	CAG	2	6	441716	441721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840532
8051	NC_021814	GA	4	8	441794	441801	50 %	0 %	50 %	0 %	525840532
8052	NC_021814	AAGA	2	8	441806	441813	75 %	0 %	25 %	0 %	525840532
8053	NC_021814	ACT	2	6	441884	441889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840532
8054	NC_021814	CGA	2	6	441900	441905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840532
8055	NC_021814	CTT	2	6	441987	441992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840532
8056	NC_021814	ATA	2	6	442046	442051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840532
8057	NC_021814	CCG	2	6	442097	442102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840532
8058	NC_021814	CGG	2	6	442161	442166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840532
8059	NC_021814	GAT	2	6	442168	442173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840532
8060	NC_021814	CGG	2	6	442212	442217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840532
8061	NC_021814	AAT	2	6	442226	442231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840532
8062	NC_021814	A	7	7	442250	442256	100 %	0 %	0 %	0 %	525840532
8063	NC_021814	T	6	6	442288	442293	0 %	100 %	0 %	0 %	525840532
8064	NC_021814	CTGA	2	8	442344	442351	25 %	25 %	25 %	25 %	525840532
8065	NC_021814	AGTT	2	8	442368	442375	25 %	50 %	25 %	0 %	525840532
8066	NC_021814	TTG	2	6	442387	442392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840532
8067	NC_021814	TAA	2	6	442402	442407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840532
8068	NC_021814	ATT	2	6	442420	442425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840532
8069	NC_021814	A	6	6	442441	442446	100 %	0 %	0 %	0 %	525840532
8070	NC_021814	AAT	2	6	442471	442476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840532
8071	NC_021814	GCTT	2	8	442482	442489	0 %	50 %	25 %	25 %	525840532
8072	NC_021814	TTGCT	2	10	442490	442499	0 %	60 %	20 %	20 %	525840532
8073	NC_021814	AAT	2	6	443099	443104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837135
8074	NC_021814	ATT	2	6	443130	443135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837135
8075	NC_021814	GGC	2	6	443336	443341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837135
8076	NC_021814	GCC	2	6	443448	443453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837135
8077	NC_021814	AGG	2	6	443456	443461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837135
8078	NC_021814	GC	3	6	443476	443481	0 %	0 %	50 %	50 %	525837135
8079	NC_021814	GAA	2	6	443583	443588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837135
8080	NC_021814	TGGC	2	8	443607	443614	0 %	25 %	50 %	25 %	525837135
8081	NC_021814	GAAGTG	2	12	443619	443630	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525837135
8082	NC_021814	CCGGTA	2	12	443670	443681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525837135
8083	NC_021814	TGAA	2	8	443786	443793	50 %	25 %	25 %	0 %	525837136
8084	NC_021814	CGC	2	6	443845	443850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837136
8085	NC_021814	GCG	2	6	444023	444028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837136
8086	NC_021814	GGC	2	6	444049	444054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837136
8087	NC_021814	TAT	2	6	444087	444092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837136
8088	NC_021814	CGG	2	6	444185	444190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837136
8089	NC_021814	CGG	2	6	444197	444202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837136
8090	NC_021814	GGC	2	6	444282	444287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837136
8091	NC_021814	ATG	2	6	444304	444309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837136
8092	NC_021814	GCC	2	6	444318	444323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837136
8093	NC_021814	ATT	2	6	444433	444438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837136
8094	NC_021814	GC	3	6	444443	444448	0 %	0 %	50 %	50 %	525837136
8095	NC_021814	GCG	2	6	444452	444457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837136
8096	NC_021814	TGGGGC	2	12	444533	444544	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	525837136
8097	NC_021814	ACA	2	6	444581	444586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837136
8098	NC_021814	GGC	2	6	444828	444833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837136
8099	NC_021814	GAT	2	6	444838	444843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837136
8100	NC_021814	GGC	2	6	444853	444858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837136
8101	NC_021814	GCT	2	6	445024	445029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840533
8102	NC_021814	ACT	2	6	445235	445240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840533
8103	NC_021814	CCAG	2	8	445315	445322	25 %	0 %	25 %	50 %	525840533
8104	NC_021814	AGT	2	6	445333	445338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840533
8105	NC_021814	GA	3	6	445357	445362	50 %	0 %	50 %	0 %	525840533
8106	NC_021814	CGC	2	6	445439	445444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840533
8107	NC_021814	CGC	2	6	445486	445491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840533
8108	NC_021814	GCG	2	6	445503	445508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840533
8109	NC_021814	GGGC	2	8	445513	445520	0 %	0 %	75 %	25 %	525840533
8110	NC_021814	CGG	2	6	445547	445552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840533
8111	NC_021814	TGA	2	6	445581	445586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840533
8112	NC_021814	GCT	2	6	445595	445600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840533
8113	NC_021814	GC	3	6	445601	445606	0 %	0 %	50 %	50 %	525840533
8114	NC_021814	GTC	2	6	445607	445612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840533
8115	NC_021814	TGGC	2	8	445637	445644	0 %	25 %	50 %	25 %	525840533
8116	NC_021814	AAT	2	6	445649	445654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840533
8117	NC_021814	CA	3	6	445685	445690	50 %	0 %	0 %	50 %	525840533
8118	NC_021814	CGA	2	6	445738	445743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840533
8119	NC_021814	AGC	2	6	445754	445759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840533
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8121	NC_021814	CG	3	6	446046	446051	0 %	0 %	50 %	50 %	525837137
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8485	NC_021814	TGCC	2	8	465557	465564	0 %	25 %	25 %	50 %	525837151
8486	NC_021814	CGC	2	6	465572	465577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837151
8487	NC_021814	CGG	2	6	465636	465641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837151
8488	NC_021814	AGC	2	6	465704	465709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837151
8489	NC_021814	GAC	2	6	465753	465758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837151
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