MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_021814	CAAA	2	8	413597	413604	75 %	0 %	0 %	25 %	525837119
7502	NC_021814	TGA	2	6	413620	413625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837119
7503	NC_021814	TGC	2	6	413629	413634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7504	NC_021814	CTG	2	6	413664	413669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7505	NC_021814	CGA	2	6	413684	413689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7506	NC_021814	CG	4	8	413720	413727	0 %	0 %	50 %	50 %	525837119
7507	NC_021814	CCG	2	6	413728	413733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837119
7508	NC_021814	TGG	2	6	413851	413856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837119
7509	NC_021814	CCG	2	6	413863	413868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837119
7510	NC_021814	G	6	6	414079	414084	0 %	0 %	100 %	0 %	525837119
7511	NC_021814	CTGG	2	8	414101	414108	0 %	25 %	50 %	25 %	525837119
7512	NC_021814	CGT	2	6	414129	414134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7513	NC_021814	GTT	2	6	414161	414166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837119
7514	NC_021814	TTG	2	6	414313	414318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837119
7515	NC_021814	GGCG	2	8	414386	414393	0 %	0 %	75 %	25 %	525837119
7516	NC_021814	GAG	2	6	414402	414407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837119
7517	NC_021814	CT	3	6	414456	414461	0 %	50 %	0 %	50 %	525837119
7518	NC_021814	CTG	2	6	414513	414518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7519	NC_021814	CGC	2	6	414547	414552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837119
7520	NC_021814	TGG	2	6	414568	414573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837119
7521	NC_021814	GC	3	6	414619	414624	0 %	0 %	50 %	50 %	525837119
7522	NC_021814	CGG	2	6	414660	414665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837119
7523	NC_021814	GTCA	2	8	414670	414677	25 %	25 %	25 %	25 %	525837119
7524	NC_021814	GTT	2	6	414752	414757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837119
7525	NC_021814	GAA	2	6	414795	414800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837119
7526	NC_021814	GCA	2	6	414896	414901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7527	NC_021814	TGC	2	6	414928	414933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7528	NC_021814	GCT	2	6	415034	415039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7529	NC_021814	GGC	2	6	415057	415062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837119
7530	NC_021814	TTC	2	6	415128	415133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837119
7531	NC_021814	ATTG	2	8	415166	415173	25 %	50 %	25 %	0 %	525837119
7532	NC_021814	CAG	2	6	415176	415181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7533	NC_021814	CGG	2	6	415210	415215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837119
7534	NC_021814	CTG	2	6	415365	415370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7535	NC_021814	ACG	2	6	415378	415383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7536	NC_021814	TGA	2	6	415423	415428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837119
7537	NC_021814	CGA	2	6	415463	415468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7538	NC_021814	GCA	2	6	415505	415510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7539	NC_021814	TCCA	2	8	415539	415546	25 %	25 %	0 %	50 %	525837119
7540	NC_021814	ATA	2	6	415549	415554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837119
7541	NC_021814	TGG	2	6	415588	415593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837119
7542	NC_021814	CGA	2	6	415625	415630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7543	NC_021814	TGA	2	6	415643	415648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837119
7544	NC_021814	AG	3	6	415746	415751	50 %	0 %	50 %	0 %	525837119
7545	NC_021814	AGTC	2	8	415767	415774	25 %	25 %	25 %	25 %	525837119
7546	NC_021814	T	6	6	415878	415883	0 %	100 %	0 %	0 %	525837119
7547	NC_021814	AG	3	6	415916	415921	50 %	0 %	50 %	0 %	525837119
7548	NC_021814	GAC	2	6	416010	416015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837119
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7550	NC_021814	GCA	2	6	416108	416113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7551	NC_021814	GGCT	2	8	416196	416203	0 %	25 %	50 %	25 %	525837119
7552	NC_021814	AGG	2	6	416215	416220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837119
7553	NC_021814	ATT	2	6	416225	416230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837119
7554	NC_021814	GCG	2	6	416305	416310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837119
7555	NC_021814	TCT	2	6	416430	416435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837119
7556	NC_021814	GCG	3	9	416458	416466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837119
7557	NC_021814	ATG	2	6	416497	416502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837119
7558	NC_021814	GAC	2	6	416511	416516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837119
7559	NC_021814	GAT	2	6	416517	416522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837119
7560	NC_021814	ATG	2	6	416571	416576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837119
7561	NC_021814	GCG	2	6	416581	416586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837119
7562	NC_021814	GCA	2	6	416893	416898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840529
7563	NC_021814	GTTATT	2	12	416912	416923	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525840529
7564	NC_021814	TGG	2	6	417043	417048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840529
7565	NC_021814	ATCCG	2	10	417059	417068	20 %	20 %	20 %	40 %	525840529
7566	NC_021814	GTG	2	6	417096	417101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840529
7567	NC_021814	TCA	2	6	417131	417136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840529
7568	NC_021814	A	7	7	417179	417185	100 %	0 %	0 %	0 %	525840529
7569	NC_021814	ACG	2	6	417289	417294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840529
7570	NC_021814	CGAACG	2	12	417362	417373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840529
7571	NC_021814	GC	3	6	417402	417407	0 %	0 %	50 %	50 %	525840529
7572	NC_021814	GGC	2	6	417483	417488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840529
7573	NC_021814	TGA	2	6	417574	417579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840529
7574	NC_021814	TAA	2	6	417596	417601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840529
7575	NC_021814	GCC	2	6	417627	417632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840529
7576	NC_021814	A	6	6	417666	417671	100 %	0 %	0 %	0 %	525840529
7577	NC_021814	TCA	2	6	417691	417696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840529
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7580	NC_021814	GC	3	6	417784	417789	0 %	0 %	50 %	50 %	525840529
7581	NC_021814	GCA	2	6	417796	417801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840529
7582	NC_021814	CT	3	6	417852	417857	0 %	50 %	0 %	50 %	525840529
7583	NC_021814	TCCGA	2	10	417903	417912	20 %	20 %	20 %	40 %	525840529
7584	NC_021814	GCG	2	6	417928	417933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840529
7585	NC_021814	TGA	2	6	417980	417985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840529
7586	NC_021814	GTC	2	6	417987	417992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840529
7587	NC_021814	GATA	2	8	418034	418041	50 %	25 %	25 %	0 %	525840529
7588	NC_021814	TGGC	2	8	418125	418132	0 %	25 %	50 %	25 %	525840529
7589	NC_021814	GCG	2	6	418173	418178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840529
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7592	NC_021814	GC	3	6	418245	418250	0 %	0 %	50 %	50 %	525840529
7593	NC_021814	ATA	2	6	418279	418284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840529
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7596	NC_021814	TCAGC	2	10	418628	418637	20 %	20 %	20 %	40 %	525840529
7597	NC_021814	GGC	2	6	418643	418648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840529
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7602	NC_021814	GGA	2	6	418775	418780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840529
7603	NC_021814	GAT	2	6	418814	418819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840529
7604	NC_021814	GAT	2	6	418871	418876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840529
7605	NC_021814	TGA	2	6	418901	418906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840529
7606	NC_021814	TGC	2	6	418918	418923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840529
7607	NC_021814	CT	3	6	419027	419032	0 %	50 %	0 %	50 %	525840529
7608	NC_021814	GTG	2	6	419075	419080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840529
7609	NC_021814	CAA	2	6	419084	419089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840529
7610	NC_021814	GTG	2	6	419094	419099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840529
7611	NC_021814	ACG	2	6	419185	419190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840529
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7620	NC_021814	GGC	2	6	419899	419904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840530
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7651	NC_021814	GC	3	6	421356	421361	0 %	0 %	50 %	50 %	525840530
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7992	NC_021814	CAG	2	6	438872	438877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837133
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