MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021814	TGA	2	6	326195	326200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837056
6002	NC_021814	GGC	2	6	326211	326216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837056
6003	NC_021814	GGC	2	6	326269	326274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837056
6004	NC_021814	GC	4	8	326314	326321	0 %	0 %	50 %	50 %	525837056
6005	NC_021814	TCG	2	6	326327	326332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837056
6006	NC_021814	GCG	2	6	326333	326338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837056
6007	NC_021814	T	6	6	326384	326389	0 %	100 %	0 %	0 %	525837056
6008	NC_021814	CAT	2	6	326485	326490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837056
6009	NC_021814	ACT	2	6	326504	326509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837056
6010	NC_021814	GAA	2	6	326566	326571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837056
6011	NC_021814	A	7	7	326578	326584	100 %	0 %	0 %	0 %	525837056
6012	NC_021814	GAA	2	6	326638	326643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837056
6013	NC_021814	GCT	2	6	326661	326666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837056
6014	NC_021814	TCA	2	6	327012	327017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837057
6015	NC_021814	T	6	6	327051	327056	0 %	100 %	0 %	0 %	525837057
6016	NC_021814	GGC	2	6	327148	327153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837057
6017	NC_021814	CGG	2	6	327164	327169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837057
6018	NC_021814	CGT	2	6	327249	327254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837057
6019	NC_021814	GCG	2	6	327260	327265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837057
6020	NC_021814	CTG	2	6	327331	327336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837057
6021	NC_021814	CT	3	6	327355	327360	0 %	50 %	0 %	50 %	525837057
6022	NC_021814	CGG	2	6	327363	327368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837057
6023	NC_021814	CGCTGC	2	12	327383	327394	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525837057
6024	NC_021814	GC	3	6	327396	327401	0 %	0 %	50 %	50 %	525837057
6025	NC_021814	AAG	2	6	327512	327517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837057
6026	NC_021814	GATC	2	8	327522	327529	25 %	25 %	25 %	25 %	525837057
6027	NC_021814	CAT	2	6	327532	327537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837057
6028	NC_021814	TGCC	2	8	327597	327604	0 %	25 %	25 %	50 %	525837057
6029	NC_021814	GAT	2	6	327625	327630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837057
6030	NC_021814	TCG	2	6	327653	327658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837057
6031	NC_021814	CGG	2	6	327738	327743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837057
6032	NC_021814	GGC	2	6	327858	327863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837057
6033	NC_021814	GGC	2	6	327897	327902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837057
6034	NC_021814	GAA	2	6	327903	327908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837057
6035	NC_021814	ATT	2	6	328018	328023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837058
6036	NC_021814	GCG	2	6	328068	328073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837058
6037	NC_021814	TCG	2	6	328086	328091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837058
6038	NC_021814	GAC	2	6	328105	328110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837058
6039	NC_021814	TGG	2	6	328141	328146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837058
6040	NC_021814	AAT	2	6	328192	328197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837058
6041	NC_021814	GA	3	6	328222	328227	50 %	0 %	50 %	0 %	525837058
6042	NC_021814	CCT	2	6	328293	328298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837058
6043	NC_021814	GCC	2	6	328305	328310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837058
6044	NC_021814	CTTT	2	8	328351	328358	0 %	75 %	0 %	25 %	525837058
6045	NC_021814	TCA	2	6	328420	328425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837058
6046	NC_021814	GCG	2	6	328542	328547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837058
6047	NC_021814	GCT	2	6	328577	328582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837058
6048	NC_021814	GAA	2	6	328689	328694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837058
6049	NC_021814	AGCA	2	8	328751	328758	50 %	0 %	25 %	25 %	525837058
6050	NC_021814	CGACCG	2	12	329217	329228	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525837059
6051	NC_021814	CTG	2	6	329272	329277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837059
6052	NC_021814	ACT	2	6	329386	329391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837059
6053	NC_021814	GGC	2	6	329451	329456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837059
6054	NC_021814	ATG	2	6	329524	329529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837059
6055	NC_021814	CT	3	6	329553	329558	0 %	50 %	0 %	50 %	525837059
6056	NC_021814	ATG	2	6	329597	329602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837059
6057	NC_021814	GAA	2	6	329737	329742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837059
6058	NC_021814	TGAC	2	8	329753	329760	25 %	25 %	25 %	25 %	525837059
6059	NC_021814	CTG	2	6	329770	329775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837059
6060	NC_021814	CAT	2	6	329787	329792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837059
6061	NC_021814	AACA	2	8	329809	329816	75 %	0 %	0 %	25 %	525837059
6062	NC_021814	GC	3	6	329837	329842	0 %	0 %	50 %	50 %	525837059
6063	NC_021814	AAG	2	6	329942	329947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837059
6064	NC_021814	GCT	2	6	330016	330021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837059
6065	NC_021814	TCG	2	6	330030	330035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837059
6066	NC_021814	ATCC	2	8	330104	330111	25 %	25 %	0 %	50 %	525837059
6067	NC_021814	CGG	2	6	330180	330185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837059
6068	NC_021814	CATT	2	8	330264	330271	25 %	50 %	0 %	25 %	525837059
6069	NC_021814	CGG	2	6	330324	330329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837059
6070	NC_021814	TCG	2	6	330362	330367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837059
6071	NC_021814	TGA	2	6	330401	330406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837059
6072	NC_021814	AAC	2	6	330407	330412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837059
6073	NC_021814	GCA	2	6	330624	330629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837059
6074	NC_021814	GGT	2	6	330667	330672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837059
6075	NC_021814	ACTG	2	8	330762	330769	25 %	25 %	25 %	25 %	525837059
6076	NC_021814	GC	3	6	330784	330789	0 %	0 %	50 %	50 %	525837059
6077	NC_021814	TGC	2	6	330851	330856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837059
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6080	NC_021814	TGT	2	6	330980	330985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837059
6081	NC_021814	CTG	2	6	331036	331041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837059
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6083	NC_021814	ACC	2	6	331125	331130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840502
6084	NC_021814	CGA	2	6	331174	331179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840502
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6086	NC_021814	GGC	2	6	331278	331283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840502
6087	NC_021814	CCA	2	6	331309	331314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840502
6088	NC_021814	GCG	2	6	331326	331331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840502
6089	NC_021814	TGCG	2	8	331392	331399	0 %	25 %	50 %	25 %	525840502
6090	NC_021814	TCC	2	6	331410	331415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840502
6091	NC_021814	GCG	3	9	331512	331520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840502
6092	NC_021814	GGCC	2	8	331591	331598	0 %	0 %	50 %	50 %	525840502
6093	NC_021814	GCCA	2	8	331647	331654	25 %	0 %	25 %	50 %	525840502
6094	NC_021814	GA	3	6	331831	331836	50 %	0 %	50 %	0 %	525840503
6095	NC_021814	TGT	2	6	331856	331861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840503
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6098	NC_021814	GC	3	6	331947	331952	0 %	0 %	50 %	50 %	525840503
6099	NC_021814	TAC	2	6	331960	331965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840503
6100	NC_021814	CGC	2	6	331977	331982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840503
6101	NC_021814	GATGGC	2	12	331998	332009	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525840503
6102	NC_021814	TGC	2	6	332153	332158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840503
6103	NC_021814	TGG	2	6	332169	332174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840503
6104	NC_021814	GCC	2	6	332196	332201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840503
6105	NC_021814	CCAG	2	8	332263	332270	25 %	0 %	25 %	50 %	525840503
6106	NC_021814	CGG	2	6	332362	332367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840503
6107	NC_021814	CGGA	2	8	332379	332386	25 %	0 %	50 %	25 %	525840503
6108	NC_021814	CGC	2	6	332544	332549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840504
6109	NC_021814	CG	4	8	332653	332660	0 %	0 %	50 %	50 %	525840504
6110	NC_021814	CGA	2	6	332702	332707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840504
6111	NC_021814	CAG	2	6	332709	332714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840504
6112	NC_021814	GGC	2	6	332743	332748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840504
6113	NC_021814	CAG	2	6	332829	332834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840504
6114	NC_021814	CGCC	2	8	332970	332977	0 %	0 %	25 %	75 %	525840504
6115	NC_021814	CAG	2	6	332997	333002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840504
6116	NC_021814	GCC	2	6	333013	333018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840504
6117	NC_021814	AGC	2	6	333055	333060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840504
6118	NC_021814	GTG	2	6	333061	333066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840504
6119	NC_021814	GCC	2	6	333070	333075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840504
6120	NC_021814	CGTA	2	8	333147	333154	25 %	25 %	25 %	25 %	525837060
6121	NC_021814	GCA	3	9	333167	333175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837060
6122	NC_021814	GAT	2	6	333183	333188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837060
6123	NC_021814	CGAC	2	8	333236	333243	25 %	0 %	25 %	50 %	525837060
6124	NC_021814	CCA	2	6	333245	333250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837060
6125	NC_021814	CGA	2	6	333278	333283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837060
6126	NC_021814	CGC	2	6	333308	333313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837060
6127	NC_021814	GAC	2	6	333366	333371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837060
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6129	NC_021814	AGC	2	6	333487	333492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837060
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6132	NC_021814	CTGG	2	8	333663	333670	0 %	25 %	50 %	25 %	525837060
6133	NC_021814	GAA	2	6	333722	333727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837061
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6140	NC_021814	GTG	2	6	334607	334612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837062
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6149	NC_021814	TTG	2	6	335009	335014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837062
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6153	NC_021814	CG	4	8	335115	335122	0 %	0 %	50 %	50 %	525837062
6154	NC_021814	GCCA	2	8	335123	335130	25 %	0 %	25 %	50 %	525837062
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6157	NC_021814	A	6	6	335267	335272	100 %	0 %	0 %	0 %	525837062
6158	NC_021814	TGC	2	6	335301	335306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837062
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6162	NC_021814	AATG	2	8	335465	335472	50 %	25 %	25 %	0 %	525837062
6163	NC_021814	GATCTG	2	12	335603	335614	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525837063
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6189	NC_021814	GGC	3	9	336665	336673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837063
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6243	NC_021814	CGT	2	6	339676	339681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837066
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6484	NC_021814	CAC	2	6	353089	353094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837078
6485	NC_021814	CGC	2	6	353161	353166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837078
6486	NC_021814	TGC	2	6	353184	353189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837078
6487	NC_021814	GCG	2	6	353276	353281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837078
6488	NC_021814	GCC	2	6	353288	353293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837078
6489	NC_021814	TAT	2	6	353326	353331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837078
6490	NC_021814	GCG	2	6	353348	353353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837078
6491	NC_021814	AGC	2	6	353391	353396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837078
6492	NC_021814	CCG	2	6	353401	353406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837078
6493	NC_021814	CTG	2	6	353444	353449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837078
6494	NC_021814	CGGT	2	8	353487	353494	0 %	25 %	50 %	25 %	525837078
6495	NC_021814	GGC	2	6	353539	353544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837078
6496	NC_021814	ACT	2	6	353583	353588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837078
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6498	NC_021814	ACC	3	9	353705	353713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837078
6499	NC_021814	GTT	2	6	353731	353736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837078
6500	NC_021814	TGC	2	6	353826	353831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837078

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