MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021814	ATA	2	6	268099	268104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837006
5002	NC_021814	CG	4	8	268106	268113	0 %	0 %	50 %	50 %	525837006
5003	NC_021814	AT	3	6	268279	268284	50 %	50 %	0 %	0 %	525837006
5004	NC_021814	CCAG	2	8	268373	268380	25 %	0 %	25 %	50 %	525837006
5005	NC_021814	TCG	2	6	268408	268413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837006
5006	NC_021814	GCG	2	6	268465	268470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837006
5007	NC_021814	CTTA	2	8	268549	268556	25 %	50 %	0 %	25 %	525837007
5008	NC_021814	TTC	2	6	268638	268643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837007
5009	NC_021814	TTC	2	6	268694	268699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837007
5010	NC_021814	TGA	2	6	268716	268721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837007
5011	NC_021814	AGC	2	6	268740	268745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837007
5012	NC_021814	CGA	2	6	268750	268755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837007
5013	NC_021814	CCG	2	6	268785	268790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837007
5014	NC_021814	CATC	2	8	268799	268806	25 %	25 %	0 %	50 %	525837007
5015	NC_021814	GGC	2	6	268825	268830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837007
5016	NC_021814	CAA	2	6	268871	268876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837007
5017	NC_021814	CCAT	2	8	268899	268906	25 %	25 %	0 %	50 %	525837007
5018	NC_021814	CAA	2	6	268958	268963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837007
5019	NC_021814	TCA	2	6	269019	269024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837007
5020	NC_021814	CAGCGC	2	12	269030	269041	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525837007
5021	NC_021814	CG	3	6	269042	269047	0 %	0 %	50 %	50 %	525837007
5022	NC_021814	CCG	2	6	269091	269096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837007
5023	NC_021814	TCA	2	6	269149	269154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837007
5024	NC_021814	GC	3	6	269185	269190	0 %	0 %	50 %	50 %	525837007
5025	NC_021814	GCG	2	6	269385	269390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837007
5026	NC_021814	GGC	2	6	269393	269398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837007
5027	NC_021814	GCT	2	6	269548	269553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837007
5028	NC_021814	CGC	2	6	269602	269607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837007
5029	NC_021814	GC	3	6	269669	269674	0 %	0 %	50 %	50 %	525837007
5030	NC_021814	GCC	2	6	269679	269684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837007
5031	NC_021814	CTT	2	6	269722	269727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837007
5032	NC_021814	CAG	2	6	269786	269791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837007
5033	NC_021814	CG	3	6	269820	269825	0 %	0 %	50 %	50 %	525837007
5034	NC_021814	TTCAC	2	10	269844	269853	20 %	40 %	0 %	40 %	525837007
5035	NC_021814	GTCGCT	2	12	269864	269875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837007
5036	NC_021814	GAT	2	6	269887	269892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837007
5037	NC_021814	GC	3	6	269911	269916	0 %	0 %	50 %	50 %	525837007
5038	NC_021814	GGGC	2	8	269979	269986	0 %	0 %	75 %	25 %	525837007
5039	NC_021814	AAAG	2	8	270142	270149	75 %	0 %	25 %	0 %	525837008
5040	NC_021814	CGC	2	6	270171	270176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837008
5041	NC_021814	TCT	2	6	270231	270236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837008
5042	NC_021814	TGA	2	6	270254	270259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837008
5043	NC_021814	TCG	2	6	270287	270292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837008
5044	NC_021814	ACG	2	6	270307	270312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837008
5045	NC_021814	CTT	2	6	270318	270323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837008
5046	NC_021814	CATA	2	8	270345	270352	50 %	25 %	0 %	25 %	525837008
5047	NC_021814	GGC	2	6	270373	270378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837008
5048	NC_021814	GC	3	6	270482	270487	0 %	0 %	50 %	50 %	525837008
5049	NC_021814	CCA	2	6	270543	270548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837008
5050	NC_021814	GCG	2	6	270603	270608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837008
5051	NC_021814	ACGC	2	8	270631	270638	25 %	0 %	25 %	50 %	525837008
5052	NC_021814	TCG	2	6	270644	270649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837008
5053	NC_021814	AAT	2	6	270658	270663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837008
5054	NC_021814	CTT	2	6	270759	270764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837008
5055	NC_021814	AAT	2	6	270784	270789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837008
5056	NC_021814	TGG	2	6	270825	270830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837008
5057	NC_021814	CGC	2	6	270836	270841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837008
5058	NC_021814	TCT	2	6	270857	270862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837008
5059	NC_021814	AACGC	2	10	270936	270945	40 %	0 %	20 %	40 %	525837008
5060	NC_021814	GTCCA	2	10	270986	270995	20 %	20 %	20 %	40 %	525837008
5061	NC_021814	CT	3	6	271127	271132	0 %	50 %	0 %	50 %	525837008
5062	NC_021814	GTTT	2	8	271307	271314	0 %	75 %	25 %	0 %	525837008
5063	NC_021814	TGG	2	6	271743	271748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837009
5064	NC_021814	GCG	2	6	271812	271817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837009
5065	NC_021814	GAT	2	6	271823	271828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837009
5066	NC_021814	TGA	2	6	271844	271849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837009
5067	NC_021814	CAA	2	6	271851	271856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837009
5068	NC_021814	GTG	2	6	271866	271871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837009
5069	NC_021814	GATG	2	8	271922	271929	25 %	25 %	50 %	0 %	525837009
5070	NC_021814	CTT	2	6	271949	271954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837009
5071	NC_021814	TTG	2	6	271965	271970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837009
5072	NC_021814	CGG	2	6	272003	272008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837009
5073	NC_021814	CCGG	2	8	272067	272074	0 %	0 %	50 %	50 %	525837009
5074	NC_021814	CGA	2	6	272101	272106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837009
5075	NC_021814	G	6	6	272123	272128	0 %	0 %	100 %	0 %	525837009
5076	NC_021814	GCC	2	6	272168	272173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837009
5077	NC_021814	TGG	2	6	272176	272181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837009
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5079	NC_021814	A	6	6	272376	272381	100 %	0 %	0 %	0 %	525837009
5080	NC_021814	GGC	2	6	272552	272557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837009
5081	NC_021814	TTC	2	6	272595	272600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837009
5082	NC_021814	CGT	2	6	272634	272639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837009
5083	NC_021814	TGA	2	6	272665	272670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837009
5084	NC_021814	CATTG	2	10	272714	272723	20 %	40 %	20 %	20 %	525837009
5085	NC_021814	CGT	2	6	272762	272767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837009
5086	NC_021814	ATGG	2	8	272840	272847	25 %	25 %	50 %	0 %	525837009
5087	NC_021814	TAT	2	6	272888	272893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837009
5088	NC_021814	TTC	2	6	272907	272912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837009
5089	NC_021814	CAT	2	6	272945	272950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837009
5090	NC_021814	CAC	2	6	272982	272987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837009
5091	NC_021814	CTT	2	6	273509	273514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840493
5092	NC_021814	A	6	6	273584	273589	100 %	0 %	0 %	0 %	525840493
5093	NC_021814	AAGA	2	8	273594	273601	75 %	0 %	25 %	0 %	525840493
5094	NC_021814	AGC	2	6	273648	273653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840493
5095	NC_021814	GAAA	2	8	273670	273677	75 %	0 %	25 %	0 %	525840493
5096	NC_021814	ATT	2	6	273689	273694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840493
5097	NC_021814	AT	3	6	273747	273752	50 %	50 %	0 %	0 %	525840493
5098	NC_021814	TTG	2	6	273997	274002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840493
5099	NC_021814	CACG	2	8	274004	274011	25 %	0 %	25 %	50 %	525840493
5100	NC_021814	GGA	2	6	274052	274057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840493
5101	NC_021814	CGGG	2	8	274062	274069	0 %	0 %	75 %	25 %	525840493
5102	NC_021814	GCT	2	6	274080	274085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840493
5103	NC_021814	TAT	2	6	274141	274146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840493
5104	NC_021814	TCAA	2	8	274161	274168	50 %	25 %	0 %	25 %	525840493
5105	NC_021814	G	7	7	274223	274229	0 %	0 %	100 %	0 %	525840493
5106	NC_021814	CAA	2	6	274233	274238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840493
5107	NC_021814	AT	3	6	274268	274273	50 %	50 %	0 %	0 %	525840493
5108	NC_021814	CA	3	6	274287	274292	50 %	0 %	0 %	50 %	525840493
5109	NC_021814	GAG	2	6	274457	274462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837010
5110	NC_021814	ATA	2	6	274514	274519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837010
5111	NC_021814	ACC	2	6	274525	274530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837010
5112	NC_021814	T	6	6	274531	274536	0 %	100 %	0 %	0 %	525837010
5113	NC_021814	AC	3	6	274545	274550	50 %	0 %	0 %	50 %	525837010
5114	NC_021814	CTA	2	6	274617	274622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837010
5115	NC_021814	TCT	2	6	274764	274769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837010
5116	NC_021814	GGA	2	6	274770	274775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837010
5117	NC_021814	GA	3	6	274809	274814	50 %	0 %	50 %	0 %	525837010
5118	NC_021814	GAT	2	6	274918	274923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837010
5119	NC_021814	AGG	2	6	274952	274957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837010
5120	NC_021814	CAT	2	6	275077	275082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837010
5121	NC_021814	ATG	3	9	275083	275091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837010
5122	NC_021814	TTGA	2	8	275101	275108	25 %	50 %	25 %	0 %	525837010
5123	NC_021814	ATG	2	6	275123	275128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837010
5124	NC_021814	A	6	6	275192	275197	100 %	0 %	0 %	0 %	525837010
5125	NC_021814	GAT	2	6	275236	275241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837010
5126	NC_021814	TGGC	2	8	275244	275251	0 %	25 %	50 %	25 %	525837010
5127	NC_021814	TCA	2	6	275831	275836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840494
5128	NC_021814	T	6	6	275891	275896	0 %	100 %	0 %	0 %	525840494
5129	NC_021814	TAA	2	6	275911	275916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840494
5130	NC_021814	GCC	2	6	275932	275937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840494
5131	NC_021814	GCT	2	6	275950	275955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840494
5132	NC_021814	CAA	2	6	275971	275976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840494
5133	NC_021814	T	7	7	275998	276004	0 %	100 %	0 %	0 %	525837011
5134	NC_021814	GC	4	8	276134	276141	0 %	0 %	50 %	50 %	525837011
5135	NC_021814	CTG	2	6	276203	276208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837011
5136	NC_021814	GAC	2	6	276255	276260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837011
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5138	NC_021814	CGG	2	6	276335	276340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837011
5139	NC_021814	CAG	2	6	276417	276422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837011
5140	NC_021814	ATG	3	9	276470	276478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837011
5141	NC_021814	GCT	2	6	276695	276700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840495
5142	NC_021814	CAT	2	6	276755	276760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840495
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5144	NC_021814	TCA	2	6	277026	277031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837012
5145	NC_021814	AGCGT	2	10	277148	277157	20 %	20 %	40 %	20 %	525837012
5146	NC_021814	AT	3	6	277168	277173	50 %	50 %	0 %	0 %	525837012
5147	NC_021814	CA	3	6	277182	277187	50 %	0 %	0 %	50 %	525837012
5148	NC_021814	GCA	2	6	277191	277196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837012
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5150	NC_021814	TAC	2	6	277306	277311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837012
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5153	NC_021814	T	6	6	277462	277467	0 %	100 %	0 %	0 %	525837012
5154	NC_021814	GAG	2	6	277511	277516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837012
5155	NC_021814	GCA	2	6	277566	277571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837012
5156	NC_021814	CCT	2	6	277665	277670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525837012
5157	NC_021814	GCA	2	6	277867	277872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837012
5158	NC_021814	CGA	2	6	277984	277989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837012
5159	NC_021814	TC	3	6	278027	278032	0 %	50 %	0 %	50 %	525837012
5160	NC_021814	ACTG	2	8	278115	278122	25 %	25 %	25 %	25 %	525837012
5161	NC_021814	CG	3	6	278137	278142	0 %	0 %	50 %	50 %	525837012
5162	NC_021814	CAG	2	6	278225	278230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837012
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5164	NC_021814	GAT	2	6	278339	278344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837012
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5169	NC_021814	A	6	6	278677	278682	100 %	0 %	0 %	0 %	525837013
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5178	NC_021814	GTAC	2	8	279298	279305	25 %	25 %	25 %	25 %	525837013
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5181	NC_021814	TTG	2	6	279443	279448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837013
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5197	NC_021814	CGGCA	2	10	280854	280863	20 %	0 %	40 %	40 %	525837015
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5204	NC_021814	CTGG	2	8	281421	281428	0 %	25 %	50 %	25 %	525837015
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5210	NC_021814	CTG	2	6	281686	281691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837015
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5212	NC_021814	TAT	3	9	281793	281801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837015
5213	NC_021814	ATT	2	6	281806	281811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837015
5214	NC_021814	TAT	2	6	281862	281867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837015
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5230	NC_021814	AGT	2	6	282433	282438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837016
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5232	NC_021814	TTC	2	6	282492	282497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837016
5233	NC_021814	ATCA	2	8	282518	282525	50 %	25 %	0 %	25 %	525837016
5234	NC_021814	ATA	2	6	282565	282570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837016
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5236	NC_021814	GA	4	8	282784	282791	50 %	0 %	50 %	0 %	525837017
5237	NC_021814	CAAT	2	8	282809	282816	50 %	25 %	0 %	25 %	525837017
5238	NC_021814	TTG	2	6	282817	282822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837017
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5240	NC_021814	CGA	2	6	283018	283023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837017
5241	NC_021814	CA	3	6	283045	283050	50 %	0 %	0 %	50 %	525837017
5242	NC_021814	ATA	2	6	283074	283079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837017
5243	NC_021814	TCG	2	6	283112	283117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837017
5244	NC_021814	AAC	2	6	283125	283130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837017
5245	NC_021814	TTG	2	6	283188	283193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837017
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5248	NC_021814	CCG	2	6	283265	283270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837017
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5318	NC_021814	C	6	6	287521	287526	0 %	0 %	0 %	100 %	525837020
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5334	NC_021814	CTT	2	6	288452	288457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837021
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5355	NC_021814	CG	3	6	289806	289811	0 %	0 %	50 %	50 %	525837023
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5368	NC_021814	CAT	2	6	290548	290553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837023
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5490	NC_021814	TGC	2	6	297550	297555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837028
5491	NC_021814	A	6	6	297662	297667	100 %	0 %	0 %	0 %	525837028
5492	NC_021814	CTG	2	6	297732	297737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837029
5493	NC_021814	GCC	2	6	297757	297762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837029
5494	NC_021814	CGG	2	6	297774	297779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837029
5495	NC_021814	GC	3	6	297800	297805	0 %	0 %	50 %	50 %	525837029
5496	NC_021814	GAC	2	6	297832	297837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837029
5497	NC_021814	TG	3	6	297882	297887	0 %	50 %	50 %	0 %	525837029
5498	NC_021814	GCCA	2	8	297937	297944	25 %	0 %	25 %	50 %	525837029
5499	NC_021814	TCT	2	6	297958	297963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837029
5500	NC_021814	GGA	2	6	298009	298014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837029

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