MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 89288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021814	TGC	2	6	238467	238472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836979
4502	NC_021814	AAG	2	6	238477	238482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836979
4503	NC_021814	ATT	3	9	238718	238726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840489
4504	NC_021814	TGT	2	6	238756	238761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840489
4505	NC_021814	GCC	2	6	239080	239085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836980
4506	NC_021814	TCA	3	9	239101	239109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836980
4507	NC_021814	GAC	2	6	239128	239133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836980
4508	NC_021814	GAA	2	6	239259	239264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836980
4509	NC_021814	TTC	2	6	239305	239310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836980
4510	NC_021814	GCG	2	6	239351	239356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836980
4511	NC_021814	T	6	6	239385	239390	0 %	100 %	0 %	0 %	525836980
4512	NC_021814	A	6	6	239434	239439	100 %	0 %	0 %	0 %	525836980
4513	NC_021814	CCG	2	6	241216	241221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836981
4514	NC_021814	GAC	2	6	241356	241361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836981
4515	NC_021814	GGGC	2	8	241397	241404	0 %	0 %	75 %	25 %	525836981
4516	NC_021814	T	6	6	241755	241760	0 %	100 %	0 %	0 %	525836981
4517	NC_021814	TGG	2	6	241814	241819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836981
4518	NC_021814	CGCT	2	8	241844	241851	0 %	25 %	25 %	50 %	525836981
4519	NC_021814	CTT	2	6	241874	241879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836981
4520	NC_021814	ATCG	2	8	241906	241913	25 %	25 %	25 %	25 %	525836981
4521	NC_021814	CGC	2	6	241941	241946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836981
4522	NC_021814	TTGC	2	8	241960	241967	0 %	50 %	25 %	25 %	525836981
4523	NC_021814	ATG	2	6	242038	242043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836981
4524	NC_021814	GC	3	6	242148	242153	0 %	0 %	50 %	50 %	525836982
4525	NC_021814	TGC	2	6	242255	242260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836982
4526	NC_021814	GAA	2	6	242307	242312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836982
4527	NC_021814	CGG	2	6	242314	242319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836982
4528	NC_021814	GGC	2	6	242322	242327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836982
4529	NC_021814	GGC	2	6	242331	242336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836982
4530	NC_021814	TCG	3	9	242347	242355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836982
4531	NC_021814	GCAG	2	8	242437	242444	25 %	0 %	50 %	25 %	525836982
4532	NC_021814	CTT	2	6	242627	242632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836982
4533	NC_021814	ACG	2	6	242731	242736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836982
4534	NC_021814	GCG	2	6	242753	242758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836982
4535	NC_021814	ACGA	2	8	242806	242813	50 %	0 %	25 %	25 %	525836982
4536	NC_021814	CCG	2	6	242938	242943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836982
4537	NC_021814	CCGT	2	8	242971	242978	0 %	25 %	25 %	50 %	525836982
4538	NC_021814	GCG	2	6	242992	242997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836982
4539	NC_021814	CCG	2	6	243025	243030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836982
4540	NC_021814	CAG	2	6	243039	243044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836982
4541	NC_021814	TCG	2	6	243058	243063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836982
4542	NC_021814	TCA	2	6	243083	243088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836982
4543	NC_021814	GGTTC	2	10	243104	243113	0 %	40 %	40 %	20 %	525836982
4544	NC_021814	CCG	2	6	243193	243198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836982
4545	NC_021814	CGA	2	6	243248	243253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836982
4546	NC_021814	TGA	2	6	243481	243486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836983
4547	NC_021814	A	6	6	243486	243491	100 %	0 %	0 %	0 %	525836983
4548	NC_021814	A	6	6	243551	243556	100 %	0 %	0 %	0 %	525836983
4549	NC_021814	AGCG	2	8	243573	243580	25 %	0 %	50 %	25 %	525836983
4550	NC_021814	TGT	2	6	243598	243603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836983
4551	NC_021814	CAT	2	6	243650	243655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836983
4552	NC_021814	TGC	2	6	243814	243819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836983
4553	NC_021814	GGC	2	6	243875	243880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836983
4554	NC_021814	ATT	2	6	243987	243992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836983
4555	NC_021814	CG	3	6	244024	244029	0 %	0 %	50 %	50 %	525836983
4556	NC_021814	GCT	2	6	244037	244042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836983
4557	NC_021814	GAAAT	2	10	244101	244110	60 %	20 %	20 %	0 %	525836983
4558	NC_021814	GGC	2	6	244139	244144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836983
4559	NC_021814	GAT	4	12	244247	244258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836983
4560	NC_021814	ACG	2	6	244261	244266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836983
4561	NC_021814	CAC	2	6	244491	244496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836984
4562	NC_021814	CAG	2	6	244635	244640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836984
4563	NC_021814	A	6	6	244656	244661	100 %	0 %	0 %	0 %	525836984
4564	NC_021814	CGG	2	6	244669	244674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836984
4565	NC_021814	TTG	2	6	244700	244705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836984
4566	NC_021814	GCA	2	6	244706	244711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836984
4567	NC_021814	GCAA	2	8	244741	244748	50 %	0 %	25 %	25 %	525836984
4568	NC_021814	GC	3	6	244783	244788	0 %	0 %	50 %	50 %	525836984
4569	NC_021814	TGA	2	6	244789	244794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836984
4570	NC_021814	GCCA	2	8	244813	244820	25 %	0 %	25 %	50 %	525836984
4571	NC_021814	CAG	2	6	244873	244878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836984
4572	NC_021814	CGG	2	6	244892	244897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836984
4573	NC_021814	TCG	2	6	244910	244915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836984
4574	NC_021814	A	6	6	244918	244923	100 %	0 %	0 %	0 %	525836984
4575	NC_021814	AGC	2	6	244960	244965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836984
4576	NC_021814	GCA	2	6	244994	244999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836984
4577	NC_021814	GAC	2	6	245040	245045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836984
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4579	NC_021814	ATA	2	6	245101	245106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836984
4580	NC_021814	CGG	2	6	245283	245288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836985
4581	NC_021814	ATC	2	6	245305	245310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836985
4582	NC_021814	CT	3	6	245315	245320	0 %	50 %	0 %	50 %	525836985
4583	NC_021814	CGC	2	6	245361	245366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836985
4584	NC_021814	AAT	2	6	245407	245412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836985
4585	NC_021814	GCT	2	6	245527	245532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836985
4586	NC_021814	GAT	2	6	245586	245591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836985
4587	NC_021814	CG	4	8	245595	245602	0 %	0 %	50 %	50 %	525836985
4588	NC_021814	GCCA	2	8	245618	245625	25 %	0 %	25 %	50 %	525836985
4589	NC_021814	GCG	2	6	245627	245632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836985
4590	NC_021814	GCT	2	6	245641	245646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836985
4591	NC_021814	CAG	2	6	245762	245767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836985
4592	NC_021814	GCC	2	6	245882	245887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836985
4593	NC_021814	TAT	2	6	245892	245897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836985
4594	NC_021814	ATG	2	6	245903	245908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836985
4595	NC_021814	GTC	2	6	246065	246070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836985
4596	NC_021814	TGC	2	6	246093	246098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836985
4597	NC_021814	CTGG	2	8	246106	246113	0 %	25 %	50 %	25 %	525836985
4598	NC_021814	TCA	2	6	246132	246137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836985
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4600	NC_021814	CGC	2	6	246192	246197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836985
4601	NC_021814	GC	3	6	246207	246212	0 %	0 %	50 %	50 %	525836985
4602	NC_021814	GCC	2	6	246220	246225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836985
4603	NC_021814	CA	3	6	246234	246239	50 %	0 %	0 %	50 %	525836985
4604	NC_021814	AAT	2	6	246287	246292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836985
4605	NC_021814	T	6	6	246322	246327	0 %	100 %	0 %	0 %	525836985
4606	NC_021814	GAA	2	6	246353	246358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836985
4607	NC_021814	T	6	6	246397	246402	0 %	100 %	0 %	0 %	525836985
4608	NC_021814	GTT	2	6	246647	246652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840490
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4610	NC_021814	TAA	2	6	246707	246712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840490
4611	NC_021814	TGA	2	6	246778	246783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836986
4612	NC_021814	GTC	2	6	246804	246809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836986
4613	NC_021814	TCT	2	6	246820	246825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836986
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4615	NC_021814	GC	3	6	246894	246899	0 %	0 %	50 %	50 %	525836986
4616	NC_021814	TCA	2	6	246961	246966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836986
4617	NC_021814	CT	3	6	246990	246995	0 %	50 %	0 %	50 %	525836986
4618	NC_021814	CGTCG	2	10	247050	247059	0 %	20 %	40 %	40 %	525836986
4619	NC_021814	CGA	2	6	247102	247107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836986
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4621	NC_021814	GTT	2	6	247133	247138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836986
4622	NC_021814	ACC	2	6	247191	247196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836986
4623	NC_021814	GGT	2	6	247205	247210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836986
4624	NC_021814	GCT	2	6	247232	247237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836986
4625	NC_021814	CGG	2	6	247270	247275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836986
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4628	NC_021814	TGC	3	9	247351	247359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836986
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4630	NC_021814	GGGTA	2	10	247426	247435	20 %	20 %	60 %	0 %	525836986
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4634	NC_021814	GAT	2	6	247697	247702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836987
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4643	NC_021814	CTG	2	6	248107	248112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836988
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4652	NC_021814	TCG	2	6	248531	248536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836988
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4735	NC_021814	TGA	2	6	253100	253105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836992
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4738	NC_021814	TTCTG	2	10	253284	253293	0 %	60 %	20 %	20 %	525840492
4739	NC_021814	AC	3	6	253323	253328	50 %	0 %	0 %	50 %	525840492
4740	NC_021814	CTT	2	6	253460	253465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840492
4741	NC_021814	ATA	2	6	253693	253698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836993
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4743	NC_021814	CGT	2	6	253725	253730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836993
4744	NC_021814	GCA	2	6	253749	253754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836993
4745	NC_021814	CTA	2	6	253762	253767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836993
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4866	NC_021814	CAT	2	6	260168	260173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837000
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4896	NC_021814	GGC	2	6	261782	261787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837002
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4986	NC_021814	GGC	2	6	267677	267682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837006
4987	NC_021814	CCAG	2	8	267683	267690	25 %	0 %	25 %	50 %	525837006
4988	NC_021814	CCG	2	6	267698	267703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837006
4989	NC_021814	GCCA	2	8	267741	267748	25 %	0 %	25 %	50 %	525837006
4990	NC_021814	CGT	2	6	267779	267784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837006
4991	NC_021814	CG	3	6	267828	267833	0 %	0 %	50 %	50 %	525837006
4992	NC_021814	GGC	2	6	267843	267848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837006
4993	NC_021814	GGC	2	6	267860	267865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837006
4994	NC_021814	TCG	2	6	267886	267891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837006
4995	NC_021814	GCC	2	6	267913	267918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837006
4996	NC_021814	GTC	2	6	268014	268019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837006
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4999	NC_021814	GGT	2	6	268065	268070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837006
5000	NC_021814	CTG	2	6	268092	268097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837006

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