MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 87728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021812	CCT	2	6	143310	143315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826591
2502	NC_021812	GC	3	6	143343	143348	0 %	0 %	50 %	50 %	525826591
2503	NC_021812	CAT	3	9	143383	143391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826591
2504	NC_021812	GCG	2	6	143457	143462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826591
2505	NC_021812	GCC	2	6	143479	143484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826591
2506	NC_021812	CCAGAA	2	12	143508	143519	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525826591
2507	NC_021812	CGC	2	6	143589	143594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826591
2508	NC_021812	GATT	2	8	143605	143612	25 %	50 %	25 %	0 %	525826591
2509	NC_021812	GCG	2	6	143684	143689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826591
2510	NC_021812	CCG	2	6	143745	143750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826591
2511	NC_021812	CG	3	6	143787	143792	0 %	0 %	50 %	50 %	525826591
2512	NC_021812	GGT	2	6	143890	143895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826591
2513	NC_021812	CCG	2	6	143918	143923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826591
2514	NC_021812	CAG	2	6	143983	143988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826591
2515	NC_021812	GCG	2	6	144042	144047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826591
2516	NC_021812	TAA	2	6	144048	144053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826591
2517	NC_021812	TGC	2	6	144087	144092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826591
2518	NC_021812	GAA	2	6	144115	144120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826591
2519	NC_021812	TCT	2	6	144137	144142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826591
2520	NC_021812	CAT	2	6	144163	144168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826591
2521	NC_021812	GCA	2	6	144261	144266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826591
2522	NC_021812	CTGG	2	8	144317	144324	0 %	25 %	50 %	25 %	525826591
2523	NC_021812	GCAG	2	8	144379	144386	25 %	0 %	50 %	25 %	525826591
2524	NC_021812	GTG	2	6	144467	144472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826591
2525	NC_021812	TCCG	2	8	144487	144494	0 %	25 %	25 %	50 %	525826591
2526	NC_021812	GGC	2	6	144541	144546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826591
2527	NC_021812	CGGCG	2	10	144568	144577	0 %	0 %	60 %	40 %	525826591
2528	NC_021812	GAC	2	6	144583	144588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826591
2529	NC_021812	CGG	2	6	144589	144594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826591
2530	NC_021812	GC	3	6	144600	144605	0 %	0 %	50 %	50 %	525826591
2531	NC_021812	TGCC	2	8	144664	144671	0 %	25 %	25 %	50 %	525826591
2532	NC_021812	TGC	2	6	144699	144704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826591
2533	NC_021812	GAA	2	6	144756	144761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826591
2534	NC_021812	GAA	2	6	144775	144780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826591
2535	NC_021812	CGC	2	6	144838	144843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826591
2536	NC_021812	CTT	2	6	144891	144896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826591
2537	NC_021812	TCG	2	6	144917	144922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826591
2538	NC_021812	CCG	2	6	144953	144958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826591
2539	NC_021812	TAAG	2	8	145036	145043	50 %	25 %	25 %	0 %	525826591
2540	NC_021812	T	6	6	145099	145104	0 %	100 %	0 %	0 %	525826591
2541	NC_021812	ATT	2	6	145165	145170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826591
2542	NC_021812	TCA	2	6	145280	145285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826591
2543	NC_021812	CG	3	6	145318	145323	0 %	0 %	50 %	50 %	525826591
2544	NC_021812	ACGC	2	8	145349	145356	25 %	0 %	25 %	50 %	525826591
2545	NC_021812	GAT	2	6	145373	145378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826591
2546	NC_021812	GCC	2	6	145390	145395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826591
2547	NC_021812	ATT	2	6	145426	145431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826591
2548	NC_021812	TCA	2	6	145452	145457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826591
2549	NC_021812	GC	3	6	145482	145487	0 %	0 %	50 %	50 %	525826591
2550	NC_021812	CAT	2	6	145660	145665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826591
2551	NC_021812	ATG	2	6	145667	145672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826591
2552	NC_021812	ATA	2	6	145696	145701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826591
2553	NC_021812	GC	3	6	145866	145871	0 %	0 %	50 %	50 %	525826591
2554	NC_021812	TTG	2	6	145943	145948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826591
2555	NC_021812	A	7	7	145975	145981	100 %	0 %	0 %	0 %	525826591
2556	NC_021812	GGC	2	6	146056	146061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826591
2557	NC_021812	GT	3	6	146131	146136	0 %	50 %	50 %	0 %	525826591
2558	NC_021812	GC	3	6	146146	146151	0 %	0 %	50 %	50 %	525826591
2559	NC_021812	ATC	2	6	146207	146212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826591
2560	NC_021812	AGC	3	9	146213	146221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826591
2561	NC_021812	GAT	2	6	146228	146233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826591
2562	NC_021812	CGG	2	6	146277	146282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826591
2563	NC_021812	CGC	2	6	146289	146294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826591
2564	NC_021812	TTG	2	6	146382	146387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826591
2565	NC_021812	GC	3	6	146753	146758	0 %	0 %	50 %	50 %	525830095
2566	NC_021812	TGGG	2	8	146766	146773	0 %	25 %	75 %	0 %	525830095
2567	NC_021812	TTA	2	6	146784	146789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830095
2568	NC_021812	CAG	2	6	146817	146822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830095
2569	NC_021812	GCG	2	6	146829	146834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830095
2570	NC_021812	GCG	2	6	146856	146861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830095
2571	NC_021812	GCGAA	2	10	146875	146884	40 %	0 %	40 %	20 %	525830095
2572	NC_021812	GC	3	6	146950	146955	0 %	0 %	50 %	50 %	525830095
2573	NC_021812	GCC	2	6	146991	146996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830095
2574	NC_021812	TTA	2	6	147011	147016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830095
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2578	NC_021812	GGT	2	6	147372	147377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826592
2579	NC_021812	CA	3	6	147418	147423	50 %	0 %	0 %	50 %	525826592
2580	NC_021812	ATG	2	6	147434	147439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826592
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2582	NC_021812	CGG	2	6	147724	147729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826593
2583	NC_021812	CAT	2	6	147734	147739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826593
2584	NC_021812	CGTT	2	8	147781	147788	0 %	50 %	25 %	25 %	525826593
2585	NC_021812	CATC	2	8	147797	147804	25 %	25 %	0 %	50 %	525826593
2586	NC_021812	TTC	2	6	147826	147831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826593
2587	NC_021812	GCC	2	6	147844	147849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826593
2588	NC_021812	AATC	2	8	147854	147861	50 %	25 %	0 %	25 %	525826593
2589	NC_021812	GC	3	6	147863	147868	0 %	0 %	50 %	50 %	525826593
2590	NC_021812	TGC	2	6	147915	147920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826593
2591	NC_021812	AAC	2	6	147988	147993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826593
2592	NC_021812	GCG	2	6	148030	148035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826593
2593	NC_021812	GCG	2	6	148096	148101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826593
2594	NC_021812	CGG	2	6	148216	148221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826593
2595	NC_021812	TCA	3	9	148229	148237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826593
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2597	NC_021812	ATT	2	6	148329	148334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826593
2598	NC_021812	T	6	6	148374	148379	0 %	100 %	0 %	0 %	525826593
2599	NC_021812	CGT	2	6	148406	148411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826593
2600	NC_021812	CAG	2	6	148470	148475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826593
2601	NC_021812	A	6	6	148482	148487	100 %	0 %	0 %	0 %	525826593
2602	NC_021812	GCC	2	6	148829	148834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826594
2603	NC_021812	CTG	2	6	148850	148855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826594
2604	NC_021812	TGA	2	6	148878	148883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826594
2605	NC_021812	GTTG	2	8	149061	149068	0 %	50 %	50 %	0 %	525826594
2606	NC_021812	CGC	2	6	149137	149142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826594
2607	NC_021812	TGC	2	6	149172	149177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826594
2608	NC_021812	CAG	2	6	149267	149272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826594
2609	NC_021812	CGC	2	6	149350	149355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826594
2610	NC_021812	TGG	2	6	149475	149480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826594
2611	NC_021812	TGAT	2	8	149931	149938	25 %	50 %	25 %	0 %	525826594
2612	NC_021812	TGA	2	6	149950	149955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826594
2613	NC_021812	GGCG	2	8	149971	149978	0 %	0 %	75 %	25 %	525826594
2614	NC_021812	CG	3	6	149991	149996	0 %	0 %	50 %	50 %	525826594
2615	NC_021812	TTC	2	6	150057	150062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826594
2616	NC_021812	GC	3	6	150148	150153	0 %	0 %	50 %	50 %	525826594
2617	NC_021812	GC	3	6	150327	150332	0 %	0 %	50 %	50 %	525826594
2618	NC_021812	TGC	2	6	150375	150380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826594
2619	NC_021812	CGGG	2	8	150449	150456	0 %	0 %	75 %	25 %	525826594
2620	NC_021812	TGG	2	6	150518	150523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826594
2621	NC_021812	CCG	2	6	150618	150623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826594
2622	NC_021812	CAGGGG	2	12	150626	150637	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	525826594
2623	NC_021812	CG	3	6	150759	150764	0 %	0 %	50 %	50 %	525826594
2624	NC_021812	GCA	2	6	150934	150939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826594
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2850	NC_021812	T	6	6	163310	163315	0 %	100 %	0 %	0 %	525826603
2851	NC_021812	AGA	2	6	163332	163337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826603
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2853	NC_021812	ATA	2	6	163363	163368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826603
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2855	NC_021812	ATA	2	6	163500	163505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826603
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2858	NC_021812	AT	3	6	163697	163702	50 %	50 %	0 %	0 %	525826603
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2861	NC_021812	G	6	6	163804	163809	0 %	0 %	100 %	0 %	525826603
2862	NC_021812	CAAA	2	8	163840	163847	75 %	0 %	0 %	25 %	525826603
2863	NC_021812	GA	3	6	163854	163859	50 %	0 %	50 %	0 %	525826603
2864	NC_021812	AGC	2	6	163878	163883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826603
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2867	NC_021812	ATC	2	6	164018	164023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826604
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2990	NC_021812	GC	3	6	172361	172366	0 %	0 %	50 %	50 %	525826608
2991	NC_021812	GGC	2	6	172368	172373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826608
2992	NC_021812	ATGA	2	8	172456	172463	50 %	25 %	25 %	0 %	525826608
2993	NC_021812	TGA	2	6	172521	172526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826608
2994	NC_021812	GTCA	2	8	172549	172556	25 %	25 %	25 %	25 %	525826608
2995	NC_021812	CAA	2	6	172585	172590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826608
2996	NC_021812	CGG	2	6	172619	172624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826608
2997	NC_021812	CGCTT	2	10	172626	172635	0 %	40 %	20 %	40 %	525826608
2998	NC_021812	GAA	2	6	172636	172641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826608
2999	NC_021812	GCC	2	6	172645	172650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826608
3000	NC_021812	CGA	2	6	172697	172702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826608

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