MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 87728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021812	ATC	2	6	28130	28135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826499
502	NC_021812	GCG	3	9	28287	28295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
503	NC_021812	CCAG	2	8	28422	28429	25 %	0 %	25 %	50 %	525826499
504	NC_021812	CCG	2	6	28449	28454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826499
505	NC_021812	GC	3	6	28519	28524	0 %	0 %	50 %	50 %	525826499
506	NC_021812	GCC	2	6	28661	28666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826499
507	NC_021812	AGC	2	6	28668	28673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826499
508	NC_021812	ACC	2	6	28689	28694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826499
509	NC_021812	CTG	2	6	28769	28774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826499
510	NC_021812	GAA	2	6	28832	28837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826499
511	NC_021812	TGG	2	6	28878	28883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826499
512	NC_021812	CCTG	2	8	28911	28918	0 %	25 %	25 %	50 %	525826499
513	NC_021812	GCC	2	6	29009	29014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826499
514	NC_021812	GAA	2	6	29068	29073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826499
515	NC_021812	CGT	2	6	29116	29121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826499
516	NC_021812	A	6	6	29186	29191	100 %	0 %	0 %	0 %	525826499
517	NC_021812	CGC	2	6	29223	29228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826499
518	NC_021812	CAT	2	6	29230	29235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826499
519	NC_021812	CGG	2	6	29311	29316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
520	NC_021812	TGC	2	6	29355	29360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826499
521	NC_021812	GAT	2	6	29437	29442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826499
522	NC_021812	GCG	2	6	29492	29497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
523	NC_021812	AGA	3	9	29545	29553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826499
524	NC_021812	CTGGT	2	10	29611	29620	0 %	40 %	40 %	20 %	525826499
525	NC_021812	CGC	2	6	29847	29852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826499
526	NC_021812	GGC	2	6	29915	29920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
527	NC_021812	CAGC	2	8	30028	30035	25 %	0 %	25 %	50 %	525826499
528	NC_021812	CGG	2	6	30042	30047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
529	NC_021812	ATG	2	6	30056	30061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826499
530	NC_021812	CAG	2	6	30110	30115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826499
531	NC_021812	CGG	2	6	30118	30123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
532	NC_021812	CGG	2	6	30172	30177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826499
533	NC_021812	ACT	2	6	30204	30209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826499
534	NC_021812	TGG	2	6	30243	30248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826499
535	NC_021812	GAA	2	6	30259	30264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826499
536	NC_021812	CAA	2	6	30438	30443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826500
537	NC_021812	GGC	2	6	30505	30510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826500
538	NC_021812	GCT	3	9	30561	30569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826500
539	NC_021812	CGA	2	6	30606	30611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826500
540	NC_021812	CTA	2	6	30612	30617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826500
541	NC_021812	CG	3	6	30681	30686	0 %	0 %	50 %	50 %	525826500
542	NC_021812	CGCT	2	8	30691	30698	0 %	25 %	25 %	50 %	525826500
543	NC_021812	GCG	2	6	30758	30763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826500
544	NC_021812	ATG	2	6	30841	30846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826500
545	NC_021812	GCGT	2	8	30883	30890	0 %	25 %	50 %	25 %	525826500
546	NC_021812	GAA	2	6	30925	30930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826500
547	NC_021812	AAG	2	6	31000	31005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826500
548	NC_021812	TCT	2	6	31046	31051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826500
549	NC_021812	CTG	2	6	31129	31134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826500
550	NC_021812	GCC	2	6	31159	31164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826500
551	NC_021812	GCG	2	6	31282	31287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826500
552	NC_021812	GTAC	2	8	31374	31381	25 %	25 %	25 %	25 %	525826500
553	NC_021812	GCC	2	6	31405	31410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826500
554	NC_021812	GCA	2	6	31427	31432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826500
555	NC_021812	CG	3	6	31594	31599	0 %	0 %	50 %	50 %	525826500
556	NC_021812	AGC	2	6	31690	31695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826500
557	NC_021812	GCC	2	6	31799	31804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826500
558	NC_021812	CGCA	2	8	31841	31848	25 %	0 %	25 %	50 %	525826500
559	NC_021812	TGC	2	6	31892	31897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826501
560	NC_021812	GCA	2	6	31904	31909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826501
561	NC_021812	CAG	2	6	31911	31916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826501
562	NC_021812	GTT	2	6	31919	31924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826501
563	NC_021812	CTG	2	6	32010	32015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826501
564	NC_021812	GCT	3	9	32066	32074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826501
565	NC_021812	AGC	2	6	32143	32148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826501
566	NC_021812	ATC	2	6	32182	32187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826501
567	NC_021812	AAGCG	2	10	32225	32234	40 %	0 %	40 %	20 %	525826501
568	NC_021812	GCT	2	6	32270	32275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826501
569	NC_021812	CTG	2	6	32325	32330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826501
570	NC_021812	A	6	6	32374	32379	100 %	0 %	0 %	0 %	525826501
571	NC_021812	TGA	2	6	32396	32401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826501
572	NC_021812	GAA	2	6	32430	32435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826501
573	NC_021812	TTC	2	6	32448	32453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826501
574	NC_021812	CGT	2	6	32496	32501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826501
575	NC_021812	CAC	2	6	32537	32542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826501
576	NC_021812	GGA	2	6	32544	32549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826501
577	NC_021812	TTC	2	6	32576	32581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826502
578	NC_021812	GTTAC	2	10	32632	32641	20 %	40 %	20 %	20 %	525826502
579	NC_021812	GGCG	2	8	32661	32668	0 %	0 %	75 %	25 %	525826502
580	NC_021812	CGC	2	6	32772	32777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826502
581	NC_021812	AGA	2	6	32817	32822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826502
582	NC_021812	GAT	2	6	32827	32832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826502
583	NC_021812	CGG	2	6	32836	32841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826502
584	NC_021812	GCG	2	6	32847	32852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826502
585	NC_021812	CGT	2	6	32888	32893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826502
586	NC_021812	CCA	2	6	32916	32921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826502
587	NC_021812	TC	3	6	32944	32949	0 %	50 %	0 %	50 %	525826502
588	NC_021812	GCT	2	6	32950	32955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826502
589	NC_021812	GC	3	6	32967	32972	0 %	0 %	50 %	50 %	525826502
590	NC_021812	CTG	2	6	32978	32983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826502
591	NC_021812	ATG	2	6	33023	33028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826502
592	NC_021812	CAGT	2	8	33047	33054	25 %	25 %	25 %	25 %	525826502
593	NC_021812	TGT	2	6	33144	33149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826502
594	NC_021812	T	7	7	33272	33278	0 %	100 %	0 %	0 %	525830074
595	NC_021812	CCG	2	6	33318	33323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830074
596	NC_021812	T	6	6	33409	33414	0 %	100 %	0 %	0 %	525830074
597	NC_021812	ATG	3	9	33427	33435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830074
598	NC_021812	TCA	2	6	33486	33491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830075
599	NC_021812	ATA	3	9	33501	33509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830075
600	NC_021812	AT	3	6	33514	33519	50 %	50 %	0 %	0 %	525830075
601	NC_021812	GCT	2	6	33540	33545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830075
602	NC_021812	GAG	2	6	33552	33557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830075
603	NC_021812	CCG	2	6	33565	33570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830075
604	NC_021812	AGA	2	6	33575	33580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830075
605	NC_021812	GC	3	6	33631	33636	0 %	0 %	50 %	50 %	525830075
606	NC_021812	GGC	2	6	33824	33829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830075
607	NC_021812	TAG	2	6	33842	33847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830075
608	NC_021812	TATG	2	8	33875	33882	25 %	50 %	25 %	0 %	525830075
609	NC_021812	GCC	2	6	33933	33938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830075
610	NC_021812	CCAA	2	8	33942	33949	50 %	0 %	0 %	50 %	525830075
611	NC_021812	GCG	2	6	34074	34079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830075
612	NC_021812	TAC	2	6	34089	34094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830075
613	NC_021812	GTACA	2	10	34308	34317	40 %	20 %	20 %	20 %	525830075
614	NC_021812	CTGC	2	8	34515	34522	0 %	25 %	25 %	50 %	525830075
615	NC_021812	CAT	2	6	34541	34546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830075
616	NC_021812	GACA	2	8	34578	34585	50 %	0 %	25 %	25 %	525830075
617	NC_021812	AGC	2	6	34607	34612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830075
618	NC_021812	ATA	2	6	34795	34800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830075
619	NC_021812	GTAT	2	8	34831	34838	25 %	50 %	25 %	0 %	525830075
620	NC_021812	GAT	2	6	34854	34859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830075
621	NC_021812	GAAA	2	8	34878	34885	75 %	0 %	25 %	0 %	525830075
622	NC_021812	GCC	2	6	34932	34937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830075
623	NC_021812	AGG	2	6	34972	34977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830075
624	NC_021812	GAA	2	6	34994	34999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830075
625	NC_021812	GATAA	2	10	35005	35014	60 %	20 %	20 %	0 %	525830075
626	NC_021812	AAT	2	6	36328	36333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826503
627	NC_021812	GC	3	6	36381	36386	0 %	0 %	50 %	50 %	525826503
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