MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 87728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_021812	A	6	6	315317	315322	100 %	0 %	0 %	0 %	525826717
5503	NC_021812	GGA	2	6	315328	315333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525826717
5504	NC_021812	GCC	2	6	315371	315376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826717
5505	NC_021812	GAA	2	6	315454	315459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826717
5506	NC_021812	ATCC	2	8	315470	315477	25 %	25 %	0 %	50 %	525826717
5507	NC_021812	GC	3	6	315653	315658	0 %	0 %	50 %	50 %	525826717
5508	NC_021812	GA	3	6	315702	315707	50 %	0 %	50 %	0 %	525826717
5509	NC_021812	CGC	2	6	315729	315734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826717
5510	NC_021812	ATCG	2	8	315803	315810	25 %	25 %	25 %	25 %	525826717
5511	NC_021812	CGG	2	6	315811	315816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826717
5512	NC_021812	CA	3	6	315873	315878	50 %	0 %	0 %	50 %	525826717
5513	NC_021812	T	6	6	315936	315941	0 %	100 %	0 %	0 %	525826718
5514	NC_021812	CCG	2	6	316025	316030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826718
5515	NC_021812	GCGG	2	8	316044	316051	0 %	0 %	75 %	25 %	525826718
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5519	NC_021812	TGG	2	6	316192	316197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826718
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5521	NC_021812	CGC	2	6	316268	316273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826718
5522	NC_021812	A	6	6	316395	316400	100 %	0 %	0 %	0 %	525826718
5523	NC_021812	GCTG	2	8	316409	316416	0 %	25 %	50 %	25 %	525826718
5524	NC_021812	CG	4	8	316432	316439	0 %	0 %	50 %	50 %	525826718
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5530	NC_021812	GCA	2	6	316673	316678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826719
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5539	NC_021812	CG	4	8	317052	317059	0 %	0 %	50 %	50 %	525826719
5540	NC_021812	TGG	2	6	317105	317110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826719
5541	NC_021812	TAC	2	6	317129	317134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826719
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5543	NC_021812	GCCA	2	8	317176	317183	25 %	0 %	25 %	50 %	525826719
5544	NC_021812	CTTG	2	8	317226	317233	0 %	50 %	25 %	25 %	525826719
5545	NC_021812	GCT	2	6	317246	317251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826719
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5547	NC_021812	TGC	2	6	317297	317302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826719
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5551	NC_021812	T	6	6	317445	317450	0 %	100 %	0 %	0 %	525826720
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5559	NC_021812	CTGG	2	8	317706	317713	0 %	25 %	50 %	25 %	525826720
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5607	NC_021812	GC	3	6	320566	320571	0 %	0 %	50 %	50 %	525826723
5608	NC_021812	TGA	2	6	320572	320577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826723
5609	NC_021812	ACC	2	6	320789	320794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826724
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5621	NC_021812	CTG	2	6	321137	321142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826724
5622	NC_021812	A	6	6	321223	321228	100 %	0 %	0 %	0 %	525826724
5623	NC_021812	CGA	2	6	321256	321261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826724
5624	NC_021812	TGA	2	6	321328	321333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826724
5625	NC_021812	CTG	2	6	321335	321340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826724
5626	NC_021812	GACC	2	8	321427	321434	25 %	0 %	25 %	50 %	525826724
5627	NC_021812	CG	3	6	321451	321456	0 %	0 %	50 %	50 %	525826724
5628	NC_021812	CGC	2	6	321465	321470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826724
5629	NC_021812	GAT	2	6	321494	321499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826724
5630	NC_021812	ACG	2	6	321531	321536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826724
5631	NC_021812	TGA	2	6	321697	321702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826724
5632	NC_021812	GACG	2	8	321704	321711	25 %	0 %	50 %	25 %	525826724
5633	NC_021812	TC	3	6	321726	321731	0 %	50 %	0 %	50 %	525826724
5634	NC_021812	GC	3	6	321967	321972	0 %	0 %	50 %	50 %	525826725
5635	NC_021812	TCG	2	6	321979	321984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826725
5636	NC_021812	CTG	2	6	321986	321991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826725
5637	NC_021812	GCTG	2	8	322021	322028	0 %	25 %	50 %	25 %	525826725
5638	NC_021812	CGC	2	6	322030	322035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826725
5639	NC_021812	GGC	2	6	322151	322156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826725
5640	NC_021812	A	6	6	322188	322193	100 %	0 %	0 %	0 %	525826725
5641	NC_021812	GCT	2	6	322294	322299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826725
5642	NC_021812	TCC	2	6	322344	322349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826725
5643	NC_021812	CGC	2	6	322351	322356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826725
5644	NC_021812	GGC	2	6	322360	322365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826725
5645	NC_021812	CGC	2	6	322389	322394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826725
5646	NC_021812	GCG	2	6	322422	322427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826725
5647	NC_021812	GGCG	2	8	322441	322448	0 %	0 %	75 %	25 %	525826725
5648	NC_021812	CCG	2	6	322539	322544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826725
5649	NC_021812	TCG	2	6	322545	322550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826725
5650	NC_021812	ACC	2	6	322559	322564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826725
5651	NC_021812	ACT	2	6	322588	322593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826725
5652	NC_021812	CG	3	6	322624	322629	0 %	0 %	50 %	50 %	525826725
5653	NC_021812	TGA	2	6	322695	322700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826725
5654	NC_021812	GCCA	2	8	322703	322710	25 %	0 %	25 %	50 %	525826725
5655	NC_021812	GGGC	2	8	322759	322766	0 %	0 %	75 %	25 %	525826725
5656	NC_021812	CGT	2	6	322822	322827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826725
5657	NC_021812	CT	3	6	322841	322846	0 %	50 %	0 %	50 %	525826725
5658	NC_021812	CCG	2	6	322847	322852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826725
5659	NC_021812	TG	3	6	322879	322884	0 %	50 %	50 %	0 %	525826725
5660	NC_021812	CAG	2	6	322906	322911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826725
5661	NC_021812	GC	3	6	322920	322925	0 %	0 %	50 %	50 %	525826725
5662	NC_021812	GCG	2	6	322929	322934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826725
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5664	NC_021812	GGC	2	6	323062	323067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826725
5665	NC_021812	TGA	2	6	323097	323102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826725
5666	NC_021812	CTG	2	6	323141	323146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826725
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5670	NC_021812	GCG	2	6	323293	323298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826726
5671	NC_021812	T	6	6	323306	323311	0 %	100 %	0 %	0 %	525826726
5672	NC_021812	AAT	2	6	323324	323329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826726
5673	NC_021812	GCCAG	2	10	323343	323352	20 %	0 %	40 %	40 %	525826726
5674	NC_021812	CAGT	2	8	323413	323420	25 %	25 %	25 %	25 %	525826726
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5678	NC_021812	TCAT	2	8	323511	323518	25 %	50 %	0 %	25 %	525826726
5679	NC_021812	GCC	2	6	323531	323536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826726
5680	NC_021812	GCT	2	6	323630	323635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826726
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5682	NC_021812	TTG	2	6	323718	323723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826726
5683	NC_021812	ACC	2	6	323786	323791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826726
5684	NC_021812	GTA	2	6	323806	323811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826726
5685	NC_021812	ACC	2	6	323823	323828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826726
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5688	NC_021812	CGC	2	6	324061	324066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826727
5689	NC_021812	TGGT	2	8	324083	324090	0 %	50 %	50 %	0 %	525826727
5690	NC_021812	CTG	2	6	324139	324144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826727
5691	NC_021812	GCG	2	6	324195	324200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826727
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5693	NC_021812	TAAA	2	8	324225	324232	75 %	25 %	0 %	0 %	525826727
5694	NC_021812	CGC	2	6	324273	324278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826727
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5696	NC_021812	CGC	2	6	324313	324318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826727
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5698	NC_021812	ATCA	2	8	324562	324569	50 %	25 %	0 %	25 %	525826727
5699	NC_021812	CG	4	8	324585	324592	0 %	0 %	50 %	50 %	525826727
5700	NC_021812	ATA	2	6	324715	324720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826727
5701	NC_021812	CTG	2	6	324802	324807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826727
5702	NC_021812	A	6	6	324817	324822	100 %	0 %	0 %	0 %	525826727
5703	NC_021812	TAA	2	6	324837	324842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826727
5704	NC_021812	CGGCAG	2	12	324874	324885	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525826727
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5706	NC_021812	TGC	2	6	324906	324911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826727
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5708	NC_021812	CGG	2	6	324999	325004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826727
5709	NC_021812	ATCA	2	8	325147	325154	50 %	25 %	0 %	25 %	525826727
5710	NC_021812	ACC	2	6	325220	325225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826727
5711	NC_021812	TAAT	2	8	325349	325356	50 %	50 %	0 %	0 %	525826728
5712	NC_021812	ATG	2	6	325415	325420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826728
5713	NC_021812	CGC	2	6	325538	325543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826728
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5716	NC_021812	TTC	2	6	325676	325681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826728
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5719	NC_021812	GT	3	6	325780	325785	0 %	50 %	50 %	0 %	525826728
5720	NC_021812	GCG	2	6	325792	325797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826728
5721	NC_021812	GCA	2	6	325804	325809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826728
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5724	NC_021812	GCG	3	9	326007	326015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826728
5725	NC_021812	CCA	2	6	326047	326052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826728
5726	NC_021812	CGG	2	6	326065	326070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826728
5727	NC_021812	ACGCT	2	10	326077	326086	20 %	20 %	20 %	40 %	525826728
5728	NC_021812	CG	3	6	326109	326114	0 %	0 %	50 %	50 %	525826728
5729	NC_021812	CTG	2	6	326120	326125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826728
5730	NC_021812	CTG	2	6	326141	326146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826728
5731	NC_021812	GCG	2	6	326152	326157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826728
5732	NC_021812	GC	3	6	326174	326179	0 %	0 %	50 %	50 %	525826728
5733	NC_021812	GGC	2	6	326180	326185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826728
5734	NC_021812	GCGA	2	8	326404	326411	25 %	0 %	50 %	25 %	525826729
5735	NC_021812	AAC	2	6	326420	326425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826729
5736	NC_021812	TTA	2	6	326447	326452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826729
5737	NC_021812	T	6	6	326492	326497	0 %	100 %	0 %	0 %	525826729
5738	NC_021812	TAC	2	6	326543	326548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826729
5739	NC_021812	CAG	3	9	326583	326591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826729
5740	NC_021812	TTTCTA	2	12	326600	326611	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525826729
5741	NC_021812	TTA	2	6	326695	326700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826729
5742	NC_021812	CCT	2	6	326702	326707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525826729
5743	NC_021812	ATG	2	6	326728	326733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826729
5744	NC_021812	TGCG	2	8	326759	326766	0 %	25 %	50 %	25 %	525826729
5745	NC_021812	GCG	2	6	326786	326791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826729
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5981	NC_021812	AT	3	6	339340	339345	50 %	50 %	0 %	0 %	525830131
5982	NC_021812	AT	3	6	339355	339360	50 %	50 %	0 %	0 %	525830131
5983	NC_021812	ATTA	2	8	339384	339391	50 %	50 %	0 %	0 %	525830131
5984	NC_021812	A	7	7	339509	339515	100 %	0 %	0 %	0 %	525826740
5985	NC_021812	GAAAA	2	10	339517	339526	80 %	0 %	20 %	0 %	525826740
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5988	NC_021812	GCA	2	6	339566	339571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826740
5989	NC_021812	CGC	2	6	339574	339579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826740
5990	NC_021812	CAA	2	6	339601	339606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826740
5991	NC_021812	TGA	2	6	339649	339654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826740
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