MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069

Total Repeats: 87728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021812	TTC	2	6	258613	258618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830113
4502	NC_021812	CAG	2	6	258630	258635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830113
4503	NC_021812	ACC	2	6	258676	258681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830113
4504	NC_021812	CGA	2	6	259036	259041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826671
4505	NC_021812	GGCGGG	2	12	259069	259080	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	525826671
4506	NC_021812	GACG	2	8	259132	259139	25 %	0 %	50 %	25 %	525826671
4507	NC_021812	GAAA	2	8	259177	259184	75 %	0 %	25 %	0 %	525826671
4508	NC_021812	A	6	6	259288	259293	100 %	0 %	0 %	0 %	525826671
4509	NC_021812	TCA	2	6	259313	259318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826671
4510	NC_021812	GCG	2	6	259334	259339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826671
4511	NC_021812	AAGAT	2	10	259353	259362	60 %	20 %	20 %	0 %	525826671
4512	NC_021812	GCA	2	6	259366	259371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826671
4513	NC_021812	CAA	2	6	259406	259411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826671
4514	NC_021812	AATCA	2	10	259464	259473	60 %	20 %	0 %	20 %	525826671
4515	NC_021812	ATG	2	6	259546	259551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826671
4516	NC_021812	GGC	2	6	259589	259594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826671
4517	NC_021812	CGG	2	6	259599	259604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826671
4518	NC_021812	AAT	2	6	259618	259623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826671
4519	NC_021812	CGT	2	6	259631	259636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826671
4520	NC_021812	CAG	2	6	259769	259774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826671
4521	NC_021812	CCG	2	6	259796	259801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826671
4522	NC_021812	CG	3	6	259800	259805	0 %	0 %	50 %	50 %	525826671
4523	NC_021812	TGCGC	2	10	260403	260412	0 %	20 %	40 %	40 %	525830114
4524	NC_021812	ATC	2	6	260419	260424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830114
4525	NC_021812	AC	3	6	260433	260438	50 %	0 %	0 %	50 %	525830114
4526	NC_021812	CGAAC	2	10	260448	260457	40 %	0 %	20 %	40 %	525830114
4527	NC_021812	T	7	7	260469	260475	0 %	100 %	0 %	0 %	525830114
4528	NC_021812	GCG	2	6	260484	260489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830114
4529	NC_021812	CAG	2	6	260541	260546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830114
4530	NC_021812	T	6	6	260575	260580	0 %	100 %	0 %	0 %	525830114
4531	NC_021812	GCT	2	6	260811	260816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830115
4532	NC_021812	ACGCC	2	10	260832	260841	20 %	0 %	20 %	60 %	525830115
4533	NC_021812	CTG	2	6	260853	260858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830115
4534	NC_021812	AAC	2	6	260892	260897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830115
4535	NC_021812	CGCTGG	2	12	260995	261006	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525830115
4536	NC_021812	GGA	2	6	261014	261019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525830115
4537	NC_021812	TAAA	2	8	261507	261514	75 %	25 %	0 %	0 %	525830116
4538	NC_021812	CTGCG	2	10	261543	261552	0 %	20 %	40 %	40 %	525830116
4539	NC_021812	A	6	6	261555	261560	100 %	0 %	0 %	0 %	525830116
4540	NC_021812	GTC	2	6	261621	261626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830116
4541	NC_021812	TCA	2	6	261637	261642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830116
4542	NC_021812	T	6	6	261690	261695	0 %	100 %	0 %	0 %	525830116
4543	NC_021812	CAA	2	6	261759	261764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830116
4544	NC_021812	TAT	2	6	261775	261780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830116
4545	NC_021812	TAAT	2	8	261817	261824	50 %	50 %	0 %	0 %	525830116
4546	NC_021812	TCA	2	6	261840	261845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830116
4547	NC_021812	TGA	2	6	261848	261853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830116
4548	NC_021812	C	6	6	261928	261933	0 %	0 %	0 %	100 %	525830116
4549	NC_021812	TTTC	2	8	261997	262004	0 %	75 %	0 %	25 %	525830116
4550	NC_021812	AACC	2	8	262086	262093	50 %	0 %	0 %	50 %	525830117
4551	NC_021812	AGCT	2	8	262156	262163	25 %	25 %	25 %	25 %	525830117
4552	NC_021812	AAT	2	6	262268	262273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830117
4553	NC_021812	ATC	2	6	262297	262302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830117
4554	NC_021812	ATA	2	6	262357	262362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830117
4555	NC_021812	CTT	2	6	262377	262382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830117
4556	NC_021812	GGT	2	6	262676	262681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826672
4557	NC_021812	TGT	2	6	262696	262701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826672
4558	NC_021812	A	7	7	262738	262744	100 %	0 %	0 %	0 %	525826672
4559	NC_021812	CATC	2	8	262746	262753	25 %	25 %	0 %	50 %	525826672
4560	NC_021812	TCA	2	6	262766	262771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826672
4561	NC_021812	T	6	6	262819	262824	0 %	100 %	0 %	0 %	525826672
4562	NC_021812	CAT	2	6	262842	262847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826672
4563	NC_021812	CTT	2	6	262850	262855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826672
4564	NC_021812	AAT	2	6	262974	262979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830118
4565	NC_021812	CCA	2	6	263001	263006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830118
4566	NC_021812	ATA	2	6	263013	263018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830118
4567	NC_021812	GTT	2	6	263043	263048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525830118
4568	NC_021812	ACT	2	6	263274	263279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830119
4569	NC_021812	GCA	2	6	263280	263285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830119
4570	NC_021812	TG	3	6	263382	263387	0 %	50 %	50 %	0 %	525830119
4571	NC_021812	GAA	2	6	263430	263435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525830119
4572	NC_021812	TAT	2	6	263444	263449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830119
4573	NC_021812	TGA	2	6	263489	263494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830119
4574	NC_021812	A	7	7	263536	263542	100 %	0 %	0 %	0 %	525826673
4575	NC_021812	CATAC	2	10	263548	263557	40 %	20 %	0 %	40 %	525826673
4576	NC_021812	A	8	8	263569	263576	100 %	0 %	0 %	0 %	525826673
4577	NC_021812	GAA	2	6	263627	263632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826673
4578	NC_021812	GTG	2	6	263657	263662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525826673
4579	NC_021812	ATG	2	6	263738	263743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826673
4580	NC_021812	GACAC	2	10	263757	263766	40 %	0 %	20 %	40 %	525826673
4581	NC_021812	CATT	2	8	263896	263903	25 %	50 %	0 %	25 %	525830120
4582	NC_021812	CCCG	2	8	263909	263916	0 %	0 %	25 %	75 %	525830120
4583	NC_021812	CTG	2	6	263971	263976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830120
4584	NC_021812	TGTT	2	8	264037	264044	0 %	75 %	25 %	0 %	525830120
4585	NC_021812	CA	3	6	264063	264068	50 %	0 %	0 %	50 %	525830120
4586	NC_021812	GCTT	2	8	264107	264114	0 %	50 %	25 %	25 %	525830120
4587	NC_021812	ACTG	2	8	264134	264141	25 %	25 %	25 %	25 %	525830120
4588	NC_021812	CAG	2	6	264142	264147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830120
4589	NC_021812	CAC	2	6	264176	264181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525830120
4590	NC_021812	CAA	2	6	264201	264206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830120
4591	NC_021812	ACG	2	6	264211	264216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830120
4592	NC_021812	CTGG	2	8	264284	264291	0 %	25 %	50 %	25 %	525830120
4593	NC_021812	TCT	2	6	264457	264462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830121
4594	NC_021812	CGT	2	6	264522	264527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525830121
4595	NC_021812	GCAG	2	8	264551	264558	25 %	0 %	50 %	25 %	525830121
4596	NC_021812	TA	3	6	264588	264593	50 %	50 %	0 %	0 %	525830121
4597	NC_021812	CCAG	2	8	264603	264610	25 %	0 %	25 %	50 %	525830121
4598	NC_021812	TTGC	2	8	264731	264738	0 %	50 %	25 %	25 %	525830121
4599	NC_021812	GTA	2	6	264747	264752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830121
4600	NC_021812	TTC	2	6	264753	264758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830121
4601	NC_021812	TTTG	2	8	264784	264791	0 %	75 %	25 %	0 %	525830121
4602	NC_021812	ACA	2	6	264806	264811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525830121
4603	NC_021812	TGA	2	6	264836	264841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830121
4604	NC_021812	T	6	6	264869	264874	0 %	100 %	0 %	0 %	525830121
4605	NC_021812	AATG	2	8	264893	264900	50 %	25 %	25 %	0 %	525830121
4606	NC_021812	A	6	6	264938	264943	100 %	0 %	0 %	0 %	525830121
4607	NC_021812	TCA	2	6	264994	264999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830121
4608	NC_021812	ACG	2	6	265051	265056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830121
4609	NC_021812	CTC	2	6	265071	265076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525830121
4610	NC_021812	CAT	2	6	265133	265138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830121
4611	NC_021812	CTTT	2	8	265150	265157	0 %	75 %	0 %	25 %	525830121
4612	NC_021812	AAT	2	6	265170	265175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525830121
4613	NC_021812	TAT	2	6	265181	265186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830121
4614	NC_021812	TTAA	2	8	265213	265220	50 %	50 %	0 %	0 %	525830121
4615	NC_021812	TAT	2	6	265257	265262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830121
4616	NC_021812	CTT	2	6	265292	265297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525830121
4617	NC_021812	AT	3	6	265465	265470	50 %	50 %	0 %	0 %	525830121
4618	NC_021812	AAC	2	6	265754	265759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826674
4619	NC_021812	ACG	2	6	265838	265843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826674
4620	NC_021812	TGC	2	6	265857	265862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826674
4621	NC_021812	TAT	2	6	265865	265870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826674
4622	NC_021812	CGT	2	6	265910	265915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826674
4623	NC_021812	CAA	2	6	265945	265950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826674
4624	NC_021812	TAA	2	6	265978	265983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826674
4625	NC_021812	GC	3	6	265996	266001	0 %	0 %	50 %	50 %	525826674
4626	NC_021812	AATT	2	8	266027	266034	50 %	50 %	0 %	0 %	525826674
4627	NC_021812	TCA	2	6	266037	266042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826674
4628	NC_021812	GC	3	6	266059	266064	0 %	0 %	50 %	50 %	525826674
4629	NC_021812	CAC	2	6	266066	266071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826674
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4631	NC_021812	GCG	2	6	266225	266230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830122
4632	NC_021812	ACG	2	6	266305	266310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525830122
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4634	NC_021812	CGG	2	6	266400	266405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830122
4635	NC_021812	CAT	2	6	266467	266472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830122
4636	NC_021812	GCCGG	2	10	266638	266647	0 %	0 %	60 %	40 %	525830122
4637	NC_021812	TCA	2	6	266660	266665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830122
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4641	NC_021812	GAT	2	6	266835	266840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525830122
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4644	NC_021812	CGGA	2	8	266959	266966	25 %	0 %	50 %	25 %	525830122
4645	NC_021812	GC	3	6	267013	267018	0 %	0 %	50 %	50 %	525830122
4646	NC_021812	AGGTA	2	10	267039	267048	40 %	20 %	40 %	0 %	525830122
4647	NC_021812	CCG	2	6	267079	267084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525830122
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4652	NC_021812	ATT	2	6	267417	267422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525830122
4653	NC_021812	GCG	2	6	267489	267494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525830122
4654	NC_021812	TCA	2	6	267507	267512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525830122
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4657	NC_021812	CAA	2	6	267739	267744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525826675
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4661	NC_021812	ATC	3	9	267863	267871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826675
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4665	NC_021812	CGC	2	6	268216	268221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826675
4666	NC_021812	CGT	2	6	268308	268313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826675
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4670	NC_021812	TTA	2	6	268497	268502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826675
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4678	NC_021812	GCTG	2	8	269028	269035	0 %	25 %	50 %	25 %	525826676
4679	NC_021812	A	7	7	269069	269075	100 %	0 %	0 %	0 %	525826676
4680	NC_021812	GTT	2	6	269084	269089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826676
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4688	NC_021812	AGTG	2	8	269506	269513	25 %	25 %	50 %	0 %	525826676
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4692	NC_021812	A	6	6	269680	269685	100 %	0 %	0 %	0 %	525826676
4693	NC_021812	GTGG	2	8	269739	269746	0 %	25 %	75 %	0 %	525826676
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4699	NC_021812	AT	3	6	270004	270009	50 %	50 %	0 %	0 %	525826676
4700	NC_021812	GAT	2	6	270026	270031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826676
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4704	NC_021812	ACT	2	6	270114	270119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826676
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4712	NC_021812	ATG	2	6	270420	270425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826676
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4726	NC_021812	TGA	2	6	271365	271370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826677
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4729	NC_021812	T	7	7	271460	271466	0 %	100 %	0 %	0 %	525826677
4730	NC_021812	CGG	2	6	271578	271583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826677
4731	NC_021812	TGCTC	2	10	271620	271629	0 %	40 %	20 %	40 %	525826677
4732	NC_021812	TGT	2	6	271788	271793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826677
4733	NC_021812	CGG	2	6	271818	271823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826677
4734	NC_021812	CATG	2	8	271827	271834	25 %	25 %	25 %	25 %	525826677
4735	NC_021812	AT	3	6	271844	271849	50 %	50 %	0 %	0 %	525826677
4736	NC_021812	CTGG	2	8	271921	271928	0 %	25 %	50 %	25 %	525826677
4737	NC_021812	GCTATC	2	12	271930	271941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525826677
4738	NC_021812	TAA	2	6	272017	272022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525826677
4739	NC_021812	AAGA	2	8	272063	272070	75 %	0 %	25 %	0 %	525826678
4740	NC_021812	ATTA	2	8	272080	272087	50 %	50 %	0 %	0 %	525826678
4741	NC_021812	CGGAT	2	10	272110	272119	20 %	20 %	40 %	20 %	525826678
4742	NC_021812	GAAC	2	8	272136	272143	50 %	0 %	25 %	25 %	525826678
4743	NC_021812	TTAC	2	8	272151	272158	25 %	50 %	0 %	25 %	525826678
4744	NC_021812	ATT	2	6	272165	272170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525826678
4745	NC_021812	TTC	2	6	272193	272198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525826678
4746	NC_021812	A	6	6	272228	272233	100 %	0 %	0 %	0 %	525826678
4747	NC_021812	TTG	2	6	272247	272252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826678
4748	NC_021812	TATT	2	8	272260	272267	25 %	75 %	0 %	0 %	525826678
4749	NC_021812	TTG	2	6	272305	272310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826678
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4854	NC_021812	GTC	2	6	278449	278454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826682
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4859	NC_021812	GT	3	6	278791	278796	0 %	50 %	50 %	0 %	525826682
4860	NC_021812	ACAG	2	8	278830	278837	50 %	0 %	25 %	25 %	525826682
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4867	NC_021812	TGC	2	6	279352	279357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826683
4868	NC_021812	CGG	2	6	279365	279370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826683
4869	NC_021812	CGC	2	6	279439	279444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826683
4870	NC_021812	AG	4	8	279634	279641	50 %	0 %	50 %	0 %	525826683
4871	NC_021812	CGAC	2	8	279709	279716	25 %	0 %	25 %	50 %	525826684
4872	NC_021812	C	6	6	279755	279760	0 %	0 %	0 %	100 %	525826684
4873	NC_021812	GCT	2	6	279775	279780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826684
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4875	NC_021812	GCA	2	6	279794	279799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826684
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4883	NC_021812	TA	3	6	280268	280273	50 %	50 %	0 %	0 %	525826685
4884	NC_021812	AGA	2	6	280430	280435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525826686
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4895	NC_021812	T	6	6	281023	281028	0 %	100 %	0 %	0 %	525826686
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4931	NC_021812	GATT	2	8	282868	282875	25 %	50 %	25 %	0 %	525826689
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4960	NC_021812	ACT	2	6	285128	285133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826690
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4975	NC_021812	GCA	2	6	286015	286020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826691
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4978	NC_021812	TGT	2	6	286122	286127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525826691
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4980	NC_021812	CCAG	2	8	286421	286428	25 %	0 %	25 %	50 %	525826692
4981	NC_021812	TGC	2	6	286456	286461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826692
4982	NC_021812	CAG	2	6	286519	286524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525826692
4983	NC_021812	CAT	2	6	286583	286588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826692
4984	NC_021812	CGG	2	6	286628	286633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826692
4985	NC_021812	ATCA	2	8	286641	286648	50 %	25 %	0 %	25 %	525826692
4986	NC_021812	TCTT	2	8	286677	286684	0 %	75 %	0 %	25 %	525826692
4987	NC_021812	CGAA	2	8	286704	286711	50 %	0 %	25 %	25 %	525826692
4988	NC_021812	TCA	2	6	286754	286759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826692
4989	NC_021812	GCG	2	6	286800	286805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826693
4990	NC_021812	AG	3	6	286815	286820	50 %	0 %	50 %	0 %	525826693
4991	NC_021812	CCG	2	6	286890	286895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525826693
4992	NC_021812	TCG	2	6	287016	287021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525826693
4993	NC_021812	AGT	2	6	287098	287103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525826693
4994	NC_021812	CAT	2	6	287131	287136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826693
4995	NC_021812	TCA	2	6	287158	287163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525826693
4996	NC_021812	GCG	2	6	287175	287180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525826693
4997	NC_021812	GC	3	6	287207	287212	0 %	0 %	50 %	50 %	525826693
4998	NC_021812	GC	4	8	287251	287258	0 %	0 %	50 %	50 %	525826693
4999	NC_021812	GC	3	6	287284	287289	0 %	0 %	50 %	50 %	525826693
5000	NC_021812	ACC	2	6	287316	287321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525826693

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