MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578

Total Repeats: 88435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021810	CGCCCG	2	12	201967	201978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814375
3502	NC_021810	CAA	2	6	202040	202045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814375
3503	NC_021810	TTG	2	6	202287	202292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814376
3504	NC_021810	TGA	2	6	202453	202458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814376
3505	NC_021810	CGA	2	6	202469	202474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814376
3506	NC_021810	CGC	2	6	202483	202488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814376
3507	NC_021810	CG	3	6	202516	202521	0 %	0 %	50 %	50 %	525814376
3508	NC_021810	A	6	6	202525	202530	100 %	0 %	0 %	0 %	525814376
3509	NC_021810	ATCG	2	8	202550	202557	25 %	25 %	25 %	25 %	525814376
3510	NC_021810	GCG	2	6	202600	202605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814376
3511	NC_021810	CAG	2	6	202641	202646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814376
3512	NC_021810	ATCGCC	2	12	202656	202667	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525814376
3513	NC_021810	CGCC	2	8	202707	202714	0 %	0 %	25 %	75 %	525814376
3514	NC_021810	CG	3	6	202774	202779	0 %	0 %	50 %	50 %	525814376
3515	NC_021810	CTGCCG	2	12	202800	202811	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525814376
3516	NC_021810	CTG	2	6	202827	202832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814376
3517	NC_021810	CGG	2	6	202855	202860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814376
3518	NC_021810	CG	3	6	202877	202882	0 %	0 %	50 %	50 %	525814376
3519	NC_021810	AAT	2	6	203004	203009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814377
3520	NC_021810	CA	3	6	203042	203047	50 %	0 %	0 %	50 %	525814377
3521	NC_021810	AAGA	2	8	203056	203063	75 %	0 %	25 %	0 %	525814377
3522	NC_021810	TGC	2	6	203078	203083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814377
3523	NC_021810	CGT	2	6	203095	203100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814377
3524	NC_021810	GCCCGC	2	12	203155	203166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814377
3525	NC_021810	CCG	2	6	203272	203277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814377
3526	NC_021810	TTTA	2	8	203290	203297	25 %	75 %	0 %	0 %	525814377
3527	NC_021810	CAA	2	6	203346	203351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814377
3528	NC_021810	GCG	2	6	203504	203509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814377
3529	NC_021810	AAGG	2	8	203527	203534	50 %	0 %	50 %	0 %	525814377
3530	NC_021810	GTC	2	6	203644	203649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814377
3531	NC_021810	GCG	2	6	203693	203698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814377
3532	NC_021810	GGC	2	6	203715	203720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814377
3533	NC_021810	TGG	2	6	203721	203726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814377
3534	NC_021810	CCGT	2	8	203739	203746	0 %	25 %	25 %	50 %	525814377
3535	NC_021810	CGCC	2	8	203769	203776	0 %	0 %	25 %	75 %	525814377
3536	NC_021810	TCG	2	6	203813	203818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814377
3537	NC_021810	TGCG	2	8	203872	203879	0 %	25 %	50 %	25 %	525814377
3538	NC_021810	CCG	2	6	204227	204232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814378
3539	NC_021810	ATT	3	9	204279	204287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814378
3540	NC_021810	CG	3	6	204352	204357	0 %	0 %	50 %	50 %	525814378
3541	NC_021810	CGG	2	6	204392	204397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814378
3542	NC_021810	CCG	2	6	204435	204440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814378
3543	NC_021810	ACC	2	6	204486	204491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814378
3544	NC_021810	CAA	2	6	204522	204527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814378
3545	NC_021810	CCT	2	6	204562	204567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814378
3546	NC_021810	CGCC	2	8	204619	204626	0 %	0 %	25 %	75 %	525814378
3547	NC_021810	TGA	2	6	204732	204737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814378
3548	NC_021810	ATT	2	6	204902	204907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814379
3549	NC_021810	ATGG	2	8	204926	204933	25 %	25 %	50 %	0 %	525814379
3550	NC_021810	AAC	2	6	204939	204944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814379
3551	NC_021810	GC	4	8	204953	204960	0 %	0 %	50 %	50 %	525814379
3552	NC_021810	GC	3	6	205040	205045	0 %	0 %	50 %	50 %	525814379
3553	NC_021810	CG	3	6	205073	205078	0 %	0 %	50 %	50 %	525814379
3554	NC_021810	CCG	2	6	205107	205112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814379
3555	NC_021810	GCC	2	6	205246	205251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814380
3556	NC_021810	TCA	2	6	205258	205263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814380
3557	NC_021810	GCG	2	6	205294	205299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814380
3558	NC_021810	GCT	2	6	205370	205375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814380
3559	NC_021810	GCG	2	6	205385	205390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814380
3560	NC_021810	GCC	2	6	205447	205452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814380
3561	NC_021810	TCC	2	6	205561	205566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525814380
3562	NC_021810	CCA	2	6	205583	205588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814380
3563	NC_021810	GCC	2	6	205663	205668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814380
3564	NC_021810	CG	3	6	205760	205765	0 %	0 %	50 %	50 %	525814380
3565	NC_021810	TGA	2	6	205875	205880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814380
3566	NC_021810	GC	3	6	206045	206050	0 %	0 %	50 %	50 %	525814381
3567	NC_021810	TCA	2	6	206063	206068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814381
3568	NC_021810	CTG	3	9	206073	206081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814381
3569	NC_021810	TGGC	2	8	206141	206148	0 %	25 %	50 %	25 %	525814381
3570	NC_021810	AAC	2	6	206167	206172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814381
3571	NC_021810	CTGT	2	8	206187	206194	0 %	50 %	25 %	25 %	525814381
3572	NC_021810	GC	3	6	206221	206226	0 %	0 %	50 %	50 %	525814381
3573	NC_021810	CCG	3	9	206351	206359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814381
3574	NC_021810	CGC	2	6	206430	206435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814381
3575	NC_021810	GC	3	6	206434	206439	0 %	0 %	50 %	50 %	525814381
3576	NC_021810	CGG	2	6	206444	206449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814381
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3580	NC_021810	TG	3	6	206743	206748	0 %	50 %	50 %	0 %	525814381
3581	NC_021810	GC	3	6	206758	206763	0 %	0 %	50 %	50 %	525814381
3582	NC_021810	TTG	2	6	206826	206831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814381
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3588	NC_021810	GCT	2	6	207103	207108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814382
3589	NC_021810	GCGA	2	8	207131	207138	25 %	0 %	50 %	25 %	525814382
3590	NC_021810	GCC	2	6	207155	207160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814382
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3592	NC_021810	CAA	2	6	207274	207279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814382
3593	NC_021810	TGG	2	6	207288	207293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814382
3594	NC_021810	ATCG	2	8	207320	207327	25 %	25 %	25 %	25 %	525814382
3595	NC_021810	GC	3	6	207587	207592	0 %	0 %	50 %	50 %	525814382
3596	NC_021810	CGA	2	6	207628	207633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814382
3597	NC_021810	A	6	6	207709	207714	100 %	0 %	0 %	0 %	525814382
3598	NC_021810	TAT	2	6	207792	207797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814383
3599	NC_021810	GTG	2	6	207854	207859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525814383
3600	NC_021810	CAT	2	6	207874	207879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814383
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3602	NC_021810	CTG	2	6	207932	207937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814383
3603	NC_021810	TTA	2	6	207957	207962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814383
3604	NC_021810	CTG	2	6	208046	208051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814383
3605	NC_021810	TCT	2	6	208053	208058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525814383
3606	NC_021810	TGC	2	6	208062	208067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814383
3607	NC_021810	CTGC	2	8	208169	208176	0 %	25 %	25 %	50 %	525814383
3608	NC_021810	GGC	2	6	208181	208186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814383
3609	NC_021810	TGC	2	6	208212	208217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814383
3610	NC_021810	TGC	2	6	208275	208280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814383
3611	NC_021810	AGCC	2	8	208359	208366	25 %	0 %	25 %	50 %	525814384
3612	NC_021810	CGA	2	6	208392	208397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814384
3613	NC_021810	CCGCC	2	10	208415	208424	0 %	0 %	20 %	80 %	525814384
3614	NC_021810	ATT	2	6	208540	208545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814384
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3618	NC_021810	GC	3	6	208757	208762	0 %	0 %	50 %	50 %	525814385
3619	NC_021810	GGC	2	6	208829	208834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814385
3620	NC_021810	GC	3	6	208833	208838	0 %	0 %	50 %	50 %	525814385
3621	NC_021810	CG	3	6	208852	208857	0 %	0 %	50 %	50 %	525814385
3622	NC_021810	CTG	2	6	208901	208906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814385
3623	NC_021810	GAC	2	6	208928	208933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814385
3624	NC_021810	CTGGC	2	10	209014	209023	0 %	20 %	40 %	40 %	525814385
3625	NC_021810	GGC	2	6	209038	209043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814385
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3642	NC_021810	GTTCG	2	10	209792	209801	0 %	40 %	40 %	20 %	525814386
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3647	NC_021810	ACT	2	6	209941	209946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814386
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3652	NC_021810	TGA	2	6	210092	210097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814386
3653	NC_021810	GC	4	8	210143	210150	0 %	0 %	50 %	50 %	525814386
3654	NC_021810	CGA	2	6	210209	210214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814386
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3661	NC_021810	GCC	2	6	210621	210626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814387
3662	NC_021810	CTG	2	6	210655	210660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814387
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3730	NC_021810	GC	3	6	214347	214352	0 %	0 %	50 %	50 %	525814391
3731	NC_021810	TCGCCA	2	12	214355	214366	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525814391
3732	NC_021810	AAC	2	6	214423	214428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814391
3733	NC_021810	AGT	2	6	214478	214483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814391
3734	NC_021810	CGA	2	6	214525	214530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814391
3735	NC_021810	TCA	2	6	214567	214572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814391
3736	NC_021810	CGT	2	6	214589	214594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814391
3737	NC_021810	CAA	2	6	214876	214881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814392
3738	NC_021810	GAC	2	6	214890	214895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814392
3739	NC_021810	GC	3	6	214924	214929	0 %	0 %	50 %	50 %	525814392
3740	NC_021810	GCG	2	6	215029	215034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814392
3741	NC_021810	CGC	2	6	215088	215093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814392
3742	NC_021810	CCG	2	6	215117	215122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814392
3743	NC_021810	TC	3	6	215130	215135	0 %	50 %	0 %	50 %	525814392
3744	NC_021810	A	7	7	215223	215229	100 %	0 %	0 %	0 %	525814392
3745	NC_021810	GAGC	2	8	215256	215263	25 %	0 %	50 %	25 %	525814392
3746	NC_021810	GAT	2	6	215304	215309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814392
3747	NC_021810	CGC	2	6	215382	215387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814392
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3749	NC_021810	AGA	2	6	215553	215558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525814392
3750	NC_021810	TGGC	2	8	215572	215579	0 %	25 %	50 %	25 %	525814392
3751	NC_021810	CA	3	6	215629	215634	50 %	0 %	0 %	50 %	525814392
3752	NC_021810	GTC	2	6	215679	215684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814392
3753	NC_021810	GC	3	6	215711	215716	0 %	0 %	50 %	50 %	525814392
3754	NC_021810	CCG	2	6	215737	215742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814392
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3762	NC_021810	ATG	2	6	216224	216229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525814394
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3764	NC_021810	A	6	6	216290	216295	100 %	0 %	0 %	0 %	525814394
3765	NC_021810	CAA	2	6	216364	216369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814394
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3769	NC_021810	TAT	2	6	216742	216747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814394
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3775	NC_021810	ACC	2	6	217229	217234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525814394
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3778	NC_021810	CGC	2	6	217298	217303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525814394
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3810	NC_021810	CGG	2	6	219365	219370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525814396
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3822	NC_021810	TCACG	2	10	220187	220196	20 %	20 %	20 %	40 %	525814396
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3838	NC_021810	GAC	2	6	220869	220874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525814396
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3848	NC_021810	CTG	2	6	221545	221550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814398
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3852	NC_021810	CAA	2	6	221662	221667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814398
3853	NC_021810	TTAT	2	8	221668	221675	25 %	75 %	0 %	0 %	525814398
3854	NC_021810	AC	3	6	221695	221700	50 %	0 %	0 %	50 %	525814398
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3856	NC_021810	T	6	6	221829	221834	0 %	100 %	0 %	0 %	525814398
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3863	NC_021810	TAGA	2	8	222500	222507	50 %	25 %	25 %	0 %	525814399
3864	NC_021810	TC	3	6	222532	222537	0 %	50 %	0 %	50 %	525814399
3865	NC_021810	CAA	2	6	222549	222554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814399
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3869	NC_021810	T	6	6	222690	222695	0 %	100 %	0 %	0 %	525814399
3870	NC_021810	TGTTT	2	10	222720	222729	0 %	80 %	20 %	0 %	525814399
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3991	NC_021810	T	6	6	229490	229495	0 %	100 %	0 %	0 %	525814405
3992	NC_021810	ATA	2	6	229518	229523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525814405
3993	NC_021810	GC	3	6	229589	229594	0 %	0 %	50 %	50 %	525814405
3994	NC_021810	TGT	2	6	229618	229623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525814405
3995	NC_021810	ATT	2	6	229648	229653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525814405
3996	NC_021810	ACT	2	6	230176	230181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525814406
3997	NC_021810	GTC	2	6	230241	230246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525814406
3998	NC_021810	T	6	6	230252	230257	0 %	100 %	0 %	0 %	525814406
3999	NC_021810	CA	3	6	230316	230321	50 %	0 %	0 %	50 %	525814406
4000	NC_021810	CAA	2	6	230323	230328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525814406

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